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当前共找到 34059 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2025-12-03 |
Hypergraph-driven spatial multimodal fusion for precise domain delineation and tumor microenvironment decoding
2025-Dec-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09312-0
PMID:41326702
|
研究论文 | 提出了一种名为HAST的超图驱动空间多模态融合工具，用于精确划分空间域和解码肿瘤微环境 | 通过整合基因表达、空间坐标和组织学特征构建局部超图，有效建模多对多的空间关系，并利用超图卷积网络结合自监督对比学习来融合多视图信息 | 未在摘要中明确说明 | 精确划分空间域并解码肿瘤微环境 | 肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 超图卷积网络 | 基因表达数据、空间坐标、组织学特征 | 多个数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1042 | 2025-12-03 |
Comprehensive bulk and single-cell RNA sequencing uncovers senescence-associated biomarkers in therapeutic mesenchymal stem cells
2025-Dec-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30633-x
PMID:41326705
|
研究论文 | 本研究结合形态学、分子和转录组学分析，深入表征了犬间充质干细胞在衰老过程中的变化，并通过bulk和单细胞RNA测序发现了衰老相关的生物标志物 | 首次在犬模型（与人类衰老特征相似）中，结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序全面分析间充质干细胞的衰老过程，并发现了衰老亚群的异质性分布 | 研究基于体外传代模型，可能无法完全模拟体内衰老的复杂性；样本量相对较小 | 研究间充质干细胞在衰老过程中的转录组变化，寻找衰老相关的生物标志物，以提高细胞治疗的质量控制 | 犬间充质干细胞（早期传代P2和晚期传代P6） | 数字病理学 | 老年疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早期传代（P2）和晚期传代（P6）犬间充质干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1043 | 2025-12-03 |
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2025-Dec-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02918-6
PMID:41326819
|
综述 | 本文探讨了基于Transformer的模型在分析和整合多尺度生物数据方面的最新进展，并提出了一个模块化的“超级Transformer”架构设计 | 将Transformer模型分为三个层级进行系统分类，并提出了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化“超级Transformer”架构 | 本文为综述性文章，未涉及具体实验验证，主要讨论模型架构和挑战 | 为多尺度、多模态基因组学研究提供Transformer模型的资源与路线图 | 基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 | 机器学习 | NA | NA | Transformer, 大型语言模型 | 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1044 | 2025-12-03 |
Leveraging two novel droplet-based single-cell RNA Sequencing platforms: a comparative study with 10x genomics
2025-Dec-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12355-6
PMID:41327014
|
研究论文 | 本文对SeekOne和MobiDrop两种新型液滴式单细胞RNA测序平台与10x Genomics商业平台进行了比较研究 | 首次独立比较两种新兴液滴式单细胞RNA测序平台与行业标准10x Genomics平台的性能表现 | 研究仅基于特定样本类型，可能未涵盖所有生物对象或实验条件 | 评估不同单细胞RNA测序平台的性能，以确定最适合研究各种生物对象和实现特定实验目标的平台 | 不同复杂度和质量的细胞悬浮液样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多种类型样本 | 10x Genomics, SeekOne, MobiDrop | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SeekOne平台, MobiDrop平台 | 液滴式高通量单细胞RNA测序平台 |
| 1045 | 2025-12-03 |
IL-15 signaling via cis- and trans-presentation to progenitor-exhausted CD8+ T cells enhances radio-immunotherapy efficacy in ESCC
2025-Dec-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03881-2
PMID:41327181
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-15在食管鳞状细胞癌（ESCC）放疗联合免疫治疗中的作用，发现其通过顺式和反式呈递增强前体耗竭CD8+ T细胞功能，并可作为预测治疗反应的生物标志物 | 揭示了IL-15在ESCC肿瘤微环境中通过空间邻近性激活前体耗竭CD8+ T细胞的新机制，并首次提出IL-15水平可作为放疗联合免疫治疗的预测性生物标志物 | 研究样本量有限，且主要基于观察性临床队列和临床前小鼠模型，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索IL-15在食管鳞状细胞癌放疗联合免疫治疗中的作用机制，并评估其作为预测性生物标志物的潜力 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及临床前小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | ELISA、流式细胞术、单细胞RNA测序、空间分析 | NA | 血液和组织样本、单细胞RNA测序数据、空间分析数据 | ESCC患者临床队列及临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1046 | 2025-12-03 |
Three-Year Follow-Up of Neoadjuvant Tislelizumab with Chemotherapy in Locally Advanced Gastric and Gastroesophageal Junction Adenocarcinoma: Revealing Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Corresponding to PD-1 Blockade Efficacy
2025-Dec-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508433
PMID:41327861
|
研究论文 | 本研究报道了局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗方案治疗的三年随访数据，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响 | 首次在局部晚期胃癌新辅助免疫治疗背景下，通过单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定并验证了三种癌症相关成纤维细胞表型，特别是发现炎症性CAFs与免疫治疗疗效负相关 | 研究为单臂II期临床试验，样本量较小（49例患者），且单细胞测序仅来自7例患者，需要更大规模随机对照试验验证 | 评估新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗在局部晚期胃癌中的长期疗效，并探索癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响机制 | 局部晚期胃癌和胃食管结合部腺癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床随访数据 | 49例患者（其中7例进行了单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1047 | 2025-12-03 |
FOXA1 Upregulates HILPDA to Enhance Lipid Droplet Accumulation and Anoikis Resistance in Lung Adenocarcinoma
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502184RR
PMID:41246996
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXA1通过转录激活HILPDA促进脂滴积累，从而导致肺腺癌细胞失巢凋亡抵抗和转移的分子机制 | 首次阐明FOXA1/HILPDA轴通过调控脂滴积累影响肺腺癌失巢凋亡抵抗的新机制，并发现HILPDA可作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于A549细胞系和动物模型，缺乏临床样本验证；机制研究尚未涉及其他可能的下游通路 | 探究HILPDA在肺腺癌失巢凋亡抵抗中的作用机制及其上游调控因子 | 肺腺癌细胞系（A549及其失巢凋亡抵抗亚型A549-AR）、裸鼠移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测、Western blot、免疫荧光、油红O染色 | 细胞模型、动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 未明确样本数量，使用A549细胞系及建立的A549-AR细胞亚型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1048 | 2025-12-03 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00875-x
PMID:41318546
|
研究论文 | 本研究通过多区域空间转录组学分析，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在AD患者中同时进行多区域空间转录组学与Aβ免疫荧光染色匹配分析，揭示了区域特异性细胞类型和分子机制差异 | 样本量较小（仅2名患者），且仅针对Braak III和Thal 4阶段的AD患者，限制了结果的普适性 | 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异及其分子机制 | 两名Braak III和Thal 4阶段AD患者的四个脑区组织：内嗅皮层、枕颞皮层、背外侧前额叶皮层和纹状皮层 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 2名AD患者的4个脑区组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1049 | 2025-12-03 |
Single-cell insights into tumor microenvironment heterogeneity and plasticity: transforming precision therapy in gastrointestinal cancers
2025-Nov-28, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03567-5
PMID:41316282
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示胃肠道癌症肿瘤微环境异质性和可塑性方面的最新发现，并讨论了其对克服治疗耐药性和改善临床结果的启示 | 利用单细胞测序技术以前所未有的分辨率解析胃肠道癌症肿瘤微环境的细胞多样性和相互作用网络，揭示了驱动治疗耐药和肿瘤复发的未知细胞亚型和复杂通讯网络 | NA | 总结和讨论单细胞测序在胃肠道癌症肿瘤微环境研究中的最新发现，以重塑对肿瘤生物学的理解，并推动精准治疗的发展 | 胃肠道癌症（如胃癌、结直肠癌等）的肿瘤微环境，包括癌细胞、癌症干细胞、癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞及细胞外基质 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1050 | 2025-12-03 |
Single cell RNA-seq analysis associates Osm signaling in macrophages with osteogenic differentiation during heterotopic ossification
2025-Nov-28, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06435-2
PMID:41316383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析，揭示了巨噬细胞中Osm信号在异位骨化过程中与间充质祖细胞成骨分化的关联 | 发现巨噬细胞来源的Osm与异常软骨祖细胞分化相关，并识别Spi1作为早期巨噬细胞激活和Osm表达的新调控因子 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证，且单细胞测序技术可能受样本处理偏差影响 | 探究创伤诱导异位骨化中局部炎症微环境与间充质祖细胞成骨分化的关系 | 创伤诱导异位骨化小鼠模型中的间充质祖细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 异位骨化 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1051 | 2025-12-03 |
Exploring the impact of endocrine-disrupting chemicals on erectile dysfunction through network toxicology and machine learning
2025-Nov-28, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-025-01033-8
PMID:41316467
|
研究论文 | 本研究利用网络毒理学和机器学习方法，探索了内分泌干扰物对勃起功能障碍的影响机制 | 首次结合网络毒理学、单细胞测序和机器学习算法，系统性地识别了EDCs诱导ED的核心靶点CTNNB1和HIF1A，并通过分子对接验证了其结合亲和力 | 研究主要基于计算和体外模拟，缺乏临床或动物实验验证，且EDCs的具体暴露剂量和体内效应未充分探讨 | 阐明内分泌干扰物导致勃起功能障碍的分子机制和核心靶点 | 内分泌干扰物与勃起功能障碍相关的潜在靶点和信号通路 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 单细胞测序、网络毒理学、机器学习算法、分子对接 | 未指定具体模型，使用了三种机器学习算法 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1052 | 2025-12-03 |
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-Induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Nov-28, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101690
PMID:41320155
|
研究论文 | 本研究探讨雄激素如何通过调节2型先天淋巴细胞（ILC2s）影响幽门螺杆菌感染引起的胃部炎症，揭示其在性别差异中的作用 | 首次发现雄激素通过调控ILC2s活性来保护免受幽门螺杆菌诱导的胃部炎症，并阐明ILC2s作为性别差异的关键调节因子 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探究雄激素对幽门螺杆菌感染引起的胃部炎症反应的影响及其在性别差异中的作用 | 雄性和雌性小鼠，以及ILC2s和T细胞缺陷小鼠模型 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性和雌性小鼠，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1053 | 2025-12-03 |
A Metastasis-Competent CAF Subpopulation Defined by MFAP5⁷THY1⁷ Co-expression Drives Prostate Cancer Metastasis via EMT Activation
2025-Nov-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并功能验证了一个由MFAP5⁺THY1⁺共表达定义的、具有转移能力的癌症相关成纤维细胞亚群，该亚群通过激活AKT/EMT通路驱动前列腺癌转移 | 首次通过单细胞RNA测序整合分析，在前列腺癌中鉴定出一个由MFAP5和THY1共表达定义的、具有转移能力的CAF亚群，并揭示了其通过分泌MFAP5激活AKT/EMT通路促进转移的机制 | 需要多中心队列进一步验证其临床独立性 | 识别并功能表征前列腺癌中具有转移能力的CAF亚群，并评估其作为预测转移进展的生物标志物潜力 | 前列腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 14个前列腺癌标本中的1,214个CAFs, 78个前列腺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1054 | 2025-12-03 |
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-Nov-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf233
PMID:41288601
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系示踪技术，验证了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流和高胆固醇血症共同诱导内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫样细胞的假说 | 提出了“血流诱导的内皮细胞重编程”新概念，并首次通过遗传谱系示踪模型验证了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫样细胞的转变 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，虽然分析了人类斑块数据，但直接的人类体内验证有限 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞、人主动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 95只小鼠，共98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1055 | 2025-12-03 |
Single-Cell Dissection Reveals Immune Dysregulation After CD5 or CD7-Directed Chimeric Antigen Receptor T-Cell Therapy
2025-Nov-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509259
PMID:41290542
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，探讨了CD5或CD7导向的CAR-T细胞疗法在T细胞急性淋巴细胞白血病患者中引起的免疫失调 | 首次通过单细胞测序揭示了CD5和CD7 CAR-T疗法对多种免疫细胞类型的广泛影响，包括T细胞耗竭、B细胞功能受损、NK细胞功能增强及单核细胞激活变化，为理解感染风险提供了新机制 | 样本可能有限，且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究CD5或CD7导向的CAR-T疗法后的免疫失调机制及其与感染风险的关系 | 接受CD5或CD7 CAR-T治疗的T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | T细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1056 | 2025-12-03 |
Single-cell immune transcriptomics reveals an inflammatory-inhibitory set-point spectrum in autoimmune diabetes
2025-Nov-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199050
PMID:41325163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自身免疫性糖尿病中炎症-抑制设定点的谱系，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞水平上比较了LADA和T1D的免疫转录组，揭示了NF-κB/EGFR-JAK/STAT梯度和HLA-C-KIR轴作为疾病异质性的关键调控机制 | 研究样本仅来自外周血单核细胞，未直接分析胰腺组织；样本量相对有限；未进行长期随访以验证治疗靶点的有效性 | 探究自身免疫性糖尿病（包括T1D和LADA）中决定不同炎症状态的免疫学机制 | LADA患者、新诊断T1D患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序，配对T和B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，V(D)J序列数据 | 超过400,000个外周血单核细胞，来自LADA、T1D患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1057 | 2025-12-03 |
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for Single-cell ATAC Sequencing Data
2025-Nov-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf108
PMID:41284927
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scATAnno的Python软件包，用于自动注释单细胞ATAC测序数据的细胞类型 | 开发了首个专门用于大规模scATAC-seq参考图谱构建和自动细胞类型注释的工作流程，无需依赖scRNA-seq数据，并整合了KNN和加权距离不确定性评分以提高注释准确性 | 未明确说明软件在处理高度异质性或罕见细胞类型时的性能限制，以及计算资源需求 | 开发自动化工具以解决单细胞ATAC测序数据中细胞类型注释的挑战 | 单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌、基底细胞癌 | 单细胞ATAC测序 | KNN、加权距离算法 | 表观基因组数据 | 多个数据集（包括PBMC、TNBC、BCC等） | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1058 | 2025-12-03 |
Regional and cell specific bioactivity of injectable extracellular matrix biomaterials in myocardial infarction
2025-Nov-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65351-5
PMID:41285846
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，探究了可注射细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术，系统解析细胞外基质生物材料在心脏治疗中的细胞特异性作用机制 | 研究仅使用雌性大鼠模型，未涉及雄性或其他物种，可能限制结果的普适性 | 探究细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的生物活性机制 | 雌性大鼠心肌梗死模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1059 | 2025-12-03 |
IL-9 signaling redirects CAR T cell fate toward CD8+ memory and CD4+ cycling states, enhancing antitumor efficacy
2025-Nov-21, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.021
PMID:41274291
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研究论文 | 本研究通过改造CAR T细胞使其表达IL-9受体，以增强其在实体瘤中的抗肿瘤效果 | 首次将IL-9信号通路引入CAR T细胞，改变其分化命运，避免功能障碍，增强抗肿瘤活性 | 研究基于临床前模型，尚未进行人体试验验证 | 提高CAR T细胞在实体瘤治疗中的疗效 | CAR T细胞 | 免疫治疗 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析和RNA速度分析 | 单细胞RNA测序数据 | 临床前实体瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1060 | 2025-12-03 |
Lineage tracing technology for decoding cell evolution in pathophysiology: a bibliometric analysis
2025-Nov-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003916
PMID:41327787
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综述 | 本文通过文献计量学方法，全面回顾了谱系追踪技术的现状、热点和发展趋势 | 首次将定量图谱与技术演进分析相结合的文献计量学综述，通过数据驱动决策、算法处理、标准化分析工具和多维度指标交叉验证，克服了传统叙述性综述的局限性 | 分析基于Web of Science数据库的3252篇文献，可能未涵盖所有相关研究；文献计量学方法本身存在依赖检索策略和数据库覆盖范围的限制 | 解码细胞在病理生理学中的进化，并系统梳理谱系追踪技术的研究前沿与应用框架 | 谱系追踪技术相关的研究文献 | 生命科学/发育生物学 | NA | 文献计量学分析，谱系追踪技术 | NA | 文本（科学文献） | 3252篇相关文章（1979年1月1日至2024年9月22日） | NA | NA | NA | NA |