单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39013 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2026-04-23
Icariin Enhances the Enzymatic Activity of N-acetylgalactosaminidase to Augment Akkermansia Abundance in Gut Microbiota for Improved PD-1 Blockade Efficacy in Tumor Suppression
2026-Apr-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究发现了黄酮类化合物淫羊藿苷(icariin)作为一种新型益生元,能通过增强N-乙酰半乳糖胺糖苷酶Amuc_0920的活性,特异性富集肠道中的Akkermansia菌,从而改善抗PD-1免疫疗法的肿瘤抑制效果 首次发现淫羊藿苷能通过稳定N-乙酰半乳糖胺糖苷酶Amuc_0920与底物GalNAc结合位点的关键残基,增强其酶活性,从而促进Akkermansia菌的生长,并证明这种富集能增强肿瘤内CD8+ T细胞功能 研究主要在动物模型中进行,临床转化仍需验证;未详细探讨患者间变异性和长期安全性 寻找能特异性富集肠道Akkermansia菌的益生元,以改善癌症免疫疗法的疗效 肠道微生物Akkermansia菌、黄酮类化合物淫羊藿苷、肿瘤小鼠模型 微生物组学与免疫治疗 癌症 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 肿瘤和非肿瘤小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1042 2026-04-23
Spatial blueprint of colorectal cancer identifies Hypoxic CAF program that orchestrates Go-or-Grow decisions and predicts outcomes
2026-Apr-22, Investigational new drugs IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和空间转录组学,揭示了结直肠癌微环境中缺氧CAF亚型如何通过代谢重编程调控肿瘤细胞的增殖与侵袭,并识别了HMGA2作为关键转录调控因子 首次在结直肠癌中整合单细胞与空间转录组数据,识别了由缺氧CAF驱动的空间“增殖或侵袭”转换机制,并发现HMGA2作为该过程的核心调控因子 样本量相对有限(32名患者),且主要依赖计算推断,需进一步实验验证空间相互作用的分子机制 解析结直肠癌微环境的空间组织与功能影响,识别调控肿瘤进展的关键细胞亚群与机制 结直肠癌患者的肿瘤微环境细胞(包括肿瘤细胞、CAF、免疫细胞等) 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学,空间转录组学,SCENIC网络推断,细胞通讯分析,Seahorse代谢分析 计算生态位识别模型 单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据,体外实验数据 412,208个单细胞,76,627个空间点(来自32名患者的38个切片) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1043 2026-04-23
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-21, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析驱动设计仿生纳米药物,通过顺序递送免疫细胞模拟纳米颗粒来模拟心肌梗死后内源性免疫修复机制 提出了一种数据驱动的仿生策略,首次利用单细胞测序揭示巨噬细胞亚型在心肌梗死修复中的动态作用,并据此设计顺序递送的免疫细胞模拟纳米颗粒以复制自然免疫修复过程 NA 开发一种基于单细胞测序分析的纳米药物设计方法,以模拟内源性免疫修复机制来治疗心肌梗死 心肌梗死后的免疫细胞(特别是巨噬细胞亚型)以及仿生纳米颗粒 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1044 2026-04-23
scAClc: A Multi-Objective Adaptive Clustering Framework for Single-Cell Transcriptomics via Contrastive and Resolution-Aware Representation Learning
2026-Apr-21, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为scAClc的新型单细胞转录组学聚类框架,该框架通过多目标优化和自适应分辨率发现来解决现有聚类方法的挑战 提出了三个关键创新:1) 分层基因相关性模块整合全局基因变异性和局部邻域特异性信号;2) 锚点中心对比学习模块自适应选择代表性锚点指导嵌入学习;3) 基于鲁棒低维嵌入的自适应分辨率发现模块自动推断聚类数量 未明确说明框架在超大规模数据集上的计算效率,也未讨论对特定细胞类型或实验条件的泛化能力 开发一个能够自动推断聚类数量并提高单细胞RNA测序数据聚类准确性的框架 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 对比学习,自适应聚类框架 基因表达数据 15个真实scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1045 2026-04-23
Ultrasound-Controlled Nano-Oxygen Delivery Modulates Endothelial Cells to Enhance Tumor Perfusion
2026-Apr-21, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究展示了一种通过聚焦超声刺激氧纳米气泡(ONB_FUS)来缓解肿瘤缺氧、驱动血管正常化的新方法,从而增强肿瘤灌注和化疗疗效 利用聚焦超声刺激氧纳米气泡实现时空可控的血管重塑,首次通过单细胞RNA测序识别出肿瘤内皮细胞中毛细血管内皮细胞(CapECs)为关键响应群体,并发现促血管生成CapEC_Spp1亚群的选择性耗竭 临床转化可能面临纳米气泡递送效率、超声参数优化及长期安全性验证等挑战,且研究样本量有限,需进一步扩大验证 探索通过非药物手段诱导肿瘤血管正常化,以改善肿瘤灌注并增强化疗疗效 肿瘤内皮细胞(TECs),特别是毛细血管内皮细胞(CapECs)亚群 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、临床肿瘤样本数据 未明确指定样本数量,但涉及临床肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1046 2026-04-23
FAP-Targeted LTBR Agonist Drives HEV Differentiation and Immune Niche Formation for Improved Immunotherapy Response in Solid Tumours
2026-Apr-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向FAP的LTβR激动剂FAP-LTBR,旨在重塑肿瘤微环境,促进高内皮微静脉分化和免疫细胞浸润,以增强实体瘤的免疫治疗效果 首次开发了靶向肿瘤基质中成纤维细胞激活蛋白的淋巴毒素-β受体激动剂,能够选择性地重塑肿瘤微环境并促进三级淋巴样结构形成 研究主要基于临床前小鼠模型,尚未在人体中进行验证 改善实体瘤对免疫检查点抑制剂的治疗反应 实体瘤的肿瘤微环境、高内皮微静脉、三级淋巴样结构 肿瘤免疫学 实体瘤 空间转录组学、3D免疫表型分析、3D微流体血管模型 NA 转录组数据、图像数据 多种小鼠肿瘤模型、原代人内皮细胞 NA 空间转录组学 NA NA
1047 2026-04-23
Multi-Scale Genetic and Transcriptomic Analyses Identify Druggable Targets for Epilepsy
2026-Apr-21, Current medical science IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过整合多尺度遗传和转录组数据,识别了癫痫的致病基因和潜在药物靶点 结合GWAS、bulk eQTL和单细胞eQTL数据,利用SMR和贝叶斯共定位方法识别癫痫的因果基因,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示细胞类型特异性 研究主要基于遗传和转录组数据,功能验证和临床转化仍需进一步实验 探索癫痫的遗传基础和潜在治疗靶点 癫痫患者和脑组织样本 生物信息学 癫痫 GWAS, eQTL分析, RNA-seq, 单细胞RNA测序 SMR, 贝叶斯共定位, CellChat 遗传数据, 转录组数据 包括GWAS数据和独立RNA-seq队列的癫痫患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1048 2026-04-23
Long-acting IL-7 induces distinct transcriptomic features in peripheral T cells of patients with solid tumors
2026-Apr-21, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了长效重组人白细胞介素-7(rhIL-7-hyFc)对晚期实体瘤患者外周T细胞的转录组学和功能影响 首次在实体瘤患者中通过单细胞转录组学分析长效IL-7治疗对外周T细胞的分子机制,揭示了治疗诱导的T细胞扩增、激活状态及二次给药后反应减弱的独特转录特征 研究样本量较小,且仅针对晚期实体瘤患者,未涵盖其他癌症类型或健康对照,长期疗效和安全性需进一步验证 评估长效IL-7治疗对癌症患者外周T细胞的影响及其潜在免疫治疗应用 晚期实体瘤患者的外周血T细胞 单细胞转录组学 实体瘤 单细胞转录组学,流式细胞术 NA 单细胞RNA-seq数据,流式细胞数据 未明确样本数量,但涉及治疗前后外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1049 2026-04-23
Beyond the Transcriptome: Leveraging Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-seq) for Deeper Cellular Insights
2026-Apr-21, Annual review of biomedical data science IF:7.0Q1
综述 本文综述了CITE-seq技术的原理、应用、挑战及未来方向,该技术能同时测量单细胞的RNA和表面蛋白表达 详细阐述了CITE-seq这一能同时获取单细胞转录组和表面蛋白组数据的新兴技术,并讨论了其在空间整合和预测建模方面的未来发展方向 讨论了CITE-seq在技术和计算分析方面仍存在的持续挑战 旨在介绍和推广CITE-seq技术在生物医学研究中的应用,以弥补单细胞转录组学在揭示细胞功能蛋白状态方面的不足 单细胞 单细胞组学 肿瘤学、传染病 单细胞RNA测序、表面蛋白检测 NA RNA序列数据、蛋白质丰度数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1050 2026-04-23
Poor sleep impairs immune responses and influenza vaccine protection
2026-Apr-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了慢性睡眠碎片化如何损害流感疫苗的免疫反应和保护效果 首次通过单细胞RNA测序揭示了睡眠碎片化影响B细胞成熟和生发中心程序的转录特征,并结合临床数据分析验证了阻塞性睡眠呼吸暂停与流感感染风险的关联 研究主要基于小鼠模型,临床数据为观察性分析,因果关系需进一步验证 探究睡眠碎片化对流感疫苗免疫反应和保护效果的影响机制 小鼠模型和916,307名接种流感疫苗的成年人 免疫学 流感 单细胞RNA测序 NA 转录组数据、临床数据 小鼠模型和916,307名成年人 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1051 2026-04-23
YY1-mediated NDUFA9 upregulation promotes NSCLC cell growth through mitochondrial and Akt-mTOR pathway modulation
2026-Apr-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了YY1介导的NDUFA9上调通过调节线粒体功能和Akt-mTOR通路促进非小细胞肺癌细胞生长的机制 首次系统阐明了NDUFA9在NSCLC中的表达模式、功能作用及其转录调控机制,特别是发现了YY1作为其关键转录因子 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨NDUFA9在不同NSCLC亚型中的特异性作用 探究NDUFA9在非小细胞肺癌发生发展中的表达、功能及调控机制 非小细胞肺癌细胞系、患者组织样本及小鼠移植瘤模型 癌症生物学 肺癌 单细胞RNA测序、生物信息学分析、shRNA敲低、基因敲除、过表达、线粒体功能检测、免疫印迹、染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 TCGA数据库数据、单细胞RNA测序数据、本地患者组织及多种NSCLC细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1052 2026-04-23
Chromosome-level genome assembly of the sponge Halisarca dujardinii
2026-Apr-21, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文首次报道了海绵Halisarca dujardinii的染色体级别基因组组装,为研究其再生机制和海绵进化提供了重要资源 首次生成Halisarca dujardinii的染色体级别基因组组装,结合了长读长、短读长和Hi-C数据,并提供了线粒体基因组和全面的基因注释 NA 研究海绵Halisarca dujardinii的基因组结构,以探索其再生能力和进化背景 海绵Halisarca dujardinii 基因组学 NA Oxford Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, Hi-C, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据, RNA测序数据 NA Oxford Nanopore, Illumina 长读长测序, 短读长测序, Hi-C, 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq Oxford Nanopore平台, Illumina平台 NA
1053 2026-04-23
Identifying omic biomarkers for chronic inflammatory diseases associated with periodontitis using percolation on multi-disease gene co-expression networks
2026-Apr-21, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究开发了一种名为PMGCN的计算框架,用于识别与牙周炎相关的慢性炎症疾病的组学生物标志物 利用多疾病基因共表达网络上的最优渗流方法,首次将牙周炎与多种慢性炎症疾病的关联应用于生物标志物计算 方法主要基于批量转录组数据,可能未充分捕捉单细胞水平的异质性,且验证依赖于公开数据集 开发计算框架以识别慢性炎症疾病的组学生物标志物,并探索其与牙周炎的关联 溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和帕金森病等慢性炎症疾病 生物信息学 慢性炎症疾病 批量转录组基因表达谱分析,单细胞RNA-seq 多疾病基因共表达网络渗流模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1054 2026-04-23
A velocity-informed framework for resolving functional stratification in rare human stem cells
2026-Apr-21, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本文介绍了一种基于速度信息的框架,用于解析人类罕见干细胞中的功能分层,以人脐带血中的非常小胚胎样干细胞(VSELs)为概念验证模型 通过整合单细胞RNA测序与动态RNA速度分析,识别出两个动力学不同的VSEL亚群,并揭示了状态特异性应激反应、代谢调控和发育基因网络程序 研究依赖于间接的动力学建模,缺乏直接的功能验证,且主要针对特定罕见干细胞类型,通用性需进一步验证 开发一种框架来解析罕见和静息干细胞群体的转录分层和功能异质性 人脐带血中的非常小胚胎样干细胞(VSELs) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,RNA速度分析 动力学模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1055 2026-04-23
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了一个名为SpaNiche的计算框架,用于空间转录组学数据中的空间生态位分析,以揭示共定位模式并推断潜在的配体-受体相互作用 SpaNiche利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,同时识别细胞类型间的空间共定位模式并提供相关配体-受体相互作用的见解 NA 探索空间转录组学数据中的共定位模式和细胞相互作用 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病大脑皮层的微环境生态型 空间转录组学 结直肠癌、前列腺癌、阿尔茨海默病 空间转录组学 图正则化联合非负矩阵分解、共识聚类 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1056 2026-04-23
Exploring the CeRNA landscape in plants: advances, methods, and challenges
2026-Apr-20, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
综述 本文综述了植物中竞争性内源RNA(ceRNA)的研究进展、方法及挑战,揭示了植物与动物ceRNA的关键差异 总结了植物ceRNA在序列特征、互作模式和功能上与动物的差异,并提出了结合单细胞测序和空间转录组学等前沿技术的研究方法 现有生物信息学工具预测准确性有限,且在复杂植物组织中进行功能验证存在困难 探索植物ceRNA在基因调控中的作用,特别是在胁迫响应和作物改良中的应用 植物中的竞争性内源RNA(ceRNA) 自然语言处理 NA 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学工具 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1057 2026-04-23
High-quality acinar cell isolation enables single-cell analysis of healthy and injured pancreas
2026-Apr-20, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文开发了一种从健康和损伤胰腺组织中快速消化获取高质量单细胞的方法,用于单细胞RNA测序分析 开发了一种改进的胰腺消化协议,显著提高了腺泡细胞的分离质量和比例,克服了现有方法中腺泡细胞代表性不足的问题 方法主要在小鼠模型中验证,在人类胰腺组织中的应用效果尚需进一步研究 改进胰腺单细胞分离方法,实现对腺泡细胞群体的全面表征 小鼠胰腺组织(包括健康和急性胰腺炎模型) 单细胞组学 胰腺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1058 2026-04-23
Molecular signatures of cell diversity modulated by long noncoding RNAs in the human fetal spinal cord
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,探索了人类胎儿脊髓中神经干细胞谱系、运动神经元和胶质细胞的分子特征及长链非编码RNA的表达模式 结合scRNA-seq和scStereo RNA-seq技术,首次在人类胎儿脊髓中系统解析了长链非编码RNA与邻近编码基因的空间共表达网络及其在细胞多样性调控中的作用 研究仅覆盖妊娠8至12周的胎儿样本,未涉及更早或更晚发育阶段,且样本量有限 揭示人类胎儿脊髓中细胞多样性的分子调控机制,特别是长链非编码RNA在神经发育中的功能 人类胎儿脊髓组织中的神经干细胞、运动神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间表达数据 妊娠8至12周的人类胎儿脊髓样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞Stereo RNA-seq NA NA
1059 2026-04-23
Transcriptional noise sets fundamental limits to decoding circadian clock phase from single-cell RNA snapshots
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了从单细胞RNA快照解码生物钟相位的根本限制,发现转录噪声限制了单细胞水平的相位估计精度 结合多重smFISH技术和基于高斯过程的算法,首次量化了核心生物钟基因的转录噪声对单细胞相位估计的影响,并提出了通过平均多个细胞数据来克服噪声的方法 研究主要基于小鼠成纤维细胞,结论在其他细胞类型或生物体中的普适性有待验证;单细胞RNA-seq数据中非核心基因的噪声问题尚未完全解决 评估从单细胞RNA测量中准确推断生物钟相位的可行性,并探索克服转录噪声的策略 小鼠成纤维细胞中的核心生物钟基因(如Per1, Per2, Cry1, Cry2, Bmal1, Rev-erbα) 单细胞转录组学 NA 多重smFISH(单分子荧光原位杂交),单细胞RNA-seq 基于高斯过程的算法 图像(smFISH),RNA序列数据 涉及超过70个小鼠成纤维细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1060 2026-04-23
Targeting keratin 6 A overcomes gemcitabine resistance by restoring equilibrative nucleoside transporter 1 and TAM-mediated metabolic compensation in pancreatic cancer
2026-Apr-17, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了角蛋白6A(KRT6A)通过抑制ENT1介导的药物摄取和通过MIF-CD74/CD44轴及TAM-M2极化促进胞苷富集微环境,从而驱动胰腺癌对吉西他滨耐药的新机制,并开发了一种靶向递送siKRT6A的纳米载体以恢复化疗敏感性 首次将KRT6A鉴定为胰腺癌吉西他滨耐药的关键驱动因子,阐明了其通过调控ENT1和MIF-CD74/CD44轴及TAM-M2极化重塑肿瘤微环境的分子机制,并创新性地设计了cRGD修饰的脂质纳米载体(c-Lip@siKRT6A)实现靶向治疗 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床前数据需进一步在人体临床试验中验证;纳米载体的长期安全性和体内分布特性需更深入评估 识别吉西他滨耐药的关键驱动因子并开发靶向策略以恢复胰腺癌的化疗敏感性 胰腺癌细胞系、临床患者组织样本(包括组织微阵列)、异种移植小鼠模型 数字病理学 胰腺癌 RT-qPCR、空间转录组学、单细胞转录组学、多组学分析、代谢分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据、临床生存数据 吉西他滨治疗队列(n=90)、公共数据集中的胰腺癌队列、组织微阵列 NA 空间转录组学, 单细胞转录组学 NA NA
回到顶部