单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39398 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2026-05-03
Non-neuronal sites of latency for alphaherpesviruses
2026-04-21, Journal of virology IF:4.0Q2
综述 探讨alphaherpesvirus在非神经元细胞中潜伏存在的证据和机制 提出alphaherpesvirus在非神经元细胞如扁桃体和淋巴组织中的潜伏存在,突破传统只关注神经元的观念 区分真正的潜伏感染与人类alphaherpesvirus中的流产性或持续性感染仍具挑战性 理解非神经元储存在疱疹病毒发病机制中的作用 alphaherpesvirus亚家族成员,包括HSV-1和BoHV-1 机器学习 心血管疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
1042 2026-05-03
Single-cell spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in primary and lymph node-metastatic small cell lung cancer
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 利用单细胞空间转录组学揭示小细胞肺癌原发灶和淋巴结转移灶中肿瘤微环境的异质性 首次利用CosMx Spatial Molecular Imager对105例原发和淋巴结转移标本进行单细胞空间转录组分析,构建了超过60万个细胞的高分辨率空间图谱,并发现三种富集于淋巴结转移的恶性亚克隆及其与免疫排斥特征的空间相关性 未明确提及局限性,但可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验或未探讨其他转移部位 阐明小细胞肺癌淋巴结转移中肿瘤微环境的空间细胞生态系统及机制 75例小细胞肺癌患者的105个原发肿瘤和淋巴结转移标本 数字病理学, 机器学习 小细胞肺癌 空间转录组学, CosMx Spatial Molecular Imager NA 空间转录组数据 105个标本,来自75例小细胞肺癌患者,超过60万个细胞 NanoString Technologies 空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager CosMx Spatial Molecular Imager单细胞空间转录组学平台
1043 2026-05-03
mRNA lipid-nanoparticle-mediated mitochondrial apoptosis augments adoptive T cell immunotherapy
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 开发基于mRNA脂质纳米颗粒的策略,通过线粒体凋亡增强过继性T细胞免疫治疗效果 首次利用编码BH3结构域的mRNA脂质纳米颗粒触发肿瘤细胞线粒体凋亡,重塑免疫抑制微环境,协同增强ACT疗效 未提及具体局限性 探索mRNA介导的线粒体凋亡启动策略以提升过继性T细胞疗法对实体瘤的疗效 肿瘤细胞及过继性T细胞 机器学习 癌症(实体瘤) 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1044 2026-05-03
Robust transcriptomic hallmarks targeting intratumor heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 整合多组学数据系统刻画肝内胆管癌基因表达异质性,构建抗瘤内异质性的分子分型系统并揭示治疗策略 首次识别低瘤内异质性/高瘤间变异基因集并建立对瘤内异质性不敏感的五亚型分类系统,发现GPRC5A和VTCN1作为免疫组化标志物及HSP90抑制剂联合免疫治疗的新方案 未明确说明样本量及队列独立性验证的局限性,需进一步多中心验证亚型可重复性 开发抗瘤内异质性的肝内胆管癌分子分型系统,指导精准治疗 肝内胆管癌肿瘤组织及多区域、单区域、单细胞RNA测序数据 数字病理学 肝内胆管癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组化 聚类分析 多组学数据(转录组、免疫组化、血清标志物) 多区域、单区域及单细胞RNA测序队列样本 Illumina 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq Illumina NovaSeq NA
1045 2026-05-03
Patient-derived kidney organoids recapitulate ADPKD and facilitate the identification of Rho pathway inhibitors as candidate therapeutics
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 利用患者来源的肾类器官模拟常染色体显性多囊肾病,并发现Rho通路抑制剂作为候选治疗药物 建立了直接来源于ADPKD患者手术标本的可扩增、多谱系成人肾类器官(MAROs),忠实再现了囊性特征,并通过高通量药物筛选鉴定了Rho GTP酶抑制剂(如ML141)作为跨基因型的有效囊泡缩小剂 未提及 建立患者来源的肾类器官平台,模拟ADPKD病理,并识别Rho通路调控作为治疗策略 ADPKD患者和健康供体的手术标本来源的成人肾类器官 数字病理学 多囊肾病 单细胞转录组测序 类器官模型 单细胞转录组数据 ADPKD患者和健康供体的手术标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1046 2026-05-03
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small-cell lung cancer
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过空间多组学技术揭示复合型小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境生态位 首次结合空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序,系统解析复合型小细胞肺癌的肿瘤异质性、谱系可塑性和肿瘤微环境特征,并开发出基于突变检测的cSCLC检测方法 研究样本量有限(19例),且均为未接受治疗的原发性肿瘤,可能无法全面反映疾病的完整演化过程 探究复合型小细胞肺癌的生物学机制、谱系可塑性和肿瘤微环境特征 19例未接受治疗的复合型小细胞肺癌肿瘤样本 数字病理学 肺癌 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序、突变检测分析 NA 转录组数据、全外显子测序数据、空间转录组数据 19例复合型小细胞肺癌肿瘤样本 Illumina, 10x Genomics 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium 使用Illumina NovaSeq进行全外显子测序,10x Visium进行空间转录组分析,10x Chromium进行单核RNA测序
1047 2026-05-03
Gut-microbiota-derived 3-indoleacrylic acid alleviates neonatal necrotizing enterocolitis by inhibiting epithelial necroptosis
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究发现肠道微生物群衍生的3-吲哚丙烯酸可通过抑制上皮细胞坏死性凋亡缓解新生儿坏死性小肠结肠炎 首次揭示3-吲哚丙烯酸作为微生物群衍生的代谢物通过AhR-SOCS5轴抑制STAT1驱动的坏死性凋亡,提供了针对NEC的安全代谢物疗法策略 研究中尚未明确IA在人体中的给药安全性及长期疗效,且代谢物治疗在临床转化中的可行性需进一步验证 探究肠道微生物群衍生的代谢物在新生儿坏死性小肠结肠炎中的作用及潜在治疗机制 新生儿坏死性小肠结肠炎患者和动物模型(小鼠) 机器学习 消化系统疾病 代谢组学分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 尚未在摘要中明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1048 2026-05-03
Single-cell analysis highlights the significance of malignant cell IFN/MHC-II for immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序分析16例头颈鳞状细胞癌患者在帕博利珠单抗治疗前后的恶性细胞,发现IFN/MHC-II表达程序与免疫治疗反应相关 首次在HNSCC中揭示恶性细胞IFN/MHC-II程序作为免疫治疗反应的潜在生物标志物,并阐明恶性细胞在免疫治疗中的重要作用 未明确提及局限性,但样本量较小(16例),且主要基于单细胞测序和动物模型验证 旨在通过单细胞分析识别HNSCC中与免疫治疗反应相关的恶性细胞特征 头颈鳞状细胞癌患者的恶性细胞及肿瘤微环境 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 动物模型, 批量RNA测序反卷积 NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 免疫荧光图像 16例HNSCC患者(治疗前后配对样本),以及独立队列的批量RNA-seq数据 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台
1049 2026-05-03
Peri-Implantitis and Periodontitis: Biological Convergence, Contextual Divergence
2026-Apr-20, Journal of periodontal research IF:3.4Q1
综述 综述比较了牙周炎和种植体周围炎在临床、微生物、组织学和分子层面的异同,探讨两者是否为同一炎症谱系的不同表现 从生物趋同性和背景差异性的角度,系统评估两种疾病是否本质相同,挑战传统分类观点 现有研究多为异质性高、统计效能低的小样本研究,缺乏充分的头对头比较,尤其是组学和组织研究有限,结论受限于间接证据 评估牙周炎与种植体周围炎是否为真正不同的疾病、同一炎症谱系的背景依赖性变异,或研究设计与命名造成的人为差异 牙周炎和种植体周围炎患者的临床、微生物、组织学和分子数据 数字病理学 牙周炎,种植体周围炎 NA NA 临床数据,微生物数据,组织学数据,分子数据,转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1050 2026-05-03
Single-Cell Sequencing Plus Spatial Transcriptomics: Dissecting Tumor Heterogeneity, Immunosuppression, and Potential Targets for ASPSCR1::TFE3 Renal Cell Carcinoma
2026-Apr-18, The American journal of pathology
研究论文 利用单细胞测序和空间转录组学解析ASPSCR1::TFE3肾细胞癌的肿瘤异质性、免疫抑制及潜在治疗靶点 首次结合单细胞测序和高分辨率空间转录组技术系统比较ASPSCR1::TFE3 RCC与透明细胞肾细胞癌在肿瘤和免疫微环境上的差异,并鉴定出C3亚型及MDK-LRP1通路在免疫逃逸中的作用 未提及具体限制(可能样本量有限或缺乏功能验证等) 揭示ASPSCR1::TFE3肾细胞癌的发病机制和免疫微环境,探索临床靶向治疗和免疫治疗的新靶点 ASPSCR1::TFE3肾细胞癌和透明细胞肾细胞癌的福尔马林固定石蜡包埋样本 数字病理学 肾细胞癌 单细胞测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1051 2026-05-03
Dedifferentiation-driven oncogenic stemness promotes tumor-sustaining adaptability in the intestinal epithelium
2026-Apr-17, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示去分化驱动的致癌干性在肠道上皮肿瘤维持和适应性中的作用 首次证明去分化衍生的致癌干细胞比内源性突变干细胞更有效地维持肿瘤发生,并发现Notch信号异常和代谢可塑性协同促进自上而下的肠道肿瘤发生 研究主要基于小鼠模型,结论向人类肿瘤的推广需要进一步验证 阐明去分化驱动的致癌干性如何促进肠道肿瘤适应和维持 肠道上皮细胞,特别是Lgr5+干细胞和去分化的绒毛上皮细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞转录组) 小鼠模型(Smad4功能缺失和β-catenin功能获得) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1052 2026-05-03
Single-cell epigenetic and transcriptomic states across the continuum of monoclonal B cell lymphocytosis to chronic lymphocytic leukemia
2026-Apr-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 使用多组学单细胞测序技术,整合染色质可及性、转录、蛋白质组和线粒体DNA特征,描绘了从单克隆B细胞淋巴细胞增多症到慢性淋巴细胞白血病的克隆关系和演化轨迹 首次通过多组学单细胞分析揭示了HC-MBL向CLL转变过程中亚克隆、表观遗传和转录组的稳定性,并提出LC-MBL是早期CLL发病的关键转折点 未提及具体限制 阐明B细胞早期扩增和分子进化时机及性质 正常B细胞、低计数/高计数单克隆B细胞淋巴细胞增多症和慢性淋巴细胞白血病细胞 机器学习和数字病理学 慢性淋巴细胞白血病 多组学单细胞测序 NA 单细胞数据 未提及具体样本数量 NA 单细胞多组学 NA 整合染色质可及性、转录、蛋白质组和线粒体DNA分析
1053 2026-05-03
Pathogenic and Clinical Implications of the 2-Way Interplay Between Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential and Multiple Myeloma
2026-Apr-08, Clinical lymphoma, myeloma & leukemia
review 综述了不确定潜能的克隆造血与多发性骨髓瘤之间双向相互作用的致病和临床意义 强调了CHIP通过改变肿瘤微环境放大炎症,影响多发性骨髓瘤进展和治疗反应的双向相互作用机制 未提供具体局限性信息 总结CHIP在多发性骨髓瘤中转化和临床影响的现有证据 不确定潜能的克隆造血(CHIP)和多发性骨髓瘤(MM) NA 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1054 2026-05-03
Dissecting antibody-mediated natural killer cell effects reveals a cytotoxic CX3CR1+KLRC2-CD16hi subset linked to hepatitis B virus outcomes
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 研究抗体介导的自然杀伤细胞效应,发现一个与乙型肝炎病毒结局相关的细胞毒性CX3CR1+KLRC2-CD16hi亚群 首次揭示CX3CR1+KLRC2-CD16hi NK细胞亚群在慢性HBV感染中的功能恢复潜力,并指出其作为治疗靶点的可能性 未明确提及研究局限性 评估慢性HBV感染及抗病毒治疗过程中抗体介导的NK细胞反应的动态变化及不同NK亚群的作用 慢性HBV感染患者队列中的自然杀伤细胞及其亚群 机器学习 乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA 表达数据 横断面和纵向队列中的慢性HBV感染患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序系统
1055 2026-05-03
Meningioma cell reprogramming and microenvironment interactions underlie brain invasion
2026-Apr-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示脑膜瘤脑侵袭过程中肿瘤细胞重编程与微环境相互作用的分子机制 首次综合运用多种RNA测序技术(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组)从多维度解析脑膜瘤脑侵袭的分子特征,并发现TGM2、S100A11、ZYX和PDGFRA在脑-肿瘤界面的富集 未提及具体限制,但研究主要依赖生物信息学分析与体外共培养实验,缺乏体内验证 阐明脑膜瘤脑侵袭的分子和细胞机制 199例脑膜瘤样本(含33例脑侵袭肿瘤)、患者匹配的空间映射脑膜瘤单细胞样本、脑侵袭脑膜瘤空间转录组样本 数字病理学 脑膜瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组测序, 多重免疫荧光, 共聚焦显微镜, 多电极阵列记录, 活细胞钙成像 NA RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 199例脑膜瘤样本(其中33例为脑侵袭肿瘤) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1056 2026-05-03
Pre-operative risk assessment of hepatocellular carcinoma recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 通过液体活检无创检测术前遗传变异,建立肝细胞癌肝移植术后复发风险分层模型 首次整合血浆cfDNA拷贝数变异与单细胞转录组数据,追溯复发相关cfDNA来源至原发肿瘤内特定的恶性细胞亚群,并基于此开发了ZJU标准作为术前风险预测工具 研究为回顾性设计,样本量相对有限,且需在前瞻性队列中进一步验证 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型,预测肝细胞癌肝移植术后复发 260例来自三个中心的肝细胞癌患者 数字病理学 肝细胞癌 低覆盖全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 NA 基因测序数据、转录组数据 260例肝细胞癌患者 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、全基因组测序 NA NA
1057 2026-05-03
Association between craniosynostosis and phospholipid metabolism: Insights from single-cell and transcriptomic analysis
2026-Mar-27, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过多组学方法研究颅缝早闭与磷脂代谢之间的关联,并探索他汀类药物的潜在治疗效果 首次从磷脂代谢角度探索颅缝早闭的发病机制,结合孟德尔随机化、转录组分析、单细胞RNA测序及药物靶点分析等多种方法 他汀类药物相关遗传证据为探索性发现,统计学显著性受限于样本量,需在更大队列和实验模型中进一步验证 揭示颅缝早闭与磷脂代谢的关联,并评估他汀类药物的潜在治疗作用 颅缝早闭患者和小鼠颅缝组织 数字病理学 小儿颅面畸形 孟德尔随机化、转录组测序、单细胞RNA测序、药物靶点分析、分子对接 NA 基因表达数据、脂质性状数据 临床样本(具体数量未提及)及小鼠颅缝组织 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
1058 2026-05-03
Pharmacologic targeting of the dopamine D2 receptor impacts the efficacy of immune checkpoint blockade in melanoma
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过调节多巴胺D2受体影响免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤的效果 首次发现通过FDA批准的药物靶向多巴胺D2受体可增强免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤的效果,并揭示了不依赖催乳素的直接免疫调节机制 研究仅在动物模型中进行,未在人类患者中验证效果 探讨调节多巴胺D2受体对免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤疗效的影响及其潜在机制 小鼠黑色素瘤模型(B16F0和MEL11443细胞系)及PRL-locus响应和未响应的小鼠 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫组化 NA 基因表达数据、测序数据 多种小鼠模型,包括C57BL/6小鼠、Collaborative Cross小鼠和F1杂交小鼠,具体数量未在摘要中说明 Illumina 单细胞RNA测序、批量RNA测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序和批量RNA测序平台
1059 2026-05-03
SPTEdU-seq enables parallel optics-free newborn cell tracking and spatial total transcriptional dynamics in intact microenvironments
2026-Mar-26, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 开发了SPTEdU-seq技术,整合空间全转录组与EdU标记,实现新生细胞追踪与空间总转录动态分析 首次实现无需光学成像的新生细胞追踪与空间全转录组联合分析,能同时检测编码和非编码RNA及剪接异构体 NA 建立同时捕获基因表达和增殖动态的空间转录组学方法 小鼠发育和成体大脑、小鼠缺血性中风模型、小鼠和人类肾肿瘤组织 数字病理学 缺血性中风、肾肿瘤 空间转录组学、EdU标记 NA 空间转录组数据 小鼠和人类组织样本(具体数量未说明) NA 空间转录组学 SPTEdU-seq 整合总转录本捕获与EdU标记的空间转录组学平台
1060 2026-05-03
Targeting SPP1 +TAMs associated with liver metastasis reverses immunosuppression and synergizes with immunotherapy in colorectal cancer
2026-Mar-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌中SPP1+肿瘤相关巨噬细胞与肝转移相关的免疫抑制机制,并验证联合治疗策略 首次系统性描绘SPP1+ TAMs在结直肠癌原发灶与转移灶中的空间、发育及代谢异质性,发现其两种代谢亚型(糖酵解型ATP5F1E+和氧化磷酸化型MT-CO1+)及组织特异性分布 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证依赖小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 探究结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞在原发灶与转移灶微环境中的空间和代谢异质性及其免疫抑制机制 结直肠癌患者原发肿瘤、癌旁正常组织、肝转移灶、淋巴结转移灶及外周血样本 机器学习, 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 UMAP聚类, 伪时间推断, RNA速率, CellChat 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 来自多中心队列共998204个细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组分析
回到顶部