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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-07-01 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 首次通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序技术，系统阐明CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中介导内皮细胞与中间单核细胞相互作用的遗传机制 | 基于公开数据库的分析可能存在人群偏倚，且孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探索炎症相关细胞因子和免疫特征与主动脉瘤的因果关系，并解析CX3CL1-CX3CR1信号通路的致病机制 | 主动脉瘤患者的血液免疫特征、主动脉组织转录组数据及单细胞测序数据 | 机器学习、数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、Cellchat分析 | na | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 91种循环炎症蛋白和731种免疫特征的GWAS数据，以及批量RNA测序和单细胞RNA测序的公共数据集 | na | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | na | na |
| 1042 | 2026-07-01 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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research paper | 通过单细胞转录组学揭示胰管细胞在糖尿病炎症中可能作为介质的作用 | 首次发现胰管细胞亚群在所有胰腺细胞类型中呈现独特的促炎特征，为理解胰岛炎症传播机制提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探索暴露于炎症环境的人类胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1043 | 2026-07-01 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
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研究论文 | 通过网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术揭示金花清感颗粒在新冠肺炎中减轻细胞炎症的机制 | 本研究结合UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS、网络药理学和单细胞RNA测序技术，系统分析了金花清感颗粒的活性成分及其在免疫细胞调控中的作用，揭示其通过调节中性粒细胞、单核细胞等免疫细胞活性来减轻新冠肺炎炎症的机制 | NA | 探究金花清感颗粒在治疗新冠肺炎中的疗效和作用机制 | 金花清感颗粒的活性成分及其对新冠肺炎患者外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 网络药理学 | 新冠肺炎 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1044 | 2026-07-01 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析，揭示了难治性血清阴性重症肌无力患者中以B细胞为中心的免疫失调及可溶性CD22水平降低的免疫病理机制 | 首次利用单细胞RNA测序联合血浆蛋白质组学分析，阐明难治性血清阴性MG中B细胞免疫失调与可溶性CD22水平降低的关联，为B细胞靶向治疗提供新方向 | 样本量较小（仅30名女性参与者），且仅限于外周血分析，未涉及组织或中枢免疫器官的免疫状态验证 | 阐明血清阴性重症肌无力的免疫病理机制，探索免疫失调状态与疾病严重程度的关系 | 30名女性患者（10名健康对照、10名早发型AChR阳性MG、10名难治性早发型血清阴性MG）的外周血样本 | machine learning | geriatric disease | single-cell RNA-seq, plasma proteome analysis | NA | gene expression data, proteomic data | 30例女性患者外周血样本（每组10例，治疗前后对比） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1045 | 2026-07-01 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
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研究论文 | 介绍用于研究早期卵子发生的单细胞RNA测序数据分析流程 | 针对生殖细胞发育过程中异步分化和高度细胞异质性的挑战，利用单细胞RNA测序技术以单细胞分辨率揭示转录调控机制 | 未明确说明局限性 | 描述如何使用单细胞RNA测序分析早期雌性生殖细胞发育 | 小鼠E11.5至E14.5卵巢中的早期生殖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠E11.5至E14.5卵巢的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1046 | 2026-07-01 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
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研究论文 | 整合基因组学与人工智能，揭示狼疮性肾炎mRNA疫苗开发的分子靶点 | 将单细胞基因组学与无矩阵分解和机器学习算法相结合，系统识别狼疮性肾炎中潜在的mRNA疫苗靶点 | 信息来源有限，无法确定具体局限性 | 通过单细胞和批量转录组数据，利用机器学习识别LN中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照的单个核细胞，以及额外患者和对照的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 非负矩阵分解，机器学习算法 | 基因表达数据 | 24例LN患者和10例健康对照的单个核细胞，以及额外LN患者和对照的批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1047 | 2026-07-01 |
Multi-modal transcriptomic analysis unravels enrichment of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.558960
PMID:37873432
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研究论文 | 通过多模态转录组数据分析，揭示基底型乳腺癌中混合上皮/间质状态富集及表型异质性增强 | 整合批量、单细胞和空间转录组数据，结合数学模型解析上皮-间质转化与腔-基底可塑性之间的表观遗传串扰 | 依赖细胞系及原发肿瘤样本，未进行体内功能验证，且数学模型的预测需要实验进一步验证 | 探究乳腺癌中上皮-间质转化与腔-基底可塑性如何驱动肿瘤内表型异质性 | 乳腺癌细胞系及原发肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因调控网络数学模型 | 转录组数据 | 乳腺癌细胞系及原发肿瘤样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1048 | 2026-07-01 |
ScopeViewer: A Browser-Based Solution for Visualizing Spatial Transcriptomics Data
2023-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.549256
PMID:37546786
|
研究论文 | ScopeViewer是一种基于浏览器的空间转录组学数据可视化软件，旨在解决大数据处理、共享和可视化挑战 | 首次提供浏览器端的空间转录组数据交互可视化方案，实现原始图像与注释的双重查看，通过优化带宽和避免数据传输增强安全性 | 文章未提及局限性 | 开发用于空间转录组数据可视化的浏览器端软件工具 | 空间转录组数据的可视化方法 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1049 | 2026-07-01 |
CXCR6 is required for antitumor efficacy of intratumoral CD8+ T cell
2021-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003100
PMID:34462326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，发现CXCR6特异性表达于瘤内CD8+ T细胞，并证实其对抗肿瘤免疫效应和PD-1阻断治疗响应至关重要 | 首次明确CXCR6在瘤内CD8+ T细胞中的独特表达及其对抗肿瘤免疫的必要性，揭示其表达主要由肿瘤组织诱导而非配体趋化，为联合免疫治疗设计提供新靶点 | 未阐明CXCR6在人体肿瘤中的具体调控机制及长期治疗效果，且Cxcr6-/-小鼠模型与人体免疫系统的差异可能限制临床转化 | 探究瘤内CD8+ T细胞中CXCR6的表达特征及其在抗肿瘤免疫和免疫检查点治疗中的作用 | 瘤内CD8+ T细胞及CXCR6分子 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Cxcr6-/-小鼠、转基因OT-I小鼠及骨髓嵌合体模型，具体样本数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1050 | 2026-06-30 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Jul, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
|
研究论文 | 本文探讨了脂肪连蛋白-PEPITEM通路在早期未经治疗的类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态，以及PEPITEM给药在临床前模型中的治疗疗效 | 首次揭示了PEPITEM在免疫介导的炎性关节炎中通过调节滑膜微环境限制疾病进展的机制，并证明了PEPITEM治疗可显著降低关节炎严重程度和促炎介质表达 | 主要基于动物模型和早期患者样本，未涉及大规模临床试验验证；PEPITEM在更多免疫介导炎性疾病中的适用性尚需进一步探索 | 研究脂肪连蛋白-PEPITEM通路在免疫介导的炎性关节炎中的作用及PEPITEM的治疗潜力 | 早期类风湿关节炎和银屑病关节炎患者外周血单个核细胞，以及三种不同炎性关节炎动物模型（小鼠）的滑膜组织 | 机器学习 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 早期类风湿关节炎和银屑病关节炎患者外周血样本，以及三种小鼠炎性关节炎模型（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台（用于小鼠滑膜组织的单细胞分析） |
| 1051 | 2026-06-30 |
Distinct transcription factors control tissue adaptation and effector function in infant and adult memory T cells
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02535-1
PMID:42230957
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9技术揭示婴儿与成人记忆T细胞功能差异的分子机制 | 首次发现HELIOS和KLF6转录因子分别调控婴儿和成人记忆T细胞状态，并确定HELIOS为婴儿特异性转录程序的关键调节因子 | 未明确说明 | 探究人类记忆T细胞功能调控的年龄依赖性机制 | 婴儿（2-9个月）和成人（40-63岁）器官捐赠者的淋巴组织和粘膜组织中的T细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、ATAC测序、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 婴儿和成人器官捐赠者（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1052 | 2026-06-30 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描，研究人类手指关节在胎儿发育过程中的细胞组成、空间组织和结构，揭示近端指间关节易患炎症性关节炎而远端指间关节不受影响的细胞基础 | 首次在胚胎发育层面揭示了近端指间关节和远端指间关节在滑膜体积和成纤维细胞富集方面的差异，并发现PI16 '通用'成纤维细胞在炎症易感性中的关键作用 | NA | 探究炎症为何倾向于发生在特定部位（如手指近端指间关节）的细胞机制 | 人类胎儿手指关节 | NA | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1053 | 2026-06-30 |
Functional and dysfunctional T regulatory cell states in human tissues in RA and other autoimmune arthritic diseases
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02540-4
PMID:42304100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者滑膜组织中的调节性T细胞，发现两种主要状态：功能性CD25+CXCR6+ T细胞和功能障碍性CD25+AREG+ T细胞 | 首次在滑膜组织中鉴定出两种不同的调节性T细胞状态，并阐明皮质醇和膜结合TNF分别驱动功能障碍和功能维持的分子机制，提示逆转T细胞功能障碍的治疗策略 | 未提及具体样本数量及多中心验证，也未探讨其他组织类型中的T细胞状态差异 | 探究类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者组织中调节性T细胞的功能和功能障碍状态及其调控机制 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的调节性T细胞 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎, 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1054 | 2026-06-30 |
An inflammasome-driven differentiation program in intestinal stem cells protects against Salmonella infection
2026-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02514-6
PMID:42120792
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研究论文 | 本研究揭示了肠道干细胞通过炎症小体介导的分化程序响应沙门氏菌感染并增强上皮防御能力的免疫机制 | 首次发现Lgr5干细胞具有直接感知细胞内沙门氏菌并通过ASC依赖的炎症小体信号启动向潘氏细胞分化的内在免疫机制，展示了干细胞可塑性作为先天免疫前沿策略 | 沙门氏菌特异性反应机制是否适用于其他肠道病原体尚不清楚 | 阐明肠道干细胞在抵御肠道病原体感染中的主动免疫调控作用 | 小鼠和人类的肠道Lgr5干细胞、沙门氏菌感染模型、克罗恩病患者组织样本 | 数字病理学 | 感染性疾病, 克罗恩病 | 单细胞转录组测序、荧光标记追踪、类器官培养、遗传扰动 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 小鼠和人类肠道类器官样本，克罗恩病患者干细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于scRNA-seq分析 |
| 1055 | 2026-06-30 |
PASSpedia: A Polyadenylation Site Database Across Different Species at Single-cell Resolution
2026-Jun-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf089
PMID:40986375
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研究论文 | 基于深度学习升级管道SCAPTURE v2，从1330个单细胞RNA-seq数据集中分析七种物种的多聚腺苷酸化位点，构建跨物种单细胞分辨率数据库PASSpedia | 首次在单细胞分辨率下跨七个物种系统性地分析多聚腺苷酸化位点，并开发了SCAPTURE v2管道，利用长读长测序验证单细胞PAS分析准确性，揭示物种间PAS使用偏好差异 | 主要依赖3'标签单细胞RNA-seq数据，可能遗漏非多腺苷酸化转录本信息，跨物种偏好比较未考虑基因表达保守性之外的因素 | 构建跨物种单细胞分辨率的多聚腺苷酸化位点数据库，研究不同物种间的PAS使用偏好 | 七种物种（人类、小鼠等）的1330个已发表3'标签单细胞RNA-seq数据集 | 自然语言处理 | 不适用 | 单细胞RNA测序、长读长测序 | 深度学习（未明确指定具体模型） | 单细胞RNA测序数据 | 1330个单细胞RNA-seq数据集，覆盖七种物种 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基于3'标签的单细胞RNA-seq数据集 |
| 1056 | 2026-06-30 |
Identification of Centrosome Duplication-Related Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy Through Integrative Multi-Omics, Single-Cell Transcriptomics, and Experimental Validation
2026-06-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.047416
PMID:42261922
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研究论文 | 通过整合多组学、单细胞转录组学及实验验证，鉴定肥厚型心肌病中心体复制相关生物标志物 | 首次通过整合多组学和机器学习方法，系统鉴定与HCM相关的心体复制基因，并发现VPS8作为连接内体-溶酶体稳态与免疫重塑的关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 探究中心体复制相关基因在肥厚型心肌病发病机制中的潜在作用及生物标志物 | 肥厚型心肌病相关基因HBEGF和VPS8，重点关注VPS8在心肌细胞中的功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、多组学分析、机器学习和体外功能实验 | 多个机器学习模型（包括差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化） | 转录组数据和单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1057 | 2026-06-30 |
Integrated multi-technology exploration of the mechanism by which Badushengji San regulates core targets in diabetic foot ulcer
2026-Jun-16, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-026-02469-1
PMID:42298176
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研究论文 | 本研究整合多组学技术探索拫毒生肌散调节糖尿病足溃疡核心靶点的机制 | 首次通过整合转录组、单细胞测序和多种机器学习算法，鉴定糖尿病足溃疡生物标志物并揭示拫毒生肌散的潜在调控机制 | 研究仅基于公共数据库分析和体外实验，缺乏体内机制验证 | 鉴定糖尿病足溃疡潜在生物标志物，并初步探索拫毒生肌散的治疗机制 | 糖尿病足溃疡及拫毒生肌散 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个公共数据集（GSE199939, GSE134431, GSE165816） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1058 | 2026-06-30 |
Human vein-to-artery endothelial cell fate transition is driven by VEGF/ERK activation and PI3K inhibition
2026-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205490
PMID:42290237
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研究论文 | 开发了一种人类多能干细胞分化方案，模拟静脉到动脉的内皮细胞命运转变，并揭示VEGF激活与PI3K抑制是该过程的关键驱动信号 | 首次建立人类静脉到动脉内皮细胞转变的体外分化模型，利用单细胞RNA测序数据对比验证其与胚胎发育中血管生成源动脉内皮细胞的相似性，并明确VEGF/ERK激活和PI3K抑制为最小必需信号 | 未提及该方案的长期稳定性或体内功能验证，可能缺乏与体内复杂微环境的全面对比 | 模拟人类胚胎发育中静脉到动脉内皮细胞的转变过程，明确其关键信号通路 | 人类多能干细胞分化的内皮细胞（静脉和动脉表型）以及公共数据库中人类胚胎单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，分化方案建模 | NA | 转录组数据 | 人类多能干细胞分化模型（未明确样本数）及公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1059 | 2026-06-30 |
Beyond suppression: the plasticity, dysfunction, and therapeutic reprogramming of regulatory T cells in inflammatory bowel disease
2026-Jun-08, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
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综述 | 系统阐述炎症性肠病中调节性T细胞的生物学特征、功能缺陷及新兴治疗策略 | 提出以谱系缺陷性外Treg和耗竭性效应Treg的关键区分为核心的概念框架，并结合多组学洞察重新定义IBD中Treg功能衰竭 | 未对具体治疗策略的临床效果和安全性进行量化比较或荟萃分析 | 阐明IBD中Treg的可塑性、功能障碍及其治疗重编程机制 | 调节性T细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 1060 | 2026-06-30 |
Spatial Gene Set Enrichment Analysis with Applications to Spatially Resolved Transcriptomic Data
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729158
PMID:42282725
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研究论文 | 提出了一种名为spaGSE的贝叶斯层次模型，用于空间通路富集分析，整合空间表达分析与基因集注释 | 通过贝叶斯层次模型引入spike-and-slab先验估计富集系数，并利用逻辑回归将基因空间变异与通路成员关系关联，从而在通路层面捕获空间依赖性 | 未提及具体限制，但可能依赖先验设定和对大规模数据集的扩展性 | 开发可检测空间组织通路并提高可解释性的空间通路富集分析方法 | 空间可变基因及生物学通路 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组测序 | 贝叶斯层次模型（含高斯混合框架、逻辑回归、spike-and-slab先验） | 空间分辨转录组数据 | 四个公共空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |