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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-06-05 |
Deciphering the glioblastoma microenvironmental landscape with multi-modal radiogenomics to guide prognosis and personalized therapy
2026-May-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08226-7
PMID:42087207
|
研究论文 | 通过多模态影像基因组学解析胶质母细胞瘤微环境特征，以指导预后和个性化治疗 | 首次结合MRI影像组学特征与单细胞转录组数据建立非侵入性框架，揭示胶质母细胞瘤的异质性和微环境结构，并利用计算药物筛选识别与特定影像组学特征相关的高风险表达模式的可逆靶向药物 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、影像组学特征的临床验证不足以及单细胞数据的整合方法依赖性 | 建立非侵入性框架以表征胶质母细胞瘤的异质性，桥接影像组学特征与肿瘤微环境结构，并识别个性化治疗的新型可药物靶点 | 胶质母细胞瘤患者的MRI影像数据、单细胞转录组数据以及药物敏感性数据 | 医学影像与计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | MRI影像组学、单细胞RNA测序 | 排名计算方法用于评估单细胞水平的基因集活性 | 图像（MRI）和基因表达数据（scRNA-seq） | 未明确数量，但包括了来自公共数据集的影像组学数据和单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1042 | 2026-06-05 |
spatiAlytica: Viewer-Grounded Multimodal Agentic System for Interactive Spatial Omics Analysis
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721735
PMID:42146494
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研究论文 | 提出一个嵌入Napari查看器的多模态交互式智能系统spatiAlytica，使无编程背景的生物学家可通过自然语言进行迭代、假设驱动的空间组学分析 | 首个将查看器状态序列化、智能体记忆、生物概念至数据字段映射、代码生成与调试、空间视觉问答及有依据解释相结合的查看器中心化多模态交互系统 | 未提及具体局限性 | 为无编程背景的生物学家提供可通过自然语言进行空间组学分析的交互式工具 | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 卡波西肉瘤, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 多模态智能体系统 | 空间组学数据, 图像 | 222个单轮空间分析编码问题, 178个多轮序列工作流问题, 7350个图像基础推理问题 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1043 | 2026-06-05 |
PVAED: prior-guided variational autoencoders with diffusion denoising for interpretable single-cell representation learning
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag259
PMID:42202286
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研究论文 | 提出了一种结合生物先验知识和扩散去噪的可解释单细胞表示学习框架PVAED | 将生物先验知识整合到变分自编码器中，并利用扩散去噪模块优化潜在嵌入，同时引入邻域保持损失项确保细胞局部相似性，提高了可解释性和聚类性能 | 未明确说明局限性，但可能依赖于先验知识的完整性和准确性 | 开发一种能够整合生物先验知识的可解释降维方法，用于单细胞RNA测序数据的表示学习 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体及其调控因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器（VAE）与扩散模型 | 基因表达数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1044 | 2026-06-05 |
Integrating Spatial Proteogenomics in Cancer Research
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520744
PMID:41655216
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综述 | 系统回顾空间蛋白质基因组学在肿瘤研究中的发展，从单模态分析到多模态整合，以及从传统机器学习到人工智能驱动分析框架的演进 | 系统性梳理了空间蛋白质基因组学从单模态到多模态整合的演进脉络，涵盖RNA-蛋白共定位、空间蛋白质组+代谢组联合分析、深度视觉蛋白质组学及多模态基础AI模型等前沿技术 | 面临分辨率、标准化和数据复杂性等挑战，同时需要量子计算、活体成像和类器官整合等前沿技术的进一步突破 | 总结空间蛋白质基因组学在肿瘤研究中的应用进展和未来方向 | 肿瘤微环境中的蛋白质、RNA、代谢物等多模态分子信息 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间蛋白质基因组学, 空间转录组学, 空间代谢组学, MALDI成像, 质谱成像 | KRONOS, HEIST，多模态基础AI模型 | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 单细胞多组学 | 不适用 | 空间CITE-seq、NanoPOTS、PiMS等技术平台的具体配置信息未提供 |
| 1045 | 2026-06-05 |
PFKFB3 nuclear translocation improves diabetic retinopathy by attenuating endothelial cell senescence through inhibition of USP7-p53 axis
2026-May, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156553
PMID:41655956
|
研究论文 | 本文发现PFKFB3核转位通过抑制USP7-p53轴减少内皮细胞衰老，从而改善糖尿病视网膜病变 | 首次揭示PFKFB3核定位在抑制糖尿病内皮细胞衰老中的关键作用，并阐明其通过调控USP7-p53轴的分子机制 | 研究未涉及体内长期治疗效果评估及潜在副作用分析 | 探究PFKFB3核转位在糖尿病视网膜病变中调控内皮细胞衰老的分子机制 | 糖尿病视网膜病变小鼠模型及体外培养的人视网膜内皮细胞 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，免疫共沉淀，质谱分析，Western blotting，衰老相关β-半乳糖苷酶染色，免疫荧光，细胞周期流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本（未具体说明数量）及体外培养的内皮细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |
| 1046 | 2026-06-05 |
Sustainable Cultivation of Rare and Endangered Medicinal Plant Multicellular Spheroids Producing Bioactive Therapeutics for Alcohol-Related Liver Disease Therapy
2026-May, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504623
PMID:41668397
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研究论文 | 利用稀有濒危药用植物多细胞球体可持续生产生物活性代谢物，用于酒精性肝病治疗 | 开发了基于多细胞球体的药用植物细胞培养策略，可持续高效生产生物活性代谢物，并结合单细胞转录组学、代谢组学和网络药理学揭示其治疗酒精性肝病的机制 | 未提及具体的局限性 | 建立稀有濒危药用植物生物活性代谢物的可持续生产方式，并评估其对酒精性肝病的治疗潜力 | 雪莲（Saussurea involucrata）多细胞球体及其衍生的次级代谢产物 | 机器学习 | 酒精性肝病 | 单细胞转录组学、超高效液相色谱-串联质谱、网络药理学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 体外细胞实验和小鼠模型实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1047 | 2026-06-05 |
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-05, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103672
PMID:41794017
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综述 | 综述了衰老和癌症中细胞间通讯及器官间通讯的作用，重点分析了基于单细胞和空间转录组学数据的通讯推断工具 | 从局部和全局空间视角整合分析了衰老和癌症转移中细胞间和器官间的通讯变化，并系统梳理了相关推断工具 | 未能详细比较不同推断工具的性能和适用场景 | 探讨衰老与癌症进程中细胞间通讯和器官间通讯的分子机制及其潜在治疗靶点 | 衰老和癌症转移过程中涉及的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 癌症, 老年性疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1048 | 2026-06-05 |
Developmental neurotoxicity of thyroid hormone system-disrupting chemicals: a systems-level exploration using multi-omics approach
2026-May, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04303-4
PMID:41654649
|
研究论文 | 基于多组学方法系统探索甲状腺激素系统干扰化学物质对大脑发育的神经毒性机制 | 首次结合蛋白质组学、代谢组学和空间转录组学多组学整合分析，揭示不同作用模式的甲状腺激素干扰物在大脑中引起趋同的分子扰动，并展示多组学在预测性风险评估中的高灵敏度和潜力 | 主要关注大鼠模型，未在人体中验证；PCN暴露组的毒性效应不明显，可能限制对实际健康风险的推断 | 阐明甲状腺激素系统干扰化学物质如何通过干扰特定分子靶标影响母体甲状腺激素稳态和后代大脑发育 | 妊娠大鼠及其子代，涉及甲状腺、肝脏和脑等靶器官 | 机器学习和多组学整合分析 | 神经发育毒性 | 蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学 | NA | 蛋白质组、代谢组、空间转录组数据 | 暴露于PTU和PCN的妊娠大鼠及其子代，具体样本数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1049 | 2026-06-05 |
Multi-omic characterization of nasopharyngeal carcinoma delineates the subtype-specific landscape of response to induction chemotherapy
2026-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-026-01149-8
PMID:41986499
|
研究论文 | 通过多组学分析，描绘鼻咽癌对诱导化疗反应亚型特异性景观 | 首次整合蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、基因组学和转录组学，在240名患者中鉴定出三个对诱导化疗具有不同治疗反应的蛋白质组亚型，并验证了IgA浆细胞浸润作为GP-IC耐药和抗PD-1治疗获益的预测标志 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究鼻咽癌对吉西他滨和顺铂诱导化疗的预测标志物及亚型特异性反应景观 | 240名接受GP-IC或CCRT治疗的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 磷酸化蛋白质组数据, 基因组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间数据 | 240名患者（三个阶段临床试验和空间分析验证） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1050 | 2026-06-05 |
Tetrameric STAT5 regulates the formation of immune niche cells to protect stem cell regenerative repair against mucosal inflammation
2026-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01716-0
PMID:42062572
|
research paper | 研究四聚体STAT5如何通过调控免疫微环境细胞保护肠道干细胞在黏膜炎症中的再生修复 | 首次揭示了四聚体STAT5抑制隐窝T细胞生态位形成的作用机制，并发现干扰STAT5四聚体可促进TCRγδ细胞扩增，从而增强肠道干细胞再生修复 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，尚需在人体中进一步验证；STAT5四聚体对T细胞迁移的具体分子机制仍需深入探索 | 探究四聚体STAT5在肠道炎症中调控干细胞再生修复的机制 | 肠道干细胞、隐窝T细胞、TCRγδ细胞 | machine learning | inflammatory bowel disease | scRNA-seq, ChIP-seq | NA | single-cell RNA-seq data | 人类IBD样本、STAT5超活性和四聚体缺陷小鼠、类器官 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 1051 | 2026-06-05 |
Interpretable MRI-based Multiparametric Radiomics for Preoperative Prediction of CMS4 Colorectal Cancer
2026-May, Radiology
IF:12.1Q1
DOI:10.1148/radiol.251719
PMID:42153825
|
研究论文 | 基于MRI的放射组学机器学习模型用于术前预测结直肠癌CMS4亚型，并探索其生物学可解释性 | 首次将放射组学特征与转录组分析结合，开发了可解释的MRI多参数放射组学模型（MRC4s）用于预测结直肠癌CMS4亚型，性能优于深度学习方法，并揭示了与TGF-β和上皮-间质转化通路的关联 | 样本量有限（253例），为回顾性研究，模型在不同数据集上的泛化性需进一步验证 | 评估基于放射组学的机器学习方法能否预测结直肠癌CMS4状态，并探索放射组学特征的生物学相关性和可解释性 | 结直肠癌患者，共253例（中位年龄63岁，163名男性） | 机器学习 | 结直肠癌 | MRI成像 | 机器学习放射组学模型（MRC4s）及深度学习模型（ResNet50、VGG16、DenseNet201） | 图像数据（MRI）和转录组数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 253例结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1052 | 2026-06-05 |
Spatial and multi-omics transcriptomic dissects platinum resistance in lung adenocarcinoma: a five-gene predictive model with tumor microenvironment dynamics
2026-Apr-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.111952
PMID:41662930
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研究论文 | 通过空间和多组学转录组分析揭示肺腺癌铂类耐药机制，构建五基因预测模型并探索肿瘤微环境动态 | 首次结合空间转录组学与多组学分析，识别出Cluster1亚型和恶性上皮PH细胞为铂类耐药的关键决定因素，并构建了临床级诊断精度的五基因预测模型 | 未提及明显局限性 | 识别肺腺癌铂类耐药相关的分子亚型并构建稳健的预测模型 | 肺腺癌患者公共数据集、A549/DDP细胞系和裸鼠模型 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 肺腺癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 共识聚类 | 监督主成分分析, 机器学习, 卷积神经网络, 长短期记忆网络, 生成对抗网络 | 图像, 文本 | 未明确提及样本数量 | Illumina | 空间转录组学, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 未提供具体平台配置详情 |
| 1053 | 2026-06-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics in Phragmites australis reveal the association of B chromosomes with plant invasiveness
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04079-x
PMID:42021342
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和比较基因组学，构建了芦苇的单细胞图谱，揭示了B染色体与植物入侵性的关联 | 首次在非模式入侵植物中构建细胞类型解析的分子图谱，并发现B染色体上差异表达基因与入侵性的关联 | 研究仅分析了来自欧洲和北美洲的种群，样本范围有限；B染色体功能验证仍需进一步实验 | 阐明入侵植物芦苇的分子和基因组机制，特别是B染色体在入侵过程中的作用 | 芦苇（Phragmites australis）的欧洲原生种群和北美入侵种群 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，比较基因组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，基因组数据 | 多个欧洲原生和北美入侵种群 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 1054 | 2026-06-05 |
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04083-1
PMID:42021407
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研究论文 | 测试九种机器学习方法用于预测单细胞蛋白表达，发现基于机器学习的预测优于单独使用mRNA的推断 | 全面比较多种机器学习方法在单细胞蛋白表达预测上的效果，发现全转录组预测可成功预测mRNA缺失的蛋白 | 模型泛化性有限，需要高度相似的训练数据，限制了当前应用范围 | 评估机器学习方法从单细胞RNA-seq数据推断蛋白表达的准确性及适用性 | 单细胞蛋白表达预测的机器学习模型及其在不同数据集上的表现 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | 机器学习 | 单细胞基因表达数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1055 | 2026-06-05 |
Biomimetic nanodecoys remodel the mechano-immune microenvironment to potentiate checkpoint blockade in colorectal cancer
2026-Apr-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04458-3
PMID:42002768
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研究论文 | 开发了一种仿生纳米平台MDPAs，通过重塑结直肠癌的力学-免疫微环境来增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 首次利用血小板膜仿生纳米颗粒负载Defactinib和PD-L1抗体，同时调控肿瘤力学微环境和免疫微环境，通过抑制Integrin-FAK-YAP力学转导轴来增强免疫治疗效果 | 研究仅基于小鼠模型（原位瘤、肝转移和术后复发模型），临床转化还需进一步验证 | 探索通过调节肿瘤力学微环境来增强结直肠癌免疫检查点抑制疗法敏感性的新策略 | 结直肠癌肿瘤细胞、免疫细胞及基质细胞的相互作用关系 | 纳米医学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（原位瘤、肝转移和术后复发模型） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1056 | 2026-06-05 |
Causal inference of glucocorticoid signaling in non-small cell lung cancer: integrating Mendelian randomization, single-cell transcriptomics, and imaging data
2026-Apr-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01421-1
PMID:42000855
|
研究论文 | 整合孟德尔随机化、单细胞转录组学和影像数据，探究糖皮质激素信号在非小细胞肺癌中的因果作用 | 首次系统阐明糖皮质激素相关基因与非小细胞肺癌风险之间的潜在因果关系，并发现其可能通过调节M2巨噬细胞功能介导，构建了包含多组学特征的预后风险模型 | 信息未提供，输出NA | 探讨糖皮质激素相关基因与非小细胞肺癌的因果关联，并构建预后预测模型 | 非小细胞肺癌患者组织和细胞系 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 肺癌 | 孟德尔随机化, 单细胞转录组学, 影像组学 | Cox比例风险模型, nnU-Net | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 影像数据 | TCGA数据集、GTEx和eQTLGen数据库样本；独立测试队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1057 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-Apr-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10193-0
PMID:42000969
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示后纵韧带骨化症的细胞异质性及其免疫微环境 | 首次构建人类后纵韧带骨化病变的单细胞图谱，揭示软骨细胞向成骨转化的轨迹及免疫-基质细胞互作网络，特别是SPP1-CD44信号在晚期骨化中的关键作用 | 探索性研究样本量较小（4,683个细胞），仍需更多功能验证和临床样本支持 | 阐明后纵韧带骨化症的细胞异质性和发病机制 | 手术切除的人类颈椎后纵韧带骨化病变组织细胞 | 数字病理学 | 后纵韧带骨化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自人类患者的4,683个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达文库制备 |
| 1058 | 2026-06-05 |
Comparative analysis of key phagocytic genes in humans and mice using machine learning integrated with single-cell RNA sequencing
2026-Apr-06, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习方法，比较人类和小鼠脑出血后小胶质细胞吞噬功能的关键基因，揭示物种特异性差异 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习（XGBoost）来识别脑出血后小胶质细胞吞噬相关基因，并发现Tlr2和CLEC7A分别是小鼠和人类的特异性关键基因 | 未说明具体局限性 | 鉴定脑出血后小胶质细胞吞噬功能差异相关的关键基因，并探索物种特异性响应模式 | 人类和小鼠脑出血模型中的小胶质细胞 | 机器学习 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 单细胞基因表达数据 | 人类和鼠类脑出血样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1059 | 2026-06-05 |
Mapping whole-organism genetic comorbidities across model Species using unified ontologies
2026-Apr-04, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 使用统一本体映射跨物种模式生物的全身遗传共病关系 | 首次利用跨物种表型本体整合方法，系统分析非梗阻性无精子症相关基因在不同模式生物中的全身性共病模式，并开发了CoMo DBM资源库 | 主要依赖已有模式生物数据库的基因型-表型关联数据，可能受限于现有数据覆盖度和注释完整性 | 阐明遗传变异对全身表型的影响机制，特别是男性不育与全身性疾病之间的遗传关联 | 非梗阻性无精子症相关基因及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和秀丽隐杆线虫中的同源基因 | 机器学习 | 男性不育症 | NA | NA | 基因型-表型关联数据、单细胞RNA-seq、全身基因表达数据、基因本体注释 | 204个小鼠非梗阻性无精子症相关基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1060 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals FXR1 as an actionable target for siRNA therapy in ovarian cancer
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71468-y
PMID:41932914
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FXR1作为卵巢癌siRNA治疗的可靶向靶点 | 首次利用单细胞RNA测序分析FXR1沉默对肿瘤微环境中多种细胞类型的影响，并证明LNA修饰的siRNA在体内抑制卵巢癌效果更优 | 未明确说明研究的局限性 | 研究FXR1在卵巢癌中的作用及其作为siRNA治疗靶点的可行性 | 卵巢癌肿瘤组织、腹水中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据 | 涉及体内小鼠模型及腹水样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |