单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10561 - 10580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10561 | 2024-08-05 |
Adenomyosis: single-cell transcriptomic analysis reveals a paracrine mesenchymal-epithelial interaction involving the WNT/SFRP pathway
2023-05, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2023.01.041
PMID:36736810
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析评估了腺肌症的细胞和分子景观 | 揭示了腺肌症中与WNT/SFRP通路相关的间充质-上皮相互作用的独特特征 | 样本量较小，仅包括3名患者 | 评估腺肌症的细胞和分子特点 | 分析来自腺肌症、内膜和肌层的匹配组织的单细胞RNA表达 | 数字病理学 | 腺肌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名患者的匹配组织样本 |
| 10562 | 2024-08-05 |
Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing
2023-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01804-3
PMID:36928074
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞分离方法，以便对再生C. elegans神经元进行单细胞RNA测序 | 提出了飞秒激光微切割技术（fs-LM），可直接从活组织中分离特定再生表型的神经元 | 现有细胞分离技术无法满足特定再生表型神经元的分离需求 | 探讨神经再生的分子机制，以单神经元分辨率理解神经再生 | 再生的C. elegans神经元 | 数字病理学 | NA | 飞秒激光微切割（fs-LM） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10563 | 2024-08-05 |
CTpathway: a CrossTalk-based pathway enrichment analysis method for cancer research
2022-10-13, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01119-6
PMID:36229842
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研究论文 | CTpathway是一种基于交叉通路的通路富集分析方法，适用于癌症研究 | CTpathway整合了路径交叉、分子相互作用和网络拓扑等关键路径特征，从而提供了一种新的PEA方法 | 现有的PEA方法未能充分整合必要的路径特征，导致许多风险路径未被调查 | 研究通路富集分析方法以识别癌症的风险路径 | 通过基因差异表达和交叉效应分析风险基因及其富集的风险路径 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | 超过8300个表达谱覆盖十种癌症组织和血液样本 |
| 10564 | 2024-08-05 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
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研究论文 | 本文开发了一个功能化的谱系追踪系统ClonMapper，可以综合表征异质性人群中的数千个克隆。 | ClonMapper整合了DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离，实现了高分辨率的克隆动态研究。 | NA | 研究肿瘤进展和治疗反应中的复杂克隆动态。 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及其克隆亚群体。 | 数字病理学 | 淋巴癌 | 单细胞RNA测序、DNA条形码技术 | NA | 细胞、RNA | 数千个克隆 |
| 10565 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals multi-step adaptations to endocrine therapy
2019-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11721-9
PMID:31477698
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研究论文 | 该研究揭示了在内分泌治疗过程中肿瘤细胞的多步适应机制 | 提出了一个多步模型来解释内分泌治疗的抗药性发展，并定义了稀有的预适应细胞亚群 | 研究主要集中在单细胞层面，可能无法完全捕捉复杂的肿瘤微环境 | 探索内分泌治疗期间肿瘤细胞的遗传多样性和转录塑性的贡献 | 富含遗传异质性的乳腺癌细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10566 | 2024-08-05 |
Testis single-cell RNA-seq reveals the dynamics of de novo gene transcription and germline mutational bias in Drosophila
2019-08-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47138
PMID:31418408
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研究论文 | 该研究探讨了果蝇睾丸中遗传新奇性表达模式及其细胞类型的动态变化 | 研究首次揭示了特定细胞类型中de novo基因的表达模式及其与生殖细胞替代的关系 | 研究主要集中在果蝇的睾丸，可能无法直接推广至其他物种 | 研究睾丸中的遗传新奇性如何影响生殖功能和进化创新 | 成年果蝇的睾丸细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 成年果蝇睾丸细胞的单细胞样本 |
| 10567 | 2024-08-07 |
Large Particle Fluorescence-Activated Cell Sorting Enables High-Quality Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis of Adult Cardiomyocytes
2019-08-16, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315493
PMID:31415233
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10568 | 2024-08-05 |
scAlign: a tool for alignment, integration, and rare cell identification from scRNA-seq data
2019-08-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1766-4
PMID:31412909
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研究论文 | scAlign是一种用于对scRNA-seq数据进行对齐、集成和稀有细胞识别的工具 | 提出了一种无监督深度学习方法scAlign，可处理部分、重叠或完整的细胞标签集，具备出色的数据集集成性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的集成及稀有细胞的识别问题 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA |
| 10569 | 2024-08-05 |
Multi-Objective Optimized Fuzzy Clustering for Detecting Cell Clusters from Single-Cell Expression Profiles
2019-08-13, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes10080611
PMID:31412637
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研究论文 | 本文提出了一种多目标优化的模糊聚类方法，用于从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇 | 创新点在于结合多目标优化和模糊聚类算法进行细胞簇的识别 | 未提及具体的计算效率和方法的适用范围 | 目标是提高从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇的准确性 | 研究对象为小鼠稀有肠道细胞类型的单细胞表达谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 模糊c均值聚类 | 表达数据 | 288个细胞，来自23,630个基因特征 |
| 10570 | 2024-08-05 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Data
2019-06-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.031
PMID:31178118
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研究论文 | 本文提出一种策略以整合多样的单细胞测量数据，改善细胞身份和功能的理解 | 创新点在于开发了一种'锚定'不同数据集的策略，能够跨越不同的单细胞测量技术和多重细胞模态进行数据整合 | 限制在于所开发方法可能仍需进一步验证和优化以适应更广泛的应用场景 | 探索如何有效整合不同单细胞测量技术的数据以深入理解细胞状态 | 研究对象包括不同的单细胞转录组数据和染色质可及性数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 10571 | 2024-08-05 |
Single-Cell Multi-omic Integration Compares and Contrasts Features of Brain Cell Identity
2019-06-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.006
PMID:31178122
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研究论文 | 本文开发了LIGER算法，通过整合多种实验和生物背景下的单细胞测量，定义了细胞类型的特征 | 提出了一种新的算法LIGER，能够灵活建模单细胞数据集，并揭示细胞身份的共享和特定特征 | NA | 本研究旨在定义细胞类型并加速细胞类型定义、基因调控和疾病状态的调查 | 研究对象包括人类和小鼠脑细胞的单细胞基因表达和表观基因组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 四个不同的分析，涉及来自人类和小鼠的大脑细胞 |
| 10572 | 2024-08-05 |
CD49b defines functionally mature Treg cells that survey skin and vascular tissues
2018-11-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20181442
PMID:30355617
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研究论文 | 本研究识别了一种表达CD49b的功能成熟的Treg细胞亚群。 | 发现了具有独特组织分布和功能的短暂效应Treg细胞亚群。 | 未阐明不同组织来源的Treg细胞之间的关系的全部情况。 | 阐明功能成熟的Treg细胞亚群的身份和发展。 | CD49b Treg细胞亚群及其在外周组织中的作用。 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 10573 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Cell Type-Specific Molecular Pathology in a 2VO Cerebral Ischemic Mouse Model
2024-Aug, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03755-4
PMID:38180614
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研究论文 | 本研究利用小鼠双血管阻塞缺血模型分析了海马中特定细胞类型的分子病理 | 首次对2VO模型进行单细胞转录组分析，揭示了不同寻常的少突胶质前体细胞亚型 | 缺乏对其他脑区的细胞类型-specific基因表达的研究 | 研究缺血后海马中细胞类型特异性的分子病理 | 2VO小鼠模型中的海马细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组分析 | 2VO模型 | 细胞 | 27,069个细胞对应14种细胞类型 |
| 10574 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
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研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 |
| 10575 | 2024-08-04 |
Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50291-3
PMID:39009595
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研究论文 | 本文开发了一种基于总RNA的单细胞RNA测序方法snapTotal-seq，并展示其在转录因子调控中的应用 | 创新性地提出了一种同时测量未剪接RNA和剪接RNA的一步总RNA化学方法 | 只对单细胞RNA-seq化学的表现进行了比较，未评估其在其他细胞类型或条件下的适用性 | 本研究旨在通过新的方法深入了解基因调控，特别是在细胞状态转变中的调控机制 | 研究对象包括单细胞中的转录因子及其调控的细胞周期和衰老 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | NA |
| 10576 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of bullous pemphigoid unveils immune-stromal crosstalk in type 2 inflammatory disease
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50283-3
PMID:39009587
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研究论文 | 本研究揭示了水疱性皮肤病中免疫-基质间的相互作用。 | 首次识别IL13-IL13RA1配体-受体对作为水疱性皮肤病中免疫-基质互动的重要介质。 | 未提供关于样本数量和具体实验条件的详细信息。 | 全面了解水疱性皮肤病的免疫景观，特别是免疫-基质之间的相互作用。 | 研究T细胞、树突状细胞和成纤维细胞等关键细胞群体。 | 数字病理学 | 水疱性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 10577 | 2024-08-04 |
Endoplasmic reticulum stress promotes hepatocellular carcinoma by modulating immunity: a study based on artificial neural networks and single-cell sequencing
2024-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05460-9
PMID:39010084
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激如何通过调节免疫反应促进肝细胞癌的发展 | 提出了一种新的预测模型，结合多种机器学习算法与人工神经网络，为肝细胞癌的诊断提供新方向 | 采用的数据集和方法可能无法全面覆盖所有与内质网应激相关的基因和免疫机制 | 探讨内质网应激在肝细胞癌发展中的分子机制及早期诊断和治疗靶点 | 研究涉及与内质网应激相关的不同ially表达基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、机器学习（随机森林和支持向量机）、人工神经网络 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 综合GEO数据集（GSE25097, GSE62232, GSE65372） |
| 10578 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
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研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 |
| 10579 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10580 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 |