本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
10521 | 2025-10-07 |
Longitudinal Multi-omic Immune Profiling Reveals Age-Related Immune Cell Dynamics in Healthy Adults
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612119
PMID:39314416
|
研究论文 | 通过纵向多组学分析揭示健康成年人年龄相关的免疫细胞动态变化 | 建立包含1600多万个PBMCs的单细胞RNA测序数据集,创建新的免疫健康图谱,并开发在线数据探索工具 | 研究样本仅限于健康成年人,未包含疾病状态或更广泛年龄范围的个体 | 理解健康免疫系统在生命周期中的基本变化,为年龄相关感染和疾病易感性开发干预措施 | 300多名健康成年人,其中96名年轻和年长成年人进行为期两年的年度疫苗接种随访 | 免疫学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 300多名健康成年人,1600多万个PBMCs,71个免疫细胞亚群 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | NA |
10522 | 2025-10-07 |
Investigating gene functions and single-cell expression profiles of de novo variants in orofacial clefts
2024-Jul-18, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100313
PMID:38807368
|
研究论文 | 本研究通过分析唇腭裂中的新生变异基因功能及其单细胞表达谱,探索了非OMIM数据库基因在颅面发育中的作用 | 首次将新生变异基因与OMIM已知基因进行系统性比较,并利用单细胞RNA测序技术揭示这些基因在鼠唇发育过程中的细胞类型特异性表达模式 | CPO基因集分析因DNV基因数量有限而未获得显著发现 | 探索唇腭裂中新生变异基因的功能及其在颅面发育中的表达特征 | 853个含新生变异基因(其中230个与CL/P相关,23个与CPO相关)及OMIM数据库中的455个已知基因(178个CL/P基因,277个CPO基因) | 基因组学 | 唇腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞表达数据 | 960个新生变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10523 | 2025-10-07 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
|
研究论文 | 本研究揭示了健康造血干细胞和祖细胞在急性髓系白血病微环境中通过炎症反应主动参与疾病进程 | 首次发现HSPCs是白血病细胞介导骨髓炎症适应的未知组成部分,并证明AML来源的细胞外囊泡足以触发这种炎症反应 | 研究基于两种同源AML模型,结果在人类AML中的适用性需要进一步验证 | 探究健康造血干细胞和祖细胞在AML骨髓微环境炎症反应中的作用机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)、急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、骨髓血浆分泌组分析、细胞外囊泡研究 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | 两种同源AML模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10524 | 2025-10-07 |
Tetrahedral DNA loaded siCCR2 restrains M1 macrophage polarization to ameliorate pulmonary fibrosis in chemoradiation-induced murine model
2024-Mar-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.01.022
PMID:38273656
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型小鼠肺纤维化模型,并验证了通过四面体DNA递送siCCR2抑制M1巨噬细胞极化治疗肺纤维化的新策略 | 整合博来霉素气管给药和胸部照射建立持续性肺泡炎介导的纤维化小鼠模型;首次揭示CCL2/CCR2轴驱动M1巨噬细胞极化的关键作用;开发了多粘性末端四面体框架核酸结合四联ccr2-siRNA的新型治疗平台 | 动物模型仍需进一步验证与人类IPF的相似性;治疗策略的长期安全性和有效性需要更多研究 | 探索肺纤维化发病机制并开发新型治疗策略 | 小鼠模型和人类IPF患者 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,基因沉默技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,病理数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10525 | 2025-10-07 |
Identification of AgRP cells in the murine hindbrain that drive feeding
2024-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101886
PMID:38246589
|
研究论文 | 本研究在小鼠后脑中发现并表征了先前未知的AgRP细胞群,这些细胞能够独立于下丘脑AgRP神经元驱动摄食行为 | 首次在小鼠后脑区域(包括最后区、亚后区及孤束核连合部)鉴定出AgRP表达细胞群,证明这些细胞具有独立于下丘脑的促食欲功能 | 研究主要聚焦于小鼠模型,尚未在其它物种中验证;对AgRPHind细胞的具体神经环路机制仍需进一步探索 | 探究后脑中AgRP细胞的存在及其在摄食调控中的作用 | 小鼠后脑AgRP表达细胞 | 神经科学 | 代谢疾病 | 基因表达分析、单细胞RNA测序、免疫荧光分析、DREADD化学遗传学、SOUL光遗传学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、行为学数据 | 多种转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10526 | 2025-10-07 |
Single Cell Sequencing Technology and Its Application in Alzheimer's Disease
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230861
PMID:38217599
|
综述 | 概述单细胞测序技术及其在阿尔茨海默病研究中的应用 | 系统总结单细胞测序技术在解析阿尔茨海默病中枢神经系统细胞异质性方面的独特优势 | NA | 探讨单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用价值 | 中枢神经系统细胞 | 单细胞测序 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 单细胞表观基因组学, 单细胞基因组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
10527 | 2025-10-07 |
Transcriptional programming of immunoregulatory responses in human Langerhans cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.892254
PMID:36203560
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析研究人表皮朗格汉斯细胞在稳态和迁移过程中的转录编程及其免疫调节功能 | 首次揭示稳态朗格汉斯细胞存在于连续成熟状态,并发现迁移诱导的免疫调节基因组模块和关键转录因子网络 | NA | 研究人原代朗格汉斯细胞在稳态期间的转录编程和免疫调节功能 | 人表皮朗格汉斯细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, Partial Information Decomposition in Context | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10528 | 2025-10-07 |
The Hypoxia-Associated High-Risk Cell Subpopulation Distinctly Enhances the Progression of Glioma
2025-Mar-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416231
PMID:40047299
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别出与胶质瘤进展相关的CDC20/KIF20A/PTTG1标记的高风险细胞亚群 | 首次聚焦于低级别胶质瘤起源的高风险细胞亚群,发现其通过缺氧核心激活驱动胶质瘤进展的机制 | NA | 探究低级别胶质瘤向胶质母细胞瘤转化的关键细胞亚群及其治疗策略 | 低级别胶质瘤样本和胶质瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10529 | 2025-10-07 |
Detection by Single-Cell RNA Sequencing of Virally Mediated Skin Diseases
2025-May, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100348
PMID:40026481
|
研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的方法检测皮肤活检样本中的病毒转录本 | 首次将单细胞RNA测序与病毒组检测策略结合,实现病毒感染的样本检测、单细胞分辨率识别和转录组扰动分析 | 在已确定的非病毒介导的炎症性皮肤病中未发现一致的病毒感染证据 | 研究病毒在皮肤疾病中的作用机制和转录调控 | 人类皮肤活检样本 | 单细胞测序分析 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种皮肤疾病活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10530 | 2025-10-07 |
The future of cardiology: Integrating single-cell transcriptomics with multi-omics for enhanced cardiac disease insights
2025-Apr, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2025.103005
PMID:39894239
|
综述 | 探讨单细胞转录组测序技术在心血管疾病研究中的应用及其与多组学整合的未来发展方向 | 强调将空间转录组学与其他组学技术整合以增强对心脏生物学的理解 | 当前单细胞转录组测序面临数据整合挑战,需要更全面的多组学方法 | 通过整合单细胞转录组学与多组学技术提升对心血管疾病的认知 | 哺乳动物心脏细胞及心血管疾病机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
10531 | 2025-10-07 |
Shining a light on cell biology of the nucleus with single-cell sequencing
2025-Apr, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102468
PMID:39903993
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的最新进展和应用 | 系统总结单细胞测序技术如何揭示细胞核内过程的异质性和相互作用机制 | NA | 探讨单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的应用前景 | 细胞核生物学过程和细胞状态 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞基因组测序 | NA | NA |
10532 | 2025-10-07 |
Novel photocrosslinking chemical probes utilized for high-resolution spatial transcriptomics
2025-Mar-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d4cb00262h
PMID:39845105
|
研究论文 | 开发了一种名为CrossSeq的新型空间转录组学技术,利用光交联化学探针和共聚焦显微镜在固定细胞上标记感兴趣区域 | 采用光交联荧光探针和共聚焦显微镜激活技术,能够在固定细胞上定义用户感兴趣区域进行多重空间转录组分析 | 未明确说明技术在处理更复杂组织样本时的适用性和分辨率限制 | 开发高分辨率空间转录组学技术以解决当前细胞标记方法的空间分辨率和多重分析限制 | 固定细胞和MDA-MB-231-LM2转移性癌症迁移模型 | 空间转录组学 | 转移性癌症 | 光交联技术、共聚焦显微镜、流式细胞术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | CrossSeq技术平台,使用光交联荧光探针和共聚焦显微镜 |
10533 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by macrophage cells gene signature in lung adenocarcinoma
2025-Mar-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01834-7
PMID:40029500
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别肿瘤相关巨噬细胞基因特征,构建肺腺癌预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别肿瘤相关巨噬细胞相关基因特征,并构建包含9个基因的预后风险评分模型 | 样本量相对有限(19例患者的29个样本),需要更多独立队列验证 | 识别肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞相关生物标志物及其预后意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 19例肺腺癌患者的29个单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10534 | 2025-10-07 |
Blood TCTP as a potential biomarker associated with immunosuppressive features and poor clinical outcomes in metastatic gastric cancer
2025-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010455
PMID:40032602
|
研究论文 | 探讨血浆TCTP作为转移性胃癌免疫抑制特征和不良临床结局的潜在生物标志物 | 首次将血浆TCTP与胃癌免疫抑制性髓系细胞特征及临床预后相关联 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 评估血浆TCTP在晚期胃癌中的预后价值和免疫学意义 | 接受一线化疗或三线纳武利尤单抗治疗的胃癌患者 | 数字病理 | 胃癌 | ELISA, 多重蛋白质组分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 血浆样本, 蛋白质表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 308名胃癌患者(队列1:143人,队列2:165人) | Olink | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组分析 | NA | Olink多重蛋白质组分析平台 |
10535 | 2025-10-07 |
The role of senescence-related genes in major depressive disorder: insights from machine learning and single cell analysis
2025-Mar-03, BMC psychiatry
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12888-025-06542-8
PMID:40033248
|
研究论文 | 通过机器学习和单细胞分析探讨衰老相关基因在重度抑郁症中的作用 | 首次结合随机森林、支持向量机和单细胞RNA测序技术系统分析衰老相关基因在重度抑郁症中的表达模式和功能 | 样本量相对有限(144例MDD患者和72例对照),数据来源于公共数据库 | 探索衰老相关基因与重度抑郁症的关联机制 | 重度抑郁症患者和健康对照人群 | 机器学习, 单细胞分析 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | Random Forest, SVM-RFE, 逻辑回归 | 基因表达数据 | 144例MDD患者和72例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10536 | 2025-10-07 |
Leveraging prior knowledge to infer gene regulatory networks from single-cell RNA-sequencing data
2025-Mar, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00088-3
PMID:39939367
|
综述 | 探讨如何利用先验知识提升单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的可靠性 | 提出整合先验知识的方法分类体系,并建立标准化基准测试框架 | 作为综述文章,不包含原始实验数据验证 | 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络推断算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
10537 | 2025-10-07 |
The Exploration of Disturbance of Capillary and Photoreceptor Communication Networks in Diabetic Retinopathy Through Single-Cell RNA-Seq
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70442
PMID:40032635
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索糖尿病视网膜病变中毛细血管与光感受器细胞通讯网络的扰动机制 | 首次在糖尿病视网膜病变中发现血管内皮细胞与光感受器细胞之间通过PTN、MK、ANGPTL和CXCL信号通路的异常通讯,并鉴定出Angptl4-Sdc4等关键配体-受体对 | 研究样本量较小(仅5只大鼠),且为动物模型研究,需要进一步在人类样本中验证 | 探究糖尿病视网膜病变中血管内皮细胞与光感受器细胞通讯网络的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠视网膜组织 | 单细胞测序分析 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,qPCR,免疫组化,TUNEL,ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5只Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10538 | 2025-10-07 |
Single-cell analyses reveal metastasis mechanism and microenvironment remodeling of lymph node in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101275
PMID:40041119
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示肝内胆管癌淋巴结转移的机制和微环境重塑 | 首次系统揭示iCCA淋巴结转移微环境的异质性,鉴定CD36+巨噬细胞和SAA1+肿瘤细胞在转移过程中的关键作用 | 样本量相对较小(4例单细胞测序患者),需要更大规模研究验证 | 系统探索肝内胆管癌淋巴结转移相关微环境的异质性 | 肝内胆管癌患者的原发肿瘤、癌旁肝组织和肿瘤引流淋巴结 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 差异基因表达分析, 功能富集分析, 单细胞拷贝数变异评估, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 4例患者(单细胞测序), 81例肿瘤和匹配淋巴结组织切片 | NA | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
10539 | 2025-10-07 |
Dual function of MrgprB2 receptor-dependent neural immune axis in chronic pain
2025-Feb-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.037
PMID:40024332
|
研究论文 | 本研究揭示了MrgprB2受体依赖的神经免疫轴在化疗引起的神经病理性疼痛中的双向调节作用 | 首次发现MrgprB2/Tryptase/PAR2信号轴在慢性疼痛中具有双向调节功能,既能促进疼痛发展又能促进疼痛缓解 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 研究肥大细胞MrgprB2介导的神经免疫相互作用在化疗引起的神经病理性疼痛中的双向调节机制 | 野生型小鼠、MrgprD基因敲除小鼠、肥大细胞缺陷小鼠、MrgprB2基因敲除小鼠和MrgprB2-Cre tdTomato小鼠 | 神经免疫学 | 神经病理性疼痛 | 钙成像、细胞因子抗体阵列、单细胞测序数据库挖掘、免疫荧光、Western blotting、免疫共沉淀 | NA | 分子生物学数据、成像数据、基因表达数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
10540 | 2025-10-07 |
Characterization of Ferroptosis-Related Genes in Aplastic Anaemia: An Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025-Feb-12, Acta haematologica
IF:1.7Q3
DOI:10.1159/000543656
PMID:39938486
|
研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,研究铁死亡相关基因在再生障碍性贫血中的作用 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析AA中铁死亡相关基因,并在细胞水平识别关键基因DDIT4和NCF2 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索铁死亡相关基因在再生障碍性贫血发病机制中的作用 | 再生障碍性贫血患者样本 | 生物信息学 | 再生障碍性贫血 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |