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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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10521 | 2024-09-01 |
Spatial mapping of protein composition and tissue organization: a primer for multiplexed antibody-based imaging
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01316-y
PMID:34811556
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perspective | 本文探讨了多重抗体成像技术在组织蛋白质组成和结构组织空间映射中的应用 | 介绍了多重蛋白成像方法的最新进展,这些方法能够提供复杂组织的空间和功能详细图谱 | 目前的方法主要依赖于单细胞测序,缺乏理解细胞间通信和相关结构组织所需的空间背景 | 旨在为多重抗体成像技术提供必要的资源和关键考虑,以促进其广泛应用和数据标准化 | 组织和器官中的细胞类型及其在生理功能中的协同作用 | NA | NA | 多重蛋白成像 | NA | 图像 | NA |
10522 | 2024-09-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Changes of Tumor Immune Microenvironment in Oral Squamous Cell Carcinoma After Chemotherapy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.914120
PMID:35784460
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫微环境的变化 | 本研究首次在单细胞转录组水平揭示了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤微环境的特征 | NA | 研究化疗对口腔鳞状细胞癌中肿瘤细胞和肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌化疗后的肿瘤微环境 | digital pathology | 口腔癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
10523 | 2024-09-01 |
Applications and Achievements of Single-Cell Sequencing in Gastrointestinal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.905571
PMID:35785171
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用及其最新进展 | 单细胞测序技术提供了比大规模测序技术更准确的数据,能够解析细胞和分子层面的单细胞分辨率特征 | NA | 探讨单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用 | 胃肠癌的来源、异质性、微环境信息以及诊断和治疗方法 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA |
10524 | 2024-09-01 |
Progress and Prospect of Immunotherapy for Triple-Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919072
PMID:35795050
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌(TNBC)免疫治疗的进展和前景 | 介绍了基于免疫分子疗法、溶瘤病毒疗法和过继免疫细胞转移疗法等多种新型免疫治疗方法 | 目前免疫治疗在乳腺癌患者中的总体反应不强,且存在一系列挑战和机遇 | 探讨三阴性乳腺癌免疫治疗的新发现、临床试验结果及未来发展方向 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其免疫治疗策略 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 免疫检查点抑制剂(ICIs)、单细胞测序、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA |
10525 | 2024-09-01 |
Tumor-Infiltrating Regulatory T-cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Is Mediated by IL33/ST2 Signaling
2020-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0828
PMID:32878747
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中肿瘤浸润调节性T细胞(Treg)积累的分子机制,特别是IL33/ST2信号通路的作用 | 首次揭示了IL33/ST2轴在肿瘤微环境中调节性T细胞积累的关键作用,并提出了这一通路作为癌症免疫治疗潜在靶点的可能性 | NA | 阐明肿瘤微环境中调节性T细胞积累的分子机制 | 肿瘤浸润调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的积累机制 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 来自同种肿瘤小鼠的肿瘤浸润Treg和脾脏Treg |
10526 | 2024-09-01 |
Development and Arealization of the Cerebral Cortex
2019-09-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.07.009
PMID:31557462
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综述 | 本文综述了大脑皮层区域多样性的早期发育过程,包括内在和外在机制,并提出了一个整合模型。 | 引入单细胞转录组学等新兴技术,提供了一个新的视角来理解区域特异性的分子多样性。 | NA | 探讨大脑皮层区域多样性的发育过程及其在神经发育障碍中的潜在应用。 | 大脑皮层的发育过程和区域多样性。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
10527 | 2024-08-31 |
Personalized composite scaffolds for accelerated cell- and growth factor-free craniofacial bone regeneration
2024-Nov, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.029
PMID:39188380
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研究论文 | 本文介绍了一种用于加速颅面骨再生的个性化复合支架系统,该系统采用3D打印技术制造,包含多孔聚二醇柠檬酸-羟基磷灰石复合弹性体和聚二醇柠檬酸-石墨烯氧化物水凝胶复合物。 | 该支架系统通过材料中心的设计,无需细胞和生长因子即可促进骨再生,具有简化的制造过程和临床转化优势。 | NA | 开发一种新型的复合支架系统,用于加速颅面骨的再生。 | 颅面骨的再生 | 生物材料 | 骨骼疾病 | 3D打印 | NA | NA | NA |
10528 | 2024-08-31 |
Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102268
PMID:39171140
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研究论文 | 研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸,触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化 | 本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力 | NA | 阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 寡核苷酸技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠来源的急性髓系白血病细胞 |
10529 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据,构建并验证了一个基于急性髓系白血病(AML)肿瘤微环境(TME)的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据,构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型,用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型,以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 |
10530 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性,并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用,并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因,未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 |
10531 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10532 | 2024-08-31 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 本文介绍了Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI)框架,该框架通过整合细胞形态学和空间转录组学来深入分析肿瘤生态系统 | METI框架结合了空间转录组学、细胞形态学和精选基因签名,增强了我们对组织内分子景观和细胞相互作用的理解 | NA | 开发和评估一种新的分析工具METI,用于改善肿瘤微环境研究中的细胞类型和状态的分层以及细胞共定位分析 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 | 数字病理学 | 胃癌, 肺癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因数据 | 多种肿瘤组织样本,包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 |
10533 | 2024-08-31 |
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557958
PMID:37745510
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研究论文 | 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 | 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统,并结合原有的报告基因,揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 | 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 | 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 | 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括异种移植模型和临床样本 |
10534 | 2024-08-31 |
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110534
PMID:39175771
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研究论文 | 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大(eTA)细胞的激活机制,特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 | 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 | NA | 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 | 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
10535 | 2024-08-31 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 | 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤,并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 | 研究为非随机第一阶段试验,样本量较小,且未涉及标准疗法的比较 | 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 九名患者 |
10536 | 2024-08-31 |
bHLH transcription factors cooperate with chromatin remodelers to regulate cell fate decisions during Arabidopsis stomatal development
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002770
PMID:39150946
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研究论文 | 本文研究了bHLH转录因子与染色质重塑因子在拟南芥气孔发育中的细胞命运决策中的协同作用 | 本文通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析,揭示了气孔发育中转录调控的不同阶段,并提出了bHLH转录因子和染色质重塑因子共同调控转录和染色质重塑的模型 | NA | 探讨转录因子、顺式调控元件和表观基因组在细胞命运承诺中的协同调控机制 | 拟南芥叶表皮中的气孔发育 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | bHLH转录因子, SWI/SNF染色质重塑复合体, 组蛋白乙酰转移酶HAC1 | 基因组数据 | NA |
10537 | 2024-08-31 |
Soma-germline communication drives sex maintenance in the Drosophila testis
2024-Aug, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae215
PMID:39183747
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了果蝇睾丸中体细胞与生殖细胞间通讯在性别维持中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术,详细解析了体细胞中Chinmo蛋白在性别决定和胰岛素信号通路中的直接调控作用 | 研究主要集中在果蝇睾丸模型中,可能需要进一步在其他物种中验证相关机制 | 探讨体细胞信号如何调控生殖细胞以实现正常的配子发生 | 果蝇睾丸中的体细胞和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CUT&Tag | NA | RNA | 多个果蝇睾丸样本 |
10538 | 2024-08-31 |
Multiomics unveils extracellular vesicle-driven mechanisms of endothelial communication in human carotid atherosclerosis
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.21.599781
PMID:38979218
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研究论文 | 本文研究了外周血管疾病中的细胞间通信机制,特别是通过外泌体在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次综合分析了外泌体在颈动脉粥样硬化中的多组学特征,揭示了其在疾病进展中的复杂通信网络和功能影响 | 研究样本量相对较小,且仅限于颈动脉粥样硬化的特定阶段 | 探讨外泌体在颈动脉粥样硬化中的细胞间通信机制及其对疾病进展的影响 | 颈动脉粥样硬化患者的外泌体及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全转录组miRNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | RNA测序数据和蛋白质组学数据 | 症状性患者16例,无症状患者13例 |
10539 | 2024-08-31 |
Negative selection allows human primary fibroblasts to tolerate high somatic mutation loads induced by N-ethyl-N-nitrosourea
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588286
PMID:38617356
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研究论文 | 本文研究了人类原代成纤维细胞在N-乙基-N-亚硝基脲(ENU)诱导的高体细胞突变负荷下的耐受性 | 首次揭示了单个细胞能够承受约60,000个单核苷酸变异(SNVs)而仅轻微影响生长速率,并证明了这种高突变水平仅通过基因编码区域和维持基本细胞功能及生长的遗传途径中的负选择来耐受 | 研究仅限于人类原代成纤维细胞,未涉及其他组织类型 | 探讨细胞在衰老过程中积累的突变负荷对功能的影响 | 人类原代成纤维细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 多个低剂量ENU处理的细胞样本 |
10540 | 2024-08-31 |
Characterizing enteric neurons in dopamine transporter (DAT)-Cre reporter mice reveals dopaminergic subtypes with dual-transmitter content
2024-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16307
PMID:38487941
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研究论文 | 本研究利用报告鼠系对肠道中的多巴胺能神经元进行了全面表征,揭示了具有双重递质含量的多巴胺能亚型。 | 本研究首次在肠道神经系统中发现了一种新型多巴胺能神经元群体,这些神经元同时表达胆碱乙酰转移酶和多巴胺转运体。 | 需要进一步研究以定义这些多巴胺能肠道神经元的功能特征及其在疾病中的作用。 | 旨在全面表征肠道中的多巴胺能神经元,并揭示其亚型和功能。 | 肠道神经系统中的多巴胺能神经元及其亚型。 | 神经科学 | NA | 免疫荧光、单细胞转录组学、原位杂交 | NA | 图像 | 使用多巴胺转运体报告鼠系进行研究 |