单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10501 - 10520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10501 | 2024-08-05 |
Lgr5 and Col22a1 Mark Progenitor Cells in the Lineage toward Juvenile Articular Chondrocytes
2019-10-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.08.006
PMID:31522976
|
研究论文 | 本文通过谱系追踪研究识别了Lgr5标记的细胞群体在关节组织形成中的贡献 | 揭示了Lgr5细胞在关节前体的谱系分化及其向关节软骨细胞的进展中的重要性 | 对谱系标记的细胞在整个关节组织形成过程中的具体作用尚不完全了解 | 探索关节形成过程中前体细胞的谱系规格化 | Lgr5和Col22a1标记的前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | NA |
| 10502 | 2024-08-05 |
MULTI-seq: sample multiplexing for single-cell RNA sequencing using lipid-tagged indices
2019-07, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0433-8
PMID:31209384
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研究论文 | 本研究开发了MULTI-seq，一种使用脂质标记指标的单细胞RNA测序多重化方法 | MULTI-seq提供了一种通用和可扩展的样本条形码策略，能够对任何细胞类型或细胞核进行标记 | 目前未提及任何具体的局限性 | 研究的目的是提高单细胞RNA测序的成本效益和数据质量 | 研究对象包括主要的人类乳腺上皮细胞和来自患者衍生异种移植小鼠模型的多发性肿瘤及转移部位的细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 96个样本及其他来自肿瘤和转移部位的细胞 |
| 10503 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Approach to the Elusive Latent Human Cytomegalovirus Transcriptome
2018-06-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01001-18
PMID:29895640
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研究论文 | 本研究探讨了人类巨型细胞病毒潜伏转录组的单细胞RNA测序特点 | 通过单细胞RNA测序定义了人类巨型细胞病毒潜伏期的转录组特征 | 在潜伏期的定义和单细胞RNA测序分析中存在众多挑战 | 探讨人类巨型细胞病毒的潜伏转录组特征 | 关注于宿主内不同的细胞亚群体及其潜伏感染 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10504 | 2024-08-05 |
A general pHLA-CD80 scaffold fusion protein to promote efficient antigen-specific T cell-based immunotherapy
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200827
PMID:39027379
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研究论文 | 本文介绍了一种通用的pHLA-CD80融合蛋白，以促进有效的抗原特异性T细胞免疫治疗 | 文中提出的APC-mimic融合蛋白有效模仿了抗原呈递细胞的自然抗原呈递模式，能够直接扩展T细胞 | 研究中未提及特定抗原呈递细胞的需求，可能在应用中存在局限 | 研究旨在提高抗原特异性T细胞的激活和扩展 | 研究对象为抗原特异性T细胞及其在小鼠模型中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞TCR测序（scTCR-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | OT-1小鼠模型 |
| 10505 | 2024-08-04 |
Abnormal metabolism in melanocytes participates in the activation of dendritic cell in halo nevus
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110300
PMID:38950722
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研究论文 | 本研究分析了光晕痣中黑色素细胞的异常代谢及其对树突状细胞激活的影响 | 首次揭示了光晕痣中黑色素细胞衍生的UDP-G在树突状细胞激活中的重要作用 | 实验中的样本量和具体机制尚需进一步研究 | 深入了解光晕痣的进展及其免疫反应的机制 | 聚焦于光晕痣中黑色素细胞、树突状细胞和相关代谢产物 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 10506 | 2024-08-04 |
Tissue gene expression profiles and communication networks inform candidate blood biomarker identification in psoriasis and atopic dermatitis
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110283
PMID:38880200
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了银屑病和特应性皮炎患者的转录特征。 | 本研究首次通过空间转录组学结合体外预测探索了潜在的血液生物标志物，为其他炎症性疾病的研究提供了新方法。 | 研究可能存在样本规模限制，且对某些转录本的验证仅限于外周血T细胞。 | 本研究旨在识别银屑病和特应性皮炎的潜在生物标志物。 | 研究对象为银屑病和特应性皮炎患者的角质形成细胞和特定CD4/CD8 T淋巴细胞。 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10507 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analysis and machine learning developed diagnostic markers and prognostic model based on Efferocytosis-associated signatures for septic cardiomyopathy
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110301
PMID:38944364
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研究论文 | 这篇文章通过整合多组学分析，揭示了与凋亡细胞吞噬相关的关键基因及其在脓毒症心肌病中的作用 | 识别了一个新的与凋亡细胞吞噬相关的脓毒症心肌病亚型及诊断生物标志物 | NA | 探讨凋亡细胞吞噬在脓毒症心肌病中的临床和遗传作用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症心肌病 | scRNA-seq | NA | 基因数据 | 感染脓毒症患者的外周血单核细胞 |
| 10508 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-Jul-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
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研究论文 | 本研究揭示了FKBP5作为面部浸润性脂肪瘤的治疗靶点。 | 首次通过单细胞转录组测序确定了FKBP5在面部浸润性脂肪瘤中的显著过表达。 | 尚未完全理解PIK3CA变异的具体机制。 | 探讨面部浸润性脂肪瘤的发病机制及其潜在治疗靶点。 | 面部浸润性脂肪瘤患者和非患者的面部脂肪组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 面部脂肪组织样本来源于FIL患者和非FIL个体 |
| 10509 | 2024-08-05 |
Perimenopausal and Menopausal Mammary Glands In A 4-Vinylcyclohexene Diepoxide Mouse Model
2024-Jul-17, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-024-09569-x
PMID:39017946
|
研究论文 | 该论文描述了一种新的小鼠模型，能够表征围绝经期和绝经期乳腺腺体。 | 创新点在于开发了4-乙烯基环己烯二醇小鼠模型，该模型能够精准模拟女性的围绝经期和绝经期状态。 | 该研究未明确提及对模型的其他潜在限制。 | 研究围绝经期和绝经期对乳腺癌的影响。 | 对4-乙烯基环己烯二醇处理的小鼠乳腺进行表征与分析。 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | VCD小鼠模型 | 生物样本 | 实验中使用了处理的小鼠，但具体样本数量未提及 |
| 10510 | 2024-08-05 |
The thalamic reticular nucleus orchestrates social memory
2024-Jul-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.04.013
PMID:38701789
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研究论文 | 本文研究了感觉丘脑网状核中介导社会记忆的parvalbumin阳性神经元 | 揭示了sTRN神经元通过调节新的皮层-丘脑回路协调社会记忆的机制 | 研究中可能未涵盖所有影响社会记忆的神经元类型或回路 | 探讨sTRN神经元在社会记忆中的作用 | 老鼠的parvalbumin阳性神经元及其在社会记忆中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 10511 | 2024-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals cellular and molecular insights into primary Sjögren's syndrome
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33433
PMID:39027515
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研究论文 | 本研究综合分析了基因组、转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，以揭示原发性舍格伦综合征的分子基础 | 通过整合多组学数据，发现CTSS和GSTO1是潜在的生物标志物和治疗靶点 | 需要进一步研究以阐明潜在机制并开发针对这种复杂自身免疫疾病的靶向疗法 | 研究原发性舍格伦综合征的分子基础及探索潜在的治疗靶点 | 研究原发性舍格伦综合征患者的不同血细胞类型的差异表达基因 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 10512 | 2024-08-04 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-Jul, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 该研究探讨了HEC1在胶质瘤中的功能及其对预后的影响 | 首次揭示了HEC1的过表达与胶质瘤预后不良和肿瘤微环境中的免疫抑制相关 | 研究主要集中在细胞实验和RNA-seq分析，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HEC1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤及其细胞系 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 人类胶质瘤组织和细胞系 |
| 10513 | 2024-08-04 |
Opening the Black Box: Spatial Transcriptomics and the Relevance of Artificial Intelligence-Detected Prognostic Regions in High-Grade Serous Carcinoma
2024-Jul, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100508
PMID:38704029
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研究论文 | 本研究探讨了空间转录组学与人工智能识别的与预后相关区域在高等级浆液性癌中的相关性 | 该研究展示了AI引导的空间转录组分析改善了与患者预后相关的生物特征的识别 | 对肿瘤的异质性理解有限，且样本量相对较小 | 提高对高等级浆液性癌患者预后相关生物特征的理解 | 研究对象为16名接受初次减瘤手术和铂类化疗的高等级浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织样本 | 16名患者，分别为8名短期和长期化疗反应组 |
| 10514 | 2024-08-05 |
Integrative profiling of untreated primary membranous nephropathy at the single-cell transcriptome level
2024-Jul, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfae168
PMID:39027416
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研究论文 | 本研究在单细胞转录组水平上综合剖析了未治疗的原发性膜性肾病 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析原发性膜性肾病患者的血液、肾脏和尿液样本，揭示了细胞成分和细胞间通信的变化 | 样本数量较少，仅包含五名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨原发性膜性肾病的发病机制与潜在的干预策略 | 五名经活检证实的原发性膜性肾病患者 | 数字病理学 | 原发性膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液、肾脏和尿液样本 | 五名患者的血液、肾脏和尿液样本 |
| 10515 | 2024-08-05 |
Selectively T cell phosphorylation activation of azvudine in the thymus tissue with immune protection effect
2024-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.03.032
PMID:39027259
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研究论文 | 本研究探讨了药物Azvudine在胸腺组织中选择性激活T细胞磷酸化的作用及其免疫保护效果 | 研究表明胸腺的免疫细胞对氟呱韦(FNC)表现出较强的代谢能力，并强调了磷酸化激酶在NA药物性质评估中的重要性 | 本研究主要在大鼠和树猕猴模型中进行，可能缺乏对人类患者的直接适用性 | 探讨Azvudine在处理COVID-19患者时的免疫保护机制 | 该研究的对象为大鼠和SARS-CoV-2树猕猴的胸腺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，平行反应监测（PRM） | NA | RNA，蛋白质 | NA |
| 10516 | 2024-08-05 |
scBoolSeq: Linking scRNA-seq statistics and Boolean dynamics
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011620
PMID:38976751
|
研究论文 | 提出了一种名为scBoolSeq的方法，旨在将scRNA-seq数据与基因的布尔激活状态双向链接。 | scBoolSeq能够通过计算统计标准和适应基因相关参数的概率模型，成功实现对scRNA-seq数据的二值化和从布尔模型生成合成数据。 | 将scRNA-seq数据特征与布尔状态链接是一项具有挑战性的任务。 | 研究目的在于实现scRNA-seq数据与布尔动力学之间的连接，以促进数据驱动的模型构建和验证。 | 研究对象包括基因及转录因子的激活状态以及scRNA-seq数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用参考的scRNA-seq数据集进行案例研究，具体样本量未明确说明 |
| 10517 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
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研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型，并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA |
| 10518 | 2024-08-05 |
Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06699-2
PMID:38886351
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研究论文 | 本研究提出了一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，显著提高了患者的抗肿瘤免疫反应 | 首次提出聚焦于SAMD4B-APOA2-PD-L1轴的协同免疫化疗，组合了三种常见抗肿瘤药物以提高肝细胞癌患者的三年生存率 | 缺乏更大规模临床试验的验证以及长期效果的数据 | 提高晚期肝细胞癌患者的预后和生存率 | 晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色 | NA | 文本 | 包括临床实践中的晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 |
| 10519 | 2024-08-05 |
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1735
PMID:38899748
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研究论文 | 本研究深入探讨了肿瘤线粒体外膜通透性活动对免疫的影响 | 创新性地开发了MOMP特征（MOMP.Sig）以准确反映肿瘤MOMP活动，并使用机器学习模型展示了其临床预测价值 | NA | 明确肿瘤MOMP对免疫及免疫疗法效果的影响，指导更有效的免疫治疗策略 | 分析了包括30种癌症类型转录组和免疫疗法转录组在内的综合数据集 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涉及30种癌症类型的转录组和20个免疫治疗转录组以及3个免疫治疗scRNA-seq数据集 |
| 10520 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics of gastric cancer brain metastasis reveals atypical vasculature strategies with supportive immune profiles
2024, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goae067
PMID:39027914
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌脑转移中不典型血管化策略和支持性免疫特征的空间转录组学。 | 本研究展示了肿瘤与免疫成分之间的空间互动，特别是不同的血管招募策略，提供了对GCBM的新的分子见解。 | 该研究的样本数量有限，仅研究了三例GCBM患者，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究胃癌脑转移患者中不同细胞成分之间的空间相互作用，尤其是血管系统与脑微环境的关系。 | 研究对象为三名胃癌脑转移患者的肿瘤、免疫和脑组织区域。 | 数字病理学 | 胃癌 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 三名胃癌脑转移患者的140个区域 |