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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10501 | 2025-10-07 |
Early clinical outcomes and molecular smooth muscle cell phenotyping using a prophylactic aortic arch replacement strategy in Loeys-Dietz syndrome
2023-11, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2023.07.023
PMID:37500053
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研究论文 | 本研究评估了Loeys-Dietz综合征患者预防性主动脉弓置换术的临床风险和血流动力学后果,并通过单细胞RNA测序表征平滑肌细胞表型 | 首次结合预防性主动脉弓置换术的临床评估与单细胞RNA测序分析,揭示Loeys-Dietz综合征主动脉平滑肌细胞的表型连续变化谱 | 样本量较小(Loeys-Dietz综合征患者n=8),随访时间较短(中位2年) | 评估预防性主动脉弓置换术在Loeys-Dietz综合征中的安全性和有效性,并探究疾病相关的平滑肌细胞分子表型 | Loeys-Dietz综合征患者、马凡综合征患者、无主动脉病变的对照患者及器官捐献者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,四维血流磁共振成像,组织学评估 | NA | 基因表达数据,医学影像数据,组织学数据 | 8例Loeys-Dietz综合征患者,5例马凡综合征患者,5例对照患者,2例器官捐献者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10502 | 2025-10-07 |
Endothelial senescence induced by PAI-1 promotes endometrial fibrosis
2025-Mar-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02377-0
PMID:40050610
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)诱导的内皮细胞衰老促进子宫内膜纤维化的机制 | 首次揭示PAI-1通过uPAR受体诱导内皮细胞衰老在宫腔粘连发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制 | 宫腔粘连患者和小鼠模型中的内皮细胞与基质细胞 | 单细胞生物学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10503 | 2025-10-07 |
[Explorations about the correlation between biological changes of meninges in periodontitis mice and cognitive impairment via single-cell RNA sequencing]
2024-Jun-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙周炎小鼠脑膜的生物学变化,探讨其与认知障碍的潜在关联 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统分析牙周炎小鼠脑膜的细胞组成和基因表达变化,揭示脑膜免疫与屏障功能在牙周炎相关认知障碍中的作用 | 样本量有限(30只小鼠),仅使用C57BL/6小鼠品系,未涉及其他动物模型或人类样本验证 | 阐明牙周炎小鼠脑膜生物学变化与认知障碍之间的相关性 | C57BL/6小鼠(实验组15只,对照组15只) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,免疫组织化学,基因本体富集分析,KEGG通路分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,行为学数据,分子生物学数据 | 30只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10504 | 2025-10-07 |
Single Cell Analysis of Human Colonoids Exposed to Uranium-Bearing Dust
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13855
PMID:38771937
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类结肠类器官暴露于含铀粉尘后的分子和细胞变化 | 首次在人类结肠类器官模型中揭示含铀粉尘暴露对肠道上皮细胞谱系分化的特异性影响,特别是对分泌谱系细胞(肠内分泌细胞)的异常分化 | 仅使用三个生物学上不同的供体样本,样本量有限;仅研究急性暴露效应,未评估长期暴露影响 | 确定结肠在响应含铀粉尘暴露时发生的分子和细胞变化 | 人类结肠类器官 | 单细胞组学 | 环境暴露相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 形态学分析, 成像技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 来自三个不同生物学供体的人类结肠类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10505 | 2025-10-07 |
Targeting Caveolin-1 for enhanced rotator cuff repair: findings from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02359-2
PMID:40044676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肩袖损伤组织中细胞亚群的异质性,并评估Caveolin-1对脂肪细胞浸润的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示Cav-1表达与成脂活性的负相关性,并验证其作为治疗靶点的潜力 | NA | 探索Caveolin-1在肩袖损伤修复中的作用机制 | 肩袖损伤组织中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10506 | 2025-10-07 |
Identification of increased dedifferentiation along the Prom1+ cancer cells in Müllerian adenosarcoma with sarcomatous overgrowth
2025-Mar, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02943-4
PMID:39920368
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析苗勒管腺肉瘤中Prom1+癌细胞谱系的异质性和去分化过程 | 首次在MASO中发现Prom1+癌细胞存在三种表型分化轨迹,并鉴定出HMGB2/3+亚型为主要的去分化样癌细胞 | 样本量较小,研究聚焦于单一癌症类型 | 探究苗勒管腺肉瘤伴肉瘤样过度生长的肿瘤发生机制 | MASO肿瘤组织及配对正常组织 | 单细胞测序 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,体外实验 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据,TCGA数据,免疫组化图像 | MASO和配对正常组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10507 | 2025-10-07 |
PCBP2 promotes immune evasion via cGAS-STING pathway in biochemical recurrence of prostate cancer
2025-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250173
PMID:40051782
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研究论文 | 本研究探索前列腺癌中癌症内在免疫逃逸相关基因,并开发了预测生化复发的风险特征 | 首次发现PCBP2通过抑制cGAS-STING通路促进前列腺癌免疫逃逸,并建立了基于CIERGs的生化复发预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索前列腺癌免疫逃逸机制并开发生化复发预测模型 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | TCGA-PRAD和GSE70769队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
10508 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型,并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限(79例患者),需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞,来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10509 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptome and metabolome landscapes of cotton somatic embryos
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-55870-6
PMID:39833155
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学技术,揭示了棉花体细胞胚胎发育过程中的时空基因表达和代谢模式 | 首次在棉花中应用单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学的整合分析方法,构建了公开可用的网络资源数据库 | 棉花体细胞胚胎发生过程仍然存在难以操作的问题,研究可能受限于样本获取的难度 | 解析棉花体细胞胚胎发生过程中的基因表达重编程机制 | 棉花体细胞胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
10510 | 2025-10-07 |
AI applications in HIV research: advances and future directions
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1541942
PMID:40051479
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综述 | 探讨人工智能在HIV研究中的应用进展及未来发展方向 | 整合人工智能与单细胞测序等技术,实现精准生物标志物识别和改进治疗靶向 | 存在数据限制和模型可解释性等挑战 | 探索人工智能技术在HIV研究各领域的应用进展 | 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)和获得性免疫缺陷综合征(AIDS) | 机器学习 | 艾滋病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10511 | 2025-10-07 |
Comprehensive multi-omics integration uncovers mitochondrial gene signatures for prognosis and personalized therapy in lung adenocarcinoma
2024-Oct-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05754-y
PMID:39434164
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研究论文 | 通过整合多组学数据开发基于线粒体相关基因的预后模型,用于肺腺癌的预后评估和个性化治疗 | 首次将单细胞RNA测序与转录组数据结合,聚焦线粒体相关基因,开发AI驱动的预后特征模型 | 基于公开数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 阐明线粒体相关基因在肺腺癌中的预后价值并开发个性化治疗策略 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | 集成机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA-LUAD数据集及多个独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
10512 | 2025-10-07 |
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005
PMID:39122180
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学探索小鼠睑板腺功能障碍中细胞组成、分化和基因表达的变化 | 首次结合单细胞和空间转录组学揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的层次表达模式,以及年龄和Awat2基因缺失对腺体功能的影响 | 研究仅限于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究年龄和功能障碍对睑板腺群体动态的影响机制 | 野生型C57Bl/6小鼠和Awat2基因敲除小鼠的睑板腺组织 | 空间转录组学 | 睑板腺功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 年轻(6月)和老年(22月)野生型小鼠,年轻(3月)和老年(13月)Awat2 KO小鼠 | Resolve Biosciences | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Molecular Cartography | 100基因睑板腺特异性Molecular Cartography面板 |
10513 | 2024-08-07 |
[Research progress of single-cell RNA sequencing in airway type 2 inflammatory diseases]
2023-12-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10514 | 2025-10-07 |
Heterogeneities of Site-Specific N-Glycosylation in the Hippocampus of Depression-like Behavior Models in Mice Induced by Acute Stress and Chronic Stress
2025-Mar-07, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00655
PMID:39992808
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研究论文 | 通过整合N-糖蛋白组学和蛋白质组学分析,研究急性和慢性应激诱导的小鼠抑郁样行为模型中海马区糖蛋白和位点特异性糖基化的异质性 | 首次在急性和慢性应激抑郁模型中系统分析海马区位点特异性N-糖基化异质性,并发现两种应激模式对糖基化的不同影响模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本量相对有限 | 探索应激诱导抑郁的糖基化机制 | 对照组、急性应激组和慢性温和应激组小鼠的海马组织 | 蛋白质组学 | 抑郁症 | N-糖蛋白组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | tSNE | 蛋白质组数据、糖基化数据、单细胞转录组数据 | 三组小鼠海马组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10515 | 2025-03-08 |
Erratum for the Research Article "Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria" by A. Sarfatis et al
2025-Mar-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0881
PMID:40048545
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10516 | 2024-10-04 |
Unravelling lipidomic disruptions across multiple tissues in Chd8-mutant ASD mice through integration of lipidomics and single-cell transcriptomics
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332972
PMID:39358004
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10517 | 2025-10-07 |
Adipose-derived stem cells attenuate rheumatoid arthritis by restoring CX3CR1+ synovial lining macrophage barrier
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04144-5
PMID:40038808
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源干细胞通过恢复CX3CR1+滑膜巨噬细胞屏障来缓解类风湿关节炎的机制 | 首次揭示ADSCs通过线粒体转移改善CX3CR1+巨噬细胞能量代谢并促进屏障修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究ADSCs治疗类风湿关节炎的分子机制及其与CX3CR1+巨噬细胞的相互作用 | 血清转移诱导的关节炎模型小鼠和CX3CR1+滑膜巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 线粒体移植 | NA | 基因表达数据 | 关节炎模型小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
10518 | 2025-10-07 |
GCLink: a graph contrastive link prediction framework for gene regulatory network inference
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf074
PMID:39960893
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研究论文 | 提出一种基于图对比学习的链接预测框架GCLink,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 引入图对比学习策略聚合基因的特征和邻域信息,减少对样本量的依赖并提升预测潜在基因调控相互作用的能力 | 未明确说明模型在极稀疏数据场景下的性能表现 | 开发能够从单细胞RNA测序数据准确推断基因调控网络的计算方法 | 基因调控网络和基因间调控相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习链接预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10519 | 2025-10-07 |
Benchmarking copy number aberrations inference tools using single-cell multi-omics datasets
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf076
PMID:40037644
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研究论文 | 本研究对五种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的计算方法进行了全面性能评估 | 首次对单细胞多组学数据集中的拷贝数变异推断工具进行独立综合基准测试 | 仅评估了五种计算方法,可能未涵盖所有可用工具 | 评估和比较从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的计算工具性能 | 五种最先进的拷贝数变异推断计算方法 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10520 | 2025-10-07 |
Single cell immunoprofile of synovial fluid in rheumatoid arthritis with TNF/JAK inhibitor treatment
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57361-0
PMID:40038288
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者滑膜液中免疫细胞的特征及其在TNF/JAK抑制剂治疗后的变化 | 首次在单细胞水平揭示滑膜液来源的致病细胞(SPP1巨噬细胞和CXCL13CD4 T细胞)在类风湿关节炎治疗中的功能作用及细胞间通讯机制 | 样本量有限,主要关注滑膜液细胞而未全面分析其他组织类型 | 研究类风湿关节炎患者滑膜液中致病细胞在TNF/JAK抑制剂治疗过程中的变化机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜液样本和胶原诱导关节炎小鼠模型 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎患者滑膜液样本(治疗前后对比) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |