单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10481 - 10500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10481 | 2025-10-07 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
|
研究论文 | 介绍Seq-Scope协议，将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 | 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 | 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备，方法复杂度较高 | 建立高分辨率空间转录组学分析协议 | 多种生物组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 无分割分析方法 | 图像, 转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina测序流动池，支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析 |
| 10482 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示细菌和过氧化氢酶与瘢痕疙瘩疾病的关联 | 首次综合运用微生物组、宏蛋白质组、代谢组、单细胞转录组和CDX小鼠模型研究细菌在瘢痕疙瘩中的作用机制 | 研究样本量有限，未明确说明具体样本数量 | 探索细菌在瘢痕疙瘩疾病发生发展中的作用机制 | 瘢痕疙瘩组织、健康皮肤组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、BALB/c雌性裸鼠 | 多组学分析 | 瘢痕疙瘩 | 16S rRNA测序, 宏蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 细胞源性异种移植模型 | CDX小鼠模型 | 微生物组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10483 | 2025-10-07 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2致死感染过程中的肺部分子和细胞图谱 | 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示SARS-CoV-2感染过程中肺部细胞动态变化和分子机制 | 研究基于转基因小鼠模型，与人类疾病存在物种差异 | 探究SARS-CoV-2在肺部组织中的致病机制和细胞响应 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | K18-hACE2转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10484 | 2025-10-07 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 本研究通过CD8+淋巴细胞耗竭实验证明其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在灵长类动物模型中系统证明CD8+淋巴细胞对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并揭示其多功能细胞毒性特征 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，未在人类中验证 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 食蟹猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 食蟹猴实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10485 | 2025-10-07 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现重症COVID-19与鼻咽部真菌定植及鼻腔上皮IL-17反应增强相关 | 首次在单细胞水平揭示重症COVID-19患者鼻咽部真菌定植与IL-17免疫应答的关联 | 样本量有限，真菌检测方法可能存在灵敏度限制 | 探讨COVID-19严重程度与呼吸道真菌定植及局部免疫应答的关系 | COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 先前研究队列的子集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10486 | 2025-10-07 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
|
研究论文 | 本研究揭示了严重COVID-19患者CD4+ T细胞功能失调与TNF-α/TNFR1信号通路的依赖性关系 | 首次证明严重COVID-19中CD4+ T细胞功能失调依赖于TNF-α/TNFR1通路，且TNF-α阻断能挽救T细胞功能 | 研究样本量有限，需要更大规模研究验证TNF-α阻断治疗的临床效益 | 探究严重COVID-19患者T细胞功能失调的免疫机制 | 148名严重COVID-19患者及轻度康复患者的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 148名严重COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10487 | 2025-10-07 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
|
研究论文 | 通过多模态方法研究猕猴肺肉芽肿，揭示结核病控制的细胞相关性 | 首次通过共配准纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量，系统识别肉芽肿中细菌控制的细胞相关性 | 研究仅限于猕猴模型，人类肉芽肿可能存在差异 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制与持续的细胞和分子机制 | 食蟹猕猴肺结核肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, PET-CT成像 | NA | 影像数据, 基因表达数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10488 | 2025-10-07 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析揭示了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2通路加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次发现CD177+中性粒细胞是脓毒症肺组织中的主要中性粒细胞亚群，并阐明其通过NETs激活AIM2炎症小体加重肺损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；样本量相对有限 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤的免疫细胞异质性及其关键作用机制 | CLP模型小鼠的肺组织免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据,基因表达数据 | CLP模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10489 | 2025-10-07 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
|
综述 | 本文回顾了TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的研究历程与临床转化潜力 | 首次系统梳理TREM2从基础研究到治疗干预的转化路径，提出其作为动脉粥样硬化新型治疗靶点的可行性 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的理论基础与临床应用前景 | 动脉粥样硬化斑块中的泡沫样巨噬细胞及TREM2阳性髓系细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10490 | 2025-10-07 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 本研究通过计算分析方法探讨了染色体外DNA在膀胱尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示了ecDNA在膀胱癌中的时空多样性特征，阐明了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制，并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子表达逃避免疫监视 | 研究主要基于计算分析，需要进一步实验验证ecDNA的功能机制；样本来源相对单一 | 探究ecDNA在膀胱尿路上皮癌进化过程中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 595例膀胱尿路上皮癌患者 | 计算生物学 | 膀胱癌 | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因组测序数据，单细胞转录组数据 | 595例患者，包含多区域采样 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10491 | 2025-03-11 |
Corrigendum to "ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost" [Microbiol. Res. 289 (2024) 127912]
2025-Mar-08, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128137
PMID:40058996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10492 | 2025-10-07 |
Sustained NF-κB activation allows mutant alveolar stem cells to co-opt a regeneration program for tumor initiation
2025-Mar-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.011
PMID:39978341
|
研究论文 | 本研究通过命运图谱和单细胞转录组学揭示了肺再生与肿瘤发生之间的相似性，发现持续NF-κB激活使突变肺泡干细胞劫持再生程序启动肿瘤 | 发现两个独立的AT2干细胞亚群具有不同的致瘤能力，揭示Il1r1作为AT2重编程的共同激活因子，阐明NF-κB持续激活是肿瘤发生与再生区别的关键机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究干细胞命运调控信号破坏如何导致肿瘤发生 | 小鼠野生型和KrasG12D突变型肺泡II型干细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 命运图谱、克隆分析、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 数千个小鼠AT2干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10493 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-Mar-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
|
研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合肺芯片模型和单细胞RNA测序技术揭示IAV和SP共感染诱导的独特转录组变化，特别是ZO-1表达下调和定位异常的分子机制 | 研究基于体外肺芯片模型，可能与体内真实肺部环境存在差异 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制 | 人肺芯片模型、肺上皮细胞、外周血单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序、GO富集分析、多重微珠免疫分析、免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10494 | 2025-10-07 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态的新机制 | 首次发现乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白实现免疫拟态，并证明CD69表达赋予肿瘤细胞增殖优势 | 需要进一步评估免疫拟态在乳腺癌预后分层中的临床应用价值 | 探究乳腺癌细胞免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理标本、乳腺癌细胞系及小鼠乳腺癌症模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织标本、细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10495 | 2025-10-07 |
Endoplasmic reticulum stress and unfolded protein response play roles in recurrent pregnancy loss: A bioinformatics study
2025-Mar, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104446
PMID:39923360
|
研究论文 | 通过生物信息学方法探讨内质网应激和未折叠蛋白反应在复发性流产中的作用机制 | 首次整合多组学数据系统分析ERS/UPR在RPL中的作用，发现单核/巨噬细胞中相关基因表达上调 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索ERS和UPR过程作为复发性流产预防、诊断和治疗潜在靶点的可能性 | 复发性流产患者基因表达数据 | 生物信息学 | 复发性流产 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE165004和GSE26787数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10496 | 2025-10-07 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.636505
PMID:40027655
|
研究论文 | 提出了一种用于评估空间转录组学聚类性能的计算框架STEAM | 开发了首个专门针对空间转录组学数据的聚类评估算法和指标，能够同时考虑空间邻近性和基因表达模式 | NA | 解决空间转录组学聚类结果验证的挑战，提供标准化评估框架 | 空间转录组学数据的聚类结果 | 生物信息学 | NA | 机器学习分类和预测方法 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 10497 | 2025-10-07 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638195
PMID:40027720
|
研究论文 | 提出一种跨空间转录组学平台的联合插补和解卷积算法SIID | 开发了首个能够同时处理空间转录组数据插补和解卷积的联合非负矩阵分解模型 | 方法性能依赖于不同平台数据间的空间对齐质量 | 整合不同空间分辨率和基因覆盖度的空间转录组数据 | 人类乳腺癌和结肠癌组织切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结肠癌 | 空间转录组测序 | 联合非负矩阵分解模型 | 基因表达矩阵, 空间位置信息 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium（全转录组多细胞分辨率）, 10x Xenium（数百基因亚细胞分辨率） |
| 10498 | 2025-10-07 |
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127912
PMID:39326350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-葡聚糖训练通过激活Th17细胞缓解鲆鱼肠道炎症的机制 | 首次在硬骨鱼中发现训练免疫通过调节肠道Th17细胞功能对抗细菌感染的机制 | 研究仅限于鲆鱼模型，尚未在其他物种验证 | 探究硬骨鱼肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 | 鲆鱼(Scophthalmus maximus)肠道免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10499 | 2025-10-07 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
|
研究论文 | 本研究探讨年龄相关的细胞外基质硬化通过TRAIL通路影响肌肉干细胞分化的机制 | 首次揭示年龄相关的ECM硬化通过激活TRAIL通路导致肌肉干细胞向成纤维细胞分化的新机制 | 研究主要关注TRAIL通路，可能还存在其他未被发现的调控机制 | 探究年龄相关ECM硬化对肌肉干细胞分化的分子机制 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 年轻和年老肌肉干细胞在软/硬基质上的四种培养条件 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10500 | 2025-10-07 |
Reciprocal regulation of SIRT1 and AMPK by Ginsenoside compound K impedes the conversion from plasma cells to mitigate for podocyte injury in MRL/lpr mice in a B cell-specific manner
2024-Mar, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2023.11.006
PMID:38465215
|
研究论文 | 本研究揭示人参皂苷化合物K通过SIRT1和AMPK的相互调节机制，以B细胞特异性方式缓解狼疮肾炎小鼠的足细胞损伤 | 首次发现人参皂苷CK通过调节B细胞亚群中SIRT1和AMPK的协同作用，抑制浆细胞转化，从而减轻免疫复合物沉积 | 研究仅限于MRL/lpr小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨人参皂苷CK在狼疮肾炎中对B细胞亚群和足细胞保护的作用机制 | 雌性MRL/lpr狼疮易感小鼠 | 分子生物学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、代谢组学分析、免疫印迹、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |