单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10461 - 10480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10461 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
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研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 |
| 10462 | 2024-08-05 |
Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation
2024-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248
PMID:38871242
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络 | 创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性 | 研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性 | 旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系 | 研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠骨髓细胞样本 |
| 10463 | 2024-08-05 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-Aug, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
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研究论文 | 本文构建了一种新的5-FU耐药相关预后标志物，以预测结直肠癌患者的化疗和免疫治疗效果 | 建立并验证了5-FU耐药相关标志物5-FRSig模型，并与多个临床特征及治疗效果相关联 | 未提及具体的样本数量和相关数据的全面性 | 构建5-FU耐药相关标志物以预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，定量实时聚合酶链反应（RT-qPCR） | 统计回归模型 | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列 |
| 10464 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 10465 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |
| 10466 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
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综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10467 | 2024-08-04 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
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综述 | 本文汇编了19种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法 | 提供了一种全面的参考，帮助研究人员选择适合其特定研究目的的整合方法 | 每种方法有其自身的优缺点和适用范围，研究者需要根据实际情况进行选择 | 旨在帮助研究人员了解和选择适合的整合方法以分析scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组测序数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA测序数据 | 19种整合方法 |
| 10468 | 2024-08-04 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 本研究提出了一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法以提高细胞类型识别 | 提出了一种新的高斯噪声增强的对比学习方法(GsRCL)，用于细胞类型识别任务 | 未提及具体的局限性 | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别准确性 | 面向具有挑战性的细胞类型识别任务 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 大规模计算评估 |
| 10469 | 2024-08-05 |
Single-cell immune landscape of measurable residual disease in acute myeloid leukemia
2024-Jul-19, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2666-8
PMID:39034351
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病中可测残留疾病的单细胞免疫景观 | 该论文利用单细胞RNA测序技术，创建了一个包含184,231个细胞的全面免疫景观，并发现MRD阳性和阴性CD8 T细胞在细胞毒性基因表达上的差异 | 本研究样本量较小，仅包含32名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 研究可测残留疾病在急性髓性白血病中的免疫细胞特征及其转化机制 | 源自20名MRD阳性患者和12名MRD阴性患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 32个样本（20个MRD阳性患者和12个MRD阴性患者） |
| 10470 | 2024-08-05 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 通过整合eQTL、GWAS和单细胞转录组数据，确定了与1型糖尿病相关的四个潜在致病基因 | 未提及具体的局限性 | 探讨CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的作用 | 分析1型糖尿病患者与健康对照的胰腺组织中的基因表达 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含1型糖尿病患者和健康对照的胰腺组织样本 |
| 10471 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 |
| 10472 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
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研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 |
| 10473 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 |
| 10474 | 2024-08-05 |
Migration Inhibition Factor Secreted by Peripheral Blood Memory B Cells Binding to CD74-CD44 Receptor Complex Drives Macrophage Behavior in Alzheimer's Disease
2024 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175241238577
PMID:38491918
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研究论文 | 本研究探讨了外周血记忆B细胞分泌的迁移抑制因子如何影响阿尔茨海默病中的巨噬细胞行为 | 发现迁移抑制因子与巨噬细胞上的CD74-CD44受体复合物结合，影响巨噬细胞行为 | NA | 探究外周免疫系统在阿尔茨海默病中的作用，特别是记忆B细胞的影响 | 外周血记忆B细胞及其分泌的迁移抑制因子 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq，免疫荧光及流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 10475 | 2024-08-05 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 本研究探讨了S100A6/S100A11在肝细胞癌（HCC）T细胞免疫调节中的作用 | 首次揭示S100A6/S100A11在HCC T细胞中的差异表达及其与NF-κB途径的相关性 | 未详细探讨其他S100家族蛋白对肝癌免疫的潜在影响 | 研究S100蛋白在肝细胞癌免疫细胞中的作用 | S100A6/S100A11在肝细胞癌及与乙型肝炎相关的HCC中的表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 分析了HCC及与乙型肝炎相关的HCC的单细胞RNA测序数据 |
| 10476 | 2024-08-04 |
Multi-omic approach identifies hypoxic tumor-associated myeloid cells that drive immunobiology of high-risk pediatric ependymoma
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107585
PMID:37694144
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研究论文 | 本研究识别了高风险儿童脊髓膜瘤中促免疫生物学的缺氧肿瘤相关髓系细胞 | 识别了八种不同的髓系衍生亚群，特别是缺氧髓系细胞，它们展示了髓系抑制细胞的特征 | 缺乏关于缺氧髓系细胞在其他肿瘤类型中的作用的研究 | 揭示脊髓膜瘤的免疫环境，以指导免疫治疗 | 高风险儿童脊髓膜瘤的免疫细胞环境和肿瘤亚型 | 数字病理学 | 脊髓膜瘤 | 单细胞测序（scRNAseq）、肿瘤基因表达去卷积、空间蛋白组学、单细胞细胞因子释放测定 | NA | 细胞数据 | 27个单细胞、299个肿瘤样本、54个空间蛋白组样本、12个单细胞细胞因子释放样本 |
| 10477 | 2024-08-05 |
A fibroblast-dependent TGFβ1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis underlies epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551383
PMID:37577522
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研究论文 | 探讨了间质肺疾病中，成纤维细胞与上皮细胞之间相互作用的机制及其对肺上皮变性的影响 | 识别了通过sFRP2介导的TGFβ1-非经典Wnt信号通路在特发性肺纤维化中的新机制 | 本研究的样本大小和临床数据的多样性未在摘要中明确说明 | 研究成纤维细胞与上皮细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及其机制 | 针对间质肺病患者的成纤维细胞和上皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 间质肺病患者的活检样本和正常供体的组织样本 |
| 10478 | 2024-08-05 |
Graphene oxide elicits microbiome-dependent type 2 immune responses via the aryl hydrocarbon receptor
2023-01, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-022-01260-8
PMID:36509925
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研究论文 | 这项研究展示了石墨烯氧化物通过芳香烃受体影响微生物组和免疫反应 | 本研究揭示了石墨烯氧化物对肠道微生物组的调节作用及其通过芳香烃受体介导的免疫反应 | 未提及特定的实验条件或样本的长期效果 | 探索石墨烯氧化物与肠道微生物组及免疫系统相互作用的机制 | 成年斑马鱼及其无菌幼体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年斑马鱼和无菌幼体的细胞样本 |
| 10479 | 2024-08-05 |
Prediction of HLA genotypes from single-cell transcriptome data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1146826
PMID:37180102
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研究论文 | 本文探讨如何从单细胞转录组数据中预测HLA基因型。 | 开发了多个计算HLA分型工具并展示了高准确性的基因型预测模型。 | 尚不清楚从单细胞数据直接预测HLA基因型的可行性。 | 评估和扩展现有HLA基因型预测工具的性能。 | 人类单细胞数据与标准分子基因分型的比较。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 组合模型 | 转录组数据 | NA |
| 10480 | 2024-08-05 |
Establishment of a high-resolution 3D modeling system for studying pancreatic epithelial cell biology in vitro
2019-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2019.09.005
PMID:31767167
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研究论文 | 本文建立了一种高分辨率的三维培养系统，用于研究胰腺上皮细胞生物学 | 本文首次建立了一种简单可重复的基于Matrigel的三维囊泡培养模型，可用于小鼠和人类胰腺前体的研究 | 尚未提及实验证明该系统在体内应用的有效性 | 研究胰腺上皮化和内分泌发育的机制 | 小鼠和人类的胰腺前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 三维囊泡培养模型 | 细胞文化数据 | NA |