单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10461 - 10480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10461 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicles from human-induced pluripotent stem cell-derived neural stem cells alleviate proinflammatory cascades within disease-associated microglia in Alzheimer's disease
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12519
PMID:39499013
|
研究论文 | 本研究探讨人诱导多能干细胞来源神经干细胞胞外囊泡对阿尔茨海默病模型小鼠神经炎症的调节作用 | 首次证明hiPSC-NSC-EVs通过调节小胶质细胞和星形胶质细胞的转录组变化来抑制AD神经炎症信号通路 | 研究仅使用5xFAD小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 开发阿尔茨海默病的疾病修饰疗法 | 3月龄5xFAD转基因小鼠和培养的人类小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | 动物模型 | 基因表达数据，蛋白质数据，行为数据 | 5xFAD小鼠模型和人类小胶质细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10462 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01888-9
PMID:39164479
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中SARS-CoV-2刺突蛋白特异性CD4 T细胞的转录表型差异 | 首次使用深度学习反向表位定位方法Trex定义抗原特异性，并比较疫苗接种与自然感染后CD4 T细胞在淋巴器官和外周血中的表型差异 | 样本时间点仅限于接种后3个月和6个月，未涵盖更长期的免疫反应动态 | 解析mRNA疫苗接种后CD4 T细胞在淋巴组织与血液中的转录表型特征 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗的个体和SARS-CoV-2感染者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞转录组测序，深度学习反向表位定位 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 分析1,277个刺突蛋白特异性CD4 T细胞（含238个通过Trex方法定义） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10463 | 2025-10-07 |
Scupa: Single-cell unified polarization assessment of immune cells using the single-cell foundation model
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.608093
PMID:39229048
|
研究论文 | 开发了首个用于全面分析免疫细胞极化的计算方法Scupa | 首个利用单细胞基础模型系统评估免疫细胞极化的计算方法 | NA | 解决缺乏系统检测细胞因子效应和免疫细胞极化方法的问题 | 免疫细胞极化状态 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | Universal Cell Embeddings基础模型 | 单细胞转录组数据 | 基于免疫词典中14种免疫细胞类型的66种细胞因子驱动极化状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10464 | 2025-10-07 |
Enhanced Complement Expression in the Tumor Microenvironment Following Neoadjuvant Therapy: Implications for Immunomodulation and Survival in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4104258/v1
PMID:38798691
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响，发现补体基因表达上调与患者生存改善相关 | 首次揭示新辅助治疗通过上调肿瘤微环境中补体基因表达重塑免疫微环境，并发现补体表达水平与患者预后相关 | 样本量有限（36例患者），需要更大规模研究验证 | 探究新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的特异性影响 | 23例接受新辅助治疗和13例未接受新辅助治疗的胰腺导管腺癌患者 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36例胰腺导管腺癌患者（23例治疗组，13例对照组） | NA | 空间转录组学,snRNA-seq | NA | NA |
| 10465 | 2025-10-07 |
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590986
PMID:38712156
|
研究论文 | 本研究通过建立新生和成年小鼠血管纹器官型外植体模型并结合单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 首次建立了保留血-迷路屏障完整性的新生和成年血管纹器官型外植体模型，并结合单细胞RNA测序揭示了发育特异性基因表达谱 | 研究主要基于小鼠模型，人类血管纹可能存在物种特异性差异 | 研究血管纹在发育和成熟过程中的分子差异，为听力损失治疗提供新见解 | 新生和成年小鼠的血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，器官型外植体培养，药理学干预 | 小鼠器官型外植体模型 | 单细胞转录组数据，组织学数据 | 新生和成年小鼠血管纹组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10466 | 2025-10-07 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588538
PMID:38645090
|
研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞转录组图谱，系统定义了分泌细胞和免疫细胞群体 | NA | 研究精囊组织的细胞组成和功能，探索其在生殖过程中的作用 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10467 | 2025-10-07 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
|
研究论文 | 介绍Seq-Scope协议，将Illumina测序流动池重新用于高分辨率空间转录组学分析 | 开发了将Illumina测序平台重新用于高分辨率、高通量空间转录组分析的新方法 | 需要Illumina NovaSeq 6000等专业设备，方法复杂度较高 | 建立高分辨率空间转录组学分析协议 | 多种生物组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 无分割分析方法 | 图像, 转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina测序流动池，支持7 mm × 7 mm或更大区域的多组织切片分析 |
| 10468 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示细菌和过氧化氢酶与瘢痕疙瘩疾病的关联 | 首次综合运用微生物组、宏蛋白质组、代谢组、单细胞转录组和CDX小鼠模型研究细菌在瘢痕疙瘩中的作用机制 | 研究样本量有限，未明确说明具体样本数量 | 探索细菌在瘢痕疙瘩疾病发生发展中的作用机制 | 瘢痕疙瘩组织、健康皮肤组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、BALB/c雌性裸鼠 | 多组学分析 | 瘢痕疙瘩 | 16S rRNA测序, 宏蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 细胞源性异种移植模型 | CDX小鼠模型 | 微生物组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10469 | 2025-10-07 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2致死感染过程中的肺部分子和细胞图谱 | 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示SARS-CoV-2感染过程中肺部细胞动态变化和分子机制 | 研究基于转基因小鼠模型，与人类疾病存在物种差异 | 探究SARS-CoV-2在肺部组织中的致病机制和细胞响应 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | K18-hACE2转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10470 | 2025-10-07 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 本研究通过CD8+淋巴细胞耗竭实验证明其在结核病早期控制中的关键作用 | 首次在灵长类动物模型中系统证明CD8+淋巴细胞对结核分枝杆菌早期感染控制的关键作用，并揭示其多功能细胞毒性特征 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，未在人类中验证 | 阐明CD8+淋巴细胞在结核病免疫防御中的功能作用 | 食蟹猴（非人灵长类动物） | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 食蟹猴实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10471 | 2025-10-07 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现重症COVID-19与鼻咽部真菌定植及鼻腔上皮IL-17反应增强相关 | 首次在单细胞水平揭示重症COVID-19患者鼻咽部真菌定植与IL-17免疫应答的关联 | 样本量有限，真菌检测方法可能存在灵敏度限制 | 探讨COVID-19严重程度与呼吸道真菌定植及局部免疫应答的关系 | COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 先前研究队列的子集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10472 | 2025-10-07 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
|
研究论文 | 本研究揭示了严重COVID-19患者CD4+ T细胞功能失调与TNF-α/TNFR1信号通路的依赖性关系 | 首次证明严重COVID-19中CD4+ T细胞功能失调依赖于TNF-α/TNFR1通路，且TNF-α阻断能挽救T细胞功能 | 研究样本量有限，需要更大规模研究验证TNF-α阻断治疗的临床效益 | 探究严重COVID-19患者T细胞功能失调的免疫机制 | 148名严重COVID-19患者及轻度康复患者的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 148名严重COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10473 | 2025-10-07 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
|
研究论文 | 通过多模态方法研究猕猴肺肉芽肿，揭示结核病控制的细胞相关性 | 首次通过共配准纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量，系统识别肉芽肿中细菌控制的细胞相关性 | 研究仅限于猕猴模型，人类肉芽肿可能存在差异 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制与持续的细胞和分子机制 | 食蟹猕猴肺结核肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, PET-CT成像 | NA | 影像数据, 基因表达数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10474 | 2025-10-07 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析揭示了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2通路加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次发现CD177+中性粒细胞是脓毒症肺组织中的主要中性粒细胞亚群，并阐明其通过NETs激活AIM2炎症小体加重肺损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；样本量相对有限 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤的免疫细胞异质性及其关键作用机制 | CLP模型小鼠的肺组织免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据,基因表达数据 | CLP模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10475 | 2025-10-07 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
|
综述 | 本文回顾了TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的研究历程与临床转化潜力 | 首次系统梳理TREM2从基础研究到治疗干预的转化路径，提出其作为动脉粥样硬化新型治疗靶点的可行性 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的理论基础与临床应用前景 | 动脉粥样硬化斑块中的泡沫样巨噬细胞及TREM2阳性髓系细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10476 | 2025-10-07 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 本研究通过计算分析方法探讨了染色体外DNA在膀胱尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示了ecDNA在膀胱癌中的时空多样性特征，阐明了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制，并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子表达逃避免疫监视 | 研究主要基于计算分析，需要进一步实验验证ecDNA的功能机制；样本来源相对单一 | 探究ecDNA在膀胱尿路上皮癌进化过程中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 595例膀胱尿路上皮癌患者 | 计算生物学 | 膀胱癌 | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因组测序数据，单细胞转录组数据 | 595例患者，包含多区域采样 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10477 | 2025-03-11 |
Corrigendum to "ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost" [Microbiol. Res. 289 (2024) 127912]
2025-Mar-08, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128137
PMID:40058996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10478 | 2025-10-07 |
Sustained NF-κB activation allows mutant alveolar stem cells to co-opt a regeneration program for tumor initiation
2025-Mar-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.011
PMID:39978341
|
研究论文 | 本研究通过命运图谱和单细胞转录组学揭示了肺再生与肿瘤发生之间的相似性，发现持续NF-κB激活使突变肺泡干细胞劫持再生程序启动肿瘤 | 发现两个独立的AT2干细胞亚群具有不同的致瘤能力，揭示Il1r1作为AT2重编程的共同激活因子，阐明NF-κB持续激活是肿瘤发生与再生区别的关键机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究干细胞命运调控信号破坏如何导致肿瘤发生 | 小鼠野生型和KrasG12D突变型肺泡II型干细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 命运图谱、克隆分析、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 数千个小鼠AT2干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10479 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-Mar-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
|
研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合肺芯片模型和单细胞RNA测序技术揭示IAV和SP共感染诱导的独特转录组变化，特别是ZO-1表达下调和定位异常的分子机制 | 研究基于体外肺芯片模型，可能与体内真实肺部环境存在差异 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制 | 人肺芯片模型、肺上皮细胞、外周血单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序、GO富集分析、多重微珠免疫分析、免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10480 | 2025-10-07 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态的新机制 | 首次发现乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白实现免疫拟态，并证明CD69表达赋予肿瘤细胞增殖优势 | 需要进一步评估免疫拟态在乳腺癌预后分层中的临床应用价值 | 探究乳腺癌细胞免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理标本、乳腺癌细胞系及小鼠乳腺癌症模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织标本、细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |