单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 10461 - 10480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10461 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human PBMCs in healthy and type 2 diabetes populations: dysregulated immune networks in type 2 diabetes unveiled through single-cell profiling
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1397661
PMID:39072276
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了2型糖尿病患者中免疫网络的失调 | 首次通过单细胞RNA测序特征化了2型糖尿病患者免疫细胞的性质和网络 | 缺乏对其他类型糖尿病和健康人群的比较分析 | 探讨与2型糖尿病相关的免疫细胞的特征 | 健康人和2型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 来自非糖尿病和2型糖尿病患者的外周血单核细胞样本 |
| 10462 | 2024-08-05 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on Clinical Manifestation, Immune Response, and Viral Dynamics in SARS-CoV-2 Coinfection
2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.15.567132
PMID:38014096
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研究论文 | 该研究探讨了慢性HIV感染引起的免疫缺陷对COVID-19的临床表现、免疫反应和病毒动态的影响 | 首次在受控环境中直接研究了慢性HIV感染在COVID-19和病毒持续性感染中的影响 | 样本数量较少，只使用了两只猕猴进行实验，结果的普适性有限 | 研究SIV诱导的免疫缺陷如何影响SARS-CoV-2的临床表现和病毒动态 | 两只慢性SIV感染的豚尾猕猴与之前未感染SIV的猕猴进行比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 2只SIV感染的猕猴 |
| 10463 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal mapping of immune and stem cell dysregulation after volumetric muscle loss
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162835
PMID:36821376
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研究论文 | 本研究探讨了体积肌肉损失后免疫细胞和干细胞失调的时空分布 | 创新点在于使用空间转录组学揭示了在VML反应中纤维化与炎性巨噬细胞与间充质来源细胞之间的细胞间相互作用 | 未提及具体的限制 | 研究体积肌肉损失后细胞间的通讯及其对肌肉修复的影响 | 以小鼠模型为对象，研究VML后的细胞行为 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 小鼠模型 | NA | NA |
| 10464 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals unique monocyte-derived interstitial macrophage subsets during lipopolysaccharide-induced acute lung inflammation
2023-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2022
PMID:36852927
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研究论文 | 本研究揭示了在脂多糖诱导的急性肺炎症期间独特的单核细胞源间质巨噬细胞亚群 | 研究深入探讨了间质巨噬细胞的起源、亚群及转录组特征，并提出了其特定功能的可能性 | 缺乏对IMs在不同类型炎症中的作用的全面理解 | 特征化间质巨噬细胞在稳态和急性肺炎症中的起源及亚群 | 研究对象为小鼠肺中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了小鼠模型及其肺组织样本 |
| 10465 | 2024-08-05 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
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研究论文 | 本文章介绍了一种新的神经网络方法UNIFAN，用于对单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据进行细胞功能注释和聚类 | UNIFAN将细胞聚类和注释结合在一起，利用已知基因集来改善细胞类型分配，具有创新性 | 缺乏对不同细胞类型间复杂相互作用的深入分析 | 开发一种新的无监督方法来提高单细胞RNA-seq数据的细胞类型分配准确性 | 人类和小鼠的单细胞RNA-seq数据集，来源于多个不同的器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 多个不同器官的不同样本 |
| 10466 | 2024-08-05 |
Identifying cell state-associated alternative splicing events and their coregulation
2022-Jul-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276109.121
PMID:35858747
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研究论文 | 本研究提出了一种新的方法Psix，以识别单细胞中的替代剪接事件及其共调控 | Psix方法利用稳健的概率模型，能够在数据限制下自信地识别替代剪接，从而揭示细胞类型依赖的剪接模式和调控网络 | 该方法依赖于单细胞RNA测序的质量和数据，可能受到样本质量的限制 | 揭示替代剪接如何影响单细胞转录组和细胞身份 | 使用小鼠大脑发育过程中的数据来研究替代剪接模式 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 概率模型 | RNA序列数据 | NA |
| 10467 | 2024-08-05 |
Zebrafish transposable elements show extensive diversification in age, genomic distribution, and developmental expression
2022-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275655.121
PMID:34987056
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼转座元件（TEs）的群体学特征和基因组分布及其在胚胎发育中的表达 | 揭示了斑马鱼中近2000个不同TE家族的多样性，并显示出TE在发育过程中的动态表达模式 | 目前对斑马鱼TE的研究仍然不足，表征还不够详细 | 探讨转座元件对脊椎动物发育的影响 | 斑马鱼转座元件及其在胚胎发育中的表达 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了大量和单细胞RNA测序数据 |
| 10468 | 2024-08-05 |
TNFR2 pathways are fully active in cancer regulatory T cells
2022-Feb-24, Bioscience, biotechnology, and biochemistry
DOI:10.1093/bbb/zbab226
PMID:35015831
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研究论文 | 本研究阐明了肿瘤坏死因子受体2 (TNFR2) 在癌症调节性T细胞中的信号传导机制 | 研究首次揭示了TNFR2在癌症Treg中的多个通路的全面激活 | 信号机制尚未完全阐明，可能影响结果的全面性 | 旨在明确TNFR2在人体调节性T细胞中的信号传导 | 研究对象为接受TNFR2激动剂抗体处理的人类调节性T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 扩增子测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10469 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10470 | 2024-08-05 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
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研究论文 | 本文揭示了健康成年人肺泡和小气道中存在的转录性不同的巨噬细胞亚群 | 首次描述了健康状态下肺间隙免疫细胞的保守异质性，并识别了两种新型巨噬细胞亚群 | 样本仅限于十名健康成年人，可能不具备广泛适用性 | 理解健康状态下肺间隙巨噬细胞的转录异质性 | 健康成年人气道灌洗液中获取的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 十名健康成年人 |
| 10471 | 2024-08-05 |
A reference single-cell transcriptomic atlas of human skeletal muscle tissue reveals bifurcated muscle stem cell populations
2020-07-06, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-020-00236-3
PMID:32624006
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研究论文 | 本文提供了人类骨骼肌组织的单细胞转录组数据集，揭示了肌肉干细胞的两种亚群体 | 通过细胞群体的无监督聚类，识别了16种不同的肌肉细胞群体，并描述了早期激活的肌肉干细胞亚群及其转录特征 | 未提及具体的样本限制或研究限制 | 研究人类骨骼肌组织的异质性及其在疾病背景下的干细胞多样性和失调 | 来自10名成年供体的肌肉样本 | 数字病理学 | 肌肉萎缩疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名成年供体的肌肉样本 |
| 10472 | 2024-08-05 |
Enhancing droplet-based single-nucleus RNA-seq resolution using the semi-supervised machine learning classifier DIEM
2020-07-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-67513-5
PMID:32620816
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研究论文 | 本文提出了一种新方法DIEM，旨在提高单核RNA测序的分辨率。 | 创新点在于使用期望最大化的方法定量评估污染并过滤snRNA-seq实验中的液滴。 | 虽然DIEM设计用于snRNA-seq，但其在单细胞RNA-seq数据上的效果未给出具体的评价。 | 研究目标是提高单核RNA测序中的污染分析和液滴过滤的精确度。 | 研究对象包括三组snRNA-seq数据集，涉及人类前脂肪细胞、鼠脑组织和人类冷冻脂肪组织。 | 机器学习 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 三个snRNA-seq数据集，涉及六个个体的人类冷冻脂肪组织 |
| 10473 | 2024-08-05 |
Cell atlas of the foetal human heart and implications for autoimmune-mediated congenital heart block
2020-07-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz257
PMID:31589297
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研究论文 | 本研究探讨了人类胎心的单细胞转录组和自体免疫介导的先天性心脏阻滞(CHB)的影响。 | 首次识别和表征了心脏中以前未被描述的多样化内皮细胞亚群，并发现了CHB心脏中不同细胞类型的干扰素反应的增加与异质性。 | 样本量较小，仅包含三个人类健康胎心和一个受CHB影响的胎心，可能影响研究结果的普适性。 | 旨在通过分子特征化正常心脏功能所需的细胞类型来深入理解人类心脏发育。 | 研究对象为人类胎心的单细胞转录组，包括健康胎心和与抗SSA/Ro相关的CHB样本。 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个样本，包括三个健康胎心和一个CHB受影响的胎心 |
| 10474 | 2024-08-05 |
Deciphering the regulatory landscape of fetal and adult γδ T-cell development at single-cell resolution
2020-07-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104159
PMID:32627520
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研究论文 | 本文建立了胎儿和成人γδ T细胞分化的高分辨率图谱 | 揭示了未极化的胸腺群体，并识别了胎儿和成人γδ T细胞分化过程中活跃的基因网络的显著相似性 | 对胸腺中γδ T细胞分化的所有方面仍未完全理解 | 探讨胎儿和成人γδ T细胞的发展和分化机制 | 胎儿和成人的γδ T细胞及其在免疫反应中的角色 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Sox13、Maf和Rorc敲除小鼠进行组合的单细胞分析 |
| 10475 | 2024-08-05 |
Mouse Retinal Cell Atlas: Molecular Identification of over Sixty Amacrine Cell Types
2020-07-01, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0471-20.2020
PMID:32457074
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研究论文 | 本研究使用高通量单细胞RNA测序对小鼠的阿马克林细胞进行分子鉴定，识别出63种细胞类型 | 首次全面分类并分子特征化超过60种阿马克林细胞类型，且发现许多新的细胞类型 | 未明确指出研究限制 | 研究小鼠视网膜内阿马克林细胞的多样性及其分子特征 | 来自小鼠（两性别）超过32,000个阿马克林细胞 | 数字病理学 | NA | 高通量单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过32,000个小鼠阿马克林细胞 |
| 10476 | 2024-08-05 |
T Cell-Expressed microRNA-155 Reduces Lifespan in a Mouse Model of Age-Related Chronic Inflammation
2020-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901484
PMID:32161096
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研究论文 | 本研究报告了T细胞中miR-155对miR-146a小鼠寿命缩短的影响。 | 本研究揭示了miR-155通过影响效应T细胞的活化和代谢重编程在衰老相关慢性炎症中起关键作用。 | 本研究的局限性在于只在小鼠模型中进行，可能无法完全应用于人类。 | 研究T细胞中特定miRNA对寿命和炎症老化的调节作用。 | 研究对象为miR-146a缺失的小鼠及其T细胞。 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 小鼠生物样本 | 超过15个月大的小鼠 |
| 10477 | 2024-08-05 |
Human primitive brain displays negative mitochondrial-nuclear expression correlation of respiratory genes
2018-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.226324.117
PMID:29903725
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研究论文 | 本文探讨了人类原始大脑中线粒体与核基因间呼吸基因的负表达相关性 | 首次揭示了在原始大脑区域内线粒体和核基因表达的负相关性，并分析了其与细胞类型及空间分布的关系 | 仅分析了人类和小鼠大脑的特定部位，可能不适用于其他区域或物种 | 探讨线粒体和核基因在氧化磷酸化中的共同调控机制 | 人类和小鼠大脑的RNA-seq实验数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, DNase-seq, ChIP-seq | NA | RNA数据 | 分析了来自48个人体部位的约8500个RNA-seq实验 |
| 10478 | 2024-08-05 |
Reconstructing differentiation networks and their regulation from time series single-cell expression data
2018-Mar-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.225979.117
PMID:29317474
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研究论文 | 本研究开发了一种方法，通过整合表达相似性与调控信息来重建动态的发育细胞轨迹 | 该方法不仅考虑了基因表达水平的相似性，还整合了转录因子的调控信息以改善细胞谱系重建 | 该方法在样本多样性、不同步的细胞种群中可能表现不佳 | 旨在通过单细胞RNA测序数据生成详细准确的器官发生模型 | 主要研究小鼠肺部发育数据中的细胞类型和谱系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | 概率模型 | 单细胞表达数据 | 涉及小鼠肺部发育数据的实验数据 |
| 10479 | 2024-08-05 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的自噬障碍和溶酶体功能失调之间的关系 | 揭示了高葡萄糖条件下溶酶体功能受损会阻碍自噬通量，从而加重牙龈上皮细胞的炎症反应 | 未明确展示临床治疗效果或长时间的观察研究数据 | 阐明糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的超炎症反应机制 | 研究对象为糖尿病相关性牙周炎患者的牙龈上皮细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、免疫组化分析、蛋白质组学分析 | NA | 细胞样本 | 研究了来自糖尿病相关性牙周炎患者的临床牙龈上皮样本 |
| 10480 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk RNA sequencing reveals the heterogeneity of melanoma tumor microenvironment and predicts the response of immunotherapy
2024-Aug, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01905-5
PMID:38896289
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研究论文 | 本文综合分析了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性，并预测了免疫治疗的反应。 | 提出了一种新的预测生物标志物，揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性。 | 未提及特定的样本数量和多样性，可能影响结果的普遍适用性 | 研究黑色素瘤的肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗反应的预测能力。 | 分析了来自两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序及批量RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 分析了两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |