单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10401 - 10420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10401 | 2024-08-05 |
Cell Tree Rings: the structure of somatic evolution as a human aging timer
2024-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-01053-4
PMID:38172489
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序构建细胞谱系树，以反映个体的衰老状态和生物年龄 | 提出了通过细胞谱系树结构与生物时间进行关联的新方法，可能成为一种更基本的衰老时钟 | 单细胞变异体的检测是一个重大技术挑战 | 探讨体细胞突变与衰老机制的关系，从而改善衰老评估 | 人类外周血单核细胞中的体细胞突变 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 惩罚多重回归模型 | 基因序列数据 | 来自数千个细胞的样本 |
| 10402 | 2024-08-05 |
Migration Inhibition Factor Secreted by Peripheral Blood Memory B Cells Binding to CD74-CD44 Receptor Complex Drives Macrophage Behavior in Alzheimer's Disease
2024 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175241238577
PMID:38491918
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研究论文 | 本研究探讨了外周血记忆B细胞分泌的迁移抑制因子如何影响阿尔茨海默病中的巨噬细胞行为 | 发现迁移抑制因子与巨噬细胞上的CD74-CD44受体复合物结合，影响巨噬细胞行为 | NA | 探究外周免疫系统在阿尔茨海默病中的作用，特别是记忆B细胞的影响 | 外周血记忆B细胞及其分泌的迁移抑制因子 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq，免疫荧光及流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 10403 | 2024-08-05 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A6/S100A11在肝细胞癌（HCC）T细胞免疫调节中的作用 | 首次揭示S100A6/S100A11在HCC T细胞中的差异表达及其与NF-κB途径的相关性 | 未详细探讨其他S100家族蛋白对肝癌免疫的潜在影响 | 研究S100蛋白在肝细胞癌免疫细胞中的作用 | S100A6/S100A11在肝细胞癌及与乙型肝炎相关的HCC中的表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 分析了HCC及与乙型肝炎相关的HCC的单细胞RNA测序数据 |
| 10404 | 2024-08-04 |
Multi-omic approach identifies hypoxic tumor-associated myeloid cells that drive immunobiology of high-risk pediatric ependymoma
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107585
PMID:37694144
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研究论文 | 本研究识别了高风险儿童脊髓膜瘤中促免疫生物学的缺氧肿瘤相关髓系细胞 | 识别了八种不同的髓系衍生亚群，特别是缺氧髓系细胞，它们展示了髓系抑制细胞的特征 | 缺乏关于缺氧髓系细胞在其他肿瘤类型中的作用的研究 | 揭示脊髓膜瘤的免疫环境，以指导免疫治疗 | 高风险儿童脊髓膜瘤的免疫细胞环境和肿瘤亚型 | 数字病理学 | 脊髓膜瘤 | 单细胞测序（scRNAseq）、肿瘤基因表达去卷积、空间蛋白组学、单细胞细胞因子释放测定 | NA | 细胞数据 | 27个单细胞、299个肿瘤样本、54个空间蛋白组样本、12个单细胞细胞因子释放样本 |
| 10405 | 2024-08-05 |
A fibroblast-dependent TGFβ1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis underlies epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551383
PMID:37577522
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研究论文 | 探讨了间质肺疾病中，成纤维细胞与上皮细胞之间相互作用的机制及其对肺上皮变性的影响 | 识别了通过sFRP2介导的TGFβ1-非经典Wnt信号通路在特发性肺纤维化中的新机制 | 本研究的样本大小和临床数据的多样性未在摘要中明确说明 | 研究成纤维细胞与上皮细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及其机制 | 针对间质肺病患者的成纤维细胞和上皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 间质肺病患者的活检样本和正常供体的组织样本 |
| 10406 | 2024-08-05 |
Graphene oxide elicits microbiome-dependent type 2 immune responses via the aryl hydrocarbon receptor
2023-01, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-022-01260-8
PMID:36509925
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研究论文 | 这项研究展示了石墨烯氧化物通过芳香烃受体影响微生物组和免疫反应 | 本研究揭示了石墨烯氧化物对肠道微生物组的调节作用及其通过芳香烃受体介导的免疫反应 | 未提及特定的实验条件或样本的长期效果 | 探索石墨烯氧化物与肠道微生物组及免疫系统相互作用的机制 | 成年斑马鱼及其无菌幼体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年斑马鱼和无菌幼体的细胞样本 |
| 10407 | 2024-08-05 |
Prediction of HLA genotypes from single-cell transcriptome data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1146826
PMID:37180102
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研究论文 | 本文探讨如何从单细胞转录组数据中预测HLA基因型。 | 开发了多个计算HLA分型工具并展示了高准确性的基因型预测模型。 | 尚不清楚从单细胞数据直接预测HLA基因型的可行性。 | 评估和扩展现有HLA基因型预测工具的性能。 | 人类单细胞数据与标准分子基因分型的比较。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 组合模型 | 转录组数据 | NA |
| 10408 | 2024-08-05 |
Establishment of a high-resolution 3D modeling system for studying pancreatic epithelial cell biology in vitro
2019-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2019.09.005
PMID:31767167
|
研究论文 | 本文建立了一种高分辨率的三维培养系统，用于研究胰腺上皮细胞生物学 | 本文首次建立了一种简单可重复的基于Matrigel的三维囊泡培养模型，可用于小鼠和人类胰腺前体的研究 | 尚未提及实验证明该系统在体内应用的有效性 | 研究胰腺上皮化和内分泌发育的机制 | 小鼠和人类的胰腺前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 三维囊泡培养模型 | 细胞文化数据 | NA |
| 10409 | 2024-08-05 |
Exploratory analysis of transposable elements expression in the C. elegans early embryo
2019-Nov-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-3088-7
PMID:31757208
|
研究论文 | 本研究分析了转座元件在秀丽隐杆线虫早期胚胎中的表达情况 | 开发了一种生物信息学管道，能够特异性量化转座元件的表达，并探讨其与发育基因的相关性 | 未提及具体的实验验证数据 | 探讨转座元件在秀丽隐杆线虫早期胚胎中的表达及其可能的功能 | 秀丽隐杆线虫早期胚胎中不同细胞类型的转座元件表达 | 数字病理学 | NA | sc-RNAseq | NA | RNA-seq数据 | 利用公共数据集，涉及多种细胞类型 |
| 10410 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptome atlas of the Drosophila larval brain
2019-11-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50354
PMID:31746739
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研究论文 | 本文介绍了果蝇幼虫大脑的单细胞转录组图谱 | 文章创新性在于建立了单细胞转录组图谱，并揭示了不同细胞类型对饥饿状态下的转录响应差异 | 研究仅限于果蝇幼虫的第一龄期大脑，可能不适用于其他发育阶段或物种 | 探索大脑细胞的多样性及其在饥饿情况下的转录变化 | 果蝇幼虫大脑的细胞类型和转录组 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10411 | 2024-08-05 |
Systematic comparative analysis of single-nucleotide variant detection methods from single-cell RNA sequencing data
2019-11-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1863-4
PMID:31744515
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研究论文 | 本研究对七种单核苷酸变异(SNV)检测工具的性能进行了系统比较 | 本研究首次为scRNA-seq数据评估了不同SNV检测工具的性能 | 在低读深度和特定基因组环境下，灵敏度显著降低 | 评估单细胞RNA测序中SNV检测工具的性能 | 七种SNV检测工具，包括SAMtools、GATK管道等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 模拟数据和scRNA-seq数据 | 涉及七种工具的比较 |
| 10412 | 2024-08-05 |
Subsets of mononuclear phagocytes are enriched in the inflamed colons of patients with IBD
2019-11-12, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-019-0322-z
PMID:31718550
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研究论文 | 本文分析了炎症性肠病（IBD）患者结肠组织中单核巨噬细胞亚群的富集情况 | 首次聚焦于炎症性肠病患者结肠中单核巨噬细胞的富集特征及其与疾病严重程度的相关性 | 未深入探讨这些免疫细胞与其他细胞在肠道微环境中的相互作用 | 研究单核巨噬细胞在IBD中的作用及其在结肠炎症中的富集情况 | IBD患者的结肠活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 来自不同肠道位置和疾病严重程度的多种样本 |
| 10413 | 2024-08-05 |
Building gene regulatory networks from scATAC-seq and scRNA-seq using Linked Self Organizing Maps
2019-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006555
PMID:31682608
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研究论文 | 本文介绍了一种利用自组织映射（SOM）将scATAC-seq区域与scRNA-seq基因连接的新方法。 | 提出了一种新的方法克服了现有分析方法在处理高噪声和稀疏数据集时的挑战，并能够生成草图式的调节网络。 | 该方法可能仍依赖于特定的时间序列分析和细胞类型的多样性。 | 研究的目的是开发一种新的分析方法，以整合不同单细胞测定的数据。 | 研究对象为小鼠前B细胞分化过程中的基因表达和染色质数据。 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq 和 scRNA-seq | 自组织映射（SOM） | 基因组数据 | NA |
| 10414 | 2024-08-05 |
LAmbDA: label ambiguous domain adaptation dataset integration reduces batch effects and improves subtype detection
2019-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz295
PMID:31038689
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研究论文 | 本文开发了一种独立于物种和数据集的迁移学习框架LAmbDA，旨在减少批次效应并改善细胞亚型检测 | LAmbDA框架能够在多个数据集和物种之间进行模型训练，解决了标记模糊的问题并提高了细胞亚型识别的准确性 | 研究主要集中在模拟数据和特定组织（如胰腺和大脑）上，可能在其他实际后台数据中的表现尚不明确 | 研究旨在开发一种新的方法，减少数据集间的系统偏差，并提高细胞亚型的分类精度 | 研究对象为不同物种和组织的单细胞RNA测序数据集中的细胞亚型 | 生物计算 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 前馈神经网络（Feedforward Neural Network） | 单细胞RNA测序数据 | 模拟数据集1: n/a; 模拟数据集2: n/a; 胰腺数据集: n/a; 大脑数据集: n/a |
| 10415 | 2024-08-05 |
Heterogeneity and plasticity in healthy and atherosclerotic vasculature explored by single-cell sequencing
2019-Oct-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz185
PMID:31350876
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综述 | 文章探讨了通过单细胞测序研究健康和动脉粥样硬化血管中的异质性和可塑性。 | 提出了异质性和可塑性的定义，并通过单细胞测序探讨了血管中的新知识。 | 当前单细胞测序研究在重复次数、细胞数量和空间信息的丧失方面存在一些局限性。 | 研究单细胞测序在揭示血管异质性中的应用及其局限性。 | 研究了健康和动脉粥样硬化血管中的细胞异质性和可塑性。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序（SCS） | NA | RNA序列数据 | 使用了不同数量的细胞，具体数量不详 |
| 10416 | 2024-08-05 |
Decoding human fetal liver haematopoiesis
2019-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1652-y
PMID:31597962
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research paper | 本文研究了人类胎儿肝脏中的确定性造血过程 | 通过单细胞转录组分析，揭示了人类发育过程中血液和免疫细胞的谱系 | 在对人类的理解方面仍然有限，特别是在特定的微环境影响下 | 探讨胎儿肝脏中的造血干细胞和多能前体的自我更新及分化机制 | 大约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 |
| 10417 | 2024-08-05 |
Embracing Systems Toxicology at Single-Cell Resolution
2019-Aug, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2019.04.003
PMID:31768481
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研究论文 | 本文探讨了单细胞分辨率下的系统毒理学。 | 介绍了单细胞RNA测序如何改变系统毒理学研究，能够敏感地检测细胞变化并精确识别受毒物影响的细胞 | NA | 研究系统毒理学在单细胞解析中的应用 | 主要集中在通过单细胞技术研究细胞特定的变化和响应轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10418 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
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研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 |
| 10419 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
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研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 |
| 10420 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
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研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 |