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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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10381 | 2024-08-07 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
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研究论文 | 本文通过多组学分析方法,研究了接受猪心脏异种移植的人类受者的分子和免疫反应 | 首次详细描述了心脏异种移植后早期分子和免疫反应的差异,并揭示了新的见解 | 研究仅基于两名受者的样本,可能限制了结果的普遍性 | 深入理解异种移植后的详细分子景观,并探索改善移植结果的靶向治疗方法 | 接受猪心脏异种移植的人类受者的血液和组织样本 | 数字病理学 | NA | 转录组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学 | NA | 血液样本和组织样本 | 两名受者 |
10382 | 2024-08-07 |
Establishment and Evaluation of Exosomes-Related Gene Risk Model in Hepatocellular Carcinoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10441-6
PMID:37405532
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者血液样本中外泌体mRNA表达水平,建立并评估了一个基于外泌体相关基因的风险预测模型,用于肝癌的诊断和预后评估 | 首次证实了与肝癌发生发展相关的六个基因存在于血液外泌体中,可用于肝癌患者的液体活检,避免了穿刺诊断的需要 | NA | 建立一个基于外泌体mRNA表达水平的风险预测模型,用于肝癌的诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者血液样本中的外泌体mRNA表达水平 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 液体活检 | Lasso Cox分析 | mRNA数据 | 肝细胞癌患者和正常对照的mRNA数据来自TCGA和exoRBase 2.0数据库 |
10383 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Pro-angiogenic Macrophage Profiles Reveal Novel Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets for Osteosarcoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10483-w
PMID:37603193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了与骨肉瘤预后相关的促血管生成巨噬细胞亚型,并发现了新的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次报道了促血管生成巨噬细胞在骨肉瘤预后中的作用,并开发了一个基于LASSO算法的预后模型 | NA | 探索骨肉瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤患者的促血管生成巨噬细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | NA |
10384 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals RAC1 Involvement in Macrophages Efferocytosis in Diabetic Kidney Disease
2024-Apr, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01942-y
PMID:38064011
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的作用 | 首次揭示了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的关键作用,并通过实验验证了RAC1的表达变化对巨噬细胞功能的影响 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未涉及体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用相关的分子机制 | 糖尿病肾病中的巨噬细胞及其吞噬作用 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个数据集,包括GSE131882, GSE195460, GSE151302, GSE131685 |
10385 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals characteristic transcription factors in polydactyly
2024-Apr, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202404_36050
PMID:38708480
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多指畸形中的特征性转录因子 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析了多指畸形样本中的转录因子及其调控网络,揭示了HOX家族成员和GLI2转录因子在多指畸形过程中的作用 | 研究仅基于四个多指畸形样本的单细胞RNA测序数据,样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 旨在为多指畸形的潜在生物标志物和治疗靶点的识别提供指导 | 多指畸形样本中的纤维细胞和角质细胞的转录因子及其调控网络 | 数字病理学 | 多指畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 四个多指畸形样本,共11,806个单细胞 |
10386 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular dynamics and therapeutic effects of astragaloside IV in slow transit constipation
2024-Jan-29, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10187
PMID:38289380
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了黄芪甲苷IV在治疗慢传输型便秘中的细胞动态和治疗效果 | 首次揭示了黄芪甲苷IV对慢传输型便秘模型中肠道细胞比例和功能的调节作用,并通过网络药理学分析了其作用机制 | 研究仅限于动物模型,需要进一步的人体试验验证 | 确定慢传输型便秘模型中结肠组织细胞的动态变化,并研究黄芪甲苷IV治疗的效果 | 慢传输型便秘的小鼠模型和黄芪甲苷IV的治疗效果 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用洛哌丁胺诱导的慢传输型便秘小鼠模型 |
10387 | 2024-08-07 |
Dysregulation of endometrial stromal serotonin homeostasis leading to abnormal phosphatidylcholine metabolism impairs decidualization in patients with recurrent implantation failure
2024, Human reproduction open
IF:8.3Q1
DOI:10.1093/hropen/hoae042
PMID:39091587
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研究论文 | 本研究探讨了异常的血清素稳态是否导致反复植入失败(RIF)患者子宫内膜蜕膜化受损 | 发现RIF患者子宫内膜中血清素代谢稳态异常,伴随单胺氧化酶(MAO)表达减少,影响子宫内膜基质细胞的蜕膜化,导致胚胎植入失败 | 研究揭示了血清素代谢稳态受损和MAO表达异常降低是RIF的原因之一,但血清素在子宫内膜中的来源和其他潜在功能仍需进一步探索 | 探讨异常的血清素稳态是否导致反复植入失败(RIF)患者子宫内膜蜕膜化受损及其机制 | 反复植入失败(RIF)患者的子宫内膜样本和生育能力正常的患者子宫内膜样本 | NA | 生殖系统疾病 | ELISA、免疫荧光组织化学、单细胞测序、RNA测序(RNA-seq)、液相色谱-质谱(LC/MS) | NA | 细胞、基因表达数据 | 50个子宫内膜样本(25个RIF患者和25个生育能力正常的患者) |
10388 | 2024-08-07 |
Identifying potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1433147
PMID:39092217
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化方法,旨在识别肺腺癌的新治疗靶点 | 本研究采用多组学方法,结合批量和单细胞RNA测序数据,以及孟德尔随机化分析,揭示了肺腺癌的潜在治疗靶点 | NA | 识别肺腺癌的新治疗靶点 | 肺腺癌及其相关基因和细胞类型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 513个肺腺癌组织和59个非肿瘤组织 |
10389 | 2024-08-07 |
The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1379821
PMID:39092227
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研究论文 | 本研究探讨了代谢记忆在糖尿病肾病中的作用,并通过单细胞RNA测序数据识别关键基因和治疗靶点 | 本研究首次结合人类数据和动物模型,识别出与代谢记忆和纤维化相关的关键基因NDRG1,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库数据和动物模型,需要进一步的人体临床试验验证 | 探索代谢记忆在糖尿病肾病中的作用及潜在的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的代谢记忆和纤维化相关基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种细胞类型,包括人类和动物模型 |
10390 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics of the infarcted heart define the dynamic onset of the border zone in response to mechanical destabilization
2022-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00160-3
PMID:39086770
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研究论文 | 本文通过单细胞/核RNA测序、空间转录组学和多重RNA荧光原位杂交技术,重新定义了心肌梗死边界区(BZ)的细胞和分子机制。 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术详细描述了心肌梗死边界区的动态变化,并提出了‘邻居丢失’假说来解释其转录反应的机制。 | NA | 深入理解心肌梗死边界区的细胞和分子机制。 | 心肌梗死边界区的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞/核RNA测序、空间转录组学、多重RNA荧光原位杂交 | NA | 转录组数据 | NA |
10391 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术,探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性,并且Klf4基因调控了多种表型的转变,包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能,以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 |
10392 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
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研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞,避免了肿瘤异质性的干扰,为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
10393 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
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研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小,仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 |
10394 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观,并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞(CD63 CAFs),这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性,并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
10395 | 2024-08-07 |
Identification of diverse cell populations in skeletal muscles and biomarkers for intramuscular fat of chicken by single-cell RNA sequencing
2020-Oct-31, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07136-2
PMID:33129271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,首次描述了鸡骨骼肌在两个发育阶段的异质性,并鉴定了APOA1和COL1A1作为鸡肌内脂肪细胞的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群,并鉴定了新的肌内脂肪细胞生物标志物。 | NA | 研究鸡骨骼肌发育过程中的细胞异质性及其与肌内脂肪细胞的关系。 | 鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群及其基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在孵化后第5天和第100天分别鉴定了10个和7个细胞集群。 |
10396 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of Neuroinflammatory Responses in Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Challenge or an Opportunity?
2020-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217923
PMID:33113845
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综述 | 本文综述了肌萎缩侧索硬化症(ALS)中神经炎症反应的异质性,并探讨了其作为治疗挑战或机遇的可能性 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在发现新的治疗靶点和非侵入性诊断/预后标志物方面的潜力 | 异质性/多方面的微胶质细胞反应在不同中枢神经系统区域的发生为单一药物疗法的临床转化带来了障碍 | 总结过去十年中关于ALS中微胶质细胞反应复杂性的研究结果,并讨论新技术带来的新治疗途径 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS)中的神经炎症反应及其微胶质细胞的作用 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
10397 | 2024-08-07 |
Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol
2020-Oct-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21197366
PMID:33036143
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研究论文 | 本文评估了不同的细胞免疫染色、固定和全基因组扩增方法对单细胞测序效率和产量的影响 | 优化了单细胞水平上造血干细胞的细胞固定和全基因组扩增协议 | NA | 深入理解肿瘤发病机制及肿瘤群体对治疗的反应 | 造血干细胞的单细胞基因组分析 | NA | 血液系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA |
10398 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术,分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组,揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术,全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换,并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制,以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 |
10399 | 2024-08-07 |
An Experiment on Ab Initio Discovery of Biological Knowledge from scRNA-Seq Data Using Machine Learning
2020-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2020.100071
PMID:33205121
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法在单细胞RNA测序数据上进行实验,探索了在没有现有知识指导的情况下发现生物学知识的能力和局限性 | 本研究采用无监督和监督机器学习相结合的策略,揭示了主要细胞谱系,且最小程度依赖先验知识或人工干预,实现了人类早期胚胎细胞分化的新发现 | 研究展示了机器学习在复杂生物问题知识发现的可行性和重要性,但也指出了其局限性 | 探索机器学习在无现有知识指导的高通量生物数据中发现新模式的潜力和局限 | 早期胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | NA | 数据 | NA |
10400 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding
2018-04-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aam8999
PMID:29545511
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研究论文 | 本文开发了一种名为SPLiT-seq的单细胞RNA测序方法,用于对发育中的小鼠大脑和脊髓进行单细胞转录组分析 | SPLiT-seq方法通过组合条形码标记细胞来源,适用于固定细胞或细胞核,无需定制设备,并允许高效样本复用 | NA | 研究小鼠大脑和脊髓在早期发育阶段的单细胞转录组特征 | 小鼠大脑和脊髓的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156,049个单核转录组 |