单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1021	2025-05-26	Identification of MAGE-A10 specific T cell receptor promising in immunotherapy of hepatocellular carcinoma 2025-May-14, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144243 PMID:40379175	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序技术，识别出针对肝癌细胞特异性抗原MAGE-A10的T细胞受体，为肝癌的TCR-T免疫治疗提供了新策略	首次利用单细胞测序技术识别出MAGE-A10特异性TCR，并验证其针对肝癌细胞的杀伤效果	研究样本量有限，且未进行大规模临床验证	探索肝癌的新型免疫治疗方法	肝癌患者样本中的T细胞受体	免疫治疗	肝癌	scRNA-seq, scTCR-seq, GLIPH2, TCRMatch, NetMHCpan, DLpTCR	NA	单细胞测序数据	肝癌患者样本（具体数量未明确说明）
1022	2025-05-26	Single-Cell Transcriptomics Uncovers Core Signature for Regulating Mitochondrial Homeostasis During Testicular Ageing 2025-May, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13797 PMID:39731228	研究论文	通过单细胞转录组学揭示了睾丸衰老过程中线粒体稳态调控的核心特征	首次在果蝇模型中利用单细胞RNA测序技术系统揭示了睾丸衰老过程中生殖细胞亚群的线粒体功能变化及其调控机制	研究仅基于果蝇模型，需要在哺乳动物中进行验证	探究睾丸衰老过程中线粒体功能变化的分子机制	年轻和年老果蝇的睾丸组织	单细胞组学	衰老相关疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	年轻和年老果蝇睾丸样本（具体数量未说明）
1023	2025-05-11	Unraveling Tissue Complexity Through Single-Cell and Spatial Transcriptomics 2025-May, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202500710 PMID:40342283	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1024	2025-05-26	Optineurin Cooperates With NRF2 to Regulate Tooth Root Morphogenesis by Controlling Mitochondrial Dynamics and Apoptosis 2025-May, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13799 PMID:39762159	研究论文	本研究探讨了Optineurin (OPTN)与NRF2在牙齿根部形态发生中的协同作用，通过调控线粒体动力学和凋亡影响牙齿发育	首次揭示了OPTN通过促进线粒体分裂与NRF2协同调控牙齿根部发育的机制	研究主要基于小鼠模型，人类牙齿样本数据较少	阐明OPTN在牙齿根部发育中的作用机制	小鼠胚胎及出生后牙齿、人类胚胎及成人牙齿、根尖乳头干细胞(SCAPs)	发育生物学	牙齿发育异常	单细胞测序、RNA-seq分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	E16.5、P1、P7小鼠牙齿及人类牙齿样本
1025	2025-05-26	[Public Database-based Study to Explore the Expression and Role of DDB1  in Lung Adenocarcinoma] 2025-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer DOI:10.3779/j.issn.1009-3419.2025.102.12 PMID:40404474	研究论文	本研究通过公共数据库探讨了DDB1在肺腺癌中的表达及其作用	首次系统分析了DDB1在肺腺癌中的表达模式、临床意义及其与免疫微环境的潜在关联	研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步实验验证DDB1的具体作用机制	探究DDB1在肺腺癌中的表达特征及其临床意义	肺腺癌组织和正常肺组织	肿瘤生物学	肺腺癌	生物信息学分析、组织微阵列、单细胞测序	NA	基因表达数据、临床数据、单细胞数据	公共数据库中的肺腺癌样本及验证用的组织微阵列样本
1026	2025-05-26	HMOX1-LDHB interaction promotes ferroptosis by inducing mitochondrial dysfunction in foamy macrophages during advanced atherosclerosis 2025-04-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.011 PMID:39731912	研究论文	本研究揭示了高级动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞铁死亡的细胞和分子机制	发现了HMOX1-LDHB相互作用通过诱导线粒体功能障碍促进泡沫巨噬细胞铁死亡的新机制	未明确说明样本量及实验模型的局限性	探索高级动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞死亡的分子机制	泡沫巨噬细胞	分子生物学	心血管疾病	RNA测序（bulk和single-cell）	NA	基因表达数据	NA
1027	2025-05-26	Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol 2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil) DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672 PMID:40319860	研究论文	本研究通过miRNA和mRNA共表达网络识别了与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物	首次发现miR-142-5p-SACS和miR-30a-5p-GPR157作为雌二醇调控的潜在诊断和预后生物标志物	样本量相对有限（n=408 TCGA数据 + n=9实验数据），且需要进一步实验验证	识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物	子宫内膜样子宫内膜癌（EEC）患者和经雌二醇处理的子宫内膜癌Ishikawa细胞	生物信息学	子宫内膜癌	RNA测序、单细胞转录组测序、生物信息学分析	共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络	RNA表达谱数据、单细胞转录组数据	408例TCGA数据 + 9例实验样本（3×250nM雌二醇组、3×50nM雌二醇组、3×对照组）
1028	2025-05-26	Single cell RNA-sequencing identified CCR7+/RELB+/IRF1+ T cell responding for juvenile idiopathic arthritis pathogenesis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1528446 PMID:40406113	研究论文	通过单细胞RNA测序分析，揭示了CCR7+/RELB+/IRF1+ T细胞在青少年特发性关节炎（JIA）发病机制中的关键作用	首次在单细胞水平上鉴定了HLA-B27阳性和阴性JIA患者的免疫细胞异质性，并发现CCR7+/RELB+/IRF1+三重阳性T细胞在HLA-B27阳性JIA患者中特异性存在	研究样本量未明确说明，且机制研究主要基于假设，需要进一步实验验证	探索青少年特发性关节炎不同亚型的疾病异质性并分析其发病机制	青少年特发性关节炎患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞组学	青少年特发性关节炎	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	未明确说明（包含HLA-B27阳性和阴性JIA患者、pSS患者和SLE患者的外周血样本）
1029	2025-05-26	Decoding multiple myeloma: single-cell insights into tumor heterogeneity, immune dynamics, and disease progression 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1584350 PMID:40406148	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和疾病进展	利用单细胞RNA测序技术识别了多发性骨髓瘤中的11种不同细胞类型，并揭示了神经免疫调控在肿瘤微环境中的关键作用	研究样本可能不足以完全代表多发性骨髓瘤的所有亚型	探索多发性骨髓瘤的肿瘤异质性、免疫动态和疾病进展机制	多发性骨髓瘤（MM）和高危冒烟型多发性骨髓瘤（SMMh）样本	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	CytoTRACE, Monocle2, Slingshot	RNA-seq数据	NA
1030	2025-05-26	Identification of common hub genes and construction of immune regulatory networks in aplastic anemia, myelodysplastic syndromes, and acute myeloid leukemia 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1547289 PMID:40406144	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了再生障碍性贫血(AA)、骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)的共同枢纽基因，并构建了免疫调控网络	首次发现POLG和MAP2K7作为AA、MDS和AML的共同枢纽基因，揭示了MIF介导的细胞通讯在20多条免疫调控通路中的作用	枢纽基因对细胞增殖和迁移没有显著影响，体外验证结果有限	探索AA、MDS和AML的共同发病机制，为预防疾病进展提供基础	再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病	生物信息学	血液系统疾病	基因表达差异分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、免疫浸润分析、单细胞测序、细胞通讯分析、孟德尔随机化、RT-qPCR、ELISA	NA	基因表达数据	来自GEO数据库的相关数据集（具体数量未说明）
1031	2025-05-26	Single-cell RNA sequencing reveals adrb1 as a sympathetic nerve-regulated immune checkpoint driving T cell exhaustion and impacting immunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1520766 PMID:40406147	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了ADRB1作为交感神经调节的免疫检查点，驱动T细胞耗竭并影响食管鳞状细胞癌的免疫治疗效果	首次发现ADRB1在食管鳞状细胞癌中作为免疫检查点的作用，并通过单细胞RNA测序和实验验证揭示了其在T细胞耗竭和免疫治疗中的作用	研究主要基于单细胞RNA测序和TCGA数据，需要进一步的体内实验验证ADRB1的调控机制和治疗潜力	探索ADRB1在食管鳞状细胞癌中的免疫调节作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	食管鳞状细胞癌（ESCC）患者样本中的T细胞和其他免疫细胞	数字病理学	食管鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、拷贝数变异（CNV）分析	NA	单细胞RNA测序数据、TCGA数据	未明确提及具体样本数量，但涉及ESCC患者的新辅助治疗前后样本
1032	2025-05-26	Single-Cell RNA-Seq Recognized Key Genes for Metastasis and Macrophage Infiltration in Colorectal Cancer 2025, Human mutation IF:3.3Q2 DOI:10.1155/humu/9488531 PMID:40406545	研究论文	通过单细胞RNA测序技术识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因	首次利用单细胞RNA测序数据识别出ZFAND2A作为结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因，并验证其在癌细胞活性和巨噬细胞极化中的功能	研究主要基于体外实验，尚未进行体内验证	探索结直肠癌转移和免疫细胞浸润的分子机制	结直肠癌组织和相关基因	数字病理学	结直肠癌	scRNA-seq, qRT-PCR, WB分析, CCK-8, transwell实验, ELISA, 流式细胞术	lasso回归	基因表达数据	GSE261012和GSE234804数据集中的样本
1033	2025-05-26	CD9 expression rivals IDH mutation as a prognostic marker in glioma: a novel nomogram approach 2025, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2025.1507443 PMID:40406701	研究论文	本研究评估了四跨膜蛋白CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，以确立其临床相关性并确定治疗策略	CD9作为胶质瘤的预后生物标志物，其过表达与肿瘤发展的因果关系得到证实，并开发了基于CD9的列线图以提高预后精确度	研究样本主要来自TCGA和CGGA队列，可能无法完全代表所有胶质瘤患者群体	评估CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，确立其临床相关性并确定治疗策略	胶质瘤患者样本	数字病理学	胶质瘤	多组学分析、单细胞RNA测序、Mendelian randomization (MR)、KEGG富集分析、PPI网络构建	Cox回归、CellChat、Monocle3	基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据	1,033个胶质瘤样本（来自TCGA和CGGA队列）和20个胶质母细胞瘤病例的单细胞RNA测序数据
1034	2025-05-26	Fibroblast-specific TGF-β signaling mediates cardiac dysfunction, fibrosis, and hypertrophy in obese diabetic mice 2024-Dec-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae210 PMID:39373248	research paper	该研究探讨了成纤维细胞特异性TGF-β信号在2型糖尿病心肌病发病机制中的作用	揭示了成纤维细胞特异性TGF-β/Smad3信号通路在糖尿病心肌病中的关键作用，并发现TSP-4可能作为糖尿病诱导的纤维化介质	体外实验未显示TSP-4对心脏成纤维细胞有明显的激活作用	研究TGF-β诱导的成纤维细胞激活在糖尿病心肌病发病机制中的作用	肥胖糖尿病小鼠（db/db小鼠）的心脏成纤维细胞	心血管疾病研究	心血管疾病	转录组学研究、scRNA-seq、Ingenuity通路分析（IPA）	小鼠模型	基因表达数据、scRNA-seq数据	肥胖db/db小鼠和瘦型小鼠
1035	2025-05-26	Olfr2-positive macrophages originate from monocytes proliferate in situ and present a pro-inflammatory foamy-like phenotype 2024-Nov-05, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae153 PMID:39229899	研究论文	本研究探讨了表达嗅觉受体2（Olfr2）的血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型和起源	首次揭示了Olfr2+巨噬细胞来源于单核细胞，并在疾病早期阶段积累，具有增殖和促炎潜能	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究Olfr2+血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用机制	Olfr2+巨噬细胞及其前体单核细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、RNA-seq、流式细胞术	Apoe-/-小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	CD45.1Apoe-/-Olfr2+/+和CD45.2Apoe-/-Olfr2-/-小鼠
1036	2025-05-26	Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction 2024-Jul-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae075 PMID:38666458	research paper	该研究探讨了丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的调节作用	首次揭示了SerpinA3n通过调节基质功能和炎症反应影响心肌梗死后心脏重塑的因果作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	理解Serpins在心肌梗死后瘢痕形成中的调节作用	心肌梗死后的心脏重塑过程	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞转录组学、蛋白质组学分析	条件性基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	SerpinA3n条件性敲除小鼠
1037	2025-05-26	Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19 2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.) DOI:10.1097/FM9.0000000000000190 PMID:40406392	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了一名康复的COVID-19孕妇的外周血单个核细胞的免疫反应	首次在单细胞分辨率下描绘了COVID-19康复孕妇的PBMCs免疫基因表达图谱，并发现CD16阳性单核细胞和MAIT细胞在母体免疫反应中的关键作用	研究样本量较小（仅1名患者），且缺乏纵向数据跟踪	探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制	孕妇外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1名COVID-19康复孕妇的PBMCs样本，与公开数据集中的健康孕妇对照进行比较
1038	2025-05-25	NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma 2025-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814 PMID:40262715	研究论文	探讨NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关系	首次将NR2F2与口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移联系起来，并揭示其在肿瘤干细胞亚群中的关键作用	研究主要基于细胞和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大	研究NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的分子机制	口腔鳞状细胞癌患者样本、肿瘤细胞系和动物模型	肿瘤生物学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据	未明确说明患者样本数量，包含细胞系和动物模型
1039	2025-05-25	Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq 2025-Aug, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270 PMID:40268159	研究论文	该研究通过RNA测序技术，系统描绘了创伤性脑损伤（TBI）后不同时间点的分子病理变化图谱	首次利用RNA-seq和WGCNA方法，全面揭示了TBI进展过程中时间依赖性的分子病理变化，并重点分析了细胞焦亡在神经炎症过程中的关键作用	研究仅使用了C57/BL6小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	揭示创伤性脑损伤后时间依赖性的分子病理变化机制	C57/BL6小鼠脑组织	生物信息学	创伤性脑损伤	RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光	WGCNA, Mfuzz	RNA测序数据	C57/BL6小鼠在10个时间点（0h至7d）的脑组织样本
1040	2025-05-25	Unraveling the immune activation mechanisms of DAMPs in coronary artery disease through transcriptomic and single-cell analyses 2025-Jul, Cytokine IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cyto.2025.156952 PMID:40306092	研究论文	本研究通过转录组学和单细胞分析探讨了损伤相关分子模式（DAMPs）在冠状动脉疾病（CAD）中触发免疫激活的机制	揭示了P2RY14和IFIH1基因在CAD中的显著表达差异及其在免疫反应和炎症过程中的潜在作用，以及单细胞分析中免疫细胞的独特聚类模式	NA	探究DAMPs在CAD中触发免疫激活的机制	冠状动脉疾病（CAD）患者	生物信息学	心血管疾病	RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	转录组数据, 单细胞数据	来自GSE202625、GSE242046和GSE159677数据集的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据