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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-04-23 |
Construction of ammonia death-related lncRNA prognostic signature model and immunomodulatory effect in glioblastoma multiforme
2026-Jul-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150266
PMID:41861940
|
研究论文 | 本研究构建了一个与氨死亡相关的lncRNA预后特征模型,并探讨了其在多形性胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 首次将氨诱导的细胞死亡(一种不同于凋亡和铁死亡的新机制)相关的lncRNA与GBM预后及免疫微环境联系起来,构建了新型预后特征模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞验证,缺乏体内实验和临床样本的直接功能验证 | 探索氨死亡相关lncRNA在GBM中的预后价值,并阐明其代谢-免疫调控机制 | 多形性胶质母细胞瘤(GBM)患者数据及GBM细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-GBM数据集和独立CGGA队列,以及U-251、U-87 MG人GBM细胞系和正常人星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1022 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell atlases and machine learning to construct 'in silico patients' for predicting individualized drug responses
2026-Jun, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117873
PMID:41796725
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综述 | 本文综述了整合单细胞图谱和机器学习构建'硅基患者'框架以预测个体化药物反应的新兴概念 | 提出'硅基患者'预测框架,整合大规模单细胞图谱、药物基因组数据库和患者特异性scRNA-seq数据,利用AI(特别是深度学习和迁移学习)实现个体化药物反应预测,并形成'预测-验证-优化'闭环 | 当前挑战包括多组学和空间信息整合的复杂性,以及临床转化中的验证需求 | 开发下一代个体化药物反应预测工具,以应对肿瘤内细胞异质性驱动的耐药性挑战 | 肿瘤生态系统,包括肿瘤微环境(TME)和临床相关患者单细胞数据 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多组学整合 | 深度学习,迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据,药物基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2026-04-23 |
ELK1/NOL3/GRP78 axis regulates proliferation and stemness in TP53-mutant colon cancer by enhancing adaptive endoplasmic reticulum stress
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168227
PMID:41864308
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研究论文 | 本文研究了ELK1/NOL3/GRP78轴在TP53突变结肠癌中通过增强适应性内质网应激来调控增殖和干细胞特性的机制 | 揭示了TP53突变肿瘤干细胞中内质网应激与线粒体代谢途径的同步激活,并首次将ELK1/NOL3/GRP78轴鉴定为驱动适应性内质网应激和干细胞特性的上游调控因子 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限,且未探讨该轴在其他癌症类型中的普适性 | 探究TP53突变结肠癌中适应性内质网应激的上游调控机制及其对肿瘤进展的影响 | TP53突变与野生型结肠癌细胞系(SW480、HT-29、HCT116)及TCGA-COAD和GEO队列的临床数据 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、DESeq2、LASSO回归、CCK-8、集落形成、微球形成、异种移植、双荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据 | TCGA-COAD和GEO队列的结肠癌样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1024 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Jun, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2026.105929
PMID:41865947
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展,涵盖疾病机制、发育生物学和免疫学特征三个方面 | 首次系统性地将scRNA-seq技术在猪研究中的三大应用方向(疾病解码、发育探索、免疫分析)进行整合综述,并分析了该技术在当前猪研究中的独特挑战与未来前景 | 猪参考基因组注释不完整、样本获取与处理困难、数据分析复杂度高 | 为scRNA-seq在猪传染病防控、遗传育种和生物医学模型开发中发挥更大作用提供研究思路 | 猪(作为农业经济动物和人类疾病模型) | 数字病理学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1025 | 2026-04-23 |
A comprehensive multi-omics and functional study of evolutionary adaptive responses to smoke
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115547
PMID:42016314
|
研究论文 | 本研究通过多组学和功能分析,全面探讨了吸烟引起的进化适应性反应,识别了吸烟特征及其在气道中的空间分布,并揭示了关键调控基因 | 结合单细胞和空间转录组学数据映射吸烟特征,识别人类特异性烟雾反应基因,表明进化适应,并通过甲基化和ChIP-seq分析确定主调控因子 | 研究可能受限于样本队列的多样性和规模,且进化适应性的机制需要进一步验证 | 研究吸烟引起的进化适应性反应及其在慢性肺病发展中的作用 | 当前吸烟者和非吸烟者的肺组织,包括人类和非人类灵长类动物 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组学、单细胞RNA-seq、空间转录组学、甲基化分析、ChIP-seq | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间数据、甲基化数据、ChIP-seq数据 | 多个队列的当前吸烟者和非吸烟者样本,包括人类和非人类灵长类动物 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1026 | 2026-04-23 |
Keratin 15 Regulates Cell Proliferation in Outer Enamel Epithelium
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251368346
PMID:41103018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠牙胚中角蛋白15在牙釉质外上皮细胞中的特异性表达及其在调控细胞增殖和牙发育中的作用 | 首次将角蛋白15鉴定为牙釉质外上皮的特异性标记基因,并揭示了其通过抑制p38 MAPK通路调控牙上皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系,尚未在人类样本中验证,且对Krt15调控的具体下游靶点仍需进一步探索 | 阐明牙釉质外上皮在牙发育中的功能角色及其分子调控机制 | 小鼠牙胚(出生后第7天切牙和胚胎第14天第一磨牙)及牙上皮细胞系CLDE | 单细胞转录组学 | 牙发育异常 | 单细胞RNA测序,体外器官培养,基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 小鼠牙胚样本(P7切牙和E14 P1磨牙)及CLDE细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-04-23 |
Development and validation of a cuproptosis-related gene signature for predicting prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04132-4
PMID:41296174
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于铜死亡相关基因的预后模型,用于预测胃癌患者的生存和治疗反应 | 首次在胃癌中基于铜死亡相关基因构建预后模型,并关联化疗和免疫治疗敏感性 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 构建基于铜死亡相关基因的预后模型,评估其在胃癌预后预测和治疗反应评估中的临床效用 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR | LASSO回归 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-04-23 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术,在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并揭示了其在牙髓和牙本质再生中的作用机制 | 首次在小鼠磨牙根尖处鉴定出内源性Axin2+牙髓干细胞,并利用单细胞转录组学和谱系追踪技术详细描述了其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类牙髓干细胞在根尖的定位和功能可能有所不同,且长期追踪时间(至少9个月)可能限制了临床转化的直接应用 | 探究牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的在体作用机制,为再生牙髓治疗提供新见解 | 小鼠磨牙的牙髓组织和根尖乳头 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-04-23 |
Biological multi-omics approaches to next-generation biomarkers in immune-related disorders and malignancies: An overview
2026-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04128-0
PMID:41324821
|
综述 | 本文概述了癌症和自身免疫性疾病中下一代生物标志物的研究进展,重点关注多组学整合和人工智能驱动的方法 | 强调多组学数据与人工智能/机器学习相结合,以揭示动态分子特征,并利用单细胞和空间分析来解析细胞异质性和组织背景 | 挑战包括检测标准化、患者间变异性和监管障碍 | 综述下一代生物标志物在癌症和自身免疫性疾病中的应用,以推动精准诊断和个性化治疗 | 癌症和自身免疫性疾病 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1030 | 2026-04-23 |
The cardiac conduction system: development, function and therapeutic targets
2026-May, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-025-01227-x
PMID:41478886
|
综述 | 本文综述了心脏传导系统的发育、功能及其作为治疗靶点的最新研究进展 | 整合单细胞基因组学、转录组学及空间转录组学技术,深入揭示心脏传导系统的细胞微环境与功能调控机制 | NA | 探讨心脏传导系统的生物学基础及其在疾病治疗中的应用潜力 | 心脏传导系统及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1031 | 2026-02-14 |
First longitudinal spatial transcriptomics analysis in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.02.003
PMID:41679567
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1032 | 2026-04-23 |
Kitasamycin overcomes ferroptosis and immunotherapy resistance by targeting the HUWE1-NCOA4-FTH1 axis
2026-May, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2623986
PMID:41612599
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研究论文 | 本研究筛选了96种FDA批准的抗生素,发现大环内酯类吉他霉素通过靶向HUWE1-NCOA4-FTH1轴,可恢复铁死亡敏感性并克服免疫检查点阻断疗法的耐药性 | 首次系统性地筛选并发现吉他霉素作为一种抗生素能有效诱导铁死亡,并揭示了其通过竞争性结合HUWE1、稳定NCOA4、激活铁蛋白自噬轴的全新作用机制 | 研究主要基于临床前小鼠模型,尚未在人体临床试验中得到验证;抗生素与免疫疗法联合应用的长期安全性及最佳给药方案仍需进一步探索 | 探索抗生素在调节铁死亡和克服免疫疗法耐药性中的作用,为需要同时接受抗生素治疗的癌症患者寻找潜在的免疫治疗增敏剂 | 黑色素瘤细胞系、B16F10皮下肿瘤模型、BRAF-PTEN驱动的自发性肿瘤模型、人源外周血单个核细胞人源化小鼠模型以及ICB治疗患者的临床样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、流式细胞数据、免疫组化图像数据 | 涉及96种抗生素的体外筛选、多种小鼠模型及临床患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1033 | 2026-04-23 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-May, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11092-x
PMID:41770292
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研究论文 | 本研究通过整合批量微阵列分析和单细胞RNA测序数据,揭示了人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的独特表达程序 | 首次在人类精原干细胞中系统定义了线粒体转位酶复合物和转运蛋白基因的转录架构,并识别了关键的调控网络和miRNA-mRNA相互作用 | 研究样本量较小(每组3个生物学重复),且主要基于转录组数据,缺乏功能验证实验 | 探究人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的表达模式和调控网络 | 人类精原干细胞富集群体和成纤维细胞 | 单细胞组学 | NA | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | limma, WGCNA, STRING/cytoHubba | 转录组数据 | 每组3个生物学重复的人类精原干细胞富集群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2026-04-23 |
CTPS1 modulates mitophagy to propel diffuse large B-cell lymphoma via reshaping CEPT1-mediated phospholipid metabolism
2026-May, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104132
PMID:41865720
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研究论文 | 本研究探讨了CTPS1通过调节CEPT1介导的磷脂代谢和线粒体自噬,促进弥漫大B细胞淋巴瘤进展的机制 | 首次揭示了CTPS1在DLBCL中通过上调CEPT1表达,重塑磷脂代谢并驱动BNIP3介导的线粒体自噬,促进肿瘤进展的新机制 | 未明确CTPS1抑制剂R80在临床治疗中的具体效果及潜在副作用 | 探索CTPS1在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用及其治疗潜力 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞及患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1035 | 2026-04-23 |
TIMP1 and PKM drive immunosuppression and metabolic remodeling to promote colorectal cancer progression through integrated multi-omics analysis
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151944
PMID:41966374
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研究论文 | 通过整合多组学分析,揭示了TIMP1促进免疫抑制和PKM-LDHA驱动代谢重编程在结直肠癌进展中的关键作用 | 整合转录组、单细胞RNA测序和翻译后修饰分析,识别出TIMP1和PKM作为结直肠癌免疫逃逸和代谢重塑的核心调控节点,并预测了PKM与LDHA的相互作用 | 未提及样本来源的具体队列细节或外部验证队列,功能机制验证主要在体外实验层面 | 识别结直肠癌免疫逃逸的关键靶点和机制,以克服免疫治疗的局限性 | 结直肠癌组织及相关的免疫细胞 | 生物信息学与多组学整合分析 | 结直肠癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,翻译后修饰分析,AlphaFold3结构预测,Co-IP实验 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,蛋白质修饰数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2026-04-23 |
Decoding Spatiotemporal Microenvironmental Changes in Oral Carcinogenesis
2026-May, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378087
PMID:41123100
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研究论文 | 本研究通过多组学时空分析,揭示了口腔黏膜癌变过程中微环境的动态重塑,重点关注了IGFBP2+口腔上皮祖细胞与调节性B细胞之间的相互作用及其在肿瘤发生中的作用 | 首次整合多组学时空数据解析口腔癌变全过程,发现了IGFBP2+口腔上皮祖细胞与调节性B细胞通过TGF-β信号通路的空间互作关系,并揭示了癌前阶段与癌症阶段调控机制的差异性 | 未明确说明样本的具体数量与类型,也未详细描述所使用的具体技术平台和产品型号 | 解析口腔黏膜癌变过程中微环境的动态变化,以预防疾病进展 | 口腔黏膜癌变过程(包括上皮增生、异型增生和癌变阶段)中的微环境细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 多组学时空分析,空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1037 | 2026-04-23 |
Integrated multi-omics analysis identifies TBC1D10C as an NK- and T cell-associated diagnostic biomarker in childhood obesity
2026-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04818-8
PMID:42004165
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,鉴定出TBC1D10C作为儿童肥胖中与NK细胞和T细胞相关的诊断生物标志物 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和qPCR验证数据,系统揭示了儿童肥胖中NK细胞和T细胞的转录组改变,并鉴定出TBC1D10C这一新的诊断生物标志物 | 样本量相对有限(qPCR验证队列仅29名儿童),且主要基于转录组数据,功能机制有待进一步实验验证 | 探究儿童肥胖中NK细胞和T细胞的转录组改变,并评估其作为非侵入性诊断生物标志物的潜力 | 儿童肥胖患者的免疫细胞(特别是NK细胞和T细胞) | 生物信息学 | 儿童肥胖 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, WGCNA, 机器学习 | 集成机器学习工作流(包含110种模型配置) | 转录组数据 | 多个公共数据集(GSE205668, GSE87493, GSE159960)及独立验证队列(29名儿童) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1038 | 2026-04-23 |
ANGPTL4 Induces Aberrant Lymphatic-Like Remodeling in Proliferative Diabetic Retinopathy
2026-May-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0445
PMID:41805865
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研究论文 | 本研究探讨了ANGPTL4在增殖性糖尿病视网膜病变发病机制中的作用,重点关注血管-免疫-淋巴管相互作用 | 揭示了ANGPTL4通过激活AP-1转录因子复合物和结合NRP1/VEGFR3驱动淋巴管异常重塑的新机制,该通路独立于血管生成素-Tie信号 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,临床样本量有限,抗VEGF治疗耐药的具体机制仍需进一步探索 | 探索PDR中ANGPTL4的病理作用及作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病小鼠视网膜、患者玻璃体液、小鼠心脏微血管内皮细胞、人淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、图像数据 | 患者玻璃体液样本及糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2026-04-23 |
Isocitrate Dehydrogenase Mutations in Cancer: From Bench to Bedside Applications
2026-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70732
PMID:42017056
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综述 | 本文综述了异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变在癌症中的作用机制、靶向抑制剂的发展、临床应用以及面临的挑战 | 系统性地从分子机制、临床前模型到临床应用,全面阐述了IDH突变在肿瘤发生发展中的作用,并探讨了联合治疗策略和新兴技术(如单细胞分析)的应用前景 | 作为一篇综述文章,其本身不包含原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 阐明IDH突变在肿瘤发生中的作用机制,并评估靶向IDH突变疗法的临床转化潜力 | 携带IDH突变的多种恶性肿瘤,特别是胶质瘤和急性髓系白血病 | NA | 癌症 | 单细胞分析、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞分析、空间转录组学 | NA | NA |
| 1040 | 2026-04-23 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning to Identify and Validate Prognostic Genes With Lymph Node Metastasis and Immune Cell Signatures in Lung Adenocarcinoma
2026-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503871R
PMID:41979566
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术,识别并验证了与淋巴结转移和免疫细胞特征相关的肺腺癌预后基因 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法,首次系统性地识别了与淋巴结转移和免疫细胞特征相关的肺腺癌预后基因,并构建了风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境 | 识别肺腺癌中与淋巴结转移和细胞免疫相关的预后基因,并开发改善预后的新策略 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外功能实验 | 机器学习 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据库中的肺腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |