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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-03-06 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AGED的无参考空间转录组学细胞类型解卷积框架,通过结合概率建模与神经注意力架构,自动推断组织切片中的细胞组成 | 开发了一种两阶段无参考解卷积框架,首次将线性复杂度注意力机制与概率模型结合,通过复合评分自动选择最佳细胞类型数量,并利用多种注意力机制(交叉注意力、空间注意力、协作注意力)逐步细化细胞类型特征 | 未明确提及在更广泛组织类型或疾病模型中的验证范围,也未讨论计算资源需求或运行时间效率 | 开发一种无需单细胞参考图谱的空间转录组学解卷积方法,以解决复杂空间模式下的细胞类型识别问题 | 小鼠嗅球组织、人类胰腺导管腺癌组织、人类胸腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | Performer-based network, 注意力神经网络 | 空间转录组学基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量,但包含三种组织类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1022 | 2026-03-06 |
A brain-gut excitatory peptide/CCHamide homolog regulates satiation and motivational state transitions in the Aplysia feeding circuit
2026-Feb-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111257
PMID:41654135
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研究论文 | 本研究在海洋软体动物Aplysia中鉴定了一种脑-肠兴奋肽/CCHamide同源物(apEP/CCHa),并揭示了其通过调控关键的中枢模式发生器中间神经元来抑制摄食和促进摄食动机状态转换的机制 | 首次在软体动物中系统鉴定了EP/CCHa信号通路,发现其作为饱腹信号发挥作用,并明确了其在明确界定的摄食神经回路中的具体作用靶点(B20、B34等关键中间神经元) | 研究主要基于Aplysia这一特定模型生物,其发现向其他物种(包括脊椎动物)的普适性仍需进一步验证;体外电生理实验与整体行为之间的直接因果联系需更多证据 | 探究原口动物神经肽EP/CCHa在摄食神经回路中的调控机制及其在动机状态转换中的作用 | 海洋软体动物Aplysia(海兔)的摄食神经回路及相关神经肽信号系统 | 神经科学 | NA | 质谱分析、原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序、电生理记录、行为学实验 | NA | 基因序列数据、质谱数据、RNA-seq数据、电生理数据、行为数据 | Aplysia中枢神经节、肠道组织及特定神经元群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1023 | 2026-03-06 |
Spatial Transcriptomics Characterisation of Radionecrotic Changes in Glioblastoma Patients
2026-Feb-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag026
PMID:41783996
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,对胶质母细胞瘤患者的放射性坏死变化进行了表征,揭示了其与肿瘤进展的空间差异 | 首次应用Xenium平台进行空间单细胞转录组分析,比较了胶质母细胞瘤进展与放射性坏死组织的分子特征,识别了EGFR表达差异和免疫细胞浸润模式 | 样本量较小(仅9名患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 区分胶质母细胞瘤放疗后放射性坏死变化与肿瘤进展,以改善诊断和治疗策略 | IDH野生型胶质母细胞瘤患者的手术样本,包括肿瘤复发和放射性坏死组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 9名患者的10个样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于空间单细胞转录组分析 |
| 1024 | 2026-03-06 |
ISG15-driven immune modulation and tumor progression in breast cancer metastasis: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04614-w
PMID:41639695
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了乳腺癌干细胞中ISG15通过驱动M2巨噬细胞极化和抑制T细胞活化促进淋巴结转移的免疫调节机制 | 首次在乳腺癌转移背景下结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统阐明了ISG15在癌症干细胞介导的免疫微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床样本验证相对有限,且未深入探讨ISG15在其他转移途径中的作用 | 阐明乳腺癌干细胞在淋巴结转移过程中如何通过ISG15介导的免疫调节重塑肿瘤微环境 | 乳腺癌干细胞、巨噬细胞、T细胞、淋巴结转移组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ELISA, 蛋白质印迹, 球体形成实验, 集落形成实验, CCK-8, Transwell, 荧光素酶报告基因实验, ChIP | 小鼠原位乳腺癌模型, 皮下移植模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, TCGA-BRCA数据, 体外实验数据 | 小鼠原发肿瘤和淋巴结转移组织样本, TCGA-BRCA数据集, 4T1-S乳腺癌干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1025 | 2026-03-06 |
The Transcription Factor TCF21 is Necessary for Adoption of Cell Fates by Foxd1+ Stromal Progenitors during Kidney Development
2026-Feb-03, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00345.2025
PMID:41632505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序技术,揭示了转录因子TCF21在肾脏发育过程中对Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键调控作用 | 首次将TCF21鉴定为肾脏基质细胞身份的关键决定因子,并发现其缺失导致新型Endomucin高表达细胞群的异常扩增及纤维化表型 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏发育中的TCF21功能需要进一步验证 | 探究肾脏发育过程中基质祖细胞命运决定的分子机制 | 小鼠胚胎期肾脏Foxd1+基质祖细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织图像数据 | 胚胎期14.5天和18.5天的小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1026 | 2026-03-06 |
TOP2A drives T-cell infiltration and immune remodeling in cyclophosphamide-induced cystitis: a single-cell sequencing study with potential implications for interstitial cystitis
2026-Feb-02, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02061-0
PMID:41622168
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了TOP2A在环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型中驱动T细胞浸润和免疫重塑的机制,为间质性膀胱炎提供了潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上揭示TOP2A作为节律基因与免疫簇的唯一重叠基因,在环磷酰胺诱导的膀胱炎模型中调控T细胞浸润,为间质性膀胱炎的免疫治疗提供了新靶点 | 研究基于大鼠模型,结果需在人类间质性膀胱炎组织中进一步验证;样本量较小,可能影响统计效力 | 探索间质性膀胱炎的潜在机制,特别是节律基因和免疫微环境重塑的作用 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型的膀胱组织 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, Western blot, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型膀胱组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-03-06 |
Multiomics analysis reveals that senescent CXCL16+ macrophages promote lung adenocarcinoma progression through TGF-β signalling
2026-Feb-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07766-2
PMID:41622242
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CXCL16+衰老巨噬细胞通过TGF-β信号通路促进肺腺癌进展的机制 | 首次通过整合GWAS、单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出CXCL16作为衰老相关基因,并明确了其在巨噬细胞衰老及肺腺癌进展中的因果作用 | 研究主要基于观察性数据和实验模型,临床转化潜力需进一步验证 | 探究细胞衰老在肺腺癌肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 肺腺癌患者样本、细胞系及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | GWAS, bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, 免疫荧光染色, 分子动力学模拟 | SHAP分析, 伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及TCGA数据、临床标本及实验模型 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-03-06 |
GSTP1 as a novel protective target in sepsis: evidence from proteome-wide Mendelian randomization and multi-omics analyses
2026-Feb-02, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12748-2
PMID:41629825
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和多组学分析,系统性地研究了脓毒症的致病蛋白及其调控机制,并识别出GSTP1作为一个新的保护性靶点 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析(包括单细胞RNA测序)来系统识别脓毒症的因果蛋白及其免疫调控机制,并进行了药物预测和分子对接验证 | 研究依赖于公开的遗传和组学数据集,可能存在样本选择偏差,且药物预测结果需要进一步的实验验证 | 识别脓毒症的致病蛋白并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者及相关蛋白质(如GSTP1、SFRP1、IL1RL1、INHBB) | 生物信息学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达谱芯片、甲基化定量性状位点分析、免疫浸润分析、药物预测、分子对接 | 孟德尔随机化模型、ROC分析、中介分析 | 蛋白质组数据、基因表达数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个血浆蛋白质组数据集(Decode含4,907个蛋白质,UKB-PPP含2,640个蛋白质)及独立微阵列数据集GSE95233 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-03-06 |
Single-cell omics in tumor lymph node metastasis: mechanisms and therapeutic implications
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02585-x
PMID:41629958
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示肿瘤淋巴结转移(LNM)的微环境、免疫抑制机制以及相关免疫治疗研究中的应用与发现 | 从单细胞分辨率层面系统总结了LNM过程中肿瘤细胞和微环境的异质性、细胞间通讯和细胞进化轨迹,并强调了肿瘤引流淋巴结(TDLNs)在免疫治疗中的关键作用及适应性改变 | NA | 探讨肿瘤淋巴结转移的机制及其对免疫治疗的影响 | 肿瘤淋巴结转移(LNM)过程、肿瘤引流淋巴结(TDLNs)、肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1030 | 2026-03-06 |
Short-Chain Fatty Acid Supplementation After Traumatic Brain Injury Attenuates Neurologic Injury Via the Gut-Brain-Microglia Axis
2026-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002706
PMID:40961414
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研究论文 | 本研究探讨了创伤性脑损伤(TBI)后补充短链脂肪酸(SCFAs)如何通过肠-脑-小胶质细胞轴减轻小鼠的神经损伤 | 首次系统性地研究了TBI后补充SCFAs(而非粪菌移植)对神经损伤的保护作用,并揭示了其通过调节肠道微生物组、小胶质细胞转录组和神经炎症发挥作用的机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未探索性别差异;样本量相对有限(n=52);机制研究主要基于相关性观察,直接的因果证据有待加强 | 探究TBI后补充SCFAs是否能够减轻神经损伤并阐明其潜在机制 | 14周龄雄性C57BL/6小鼠 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 16s rRNA基因扩增子测序,单细胞RNA测序(scRNAseq),3D对比增强磁共振成像 | NA | 微生物组测序数据,单细胞转录组数据,磁共振成像数据,行为学数据 | 52只雄性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1031 | 2026-03-06 |
Comprehensive transcriptomics and proteomics analysis of neointima formation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2026-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00653.2025
PMID:41569144
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研究论文 | 本研究通过转录组学和蛋白质组学分析,探讨了人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的细胞和分子机制 | 首次在人类隐静脉组织培养模型中结合转录组学、蛋白质组学和空间转录组学,揭示了新生内膜形成的动态分子变化,并识别了性别和体重指数相关的差异以及新的成纤维细胞和平滑肌细胞状态 | 研究基于体外组织培养模型,可能无法完全模拟体内生理环境,且样本量有限(72例患者),需进一步验证 | 探究人类隐静脉在冠状动脉搭桥手术中新生内膜形成的分子机制,以改善静脉移植失败问题 | 人类隐静脉样本,来自冠状动脉搭桥手术患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 | 72例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1032 | 2026-03-06 |
Large-scale single-cell analysis and in silico perturbation reveal dynamic evolution of HCC: from initiation to therapeutic targeting
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01307-2
PMID:41617928
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间分析数据,系统解析了肝细胞癌(HCC)从起始到治疗靶向的动态演化过程,揭示了肿瘤内异质性、微环境生态系统及潜在治疗靶点 | 整合跨正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓和转移淋巴结的单细胞转录组与空间分析,首次系统描绘HCC进展的细胞生态系统;识别了四种具有不同临床轨迹和治疗脆弱性的恶性肝细胞转录元程序;通过空间映射揭示了基质结构与恶性表型的空间关联;利用Geneformer虚拟敲除筛选鉴定出HSP90B1作为关键依赖性靶点 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传层面的验证;虚拟筛选结果需进一步实验验证;样本来源和数量可能限制某些亚群的普适性 | 系统解析肝细胞癌(HCC)的肿瘤内异质性和微环境动态演化,识别驱动疾病进展的关键细胞状态和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌(HCC)患者样本,包括正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓(PVTT)和转移淋巴结(MLN) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组分析,虚拟敲除筛选 | Geneformer | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 大规模单细胞样本(具体数量未明确说明),涵盖正常肝、原发肿瘤、PVTT和MLN | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1033 | 2026-03-06 |
Mitochondrial complex I subunit NDUFS4 overexpression drives glioma progression by regulating mitochondrial function and COX5B
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01281-9
PMID:41617910
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体蛋白NDUFS4在胶质瘤细胞中的表达、功能意义及潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序定位NDUFS4在胶质瘤细胞中的高表达,并揭示其通过调控线粒体功能和COX5B驱动胶质瘤进展 | NA | 探究NDUFS4在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤细胞、患者组织、胶质瘤异种移植模型 | NA | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, shRNA, 多组学整合 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2026-03-06 |
Notch3 regulates pericyte phenotypic plasticity in colorectal cancer
2026-Jan-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09629-4
PMID:41618002
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研究论文 | 本研究探讨了Notch3信号在结直肠癌中周细胞表型和功能中的作用,揭示了其调控周细胞表型可塑性及影响肿瘤血管生成的机制 | 首次将Notch3信号通路与结直肠癌周细胞的表型可塑性直接关联,并通过单细胞RNA测序揭示了周细胞异质性中Notch3活性的差异 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力需进一步验证 | 阐明Notch3信号在结直肠癌周细胞表型调控中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 小鼠和人类结直肠癌中的周细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体内基因操作 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和人类结直肠癌样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1035 | 2026-03-06 |
Prostaglandin E2 Reverses Myofibroblast Differentiation in Eosinophilic Esophagitis
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702012
PMID:41659461
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺素E2(PGE2)在嗜酸性粒细胞性食管炎(EoE)中逆转肌成纤维细胞分化的疗效和机制 | 首次探索了通过调节肌成纤维细胞作为EoE纤维狭窄性食管炎的治疗可能性,并揭示了PGE2通过cAMP/YAP/THBS-1通路促进肌成纤维细胞去分化的新机制 | 研究主要基于细胞模型和小鼠模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究PGE2对EoE肌成纤维细胞去分化的疗效和机制,探索EoE纤维狭窄的治疗策略 | 胎儿食管成纤维细胞(FEF3)、患者来源的成纤维细胞、EoE小鼠模型 | NA | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、组织学数据 | 胎儿食管成纤维细胞系、患者来源细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2026-03-06 |
Allergen-specific human IgE isolated through an allergen-agnostic pipeline-understanding immune response and allergen recognition
2026-Jan-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09600-3
PMID:41606257
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研究论文 | 本文介绍了一种从过敏患者免疫库中直接生成重组IgE的流程,用于研究过敏的分子机制 | 开发了一种不依赖特定过敏原的流程,通过单细胞测序技术从IgM B细胞中识别和生成高亲和力IgE抗体 | NA | 研究过敏的分子机制,开发用于过敏研究、诊断和治疗的抗体 | 过敏患者的骨髓和外周血IgM B细胞 | 自然语言处理 | 过敏 | 单细胞测序,高通量转录组测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2026-03-06 |
Subclinical fields of BRAF V600E-mutant melanocytes populate human skin and are enriched around melanoma and naevi
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf412
PMID:41148046
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研究论文 | 本研究揭示了在临床健康皮肤中普遍存在BRAF V600E突变黑色素细胞的亚临床区域,这些区域在黑色素瘤和痣周围富集,挑战了BRAF V600E突变本身具有致癌性的传统观点 | 首次在无可见病变的高风险成人皮肤中系统性识别出BRAF V600E突变黑色素细胞区域,并发现这些细胞处于生长停滞状态,为黑色素瘤起源提供了新视角 | 样本主要来自高风险澳大利亚人群,可能无法完全代表普通人群;研究未长期追踪这些突变细胞的肿瘤转化过程 | 探究BRAF V600E突变黑色素细胞是否普遍存在于高风险黑色素瘤成人的非病变皮肤中 | 97例来自高风险个体的临床健康皮肤样本,包括痣或黑色素瘤邻近皮肤、光损伤皮肤、光保护皮肤及新生儿包皮来源的黑色素母细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 免疫组织化学、液滴数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 97例皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1038 | 2026-03-06 |
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf427
PMID:41206452
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研究论文 | 本研究探讨了镍过敏个体在反复暴露于镍后,表皮驻留记忆T细胞的异质性生成和扩增机制 | 首次在镍过敏个体中,通过重复斑贴试验结合单细胞RNA测序,揭示了表皮TRM细胞的克隆扩增和分化多样性,并发现了耗竭样T细胞亚群的存在 | 样本量较小(12名参与者),且未发现特定T细胞亚型与临床反应严重程度的相关性 | 研究反复镍暴露如何影响镍过敏个体的临床反应及表皮TRM细胞的积累和分化 | 12名镍过敏参与者 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名镍过敏参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1039 | 2026-03-06 |
Single-cell atlas of human lung aging identifies cell type dyssynchrony and increased transcriptional entropy
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68810-9
PMID:41571679
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,描绘了人类肺部衰老过程中细胞、转录组和基因组的变化图谱,揭示了细胞类型间的不同步衰老现象 | 首次在单细胞水平上系统揭示了人类肺部衰老的细胞类型特异性变化,特别是肺泡上皮细胞和内皮细胞的转录组变化最为显著,并发现衰老与转录熵增加相关,而非传统衰老标志物细胞的增多 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平或表观遗传学的变化,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究人类肺部衰老的细胞和分子机制,识别与年龄相关的关键细胞类型和转录变化 | 人类肺部组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类肺部组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2026-03-06 |
SpaceBF: spatial coexpression analysis using Bayesian fused approaches in spatial omics datasets
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag006
PMID:41556565
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于空间组学数据中的空间共表达分析 | SpaceBF通过预定义空间邻接图上的融合马蹄先验,在局部和全局水平估计共表达,允许大边缘特定差异逃逸收缩同时保持整体结构,相比常用方法具有更高特异性和功效 | NA | 开发一种稳健的方法来识别空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达 | 空间转录组学和质谱成像数据中的基因、肽、脂质或N-聚糖 | 空间组学 | 癌症 | 空间转录组学,质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,质谱成像 | NA | NA |