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当前共找到 33678 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-11-25 |
A Reference Atlas of the Human Dorsal Root Ganglion
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.686654
PMID:41279342
|
研究论文 | 构建了人类背根神经节的参考细胞图谱，揭示了22种神经元亚型和10种非神经元细胞 | 首次系统构建人类背根神经节单细胞转录组图谱，发现新的神经元亚型并进行跨物种功能比较 | NA | 解析人类背根神经节的细胞和分子组成特征 | 人类背根神经节细胞 | 单细胞生物学 | 慢性疼痛 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,显微神经成像 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 126名捐赠者的颈段、胸段和腰段背根神经节样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1022 | 2025-11-25 |
Adaptive resampling for improved machine learning in imbalanced single-cell datasets
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.04.686583
PMID:41279118
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研究论文 | 提出一种自适应重采样方法以改进不平衡单细胞数据集中的机器学习性能 | 开发了一种基于学习潜结构进行在线自适应重采样的通用方法，可增强单细胞表征学习 | NA | 改进单细胞转录组学数据中的机器学习模型性能 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 表征学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2025-11-25 |
FADVI: disentangled representation learning for robust integration of single-cell and spatial omics data
2025-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.683998
PMID:41278629
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研究论文 | 提出FADVI变分自编码器框架，通过解耦表示学习实现单细胞和空间组学数据的鲁棒整合 | 将潜在空间划分为批次特异性、标签相关和残差子空间，结合监督分类、对抗训练和交叉协方差惩罚来分离技术变异与真实生物信号 | NA | 解决单细胞和空间组学数据整合中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和高分辨率空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | 变分自编码器(VAE) | 单细胞组学数据, 空间组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1024 | 2025-11-25 |
MERFISH+, a large-scale, multi-omics spatial technology resolves the molecular holograms of the 3D human developing heart
2025-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.02.686137
PMID:41279640
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研究论文 | 开发MERFISH+空间多组学技术并应用于人类发育心脏的3D分子图谱构建 | 将化学探针锚定技术与保护性水凝胶、高通量微流控和显微镜相结合，实现厘米级组织样本的稳健重复杂交循环 | NA | 开发能够同时量化基因表达并解析染色质位点3D组织的空间多组学技术 | 人类发育心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH)，空间多模态数据整合 | 生成整合框架(Spateo-VI) | 空间转录组数据，染色质数据，3D空间数据 | 310万个细胞，34个不同细胞群体 | NA | 空间多组学，空间转录组学 | MERFISH+ | 整合化学探针锚定保护性水凝胶与高通量微流控和显微镜的平台 |
| 1025 | 2025-11-25 |
A chromosome-level assembly and functional genomic resources for the model annelid Capitella teleta
2025-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685816
PMID:41279112
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研究论文 | 本研究通过整合多种测序技术为环节动物模型Capitella teleta构建了染色体级别的基因组组装和功能基因组资源 | 结合长读长、短读长测序和Hi-C技术首次获得该物种染色体级别基因组组装，发现核基因组与线粒体基因组存在显著重排现象 | NA | 为环节动物模型Capitella teleta提供现代化的基因组资源以推动动物和基因组进化研究 | 多毛纲环节动物Capitella teleta实验室品系 | 比较基因组学 | NA | 长读长测序,短读长测序,Hi-C染色质构象捕获,单细胞RNA-seq,ATAC-seq,EM-seq | NA | 基因组序列,转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1026 | 2025-11-25 |
Spatial Transcriptomics Identify T Cell-Driven Mechanisms of Kidney Damage in Immune Checkpoint Inhibitor-Associated Acute Interstitial Nephritis
2025-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685702
PMID:41280053
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示免疫检查点抑制剂相关急性间质性肾炎中T细胞驱动的肾脏损伤机制 | 首次使用Xenium Prime 5K空间转录组学平台比较ICI-AIN和ICI-ATN的细胞组成，发现CD8+T细胞通过IFN-γ信号通路驱动肾脏炎症的新机制 | 样本量较小（仅8例肾脏活检标本），需要更大规模研究验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关急性间质性肾炎的炎症机制 | 免疫检查点抑制剂治疗患者的肾脏活检组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | 空间感知的细胞邻域分类 | 空间转录组数据 | 8例肾脏活检标本（4例ICI-AIN，4例ICI-ATN），共332,000个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K空间转录组学平台 |
| 1027 | 2025-11-25 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
|
研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变GBM微环境中嘌呤代谢促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床疗效仍需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序，核RNA测序 | NA | 代谢组数据，基因表达数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序，核RNA测序 | NA | NA |
| 1028 | 2025-11-25 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤肿瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展 | 整合单细胞测序和空间组学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节 | NA | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合免疫治疗方案 | 实体瘤肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 实体瘤 | 单细胞测序, 空间组学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1029 | 2025-11-25 |
Cell2Spatial is a computational framework that maps single cells to spatial transcriptomic spots to reconstruct tissue architecture
2025-Nov, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003477
PMID:41248160
|
研究论文 | 开发了一种计算框架Cell2Spatial，可将单细胞数据映射到空间转录组spots以重建组织架构 | 开发了首个能够在不完全匹配的单细胞和空间转录组数据集上实现单细胞分辨率空间映射的计算框架 | NA | 解决单细胞测序缺乏空间信息和空间转录组分辨率有限的挑战 | 小鼠大脑、人类胸腺、小鼠肾脏和人类背外侧前额叶皮层组织 | 计算生物学 | NA | 信息论基因选择、空间加权似然建模、空间热点检测、神经网络引导聚类 | 神经网络、成本最小化分配算法 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 多个组织类型（包括4种不同组织） | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium, Xenium In Situ, Visium HD, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1030 | 2025-11-25 |
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00591-6
PMID:41062857
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享一种趋同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了该组织中已知祖细胞群的范围 | 体外培养条件可能影响祖细胞特性，研究结果需在体内进一步验证 | 研究体外培养条件对白色和棕色脂肪祖细胞特性的影响 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1031 | 2025-11-25 |
LogicSR: prior-guided symbolic regression for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf621
PMID:41269283
|
研究论文 | 提出一种结合布尔逻辑模型和符号回归的计算框架LogicSR，用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络 | 将布尔逻辑模型的机制可解释性与符号回归的方程发现能力相结合，并整合先验知识到多目标蒙特卡洛树搜索框架中 | NA | 从单细胞基因表达数据中重建基因调控网络 | 基因调控网络、转录因子-靶基因调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 符号回归、蒙特卡洛树搜索(MCTS)、布尔逻辑模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1032 | 2025-11-25 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Ferroptosis-Related Genes in Parkinson's Disease
2025-Nov, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.70339
PMID:41276944
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了帕金森病中铁死亡相关基因的细胞异质性、作用机制和治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析帕金森病中铁死亡相关基因的细胞特异性表达模式，并鉴定出内皮细胞为关键细胞类型 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索铁死亡相关基因在帕金森病中的调控机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的帕金森病相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1033 | 2025-11-25 |
Multi-Omics and Molecular Dynamics Analysis for Biomarker Discovery in Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2025-Nov, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70202
PMID:41277316
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和分子动力学模拟探索慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的生物标志物 | 首次结合多组学数据、分子对接和动力学模拟鉴定PRKCZ基因作为CRSwNP的潜在治疗靶点 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，需要进一步临床验证 | 发现慢性鼻窦炎伴鼻息肉的生物标志物和治疗靶点 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者相关基因和信号通路 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 多组学分析,分子对接,分子动力学模拟,单细胞测序,qRT-PCR,Western blot,免疫组化,荧光检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质结构数据 | 来自GEO数据库的差异表达基因数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2025-11-25 |
Acetoacetate suppresses colon cancer via an MR1-MAIT axis
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.29.685375
PMID:41279095
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研究论文 | 本研究揭示乙酰乙酸通过MR1-MAIT轴抑制结肠癌生长的机制 | 首次发现乙酰乙酸通过转化为甲基乙二醛与微生物衍生物结合形成强效MR1配体，选择性激活MAIT细胞杀伤肿瘤 | 目前仅限于临床前模型研究，尚未在人体临床试验中验证 | 探索乙酰乙酸对结肠癌的抑制作用及其免疫机制 | 结肠癌临床前模型、人类细胞培养物、黏膜相关恒定T细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除,抗体介导的细胞清除 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多个临床前CRC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1035 | 2025-11-25 |
A molecular map of the human spinal dorsal and ventral horn defines arrangement of neuronal types and glial sex differences
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685953
PMID:41279941
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研究论文 | 通过单核测序和空间转录组学构建人类脊髓背角和腹角的分子图谱，揭示神经元类型排列和胶质细胞性别差异 | 首次在成人人类脊髓中发现胶质细胞存在性别特异性细胞类型和状态，并构建了34个空间和遗传定义的神经元类别 | 样本量相对有限（11例器官捐赠者），仅研究腰椎脊髓区域 | 理解人类脊髓细胞多样性的空间特性及其在生理和神经系统疾病中的作用 | 人类尸体腰椎脊髓背角和腹角组织样本 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 11例器官捐赠者（6名女性，5名男性） | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium单分子空间转录组学平台 |
| 1036 | 2025-11-25 |
Defects in the DNA Damage Response of Patient-derived Endometriosis Stromal Cells
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.29.685406
PMID:41278719
|
研究论文 | 本研究通过比较健康供体和子宫内膜异位症患者来源的子宫内膜基质细胞，揭示了子宫内膜异位症细胞在DNA损伤应答机制中的缺陷 | 首次在患者来源的子宫内膜异位症基质细胞中发现DNA损伤应答缺陷，并证实这种缺陷与MRN复合物下调相关 | 研究样本来源于特定患者群体，未明确说明样本规模，且机制研究仍需进一步验证 | 探究子宫内膜异位症患者子宫内膜基质细胞的DNA损伤应答机制异常 | 健康供体和子宫内膜异位症患者来源的月经流出物中的基质细胞 | 细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 羟基脲处理 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1037 | 2025-11-25 |
Benchmarking large-scale single-cell RNA-seq analysis
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.28.681564
PMID:41279840
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研究论文 | 对五种常用单细胞RNA测序分析框架进行系统性基准测试，评估其在大规模数据集上的可扩展性、效率和准确性 | 首次对大规模单细胞RNA测序分析框架进行系统性基准测试，重点关注算法和基础设施选择对性能的影响 | 仅评估了五种分析框架，可能未涵盖所有可用工具；基准测试数据集数量有限 | 评估单细胞RNA测序分析框架在大规模数据集上的计算性能 | 五种单细胞RNA测序分析框架(Seurat、OSCA、scrapper、Scanpy、rapids singlecell) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD算法(精确、ARPACK、IRLBA、随机化、Jacobi、增量PCA) | 单细胞RNA测序数据 | 130万个小鼠脑细胞数据集和三个较小数据集(BE1、scMixology、脐带血CITE-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 1038 | 2025-11-25 |
Adipocytes are dispensable in shaping the ovarian cancer tumor microenvironment in the omentum
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.28.685098
PMID:41279871
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型证明成熟脂肪细胞对卵巢癌在网膜中的生长并非必需，而内皮细胞FABP4在支持卵巢癌代谢生长中起关键作用 | 挑战了传统认为脂肪细胞通过提供脂质促进卵巢癌生长的观点，发现内皮细胞FABP4在卵巢癌进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 重新评估脂肪细胞在卵巢癌进展中的作用机制 | 卵巢癌细胞系(ID8p53 Brca2、BPPNM、KPCA)和基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 多种卵巢癌细胞系和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1039 | 2025-11-25 |
Macrophage EHD1 promotes inflammation and stabilizes sortilin to accelerate atherosclerosis
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684958
PMID:41279772
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞内吞调节因子EHD1通过促进TNFR2-NF-κB信号通路和稳定分拣蛋白sortilin来加速动脉粥样硬化进程的新机制 | 首次发现EHD1通过调控膜运输促进炎症反应和稳定动脉粥样硬化风险因子sortilin的新功能 | 机制研究主要在骨髓来源巨噬细胞中进行，需要更多体内验证 | 探究EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 骨髓移植, 炎症信号分析, 内吞实验 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 小鼠模型和人类斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1040 | 2025-11-25 |
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2025-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648850
PMID:41279114
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研究论文 | 本研究通过将单细胞RNA测序数据转换为文本格式，训练了参数规模达270亿的大型语言模型，用于下一代单细胞分析 | 首次将大型语言模型扩展到单细胞分析领域，实现了转录组数据和文本数据的统一建模，能够进行多细胞上下文的信息合成 | 模型训练未包含某些人类细胞模型，需要在更广泛的组织类型中验证 | 开发可扩展的单细胞分析平台，提升单细胞基础模型的可扩展性和任务灵活性 | 单细胞RNA测序数据、生物学文本和元数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、强化学习 | 大型语言模型(LLM) | 文本、转录组数据 | 超过10亿个标记的转录组数据、生物学文本和元数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Cell2Sentence (C2S) 框架 |