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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1021 | 2025-10-05 |
Epithelial Lining Fluid Cystatin SN is a Noninvasive Biomarker for Predicting Type 2 Chronic Rhinosinusitis
2025-Sep, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16652
PMID:40689541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现ELF中cystatin SN可作为预测2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物 | 首次发现cystatin SN在2型慢性鼻窦炎上皮细胞中特异性表达,并验证其在ELF中的诊断价值 | 样本来源和规模可能限制结果的普适性,需要更大规模研究验证 | 识别2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物以实现个体化治疗 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体的鼻组织和上皮衬液样本 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, Luminex多重分析, 酶联免疫吸附试验, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质浓度数据, 临床评分数据 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1022 | 2025-10-05 |
Dopaminergic short axon cells integrate sensory and top-down inputs to enhance discriminative learning in the mouse olfactory bulb
2025-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003375
PMID:40956809
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研究论文 | 本研究揭示了多巴胺能短轴细胞在小鼠嗅球中整合感觉和自上而下输入以增强辨别学习的神经机制 | 发现SACs通过突触和结构可塑性实现基于气味效价的感觉输入调节,并确定胆碱能输入作为效价依赖信号调节SAC活动 | 研究局限于小鼠嗅球系统,机制在其他感觉系统中的普适性仍需验证 | 探索辨别学习中增强感觉表征的神经机制 | 小鼠嗅球中的多巴胺能短轴细胞(SACs) | 神经科学 | NA | 光学成像、空间转录组学、电子显微镜 | NA | 图像、转录组数据、显微结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1023 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing analysis reveals the promotion of ELR CXCL genes on angiogenesis and the influence on malignant progression in glioblastoma
2025-Sep-01, Journal of clinical biochemistry and nutrition
IF:2.0Q3
DOI:10.3164/jcbn.25-26
PMID:40963732
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示ELR CXCL基因在胶质母细胞瘤中促进血管生成并影响恶性进展的作用机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出癌症相关骨髓源性巨噬细胞亚群,并发现其特异性高表达ELR CXCL基因(特别是CXCL3)通过促进血管生成驱动肿瘤恶性进展 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仍需进一步扩展;细胞亚群功能机制研究深度有限 | 探究胶质母细胞瘤微环境中髓系细胞亚群的异质性及其在肿瘤恶性进展中的作用 | 胶质母细胞瘤组织样本和细胞系 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 血管生成实验, CCK-8, 集落形成实验, Transwell实验, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 实验数据 | 来自GEO数据库的胶质母细胞瘤单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1024 | 2025-10-05 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
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研究论文 | 本研究通过单细胞外泌体追踪分析发现肺细胞通过外泌体通讯显著增强造血干细胞自我更新和移植能力 | 首次揭示肺细胞通过外泌体通讯调节造血干细胞稳态的新机制,突破了传统认为造血干细胞稳态仅受骨髓微环境调控的认知 | 研究主要基于实验条件,在临床转化应用中仍需进一步验证 | 探究肺细胞通过外泌体通讯对造血干细胞功能的调控机制 | 造血干细胞,特别是长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病,骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序,外泌体microRNA分析,蛋白质组学 | 单细胞外泌体追踪流程 | 单细胞RNA测序数据,miRNA数据,蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,外泌体分析 | NA | NA |
1025 | 2025-10-05 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-Jul-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
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研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象,并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量,机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
1026 | 2025-10-05 |
The immune checkpoint regulator CD40 potentiates myocardial inflammation
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00633-1
PMID:40217124
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研究论文 | 本研究揭示CD40激动剂通过激活CCR2巨噬细胞和招募效应记忆CD8 T细胞重塑心脏免疫环境,促进心肌炎症 | 首次发现CD40激动剂通过CCR2巨噬细胞与CD8 T细胞间的IL-12b/TNF/IFNγ信号正反馈环路驱动心肌炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究CD40激动剂诱发心肌炎症的潜在机制 | 遗传工程小鼠模型的心脏免疫细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,细胞清除研究 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1027 | 2025-10-05 |
Dnmt3a-mediated hypermethylation of FoxO3 promotes redox imbalance during osteoclastogenesis
2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418023122
PMID:40106360
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研究论文 | 本研究揭示了Dnmt3a介导的FoxO3启动子高甲基化通过促进氧化还原失衡影响破骨细胞生成的新机制 | 首次发现Dnmt3a通过调控FoxO3启动子甲基化影响破骨细胞生成,而非通过RANK-TRAF6解离途径 | NA | 探究FoxO3在破骨细胞生成和骨质疏松中的作用机制 | 人股骨头组织、Lysm-Cre;FoxO3 OVX小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1028 | 2025-10-05 |
Single Cell Transcriptome Signatures of Sarcoidosis in Lung Immune Cell Populations
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.20.633917
PMID:39896662
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺结节病患者支气管肺泡灌洗细胞中的免疫细胞组成、基因表达模式和细胞间相互作用 | 首次在肺结节病中系统鉴定五种巨噬细胞亚群并揭示其特异性基因表达谱和细胞间通讯变化 | 样本量相对有限(16例患者和14例对照),且仅基于支气管肺泡灌洗细胞分析 | 识别与肺结节病风险和进展相关的细胞特异性分子变化 | 肺结节病患者(包括进展性和非进展性)和健康对照者的支气管肺泡灌洗细胞 | 单细胞组学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析,CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 16例肺结节病患者(8例进展性,8例非进展性)和14例健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | CellRanger预处理流程 |
1029 | 2025-10-05 |
HMG Box-containing Protein 1 (HBP1) Protects Against Pancreatic Injury in Acute Pancreatitis but Promotes Neoplastic Progression
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101536
PMID:40404099
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研究论文 | 本研究探讨HBP1在急性胰腺炎和胰腺肿瘤进展中的双重作用 | 首次揭示HBP1在胰腺炎中具有保护作用但在KRAS突变背景下促进肿瘤进展的双重功能 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,需要更多临床验证 | 阐明HBP1在胰腺炎发生和胰腺肿瘤进展中的功能作用 | 人类胰腺炎样本、小鼠模型、人胰腺导管上皮细胞 | 分子病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、多重蛋白检测、组织学分析、免疫染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像、蛋白质数据 | 人类胰腺炎样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1030 | 2025-10-05 |
Malignant epithelia cells-derived spermine induces APOE+ macrophages to suppress tumor immunity in adenocarcinoma of the esophagogastric junction
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1636699
PMID:40963562
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研究论文 | 本研究揭示了食管胃结合部腺癌中恶性上皮细胞通过精胺诱导APOE+巨噬细胞抑制肿瘤免疫的机制 | 首次发现AEG特异性恶性亚型通过谷氨酰胺-精氨酸-精胺代谢轴驱动肿瘤免疫抑制,阐明精胺-STAT3-APOE轴在代谢-免疫串扰中的作用 | 样本量相对有限(单细胞RNA测序11例,空间转录组4例),需要更大规模验证 | 探究食管胃结合部腺癌进展机制,特别是代谢重编程与免疫微环境的相互作用 | 食管胃结合部腺癌患者的肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 数字病理学 | 食管胃结合部腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 单细胞RNA测序11例, 空间转录组4例, 代谢组分析26例 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1031 | 2025-10-05 |
Machine learning-based integration develops an immune-derived signature for diagnosing high-altitude pulmonary hypertension
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1603140
PMID:40963580
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,开发了一种基于免疫特征的诊断模型用于高原性肺动脉高压 | 首次采用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学的多组学整合方法,结合机器学习算法筛选出六基因诊断特征 | 样本量相对有限,外部验证队列的AUC值(0.773)低于训练队列(0.995) | 开发高原性肺动脉高压的微创血液诊断方法 | 高原性肺动脉高压患者和对照组的血液样本 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学,定量PCR | 随机森林 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 单细胞RNA测序10例,批量RNA测序126例,蛋白质组学42例,训练队列55例,验证队列71例 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
1032 | 2025-10-05 |
A machine learning-derived immune-related prognostic model identifies PLXNA3 as a functional risk gene in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653794
PMID:40963600
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研究论文 | 本研究通过机器学习构建了结直肠癌免疫相关预后模型,并鉴定PLXNA3为关键风险基因 | 整合100多种机器学习算法构建预后模型,首次系统揭示PLXNA3在结直肠癌中的免疫相关功能 | NA | 开发结直肠癌预后生物标志物并探索其生物学功能 | 结直肠癌患者转录组和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫组化 | LASSO, CoxBoost, StepCox | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1033 | 2025-10-05 |
Decoding paraneoplastic neuromyelitis optica: a multi-omics investigation of tumor-driven T and B cell dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665688
PMID:40963604
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综述 | 本文探讨多组学技术如何革新肿瘤相关性视神经脊髓炎谱系疾病中T细胞和B细胞功能动态的研究 | 首次系统整合多组学技术(基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)解析肿瘤驱动自身免疫反应的分子机制 | 将研究发现转化为临床应用仍面临重大挑战,需要开发可靠的分子特征来区分肿瘤性和特发性NMOSD | 阐明肿瘤如何通过分子模拟机制触发针对中枢神经系统的自身免疫反应 | 肿瘤相关性视神经脊髓炎谱系疾病患者的T细胞和B细胞 | 生物医学 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR测序, 多组学分析 | AI, 机器学习 | 基因组, 表观基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1034 | 2025-10-05 |
Topological data analysis in single cell biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615278
PMID:40963635
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综述 | 探讨拓扑数据分析在单细胞生物学中的应用及其数学框架 | 将拓扑数据分析这一数学框架引入单细胞生物学,能够捕捉传统方法难以发现的多尺度模式和复杂数据结构 | NA | 探索拓扑数据分析在单细胞生物学中的理论基础和应用前景 | 单细胞转录组学、蛋白质组学和空间生物学数据 | 生物信息学 | NA | 拓扑数据分析 | 持久同调、Mapper算法 | 单细胞多组学数据、空间生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
1035 | 2025-10-05 |
The prognostic model based on tumor-associated neutrophils contributes to the stromal landscape and influences metabolic reprogramming in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587947
PMID:40963631
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研究论文 | 基于肿瘤相关中性粒细胞构建结直肠癌预后模型,并分析其对基质景观和代谢重编程的影响 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别18个TAN相关基因构建结直肠癌预后模型,并系统分析其与基质浸润、代谢特征和治疗反应的关系 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发结直肠癌预后分层标志物并探索肿瘤微环境特征 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,LASSO回归 | 预后风险评分模型,列线图 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
1036 | 2025-10-05 |
Integrating scRNA-seq and GWAS data reveals potentially critical endothelial cells in large artery atherosclerotic stroke
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1646993
PMID:40963808
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和全基因组关联研究数据,揭示大动脉粥样硬化性卒中中潜在的关键内皮细胞亚型 | 首次整合脑血管分区结构的单细胞RNA测序数据与多种卒中类型的GWAS数据,通过遗传力分区分析卒中风险SNP位点在各类细胞中的富集情况 | 研究中使用的细胞类型和GWAS数据集有限,需要进一步验证关键内皮细胞亚型的功能作用 | 探索卒中的分子机制并确定主要的致病细胞类型 | 脑血管细胞(包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和胶质细胞) | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 基因集富集分析, 伪时间轨迹建模, 转录调控网络分析 | CELLEX, Monocle2, SCENIC | 基因表达数据, 基因型数据 | 14个血管细胞簇,三个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1037 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals prognostic stemness genes in leiomyosarcoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1604413
PMID:40963856
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别子宫肉瘤中的预后干性基因 | 首次结合单细胞和批量RNA-seq数据系统分析子宫肉瘤干性特征与预后的关系 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 识别子宫肉瘤的可靠预后标志物和治疗靶点 | 子宫肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习, Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的子宫肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1038 | 2025-10-05 |
Case Report: A large granular cell tumor of the cervical esophagus with single cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1580121
PMID:40963874
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病例报告 | 本研究报道一例大型宫颈食管颗粒细胞瘤病例,通过肌皮游离瓣修复术后缺损,并首次采用单细胞RNA测序分析肿瘤组织 | 首次对食管颗粒细胞瘤进行单细胞RNA测序分析,发现肿瘤中神经样细胞亚群富集及X染色体区域显著拷贝数变异增加 | 单一样本病例报告,结果需要更大样本量验证 | 研究食管颗粒细胞瘤的恶性潜能标志物以指导临床治疗选择 | 宫颈食管颗粒细胞瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 食管肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者(肿瘤及癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1039 | 2025-10-05 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals a Pathological Niche Formed by FAP+ Fibroblasts, Immune, and Endothelial Cells in Psoriatic Lesions
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S541106
PMID:40963886
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示银屑病病变中由FAP+成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞形成的病理生态位 | 发现银屑病病变皮肤特有的CD4+组织驻留记忆T细胞亚群和新型静脉内皮细胞亚群Venous endo2,并首次揭示这些细胞与FAP+成纤维细胞、T细胞和抗原呈递细胞在空间上的共定位形成病理生态位 | NA | 阐明银屑病病变中免疫微环境的细胞和分子相互作用机制 | 银屑病患者的病变皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
1040 | 2025-10-05 |
Nociceptive Neurons Promote Myeloid-Derived Suppressor Cell Mobilization to Alleviate Post-Stroke Neuroinflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.119474
PMID:40963921
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研究论文 | 本研究揭示了伤害性神经元通过释放CGRP调控骨髓免疫反应缓解脑卒中后神经炎症的机制 | 首次发现伤害性神经元在脑梗死后通过CGRP信号促进髓系偏向造血和MDSC动员的神经免疫调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;靶向递送系统的长期安全性需进一步评估 | 探究伤害性神经元在脑卒中后免疫调控中的作用及治疗策略 | MCAO小鼠模型和卒中患者颅骨骨髓样本 | 神经免疫学 | 脑卒中 | 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、受体敲除、纳米颗粒递送 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 小鼠模型和人类卒中患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |