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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-06-05 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
|
review | 综述单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用，总结宿主-真菌病原体相互作用的关键发现和动态 | 系统梳理scRNA-seq在真菌感染领域的最新进展，强调其在解析宿主-真菌互作细胞异质性方面的独特优势 | 当前scRNA-seq在真菌感染研究中应用有限，存在技术挑战和研究空白 | 推动单细胞技术在真菌感染研究中的更广泛应用，促进诊断和治疗发展 | 宿主细胞与真菌病原体 | 机器学习 | 真菌感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1022 | 2026-06-05 |
THE molecular mechanisms underlying synovial fibroblast differentiation in knee osteoarthritis revealed by single-cell transcriptome sequencing
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047870
PMID:42216392
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示膝骨关节炎中滑膜成纤维细胞分化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别了膝骨关节炎滑膜成纤维细胞的7条分化轨迹和关键标志基因，提供了滑膜成纤维细胞分化的精细分子框架 | 样本量较小，仅包含3例膝骨关节炎样本，且未纳入正常对照或治疗验证 | 深入分析膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的单细胞转录组数据，识别关键靶基因和分子机制，为临床靶向治疗提供分子水平理论支持 | 膝骨关节炎患者滑膜组织中的滑膜成纤维细胞 | 机器学习 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个膝骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE176308来自基因表达综合数据库 |
| 1023 | 2026-06-05 |
Association of DNA damage repair related genes with prostate cancer: A multi-omics Mendelian Randomization analysis
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049185
PMID:42216412
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research paper | 采用多组学孟德尔随机化方法探究DNA损伤修复相关基因与前列腺癌的因果关系 | 首次通过多组学孟德尔随机化分析整合DNA损伤修复相关基因的甲基化、表达和蛋白质丰度与前列腺癌风险的遗传因果关联 | 研究基于欧洲人群队列，结论推广至其他种族人群可能存在局限性 | 阐明DNA损伤修复相关基因与前列腺癌风险之间的因果关系 | DNA损伤修复相关基因RPA2和POLI | machine learning | prostate cancer | NGS, single-cell sequencing | NA | multi-omics data | 多个欧洲队列的定量性状位点数据及全基因组关联研究数据 | Illumina | single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | single-cell sequencing analysis |
| 1024 | 2026-06-05 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
|
研究论文 | 通过分析12种癌症类型的空间转录组数据，构建泛癌三级淋巴结构图谱，并表征其空间结构和成熟状态 | 首次构建泛癌三级淋巴结构空间图谱，结合超高通量单细胞空间分析揭示成熟过程中的细胞生态位重塑，并开发AI框架从H&E染色图像预测TLS成熟状态 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于公共数据集的可推广性及AI模型的泛化能力 | 系统解析三级淋巴结构的空间组织、成熟状态及其在不同癌症类型中的临床相关性 | 12种癌症类型的空间转录组样本及独立治疗队列的病理图像 | 数字病理学, 计算机视觉 | 癌症（泛癌），肺癌，前列腺癌等 | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 组织病理图像AI分析 | 人工智能框架（具体类型未明确，可能为深度学习模型） | 图像，空间转录组数据 | 12种癌症类型的空间转录组样本，TCGA及多个独立治疗队列 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组分析，10x Chromium用于超高通量单细胞空间分析 |
| 1025 | 2026-06-05 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-May-28, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103476
PMID:42214760
|
研究论文 | 使用加速卵巢衰竭小鼠模型，研究急性木材烟雾暴露对海马细胞特异性转录组反应的影响 | 首次结合空间转录组学和加速卵巢衰竭模型，揭示围绝经期激素状态如何放大木材烟雾暴露引起的海马细胞特异性转录组变化 | 未提及具体局限性 | 探究围绝经期样激素状态是否加剧急性木材烟雾暴露对海马的反应 | 雌性C57BL/6小鼠，使用4-乙烯基环己烯二环氧化物诱导的加速卵巢衰竭模型 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 每组4个海马切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台，用于分析海马组织切片 |
| 1026 | 2026-06-05 |
Atlas-Level Single-Cell and Spatial Transcriptomics Data Integration via PRIME
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.20.726698
PMID:42239079
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研究论文 | 提出PRIME集成框架，用于大规模单细胞RNA测序和空间转录组数据的图谱级整合 | 结合随机投影共识锚定、图拉普拉斯校正和空间邻域正则化，能在数百万细胞规模下同时处理批次校正和空间一致性 | 未提及在极端不平衡细胞类型组成或超大规模数据集（如千万级细胞）上的性能表现 | 开发一种可扩展的图谱级数据集成方法，用于单细胞RNA-seq和空间转录组数据的联合分析 | 人类造血系统、背外侧前额叶皮层切片及药物扰动图谱等多源数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 图拉普拉斯模型，随机投影 | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 约33,000个细胞（人类造血基准数据）、超过100万个细胞（药物扰动图谱） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1027 | 2026-06-05 |
Current evidence on the cell of origin of meningiomas disputes the arachnoid cap cell dogma
2026-05-21, Acta neurochirurgica
IF:1.9Q2
DOI:10.1007/s00701-026-06908-1
PMID:42165909
|
综述 | 重新审视脑膜瘤起源的传统观点，质疑蛛网膜帽细胞假说，并提出基于单细胞转录组学等多组学证据的更复杂异质性起源 | 综合单细胞转录组学、空间测序、发育生物学和转基因动物模型的新证据，挑战统治百年的蛛网膜帽细胞假说，提出脑膜瘤起源的异质性和区域性 | 仅为一篇小型综述，缺乏原始实验数据验证，也可能受限于历史研究样本和传统技术的偏见 | 批判性评估脑膜瘤细胞起源的传统观点，推动基于多组学和发育生物学的更准确分类和治疗策略 | 脑膜瘤的细胞起源，包括蛛网膜帽细胞、成纤维细胞样或区域特异的脑膜祖细胞 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、空间测序、多组学、发育生物学、转基因动物模型 | NA | 分子和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1028 | 2026-06-05 |
Multiomic study of cutaneous T-cell lymphoma reveals single-cell clonal evolution in progression and therapy resistance
2026-May-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029012
PMID:41662591
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示皮肤T细胞淋巴瘤在疾病进展和治疗耐药中的单细胞克隆演化 | 首次以单细胞分辨率结合外显子组、全基因组、表观基因组、T细胞受体和RNA测序等多组学数据，全面解析CTCL的克隆演化机制，发现Rho GTPase通路失调在CTCL进展中的新作用 | 未提及具体局限性 | 明确CTCL在单细胞水平上的进展机制，识别临床有用的生物标志物和治疗靶点 | 来自34名CTCL患者的99份临床标注的系列皮肤、外周血和淋巴结样本 | 机器学习 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 外显子组测序、全基因组测序、表观基因组测序、批量RNA测序、单细胞T细胞受体测序、单细胞RNA测序、CUT&RUN | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | 34名患者的99份样本 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 使用Illumina NovaSeq进行高通量测序 |
| 1029 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics-informed induced pluripotent stem cells differentiation to tenogenic lineage
2026-05-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89652
PMID:42165310
|
研究论文 | 基于单细胞转录组学信息指导诱导多能干细胞向腱系分化 | 利用单细胞RNA测序和通路分析，通过化学定义培养基和小分子实现人诱导多能干细胞逐步分化为腱节阶段，并发现WNT抑制剂可去除神经脱靶细胞并提高腱节诱导效率 | 未提及 | 开发基于细胞的腱疗法，通过优化体外腱分化流程解决当前挑战 | 人诱导多能干细胞向腱系分化过程中的细胞类型和信号通路 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1030 | 2026-06-05 |
Single-cell atlas reveals the key role of pro-inflammatory IREB2⁺ microglia subsets in the microenvironment of Alzheimer's disease
2026-May-20, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02188-2
PMID:42159858
|
研究论文 | 通过单细胞图谱揭示IREB2⁺小胶质细胞亚群在阿尔茨海默病微环境中的促炎作用 | 首次鉴定出IREB2⁺小胶质细胞亚群（IREB2⁺ MC C1）在阿尔茨海默病中显著扩增，并证实IREB2同时驱动小胶质细胞活化和神经元炎症反应，提出双靶向治疗策略 | 可能缺乏体内动物模型验证，且IREB2在神经元中的调控机制仅通过SH-SY5Y细胞系初步验证 | 阐明IREB2在阿尔茨海默病相关神经炎症中的功能角色及其小胶质细胞亚群特性 | 阿尔茨海默病脑组织单细胞RNA测序数据及人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, siRNA敲低 | NMF, 细胞间通信算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1031 | 2026-06-05 |
Single-fiber morphometry and spatial transcriptomics reveal selective oxidative muscle fiber atrophy in non-metastatic breast cancer
2026-May-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.05.11.26351978
PMID:42238445
|
研究论文 | 通过单纤维形态测量和空间转录组学揭示非转移性乳腺癌中选择性氧化肌纤维萎缩 | 首次将空间转录组学应用于癌症患者骨骼肌研究，并建立了结合单纤维形态测量和空间转录组学的综合框架 | 信息未提供 | 探究非转移性乳腺癌相关骨骼肌病理变化及其在癌症相关疲劳中的作用 | 非转移性乳腺癌患者和健康对照者的胸大肌活检样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单纤维形态测量, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者和健康对照者的胸大肌活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1032 | 2026-06-05 |
A harmonized single-cell RNA-seq atlas of human localized and metastatic prostate cancers and benign tissues
2026-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.18.725966
PMID:42239107
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1033 | 2026-06-05 |
Accelerated amyloid neurodegeneration in HIV-1-infected APP-KI Alzheimer's disease mice
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.16.725620
PMID:42239074
|
研究论文 | 创建了一种新型APP敲入AD小鼠模型，研究HIV-1复制对阿尔茨海默病理的影响 | 首次构建了NOG/APP KM670,671NL /IL-34 (hNAIL)小鼠模型，允许同时研究HIV-1复制和AD病理 | 未明确提及 | 探究HIV-1感染与阿尔茨海默病病理之间的机制联系 | HIV-1感染的APP敲入阿尔茨海默病小鼠 | 机器学习 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 4月龄CD34+人类细胞重建小鼠感染HIV-1 ADA毒株 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1034 | 2026-06-05 |
Neuroprotection following FLASH-RT may be mediated by sustained glutamate receptor AMPAR activation in CA3 neurons
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.725423
PMID:42239092
|
研究论文 | 通过空间转录组学揭示FLASH-RT对CA3神经元中AMPAR的持续激活介导的神经保护机制 | 首次发现FLASH辐照通过持续上调谷氨酸受体AMPAR表达，提供长期神经保护，并揭示早期钙离子内流与后续AMPAR持续表达的可能机制 | 未提及具体局限性 | 阐明FLASH-RT在正常大脑中长期神经保护作用的早期机制 | C57BL/6J小鼠海马CA3和DG区域神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | C57BL/6J小鼠经全脑照射，使用1或3个分次10 Gy，FLASH剂量率5.6×10^6 Gy/s或常规剂量率0.1 Gy/s | Nanostring | 空间转录组学 | Nanostring平台 | NA |
| 1035 | 2026-06-05 |
Integrated spatial transcriptomic and metabolic profiling identifies molecular networks associated with cognitive performance in the porcine prefrontal cortex
2026-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 整合空间转录组学与代谢组学分析猪前额叶皮层，揭示认知能力相关的分子网络 | 首次在大型脑回类动物中构建空间分辨多组学框架，将转录活动、代谢状态与神经化学信号联系起来，识别出与认知表现相关的新基因 | 研究主要聚焦于皮层III-V层，未涵盖其他皮层区域，且结果基于猪模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 阐明认知功能的分子结构基础，探索神经退行性疾病的通路 | 猪前额叶皮层（特别是III-V层）及分层小鼠模型 | 空间转录组学、代谢组学、数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学、代谢组学、免疫组织化学分析、Y迷宫行为测试 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据、组织图像 | 猪组织样本（具体数量未说明）及分层小鼠模型（用于Y迷宫行为测试） | NA | 空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 1036 | 2026-06-05 |
Workload-induced changes to cell state contribute to β-cell failure in diabetes
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.725004
PMID:42239070
|
研究论文 | 揭示工作量诱导的β细胞状态变化在2型糖尿病中导致β细胞衰竭的机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义工作量诱导的β细胞转录状态变化，识别出与失代偿β细胞应激状态不同的新型补偿状态，并发现Lsd1在约束β细胞状态转变中的关键作用 | 研究主要在动物模型中进行，结果在人类中尚需进一步验证 | 探讨β细胞在2型糖尿病自然病程中从功能正常到失代偿的进展机制 | β细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 糖尿病小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1037 | 2026-06-05 |
AKT3-Driven Epithelial-Mesenchymal Plasticity Governs Ovarian Metastasis in Colorectal Cancer via Tumor Microenvironment Remodeling
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1718
PMID:41662163
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组分析，揭示AKT3驱动的上皮-间充质可塑性通过肿瘤微环境重塑调控结直肠癌卵巢转移的机制 | 首次鉴定AKT3+上皮间充质转化样细胞作为结直肠癌卵巢转移起始细胞，并揭示其与癌相关成纤维细胞的互作形成前馈环路驱动转移 | 未提及 | 阐明结直肠癌卵巢转移的生物学机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌卵巢转移患者的肿瘤样本、异种移植模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 结直肠癌，卵巢转移 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，多重免疫荧光染色，异种移植模型，患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据，多重免疫荧光图像 | 35名患者的155,163个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 1038 | 2026-06-05 |
The modified Zuojin formula (SQQT) associates ILC2-linked JAK-2/STAT5/c-Myc cascade and gastric metaplasia regression
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121345
PMID:41663001
|
研究论文 | 改良左金方通过ILC2介导的JAK-2/STAT5/c-Myc通路促进胃化生消退的机制研究 | 首次揭示了改良左金方通过调控ILC2激活及JAK-2/STAT5/c-Myc通路这一新机制来治疗胃化生 | 未明确说明研究局限性，可能包括样本量有限或动物模型与临床转化的差异 | 研究改良左金方在免疫微环境中对胃化生治疗的机制 | 胃化生患者及他莫昔芬诱导的胃化生小鼠模型 | 数字病理学 | 胃化生 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胃化生患者样本和小鼠模型，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1039 | 2026-06-05 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104201
PMID:42196184
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性和与线粒体自噬相关的生物标志物 | 首次整合单细胞和批量转录组分析，揭示RACGAP1和KIF11在IPF巨噬细胞-线粒体自噬轴中的关键作用，为理解IPF发病机制中的巨噬细胞-线粒体自噬轴提供新框架 | NA | 阐明特发性肺纤维化、巨噬细胞和线粒体自噬之间的关联，以推进早期诊断和临床管理 | IPF患者的巨噬细胞亚群和相关生物标志物 | 机器学习 | 肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1040 | 2026-06-05 |
Accurate classification of ependymomas and medulloblastomas using Raman spectroscopy and pilot transcriptomic profiling
2026-May-05, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy
DOI:10.1016/j.saa.2026.127532
PMID:41653757
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研究论文 | 利用拉曼光谱和后颅窝室管膜瘤与髓母细胞瘤的转录组谱分析实现准确分类 | 首次将拉曼光谱与空间转录组学结合，用于区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤，并在冷冻和FFPE标本中验证了分类模型的准确性 | 样本量较小（34份标本），患者级别的性能需在更大队列中验证，且为回顾性研究 | 评估拉曼光谱在区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤中的准确性，并探索相关生化差异的生物学背景 | 后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤的冷冻及FFPE组织标本 | 数字病理学 | 脑肿瘤（室管膜瘤和髓母细胞瘤） | 拉曼光谱，空间转录组学 | 主成分分析-支持向量机分类器 | 光谱数据，转录组数据 | 34份标本（21份冷冻，13份FFPE） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium In Situ v2 FFPE workflow | 10x Genomics Xenium In Situ v2 FFPE工作流程 |