单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-05-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity and Interactions Between Epithelial Cells and Fibroblasts in Post-ESD Oesophageal Stricture
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70411
PMID:39910700
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究食管狭窄组织中上皮细胞和成纤维细胞的异质性及其相互作用 | 首次在单细胞水平揭示了食管狭窄组织中上皮细胞和成纤维细胞的异质性及其相互作用，并识别了关键的配体-受体对 | 样本量有限，未进行功能验证实验 | 阐明食管狭窄形成的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 食管狭窄组织和正常对照组织 | 单细胞测序 | 食管狭窄 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 食管狭窄样本和正常对照样本（具体数量未说明） |
| 1022 | 2025-05-07 |
IgG Signalling Involves in Skin Inflammation of Atopic Dermatitis
2025-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70058
PMID:39912287
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研究论文 | 本研究探讨了IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型（特别是IgG）在特应性皮炎（AD）皮肤病变中的作用 | 揭示了IgG在AD皮肤炎症中的潜在作用及其通过巨噬细胞促进Th2炎症的机制 | 未明确IgG具体通过何种机制激活巨噬细胞及促进炎症 | 研究IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型在AD皮肤病变中的作用 | 特应性皮炎患者及非过敏性健康受试者的皮肤病变和PBMCs | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、BCR库分析 | NA | mRNA数据、单细胞RNA测序数据 | AD患者及健康受试者的皮肤病变和PBMCs样本 |
| 1023 | 2025-05-07 |
Derivation of a Human Brain Organoid with Microglia Development
2025-Jan-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67491
PMID:39895643
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research paper | 该研究开发了一种包含小胶质细胞发育的人类大脑类器官模型，用于研究神经炎症和神经感染性疾病 | 通过将iPSC分化的造血祖细胞（HPC）整合到iPSC衍生的胚胎体（EBs）中，成功构建了同时包含小胶质细胞和神经元的大脑类器官模型 | 当前方法在技术上具有挑战性，可能导致最终类器官中小胶质细胞的数量和质量存在不一致性 | 研究小胶质细胞与神经元发育的早期相互作用，以及神经炎症和神经感染性疾病的模型建立 | 人类大脑类器官 | 神经科学 | 神经炎症和神经感染性疾病 | 免疫染色和单细胞RNA测序（sc-RNA-seq）分析 | 3D类器官模型 | 基因表达数据和图像数据 | NA |
| 1024 | 2025-05-07 |
APMAT analysis reveals the association between CD8 T cell receptors, cognate antigen, and T cell phenotype and persistence
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631993
PMID:39829843
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研究论文 | 本文介绍了一种名为APMAT的实验计算框架，用于高通量捕获和分析CD8 T细胞，以及配对抗原、TCR序列和单细胞转录组 | 开发了APMAT框架，首次实现了抗原-TCR配对与T细胞表型的多组学分析，揭示了抗原-TCR对的物理化学特征与T细胞表型和持久性的强关联 | 研究仅针对HLA A*02:01 COVID-19参与者，样本量相对有限（62人） | 阐明I类肽抗原、特异性CD8 T细胞受体（TCR）和抗原刺激后出现的T细胞表型之间的关系 | CD8 T细胞及其TCR序列、抗原和单细胞转录组 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞分析、高通量测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 62名HLA A*02:01 COVID-19参与者 |
| 1025 | 2025-05-07 |
Analysis of synthetic polymer hydrogel-based generation of leukemia stem cells
2025-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151149
PMID:39700762
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研究论文 | 本文通过合成聚合物水凝胶培养K562白血病细胞，使其获得白血病干细胞特性，并研究了AKR1B1和TSPYL5在干细胞特性生成中的关键作用 | 首次利用合成聚合物水凝胶培养系统快速生成白血病干细胞，并鉴定出AKR1B1和TSPYL5作为潜在的干细胞治疗靶点 | 研究仅针对K562白血病细胞系，未在其他白血病模型或体内实验中验证 | 开发快速生成白血病干细胞的方法并探索其治疗靶点 | K562白血病细胞 | 癌症研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | K562细胞系 |
| 1026 | 2025-05-07 |
TBX3 shapes an immunosuppressive microenvironment and induces immunotherapy resistance
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.103175
PMID:39897553
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research paper | 该研究探讨了TBX3在膀胱癌免疫抑制微环境中的作用及其对免疫治疗抵抗的影响 | 首次系统性地揭示了TBX3通过调节TGFβ1表达促进免疫抑制微环境形成的分子机制，并验证了TBX3作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证TBX3的临床应用价值 | 探索膀胱癌免疫治疗抵抗的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 膀胱癌组织和细胞 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、高通量细胞因子阵列、ProcartaPlex多重免疫分析、TissueFAXS全景组织定量分析 | NA | RNA测序数据、组织微阵列数据 | 多个公共数据库样本和真实世界免疫治疗队列 |
| 1027 | 2025-05-07 |
Glycosphingolipids-Dependent Phospholipid Metabolism Enhances Cancer Initiation and Progression through SMPD1/GLTP/B3GALT4/ST8SIA6 Signaling Axis: A Novel Therapeutic Target
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.103834
PMID:39898245
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序数据和TCGA数据库，研究鞘脂代谢在结直肠癌发生发展中的关键作用 | 发现鞘脂代谢失调在结直肠癌发展中的关键作用，并确定了几个潜在的治疗靶点 | 未提及实验验证或临床前研究的具体结果 | 探索结直肠癌发生发展的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 结直肠癌细胞 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA |
| 1028 | 2025-05-07 |
Comprehensive Pan-Cancer Analysis of RAC1 Decoding the Impact on Cancer Prognosis and B cell immune Regulation
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.104488
PMID:39898257
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研究论文 | 本文对RAC1在33种癌症类型中的表达及其对癌症预后和B细胞免疫调节的影响进行了全面分析 | 揭示了RAC1在多种癌症中的高表达及其与不良预后的关联，首次系统研究了RAC1在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探索RAC1在泛癌水平上的表达特征及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 33种癌症类型中的RAC1表达 | 癌症基因组学 | 泛癌分析 | 基因组变异分析（CNV、TMB、MSI）、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | 预后特征模型 | 基因组数据、转录组数据 | 33种癌症类型的多组学数据 |
| 1029 | 2025-05-07 |
Research Trends and Dynamics in Single-cell RNA Sequencing for Musculoskeletal Diseases: A Scientometric and Visualization Study
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.104697
PMID:39898252
|
研究论文 | 本研究通过科学计量和可视化方法，分析了过去15年单细胞RNA测序技术在肌肉骨骼疾病研究中的应用趋势和动态 | 首次对scRNA-seq在肌肉骨骼疾病领域的应用进行全面科学计量和可视化分析，揭示了研究趋势、关键方向和未来前景 | 数据来源仅限于Web of Science核心合集，可能未涵盖所有相关研究 | 分析scRNA-seq技术在肌肉骨骼疾病研究中的应用进展和趋势 | 肌肉骨骼疾病相关的scRNA-seq研究文献 | 数字病理 | 肌肉骨骼疾病 | scRNA-seq | NA | 文献数据 | Web of Science核心合集中2009年1月1日至2024年9月6日的相关文献 |
| 1030 | 2025-05-07 |
Integrating Tissue Microarray to GeoMx® Digital Spatial Profiler : Spatial Transcriptomics Assay with Bioinformatics Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_9
PMID:39900760
|
研究论文 | 本文介绍了如何将组织微阵列整合到GeoMx®数字空间分析仪中，进行空间转录组学检测及生物信息学分析 | 详细描述了数字空间分析仪（DSP）的NGS检测协议及生物信息学分析流程，特别关注组织微阵列的整合及GeoMx RNA检测的特定方法 | 依赖于NanoString公司提供的GeoMX DSP指南和GeoMx数据分析手册的当前版本，需定期检查更新 | 推动空间转录组学技术在疾病研究和治疗中的应用 | 组织微阵列和GeoMx RNA检测 | 空间转录组学 | NA | NGS, RNA-Seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1031 | 2025-05-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_13
PMID:39900764
|
研究论文 | 介绍了一种名为SciDAP的用户友好平台，用于加速单细胞测序数据分析 | SciDAP平台为不具备计算专业知识的生物学家提供了便携且可重复的测序数据分析流程，使用Common Workflow Language (CWL)编写 | 未提及具体的数据分析精度或与其他平台的比较 | 解决单细胞测序数据分析中的复杂性和可重复性问题 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-Seq)和单细胞多组学测序(scMultiome)数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq, scATAC-Seq, scMultiome, scVDJ-Seq | NA | 测序数据 | NA |
| 1032 | 2025-05-07 |
Analysis of downstream targets of PAX6 and LHX2, fundamental regulators of the developing mammalian neocortex
2025, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39912400
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研究论文 | 分析PAX6和LHX2这两个哺乳动物大脑皮层发育中的基本调控因子的下游靶基因 | 比较了PAX6和LHX2的染色质占据情况以及各自缺失时的转录失调，识别了共同直接和间接靶基因，并分析了它们在神经发生过程中的表达模式 | 未进行实验验证所提出的假设 | 探究PAX6和LHX2在哺乳动物大脑皮层发育中的基因调控网络 | PAX6和LHX2转录因子及其下游靶基因 | 发育生物学 | NA | 染色质占据分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 1033 | 2025-05-07 |
Biophysical model for joint analysis of chromatin and RNA sequencing data
2024-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.110.064405
PMID:39916216
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研究论文 | 提出了一种用于联合分析染色质和RNA测序数据的生物物理模型 | 开发了一种生物物理模型，用于参数化多组数据，并评估多组数据相对于未注册的单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq的优势 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 研究如何联合分析染色质可及性和基因表达数据，以评估多组数据的优势 | 染色质动态和转录过程 | 生物信息学 | NA | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞多组学方法 | 生物物理模型 | 测序数据 | NA |
| 1034 | 2025-05-07 |
Cell-type deconvolution for bulk RNA-seq data using single-cell reference: a comparative analysis and recommendation guideline
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf031
PMID:39899596
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研究论文 | 本文通过系统评估九种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，提出了在不同场景下选择合适方法的推荐指南 | 首次系统比较了多种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，并提出了实用推荐指南 | 研究仅评估了九种方法，可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法在组织细胞类型比例估计中的准确性和鲁棒性 | 九种反卷积方法和五组单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 五组单细胞RNA测序数据集和真实批量数据 |
| 1035 | 2025-05-07 |
Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599799
PMID:38948852
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了少突胶质细胞中转录因子的协同作用对基因调控的影响 | 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，识别了少突胶质细胞中协同调控靶基因表达的转录因子对，并利用深度学习模型预测了这些转录因子的重要性 | 研究主要基于计算模型预测，部分结果需要实验验证 | 探究少突胶质细胞中转录因子如何协同调控基因表达 | 少突胶质细胞及其转录因子 | 生物信息学 | 脑部疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, ChIP-seq | 深度学习模型 | 单细胞多组学数据 | NA |
| 1036 | 2025-05-07 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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research paper | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞在治疗异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病中的疗效和安全性 | 首次使用供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发的AML患者，并探索了CAR-T细胞输注前的CD4+和CD8+比例调整以减轻副作用 | 样本量较小（12例患者），且2例患者因疾病快速进展退出研究 | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞在治疗AML中的疗效和安全性 | 14例异基因造血干细胞移植后复发的AML患者（最终12例接受治疗） | 肿瘤免疫治疗 | 急性髓系白血病（AML） | scRNA-seq | CAR-T细胞疗法 | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 12例接受治疗的AML患者 |
| 1037 | 2025-05-07 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学特性及免疫微环境，为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 利用单细胞RNA测序技术系统研究HGSOC的肿瘤异质性和免疫微环境，发现与不良预后相关的C2 IGF2+肿瘤细胞亚型及其与肿瘤进展的关联 | 研究依赖于公开数据库的scRNA-seq数据，可能受限于样本量和数据质量 | 揭示HGSOC进展和治疗抵抗的分子机制，开发更有效的个性化治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤细胞亚型及其免疫微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 1038 | 2025-05-07 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析，探讨循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及潜在生物标志物 | 结合孟德尔随机化和转录组学数据，首次系统性地研究了免疫细胞表型与IPF的因果关系，并鉴定了三个新的生物标志物 | 研究依赖于公开数据库的GWAS数据，可能存在样本选择偏倚 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化患者 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学分析、单细胞RNA测序 | IVW等五种孟德尔随机化方法 | 基因组关联研究数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公开数据库的GWAS数据和IPF患者样本 |
| 1039 | 2025-05-07 |
Novel pyroptosis-immune-related lncRNA signature exhibits a distinct immune cell infiltration landscape in breast cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522327
PMID:39906743
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研究论文 | 本研究通过分析焦亡和免疫相关的长链非编码RNA（lncRNA），构建了一个六-lncRNA特征，用于预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个结合焦亡和免疫相关lncRNA的特征，用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应，并揭示了不同的免疫细胞浸润模式 | 研究依赖于TCGA数据集，需要进一步的外部验证 | 识别乳腺癌的潜在治疗靶点，并预测患者的预后和免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | Pearson相关系数、单变量Cox回归分析、LASSO方法、单细胞测序 | 六-lncRNA特征模型 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的乳腺癌患者样本 |
| 1040 | 2025-05-07 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
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研究论文 | 一项关于BTK抑制剂zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫住院患者中的随机、安慰剂对照试验，评估其免疫生物标志物和临床效果 | 研究评估了新一代BTK抑制剂zanubrutinib在SARS-CoV-2感染患者中的效果，并观察其对免疫反应的影响 | zanubrutinib在临床恢复方面未显示出优于安慰剂的效果，可能与大多数患者同时接受类固醇和抗病毒治疗有关 | 评估zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫患者中的治疗效果及其对免疫反应的影响 | COVID-19呼吸窘迫住院患者 | 医学研究 | COVID-19 | 随机对照试验、单细胞转录组分析 | NA | 临床数据、生物标志物数据 | 队列1有63名患者（zanubrutinib组30名，安慰剂组33名），队列2有4名患者 |