单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10361 - 10380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10361 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Reveals Novel Mechanisms Involved in Perineural Invasion in Pancreatic Ductal Adenocarcinomas
2025-Mar-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050852
PMID:40075699
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术研究胰腺导管腺癌神经侵袭的新机制 | 首次使用空间转录组学揭示神经侵袭病灶对肿瘤微环境免疫景观的影响，并发现内源性大麻素和多胺代谢在神经侵袭中的作用 | 样本量较小（13例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探索胰腺导管腺癌中神经侵袭的分子机制 | 胰腺导管腺癌患者的神经侵袭和非神经侵袭病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，全转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 13例PDAC患者 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析系统 |
| 10362 | 2025-10-07 |
Single cell analysis identifies distinct CD4 + T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity related asthma
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88423-4
PMID:40000680
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+T细胞亚型 | 首次在儿童肥胖相关哮喘中鉴定出具有CDC42上调的特定CD4+T细胞亚群，并揭示其与糖皮质激素抵抗的关联机制 | 研究样本量有限，未涉及其他免疫细胞类型的分析 | 探究儿童肥胖相关哮喘中CD4+T细胞亚型的特征及其在疾病发生中的作用 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+T细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及肥胖哮喘、单纯肥胖和健康体重对照组的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10363 | 2025-10-07 |
Cancer-Associated Fibroblasts Genes and Transforming Growth Factor Beta Pathway in Gastric Cancer for Novel Therapeutic Strategy
2025-Feb-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050795
PMID:40075643
|
综述 | 本文综述了胃癌中癌症相关成纤维细胞基因及其与TGF-β通路的相互作用，为开发新治疗策略提供见解 | 整合单细胞RNA测序数据揭示CAFGs在广义CAFs（包括周细胞）中的表达模式，并系统评估其预后价值 | 与结直肠癌相比，胃癌中CAFGs功能机制研究不足，且缺乏足够的显微切割数据验证表达模式 | 总结CAFGs在胃癌中的分子特征、预后意义和功能机制，探索其治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞基因(CAFGs)和TGF-β信号通路 | 肿瘤微环境研究 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 临床病理学研究 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10364 | 2025-10-07 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
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研究论文 | 通过空间转录组学和单核RNA测序技术构建人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 首次结合Visium空间转录组学和单核RNA测序技术，在非病理性人类脑组织中系统揭示细胞衰老的异质性特征 | 研究基于非病理性组织，样本数量未明确说明 | 探索人类背外侧前额叶皮层中细胞衰老的转录组特征 | 人类背外侧前额叶皮层组织 | 空间生物学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,单核RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | Visium空间转录组技术,snRNA-seq单核RNA测序技术 |
| 10365 | 2025-10-07 |
Deciphering the generation of heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma metastasis via single-cell multiomics analysis
2025-Feb-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06154-6
PMID:39905485
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示食管鳞状细胞癌转移过程中异质性的产生机制 | 首次在单细胞水平整合scATAC-seq、scRNA-seq、ChIP-seq/CUT&Tag、Hi-C和bulk测序数据，系统解析ESCC转移中的染色质可及性调控网络 | 样本量较小（仅4例患者），且患者病理分期不同可能影响结果一致性 | 探究染色质可及性在食管鳞状细胞癌转移和异质性形成中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者的癌组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scATAC-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, CUT&Tag, Hi-C, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | 多组学整合分析 | 单细胞测序数据、表观基因组数据、转录组数据 | 4例ESCC患者（T1a、T2b、T3b、T4a分期）的癌和癌旁组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10366 | 2025-10-07 |
Differences in immune cells and gene expression in human milk by parity on integrated scRNA sequencing
2025-Feb, Clinical and experimental pediatrics
IF:3.2Q1
DOI:10.3345/cep.2024.01585
PMID:39810510
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据，研究胎次对人类母乳中免疫细胞组成和基因表达的影响 | 首次利用公开scRNA-seq数据集系统分析胎次对人类母乳免疫细胞异质性的影响 | 使用公开数据集，样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明胎次对人类母乳免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 人类母乳样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中的母乳样本（初产妇vs经产妇） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10367 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
|
研究论文 | 本文提供了使用GeoMx数字空间分析仪进行炎症性皮肤病空间转录组研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案 | 主要基于作者自身实验经验，缺乏大规模验证 | 探讨数字空间分析技术在皮肤病研究中的应用潜力 | 炎症性皮肤病包括银屑病、扁平苔藓和盘状红斑狼疮 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 10368 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10369 | 2025-10-07 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺损伤后巨噬细胞亚群，揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞是组织损伤的保守反应而非纤维化特异性程序 | 首次发现巨噬细胞亚群聚类主要由细胞起源和组织分区驱动而非损伤模型，并鉴定出Gpnmb表达巨噬细胞作为组织损伤的保守反应标志 | 研究仅基于小鼠模型和已有的人类数据集，需要进一步实验验证机制 | 探究肺损伤后不同巨噬细胞亚群在健康修复和纤维化修复中的不同作用机制 | 小鼠肺巨噬细胞和人类肺疾病数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS或博来霉素处理的小鼠肺巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10370 | 2025-10-07 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的年龄预测回归模型PolyEN | 提出了PolyEN模型，能够学习基因表达随时间的连续表示，并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据预测肺衰老 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 机器学习 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10371 | 2025-10-07 |
Metastasis of colon cancer requires Dickkopf-2 to generate cancer cells with Paneth cell properties
2024-Nov-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97279
PMID:39535280
|
研究论文 | 本研究揭示了Dickkopf-2（DKK2）通过调控HNF4A蛋白水平促进结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的新机制 | 首次发现DKK2在结肠癌转移中通过下调HNF4A蛋白水平诱导潘氏细胞特性癌细胞生成 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究结肠癌转移过程中潘氏细胞特性癌细胞生成的分子机制 | 结肠癌细胞、小鼠模型、患者转移样本 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 染色质可及性分析, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | C57BL/6小鼠模型和患者转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10372 | 2025-10-07 |
Single-cell, spatial, and fate-mapping analyses uncover niche dependent diversity of cochlear myeloid cells
2024-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.30.621184
PMID:39554030
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、命运图谱和联体共生实验揭示了小鼠耳蜗中五种髓系细胞亚群的多样性特征 | 首次系统揭示了耳蜗微环境中组织驻留巨噬细胞在基因表达、空间分布、发育起源和功能方面的独特异质性 | 研究主要聚焦小鼠模型，人类耳蜗巨噬细胞的特征仍需进一步验证 | 探索耳蜗髓系细胞的多样性及其与微环境的关系 | 小鼠耳蜗组织中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 听力相关疾病 | 单细胞转录组测序, 命运图谱分析, 联体共生实验 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 小鼠耳蜗组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10373 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals organized and distinct immune activation in cutaneous granulomatous disorders
2024-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.021
PMID:39098508
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了非感染性皮肤肉芽肿疾病中免疫激活的空间组织模式 | 首次在皮肤肉芽肿疾病中应用空间转录组学技术，揭示了不同疾病类型具有独特且空间组织化的免疫激活特征 | 样本数量有限，仅分析了CS、GA、NL和NXG四种疾病类型 | 理解皮肤肉芽肿疾病中空间基因表达特征和免疫激活模式 | 皮肤肉芽肿疾病患者组织样本，包括皮肤结节病、环状肉芽肿、脂质坏死症和坏死性黄色肉芽肿 | 空间转录组学 | 皮肤肉芽肿疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | CS、GA、NL和NXG病例组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10374 | 2025-10-07 |
SDePER: a hybrid machine learning and regression method for cell-type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03416-2
PMID:39402626
|
研究论文 | 开发了一种结合机器学习和回归的混合方法SDePER，用于空间条形码转录组数据的细胞类型解卷积 | 提出混合机器学习和回归方法，解决ST与scRNA-seq数据间的平台效应，同时处理稀疏性和空间相关性 | NA | 开发空间转录组数据细胞类型解卷积方法 | 空间条形码转录组数据和参考单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 混合机器学习与回归模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 模拟数据和四个真实数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10375 | 2025-10-07 |
Teplizumab induces persistent changes in the antigen-specific repertoire in individuals at risk for type 1 diabetes
2024-Aug-13, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177492
PMID:39137044
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研究论文 | 研究Teplizumab治疗对1型糖尿病高危人群抗原特异性T细胞库的长期影响 | 首次揭示Teplizumab通过激活后耗竭和调节机制促进操作耐受性，并阻止自身反应性T细胞扩增的长期作用机制 | 研究样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索Teplizumab在1型糖尿病高危人群中的长期免疫调节机制 | 1型糖尿病高危人群的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究参与者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10376 | 2025-10-07 |
CTHRC1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages synergistically contribute to pro-tumorigenic tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68109-z
PMID:39075108
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了胰腺导管腺癌中CTHRC1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的协同促癌作用 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与CTHRC1+肌成纤维细胞在空间上共定位并协同促进免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中细胞群体间的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10377 | 2025-10-07 |
Intestinal strictures in Crohn's disease: An update from 2023
2024-07, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.12568
PMID:38546434
|
综述 | 本文对2023年克罗恩病肠道狭窄领域的最新研究进展进行了全面回顾 | 整合了单细胞测序等新技术在肠道狭窄研究中的应用，提供了对肠道纤维化狭窄的精准理解 | NA | 回顾克罗恩病肠道狭窄的研究进展，为研究人员和临床医生提供前沿信息 | 克罗恩病患者的肠道狭窄病变 | NA | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10378 | 2025-10-07 |
hdWGCNA identifies co-expression networks in high-dimensional transcriptomics data
2023-06-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100498
PMID:37426759
|
研究论文 | 开发了hdWGCNA框架用于高维转录组数据的共表达网络分析 | 支持单细胞和空间RNA测序数据的系统级共表达网络分析，能够进行异构体水平网络分析 | 未明确说明具体的技术限制或数据要求 | 开发高维转录组数据的共表达网络分析工具 | 自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病脑样本数据 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间RNA测序,长读长单细胞测序 | 共表达网络分析 | 转录组数据 | 包含近100万个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 10379 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles
2023-05-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01179-2
PMID:37127706
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术分析人类胰岛细胞，识别新型基因标记并区分具有动态转录组特征的β细胞亚群 | 发现胰岛内分泌细胞中非经典基因标记，首次通过整合scRNA-seq和snRNA-seq区分出三个具有不同生物学动态状态的β细胞亚群 | 研究样本来源有限，仅使用同一供体的胰岛细胞进行分析 | 探索人类胰岛细胞的转录组特征和细胞异质性 | 人类胰岛细胞及其在免疫缺陷小鼠中的移植模型 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 同一供体的人类胰岛细胞 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用GRCh38-2020-A文库进行snRNA-seq数据分析，包含内含子读取 |
| 10380 | 2025-10-07 |
APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112196
PMID:36871219
|
研究论文 | 本研究探讨APOE基因型如何调控小胶质细胞的免疫代谢功能，及其在衰老、淀粉样病理和炎症挑战中的作用 | 结合bulk、单细胞和空间转录组学技术，系统揭示APOE4通过影响Hif1α表达、TCA循环和糖酵解途径改变小胶质细胞免疫代谢特征 | 研究主要基于表达人类APOE的小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 阐明APOE基因型在调节小胶质细胞免疫代谢中的核心作用机制 | 表达人类APOE的小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |