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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10341 - 10360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10341 | 2025-10-07 |
Multi-Targeting CAR-T Cell Strategies to Overcome Immune Evasion in Lymphoid and Myeloid Malignancies
2025-Mar-14, Oncology research and treatment
IF:2.0Q3
DOI:10.1159/000543806
PMID:40090318
|
综述 | 探讨多靶向CAR-T细胞策略在克服淋巴和髓系恶性肿瘤免疫逃逸中的应用 | 提出逻辑门控CAR、适配器CAR等多靶向策略应对抗原逃逸问题 | NA | 改善CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的治疗效果和持久性 | 淋巴和髓系恶性肿瘤患者 | NA | 淋巴瘤、多发性骨髓瘤 | 下一代测序(NGS)、直接随机光学重建显微镜(dSTORM)、多参数流式细胞术、CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10342 | 2025-10-07 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
|
研究论文 | 提出一种名为Smoothie的方法，通过高斯平滑去噪空间转录组数据并构建全基因组共表达网络 | 结合隐式和显式并行化技术，能够处理超过1亿个空间分辨点的数据集，具有快速运行和低内存使用的优势 | NA | 从空间转录组数据中提取深度生物学见解 | 空间基因表达数据和共表达网络 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，高斯平滑 | NA | 空间转录组数据 | 超过1亿个空间分辨点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10343 | 2025-10-07 |
Recurrent ERBB2 alterations are associated with esophageal adenocarcinoma brain metastases
2025-Feb-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322558
PMID:40061311
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示食管腺癌脑转移中ERBB2基因的复发性改变及其临床意义 | 首次在食管腺癌脑转移中发现ERBB2基因的复发性扩增，并证明其与单克隆播散相关 | 样本量较小（10例），需要更大规模研究验证 | 探究食管腺癌脑转移的分子特征和临床治疗策略 | 食管腺癌脑转移患者及其匹配的原发肿瘤 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 10例食管腺癌脑转移患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 10344 | 2025-10-07 |
Consequences of training data composition for deep learning models in single-cell biology
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639127
PMID:40060416
|
研究论文 | 系统研究训练数据组成对单细胞转录组深度学习模型性能的影响 | 首次系统探讨单细胞基础模型中训练数据组成对模型行为的影响，揭示了数据多样性对模型泛化能力的重要性 | 研究主要聚焦于人类造血系统，可能在其他生物系统或疾病类型中的普适性有待验证 | 探索训练数据组成如何影响单细胞转录组深度学习模型的性能和泛化能力 | 人类造血系统的单细胞转录组数据，包括成体和发育组织、疾病状态和扰动图谱的细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10345 | 2025-10-07 |
MolGene-E: Inverse Molecular Design to Modulate Single Cell Transcriptomics
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.638723
PMID:40060426
|
研究论文 | 开发了一种名为MolGene-E的深度生成框架，用于基于单细胞转录组数据设计新药物分子 | 首个能够利用单细胞组学数据设计新药物分子的机器学习方法，结合了跨模态数据协调和对比学习生成模型 | 单细胞组学数据存在噪声、异质性、稀缺性和高维度等挑战 | 开发能够调节单细胞转录组学的逆向分子设计方法 | 疾病细胞与健康细胞的转录组状态 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 深度生成框架,跨模态模型,对比学习生成模型 | 单细胞转录组数据,化学扰动的大量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10346 | 2025-10-07 |
Randomized Spatial PCA (RASP): a computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Feb-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6050441/v1
PMID:40034439
|
研究论文 | 提出一种名为RASP的计算高效空间转录组数据降维方法 | 开发了随机化两阶段PCA框架，结合稀疏矩阵运算和可配置空间平滑，比现有方法快数个数量级 | NA | 开发计算高效的空间转录组数据降维方法 | 人类和小鼠组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 随机化PCA | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, Stereo-Seq, MERFISH, 10x Xenium平台生成的空间转录组数据 |
| 10347 | 2025-10-07 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
|
研究论文 | 提出首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation，通过峰到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 创新性地采用跨模态预训练方法，专门处理非零峰集以提高信息密度，并利用基因表达信息监督预训练过程实现峰到基因对齐 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型，解决高维稀疏数据的学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观遗传数据, 基因表达数据 | 100,000+个单细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 10348 | 2025-10-07 |
Altered ontogeny and transcriptomic signatures of tissue-resident pulmonary interstitial macrophages ameliorate allergic airway hyperresponsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371764
PMID:38983858
|
研究论文 | 本研究探讨组织驻留肺间质巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道高反应性的影响 | 首次揭示LPS诱导肺损伤后巨噬细胞发育谱系改变可减轻过敏性气道反应，并通过单细胞测序鉴定出与过敏性疾病相关的间质巨噬细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 阐明环境暴露引起的巨噬细胞发育轨迹改变对过敏性气道反应的影响机制 | 组织驻留肺巨噬细胞和屋尘螨诱导的过敏性气道反应 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、胚胎谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10349 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics combined with single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell heterogeneity in the human spinal cord
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01876
PMID:38934400
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了人类脊髓中胶质细胞的异质性 | 首次在人类脊髓中系统绘制胶质细胞的转录组异质性图谱，并进行跨物种比较分析 | 样本数量有限，未涵盖所有可能的病理状态 | 探索人类脊髓胶质细胞的分子异质性及其在物种间的差异 | 人类和小鼠脊髓中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10350 | 2025-10-07 |
Exosomes originating from neural stem cells undergoing necroptosis participate in cellular communication by inducing TSC2 upregulation of recipient cells following spinal cord injury
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00068
PMID:38993124
|
研究论文 | 本研究探讨了脊髓损伤后经历坏死性凋亡的神经干细胞来源的外泌体在细胞通讯中的作用及其对受体细胞TSC2表达的影响 | 首次揭示了神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体通过诱导TSC2上调参与脊髓损伤后细胞通讯的新机制 | 研究主要基于体外实验模型，体内验证仍需进一步深入 | 探究脊髓损伤后神经干细胞坏死性凋亡来源的外泌体在细胞通讯中的功能 | 胚胎小鼠神经干细胞、外泌体、脊髓损伤模型 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | RNA测序数据 | 16-17天胚胎小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10351 | 2025-10-07 |
Oligodendroglial heterogeneity in health, disease, and recovery: deeper insights into myelin dynamics
2025-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00694
PMID:39665821
|
综述 | 通过单细胞RNA测序技术重新定义少突胶质细胞谱系的五种细胞状态，并探讨其在健康和疾病状态下的功能意义 | 提出基于单细胞RNA测序发现的少突胶质细胞谱系新分类系统，将传统两种细胞类型扩展为五种连续细胞状态 | NA | 建立统一的少突胶质细胞术语体系以促进跨研究数据整合，深化对髓鞘病理机制的理解 | 少突胶质细胞谱系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性硬化症,阿尔茨海默病,肌萎缩侧索硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10352 | 2025-10-07 |
Lactate drives senescence-resistant lineages in hepatocellular carcinoma via histone H2B lactylation of NDRG1
2025-Apr-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217567
PMID:39978571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序轨迹分析重建肝细胞癌克隆演化，发现乳酸通过LDHA-NDRG1轴介导的组蛋白H2B乳酰化驱动衰老抵抗谱系 | 首次揭示乳酸通过LDHA-NDRG1轴介导的组蛋白H2B K58位点乳酰化表观遗传机制，连接代谢重编程与衰老逃逸 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌异质性机制和衰老抵抗的分子基础 | 肝细胞癌细胞谱系和克隆演化 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，加权基因共表达网络分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据，公共HCC数据集 | 902个特征基因跨越7种细胞状态，14基因预后模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10353 | 2025-10-07 |
Network-based analysis of Alzheimer's Disease genes using multi-omics network integration with graph diffusion
2025-Apr, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2025.104797
PMID:39993589
|
研究论文 | 通过多组学网络整合与图扩散方法分析阿尔茨海默病基因的网络特征 | 挑战了AD基因主要是网络枢纽节点的传统观点，发现AD基因分布在不同的度中心性分位数中，且外围基因也发挥重要作用 | NA | 研究已知AD基因在网络中的特性 | 阿尔茨海默病相关基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 多组学网络整合, 图扩散, 网络分析 | 图扩散模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 基因本体数据 | NA | NA | 微阵列, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 10354 | 2024-08-07 |
Prediction of cell-cell communication patterns of dorsal root ganglion cells: single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.384067
PMID:37905887
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10355 | 2025-10-07 |
Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation
2024-Feb-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45489-4
PMID:38336745
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研究论文 | 研究揭示雄激素剥夺疗法通过异常HGF和Wnt信号激活诱导双阴性前列腺癌的机制 | 首次发现当前ADT通过异常HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号，并鉴定XPO1和核糖体蛋白在DNPC中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，需要更大规模临床验证 | 探索雄激素剥夺疗法诱导双阴性前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌细胞、小鼠前列腺组织、人类DNPC临床样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类临床DNPC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10356 | 2025-10-07 |
Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis
2023-07-08, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-023-03181-x
PMID:37422651
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在分子机制 | 整合单细胞转录组和批量RNA测序数据，结合分子对接和动力学模拟筛选姜黄素治疗牙周炎的关键靶点 | 研究基于计算模拟，缺乏实验验证 | 探索姜黄素治疗牙周炎的分子作用机制 | 牙周炎相关基因和姜黄素分子 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | PPI网络分析, KEGG/GO富集分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE164241, GSE10334, GSE16134) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 使用Seurat和Limma软件包进行数据分析 |
| 10357 | 2025-10-07 |
Divergent PTEN-p53 interaction upon DNA damage in a human thyroid organoid model with germline PTEN mutations
2025-Apr-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-24-0216
PMID:39970536
|
研究论文 | 本研究通过人类甲状腺类器官模型揭示了不同PTEN胚系突变在DNA损伤后与p53相互作用的差异机制 | 首次在人类甲状腺类器官模型中证明不同PTEN突变类型对DNA损伤反应的差异性影响，特别是PTEN-p53相互作用的变异 | 研究仅针对两种特定PTEN突变类型，样本数量有限，需要在更广泛的突变类型中验证 | 探究不同PTEN胚系突变在辐射诱导DNA损伤后如何影响肿瘤抑制网络 | 携带不同PTEN突变的人类诱导多能干细胞衍生的甲状腺类器官 | 癌症生物学 | 甲状腺癌 | CRISPR-Cas9基因编辑, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 转录组数据 | 三种基因型(野生型, PTEN WT/G132D, PTEN WT/M134R)的甲状腺类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10358 | 2025-10-07 |
Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01903-x
PMID:40072722
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤微环境中细胞间相互作用和免疫反应异质性 | 识别了14种胶质瘤细胞亚群和4种巨噬细胞/单核细胞亚型，揭示了通过MIF和SPP1通路的关键配体-受体相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证细胞间相互作用的机制 | 探索胶质瘤恶性细胞与巨噬细胞/单核细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 胶质瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，功能富集分析，发育轨迹分析，细胞通讯分析，基因调控网络分析 | 预后风险评分模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10359 | 2025-10-07 |
Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01788-w
PMID:40074978
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发了一个9基因风险模型用于卵巢癌预后预测 | 首次在卵巢癌肿瘤微环境中识别出6个免疫恶性细胞亚群，并基于转录因子调控网络构建了9基因风险预后模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发预后预测模型和识别新的免疫生物标志物 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组化, 细胞功能实验 | Lasso回归, ConsensusClusterPlus, SCENIC | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10360 | 2025-10-07 |
Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath
2025-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00841-9
PMID:40075141
|
研究论文 | 介绍QuST这一QuPath扩展工具，用于整合全切片图像和空间转录组学数据 | 开发了能够在单细胞水平上桥接全切片图像和空间转录组学分析的工具QuST | 面临训练模式准备和分辨率差异等挑战 | 通过整合数字病理学和空间转录组学技术来增强疾病理解 | 全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，全切片图像分析 | NA | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | QuPath, QuST | QuPath扩展工具QuST |