单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10321 - 10340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10321 | 2024-08-05 |
Mincle receptor in macrophage and neutrophil contributes to the unresolved inflammation during the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1385696
PMID:38770013
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研究论文 | 本文揭示了Mincle受体在急性肾损伤向慢性肾病过渡期间在巨噬细胞和中性粒细胞中的作用 | 研究首次探讨了Mincle在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的角色及其机制 | 尚未明确Mincle在慢性转变过程中的所有影响 | 研究急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的炎症机制 | 以小鼠为模型研究Mincle在急性肾损伤后炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在急性肾损伤后，对多时间点的小鼠样本进行分析 |
| 10322 | 2024-08-04 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
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研究论文 | 本研究探讨了PPARγ激动剂rosiglitazone如何通过耗尽PDGFRα+间充质细胞来减少继发性淋巴水肿中的纤维脂肪组织 | 首次提出PPARγ激动剂可以通过减少PDGFRα+细胞的数量来治疗继发性淋巴水肿导致的纤维化和脂肪组织沉积 | 本研究主要在小鼠模型中进行，缺乏长期的人体临床研究数据 | 研究rosiglitazone治疗继发性淋巴水肿的潜力，特别是其对纤维化和脂肪沉积的影响 | 小鼠模型和人类组织样本中的PDGFRα+间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学评估 | NA | 组织样本 | 人类和小鼠组织样本 |
| 10323 | 2024-08-05 |
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01654-3
PMID:37872316
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研究论文 | 本研究通过系统免疫学方法识别出重症登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫特征 | 首次揭示了重症登革热在儿童血液中的DENV靶细胞及其免疫学特征 | 该研究主要集中在儿童群体，未考虑成年人病例的免疫变化 | 定义重症登革热进展中的DENV靶细胞和免疫学特征 | 研究对象为儿童的血液样本及其中的免疫细胞 | 数字病理学 | 登革热 | 病毒包涵单细胞RNA测序（viscRNA-Seq 2）和靶向蛋白组学 | NA | 血液样本 | NA |
| 10324 | 2024-08-05 |
Genome-wide identification and functional prediction of BYPASS1-related (BPS1) homologs in soybean
2023-Aug, Molecular breeding : new strategies in plant improvement
IF:2.6Q2
DOI:10.1007/s11032-023-01403-2
PMID:37496826
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研究论文 | 本文系统研究了大豆中的BYPASS1相关基因家族及其功能预测 | 首次全面识别并分类了大豆中的BYPASS1相关基因，并探讨了其与根结表型的潜在关联 | 未能详细阐明BYPASS1相关基因的具体功能和机制 | 研究大豆中BYPASS1相关基因家族及其在植物生长发育中的作用 | 大豆及其野生种中的BYPASS1相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 遗传变异数据、表型变异数据、转录组数据 | 涉及23个大豆基因和20个野生大豆基因 |
| 10325 | 2024-08-04 |
COVID-19 of differing severity: from bulk to single-cell expression data analysis
2023 Jul-Aug, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2023.2239620
PMID:37486005
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研究论文 | 本研究分析了COVID-19不同严重程度的关键模块和基因。 | 确定了轻型和重型COVID-19的关键基因和免疫细胞浸润的差异。 | 研究样本数量相对较小，可能限制了对结果的推广性。 | 研究COVID-19不同严重程度的生物标志物和潜在靶向药物。 | 轻型COVID-19（mCOVID-19）与重型COVID-19（sCOVID-19）患者的基因表达。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 16个关键基因来自轻型COVID-19，10个关键基因来自重型COVID-19，另外分析了8个健康对照和8个轻型COVID-19患者的外周血单核细胞 |
| 10326 | 2024-08-05 |
A neural network-based method for exhaustive cell label assignment using single cell RNA-seq data
2022-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04473-4
PMID:35042860
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经网络的方法NeuCA，用于使用单细胞RNA-seq数据进行细胞注释。 | 该方法利用细胞类型的层次结构信息来提高注释准确性，特别是对于相似细胞类型的数据。 | 该方法可能对未知细胞类型仍然标记为未分配，特别是在无法预期未知细胞类型的情况下。 | 本文旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞注释准确性。 | 研究对象为单细胞RNA测序数据，特别是来自已研究组织的数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA-seq数据 | 应用于八个真实数据集 |
| 10327 | 2024-08-05 |
InterCellar enables interactive analysis and exploration of cell-cell communication in single-cell transcriptomic data
2022-Jan-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02986-2
PMID:35017628
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研究论文 | InterCellar是一个互动平台，支持科学家分析和探索单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | Strikingly, InterCellar使实验室科学家能够在无需编程技能的情况下分析和探索细胞-细胞通信 | 尽管InterCellar提供了便捷的分析功能，但其效果仍然依赖用户对生物学信号的理解 | 本研究旨在提供一个无编程需求的工具，帮助分析单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | 主要研究COVID-19和黑色素瘤中的细胞-细胞交互 | 数字病理学 | COVID-19, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据驱动分析 | 分析了来自COVID-19和黑色素瘤的细胞-细胞交互数据 |
| 10328 | 2024-08-05 |
Morphological characteristics and a single-cell analysis provide insights into function of immune and fat storage in the lamprey supraneural body
2022-Jan, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106131
PMID:34838690
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研究论文 | 本文探讨了灯盏细鱼上神经体的形态特征和单细胞分析，揭示了其在免疫和脂肪储存中的功能 | 首次利用单细胞转录组测序揭示上神经体中至少四种细胞类型及其独特的分子组成 | 对上神经体细胞的生理功能知之甚少，仍需深入研究 | 探究上神经体在免疫和脂肪储存中的生理功能 | 研究了上神经体中的白色脂肪细胞、粒细胞、淋巴细胞和红细胞等多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 10329 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
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研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 |
| 10330 | 2024-08-05 |
Significance and limitations of the use of next-generation sequencing technologies for detecting mutational signatures
2021-Nov, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2021.103200
PMID:34411908
|
综述 | 本文探讨了不同的下一代测序技术在检测突变特征中的重要性和限制 | 文章总结了多种下一代测序技术的应用及其固有的测序偏见与技术伪影 | 每种测序技术都有其固有的偏见和可能产生的技术伪影，这可能影响突变特征的可靠提取 | 研究不同下一代测序技术检测突变模式及解读突变特征的相关性和前景 | 聚焦于人类癌症的突变特征及其与环境因素和DNA修复通路的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序技术（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 10331 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 |
| 10332 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
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研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 |
| 10333 | 2024-08-05 |
Implication of specific retinal cell-type involvement and gene expression changes in AMD progression using integrative analysis of single-cell and bulk RNA-seq profiling
2021-Aug-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-95122-3
PMID:34341398
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研究论文 | 本研究分析了与年龄相关性黄斑变性（AMD）进展相关的特定视网膜细胞类型及基因表达变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和大量RNA测序深入探讨了视网膜疾病的分子机制，识别了267个细胞类型特异基因 | 研究对象仅包括两名成人供体的视网膜细胞，样本限制可能影响结果的广泛适用性 | 探讨AMD进展过程中的细胞类型组成和基因表达变化 | 来自两名成人供体的视网膜细胞及十五名成人供体的RNA样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约93,000个细胞和15名成人供体的样本 |
| 10334 | 2024-08-05 |
XenoCell: classification of cellular barcodes in single cell experiments from xenograft samples
2021-Jan-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00872-8
PMID:33514375
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研究论文 | 本文开发了XenoCell，一个用于单细胞实验的细胞条形码分类工具 | XenoCell是第一个独立的预处理工具，能够快速可靠地分类来自宿主和移植物的细胞条形码 | 在处理混合物种细胞实验时可能仍存在一定的挑战，尤其在高复杂性的样本中 | 研究旨在提高在异种移植样本中准确区分宿主与移植物的细胞序列读取的能力 | 研究对象为来自患者衍生活检的异种移植样本的单细胞序列数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 在10× Genomics平台的混合物种50:50细胞系实验和公开的PDX数据集中使用 |
| 10335 | 2024-08-05 |
Metastatic Conditioning of Myeloid Cells at a Subcutaneous Synthetic Niche Reflects Disease Progression and Predicts Therapeutic Outcomes
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-1932
PMID:31662327
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研究论文 | 本研究监测了合成生物材料支架中髓系细胞的转移条件，反映了疾病进展并预测了治疗结果 | 引入合成转移微环境作为监测肿瘤细胞动态的创新途径 | 研究主要集中在小鼠模型上，翻译到人类临床应用时可能会存在差异 | 探讨合成微环境中免疫细胞的表型如何反映转移性疾病的进展及其对治疗的反应 | 分析植入生物材料支架后，髓系细胞在不同时间点的免疫表型变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 治疗前后单只小鼠的多个生物材料植入样本 |
| 10336 | 2024-08-05 |
Benchmarking principal component analysis for large-scale single-cell RNA-sequencing
2020-01-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1900-3
PMID:31955711
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研究论文 | 本文评估了用于大规模单细胞RNA测序数据集的主成分分析(PCA)算法 | 提出了基于Krylov子空间和随机奇异值分解的PCA算法的基准评估 | 未提及特定的局限性 | 评估现有的快速和内存高效的PCA算法在大规模scRNA-seq数据集中的应用 | 大规模单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 10337 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Uncovers a Vast Diversity in Intracellular Viral Defective Interfering RNA Content Affecting the Large Cell-to-Cell Heterogeneity in Influenza A Virus Replication
2020-01-07, Viruses
DOI:10.3390/v12010071
PMID:31936115
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研究论文 | 本研究探讨了缺陷干扰颗粒（DIP）对流感A病毒复制过程中细胞间变异性的影响 | 首次揭示了感染细胞中缺陷干扰vRNA含量的显著细胞间异质性及其对病毒释放的影响 | 未明确探讨不同DIP类型对细胞间变异性的具体作用 | 研究缺陷干扰颗粒在流感A病毒复制中的作用及其对细胞间异质性的影响 | 流感A病毒感染的细胞及其内部缺陷干扰RNA含量 | 病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 逆转录聚合酶链反应 | NA | RNA | 使用细胞样本进行分析，具体样本数量未说明 |
| 10338 | 2024-08-05 |
Identification of a regeneration-organizing cell in the Xenopus tail
2019-05-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aav9996
PMID:31097661
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研究论文 | 本文识别了一种在蟾蜍尾部再生中起关键作用的细胞类型。 | 首次发现再生组织细胞（ROC），其在再生能够的蝌蚪中从表皮移动到截肢面并形成伤口表皮。 | 研究的对象仅限于蝌蚪，可能无法直接应用于其他物种或更复杂的生物系统。 | 探索蝌蚪的再生机制和功能细胞的特征。 | 研究了再生能力不同的蝌蚪，并探讨了ROC的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多个再生能力不同的蝌蚪样本 |
| 10339 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Transcriptional Landscape of Neutrophils and Highlights the Role of TREM-1 in EAE
2024-Sep, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200278
PMID:38954781
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研究论文 | 本文揭示了中性粒细胞的转录组特征，并强调了TREM-1在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次构建了EAE中颈部淋巴结内中性粒细胞的单细胞免疫细胞图谱，并发现TREM-1在中性粒细胞迁移中的关键作用 | 该研究在EAE小鼠模型中进行，结果可能不能完全代表人类多发性硬化症的病理机制 | 研究中性粒细胞在EAE进展过程中的功能及其转录组特征 | 中性粒细胞及其在颈部淋巴结中的不同亚型 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | EAE小鼠中观察到的大量中性粒细胞和多发性硬化症患者的外周中性粒细胞 |
| 10340 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals reduced intercellular adhesion molecule crosstalk between activated hepatic stellate cells and neutrophils alleviating liver fibrosis in hepatitis B virus transgenic mice post menstrual blood-derived mesenchymal stem cell transplantation
2024-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.654
PMID:39040848
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研究论文 | 该研究探讨了月经血来源的间充质干细胞对乙型肝炎病毒转基因小鼠肝纤维化的治疗作用 | 通过单细胞RNA测序，揭示了激活的肝星状细胞与中性粒细胞之间的细胞间黏附分子相互作用减少的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类的直接验证 | 揭示月经血来源的间充质干细胞在肝纤维化治疗中的作用机制 | 研究对象为乙型肝炎病毒转基因小鼠及其肝组织中的细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 乙型肝炎病毒转基因小鼠模型，具体样本量未提及 |