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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10301 | 2025-10-07 |
Macrophage-derived SPP1 exacerbate myocardial injury by interacting with fibroblasts in viral myocarditis
2025-Mar-14, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00621-2
PMID:40087693
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞来源的SPP1通过促进成纤维细胞炎症表型转化而加剧病毒性心肌炎的心肌损伤 | 首次在病毒性心肌炎中发现高表达Spp1的巨噬细胞亚群,并阐明其通过SPP1-成纤维细胞-Ccl2/Ccl7轴自我招募并加剧心肌免疫损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证;单细胞测序仅分析了急性期样本 | 探究病毒性心肌炎中巨噬细胞与成纤维细胞的相互作用机制及其在心肌损伤中的作用 | CVB3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型、心脏组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 病毒性心肌炎 | 单细胞RNA测序,CellPhoneDB细胞通讯分析,间接共培养实验,巨噬细胞清除,SPP1表达抑制 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,心脏功能数据 | 病毒性心肌炎小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10302 | 2025-10-07 |
Combination therapy with Chicoric acid and PD-1/PD-L1 blockade improves the immunotherapy response in patient-derived ovarian cancer xenograft model
2025-Mar-14, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02146-7
PMID:40087780
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研究论文 | 本研究探讨了菊苣酸与PD-1/PD-L1阻断联合疗法在卵巢癌患者来源异种移植模型中的免疫治疗增强效果 | 首次发现菊苣酸能够增强PD-1/PD-L1阻断疗法在难治性卵巢癌中的疗效,并鉴定出APP/CD74配体-受体对和CHI3L1作为潜在疗效预测标志物 | 研究基于患者来源异种移植模型,尚未进行临床试验验证 | 开发难治性卵巢癌的有效联合免疫治疗策略 | 化疗耐药晚期高级别浆液性卵巢癌患者来源的异种移植模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,免疫组织化学 | 患者来源异种移植模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织切片图像 | 15个样本中的158,734个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10303 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence-driven integration of single-cell RNA sequencing and transcriptome analysis to decipher APOE's role in gastric cancer prognosis and therapy
2025-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02100-6
PMID:40082390
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研究论文 | 本研究通过人工智能整合单细胞RNA测序和转录组分析,探索APOE在胃癌预后和治疗中的作用 | 首次将AI驱动的分析方法与单细胞RNA测序和转录组数据相结合,系统揭示APOE通过M2巨噬细胞极化诱导免疫抑制的新机制 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究来确认APOE作为预后标志物的临床价值 | 探索胃癌肿瘤微环境的复杂性,识别新的预后标志物和治疗靶点 | 胃癌患者样本和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 生物信息学分析 | AI增强分析方法, 免疫相关生存模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10304 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal heterogeneity and key subsets associated with survival and response to PD-1 blockade in cervical squamous cell carcinoma
2025-Mar-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03725-x
PMID:40082876
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈鳞状细胞癌肿瘤微环境异质性及其与PD-1阻断治疗反应的关键细胞亚群 | 首次在宫颈鳞癌中系统鉴定PCLAF+肿瘤相关上皮细胞亚群,并证实其通过抑制CD8+ T细胞功能影响免疫治疗疗效 | 样本量相对有限,需要更大规模队列验证发现 | 解析宫颈鳞癌肿瘤微环境异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 宫颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 50,649个细胞,整合TCGA数据库和临床样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10305 | 2025-10-07 |
Blocking MIF secretion enhances CAR T-cell efficacy against neuroblastoma
2025-Mar-11, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115263
PMID:39908652
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研究论文 | 本研究通过阻断巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)的分泌来增强CAR T细胞治疗神经母细胞瘤的疗效 | 首次发现MIF是神经母细胞瘤免疫抑制微环境中的关键因子,并应用PROTAC技术靶向MIF以增强CAR T细胞活性 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤,对其他实体瘤的适用性需要进一步验证 | 改善CAR T细胞在神经母细胞瘤免疫抑制微环境中的治疗效果 | 神经母细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制因子 | 肿瘤免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 质谱分析, PROTAC技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 质谱数据 | 24个神经母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
10306 | 2025-10-07 |
Dynamic responses to rejection in the transplanted human heart revealed through spatial transcriptomics
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640852
PMID:40093136
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研究论文 | 利用空间转录组学技术分析人类心脏移植排斥反应的动态分子特征 | 首次在亚细胞分辨率下使用图像引导的空间转录组学技术,纵向分析人类心脏移植活检样本中的转录异质性 | 样本量相对有限(62例患者),且主要依赖组织学诊断作为参考标准 | 表征心脏移植排斥反应期间的分子表型和免疫-心脏相互作用 | 62例成人和儿童心脏移植受者的纵向心脏活检样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织图像 | 62例心脏移植患者 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率的图像引导空间转录组学 |
10307 | 2025-10-07 |
MulNet: a scalable framework for reconstructing intra- and intercellular signaling networks from bulk and single-cell RNA-seq data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf081
PMID:40095604
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研究论文 | 提出了一个可扩展的多层网络框架MulNet,用于从bulk和单细胞RNA-seq数据重建细胞内和细胞间信号网络 | 能够整合多种分子相互作用构建可扩展的多层网络,在识别生物学相关模块方面优于现有方法 | NA | 重建细胞内和细胞间信号网络以更好地理解基因调控 | 结肠癌和头颈癌的RNA-seq数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq | 多层网络框架 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
10308 | 2025-10-07 |
Altered Arginine Metabolism Affects Proliferation and Radiosensitivity of Keloids
2025-Mar, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70077
PMID:40095415
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了瘢痕疙瘩中精氨酸和脯氨酸代谢异常与细胞增殖及放射敏感性的关联 | 首次整合代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序数据,系统揭示精氨酸代谢在瘢痕疙瘩成纤维细胞中的关键作用及治疗潜力 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探讨细胞代谢重编程与瘢痕疙瘩生物学行为的关系,寻找新的治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织及邻近正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 瘢痕疙瘩和邻近皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10309 | 2025-10-07 |
Novel therapeutic strategy: Nrf2 activation in targeting senescence-related changes in chronic obstructive pulmonary disease
2025-Feb-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-24-710
PMID:40083491
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研究论文 | 本研究探讨通过激活Nrf2靶向衰老相关变化以缓解慢性阻塞性肺疾病进展的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示Nrf2激活对衰老纤毛上皮细胞及相关分泌表型的调控作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行人体临床试验 | 探索Nrf2激活作为治疗慢性阻塞性肺疾病的新策略 | 衰老支气管上皮细胞、COPD小鼠模型 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组分析、体外细胞模型、动物模型 | COPD小鼠模型 | 基因表达数据、病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10310 | 2025-10-07 |
RNase L represses hair follicle regeneration through altered innate immune signaling
2025-Feb-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172595
PMID:39903537
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研究论文 | 本研究揭示RNase L通过改变先天免疫信号通路抑制毛囊再生的机制 | 首次发现RNase L作为再生抑制基因,通过负反馈调节机制限制dsRNA-TLR3信号级联 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索哺乳动物再生能力的分子调控机制 | 人类参与者和小鼠模型(Rnasel-/-小鼠) | 分子生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 人类激光嫩肤治疗参与者和WIHN小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
10311 | 2025-10-07 |
Multi-Omics Profiling Identifies a High-Risk Subgroup of Breast Cancer Stem Cells for Prognostic Stratification and Personalized Treatment
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.109589
PMID:40092692
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出乳腺癌干细胞高危亚群,为预后分层和个性化治疗提供新见解 | 首次在乳腺癌微环境中将乳腺癌干细胞分为两个功能亚群,并系统揭示BCSCs-2亚群的预后价值和治疗敏感性 | 研究基于现有数据库分析,需要实验验证;样本量相对有限 | 解析乳腺癌干细胞异质性及其在肿瘤微环境中的动态作用 | 乳腺癌干细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 体细胞突变分析, 药物敏感性分析 | 共表达网络分析, 伪时间发育动力学分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 459个乳腺癌干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
10312 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis reveals lysosome-associated molecular subtype characterization and prognostic modeling system in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105351
PMID:40092704
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肺腺癌中溶酶体相关分子亚型特征并构建预后模型系统 | 首次基于溶酶体相关基因建立肺腺癌预后风险分层系统,并通过单细胞测序和实验验证关键靶点SLC2A1的功能 | 研究主要依赖生物信息学分析,实验验证部分相对有限 | 探索溶酶体相关基因在肺腺癌预后分层和治疗靶点开发中的应用价值 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序, western blotting, PCR, 集落形成实验, Transwell实验 | LASSO-Cox回归模型, 列线图诊断模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
10313 | 2025-10-07 |
Identification of M2 macrophage markers for predicting outcome and therapeutic response in osteosarcoma: Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104855
PMID:40092698
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,识别骨肉瘤中M2巨噬细胞标志物并构建风险评分模型,用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序识别骨肉瘤M2巨噬细胞标志物,发现8个新的M2巨噬细胞标志基因,并构建了能预测免疫治疗反应的风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别骨肉瘤M2巨噬细胞标志物,构建预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 骨肉瘤患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,轨迹分析,细胞通讯分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个骨肉瘤数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10314 | 2025-10-07 |
T cell receptor usage and epitope specificity amongst CD8+ and CD4+ SARS-CoV-2-specific T cells
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1510436
PMID:40092978
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研究论文 | 本研究分析了COVID-19康复者中SARS-CoV-2特异性CD8+和CD4+ T细胞的表位特异性、T细胞受体使用和表型变化 | 首次系统揭示SARS-CoV-2特异性T细胞长期动态变化,发现幼稚样T细胞可能代表具有多能性和自我更新能力的干细胞记忆T细胞,并鉴定出共享的公共TCR表位特异性库 | 样本量相对较小(28例),仅针对未接种疫苗的D614G变异株感染者,未评估对其他变异株的交叉反应性 | 探究SARS-CoV-2特异性T细胞的长期免疫反应特征和动态变化 | 28例未接种疫苗的COVID-19康复者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 28例COVID-19康复者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10315 | 2025-10-07 |
Metabolic pathway activation and immune microenvironment features in non-small cell lung cancer: insights from single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546764
PMID:40092988
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据研究非小细胞肺癌肿瘤微环境特征和代谢通路激活 | 首次在单细胞水平系统分析NSCLC中代谢通路激活与免疫微环境特征的关系,并构建具有强预测能力的风险特征 | 需要进一步探索这些代谢通路的具体机制及其在临床应用中的潜力 | 深入了解非小细胞肺癌肿瘤微环境及其代谢特征 | 非小细胞肺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | PCA,UMAP,WGCNA | 单细胞转录组数据 | 29,053个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10316 | 2025-10-07 |
Unveiling the immunological landscape of disseminated tuberculosis: a single-cell transcriptome perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527592
PMID:40092995
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示播散性结核病的免疫学特征 | 首次结合单细胞RNA转录组和T细胞受体测序分析DTB患者,发现独特的TCR特征和MAIT细胞缺失现象 | 样本量较小(仅7例DTB患者),需更大规模研究验证 | 阐明播散性结核病的免疫发病机制 | 播散性结核病患者、潜伏结核感染者、活动性结核患者和健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 7例DTB患者+2例潜伏感染+3例活动性结核+2例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10317 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq to reveal the association and potential molecular mechanisms of metabolic reprogramming regulated by lactylation and chemotherapy resistance in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1513806
PMID:40093000
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示乳酸化修饰调控代谢重编程与卵巢癌化疗耐药性的关联及分子机制 | 首次发现ALDH1A1和S100A4两个乳酸化相关基因与卵巢癌化疗耐药性相关,并证实乳酸积累与耐药性的关联 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证分子机制 | 阐明卵巢癌化疗耐药性中乳酸化修饰的作用机制 | 卵巢癌组织和细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, 生存分析, 富集分析 | NA | 基因表达数据 | 铂耐药队列和敏感队列的卵巢癌组织及细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10318 | 2025-10-07 |
Identification of glycolysis-related gene signatures for prognosis and therapeutic targeting in idiopathic pulmonary fibrosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1486357
PMID:40093327
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了特发性肺纤维化中与糖酵解相关的基因标志物及其预后价值 | 首次系统识别特发性肺纤维化中糖酵解相关基因标志物,构建预后模型并验证其临床价值,同时发现潜在治疗靶点 | 研究基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;动物模型与人类疾病存在差异 | 探索特发性肺纤维化中糖酵解相关基因的预后价值和治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 | LASSO回归, SVM-RFE, 预后模型 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集和博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10319 | 2025-10-07 |
Dehydrodiisoeugenol targets the PLK1-p53 axis to inhibit breast cancer cell cycle
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545498
PMID:40093330
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研究论文 | 本研究筛选出益智仁中主要抗乳腺癌活性成分脱氢二异丁香酚,并揭示其通过调控PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的机制 | 首次系统鉴定益智仁中抗乳腺癌主要活性成分DHIE,并阐明其通过PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的新机制 | DHIE在不同乳腺癌亚型中调控p53的具体机制及与其他化疗药物相比的组合优势仍需进一步探索 | 探究益智仁抗乳腺癌的主要活性成分及其作用机制 | 乳腺癌细胞系和荷瘤小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌 | LC-MS, WGCNA, 网络药理学, 分子对接, 转录组测序, 免疫浸润分析, 单细胞测序, CCK-8, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
10320 | 2025-10-07 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
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综述 | 本文综述植物细菌病原体诊断技术的发展现状与未来展望 | 系统分析从传统培养方法到光谱技术和单细胞测序的诊断技术演进路径 | 光谱方法需要先验数据库且无法检测未知病原体 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的演进与未来发展 | 植物细菌病原体 | NA | NA | 微拉曼光谱,单细胞测序,合成生物学 | NA | 光谱数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |