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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10301 | 2025-10-07 |
RNase L represses hair follicle regeneration through altered innate immune signaling
2025-Feb-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172595
PMID:39903537
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研究论文 | 本研究揭示RNase L通过改变先天免疫信号通路抑制毛囊再生的机制 | 首次发现RNase L作为再生抑制基因,通过负反馈调节机制限制dsRNA-TLR3信号级联 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索哺乳动物再生能力的分子调控机制 | 人类参与者和小鼠模型(Rnasel-/-小鼠) | 分子生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 人类激光嫩肤治疗参与者和WIHN小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
10302 | 2025-10-07 |
Multi-Omics Profiling Identifies a High-Risk Subgroup of Breast Cancer Stem Cells for Prognostic Stratification and Personalized Treatment
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.109589
PMID:40092692
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出乳腺癌干细胞高危亚群,为预后分层和个性化治疗提供新见解 | 首次在乳腺癌微环境中将乳腺癌干细胞分为两个功能亚群,并系统揭示BCSCs-2亚群的预后价值和治疗敏感性 | 研究基于现有数据库分析,需要实验验证;样本量相对有限 | 解析乳腺癌干细胞异质性及其在肿瘤微环境中的动态作用 | 乳腺癌干细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 体细胞突变分析, 药物敏感性分析 | 共表达网络分析, 伪时间发育动力学分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 459个乳腺癌干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
10303 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis reveals lysosome-associated molecular subtype characterization and prognostic modeling system in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105351
PMID:40092704
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肺腺癌中溶酶体相关分子亚型特征并构建预后模型系统 | 首次基于溶酶体相关基因建立肺腺癌预后风险分层系统,并通过单细胞测序和实验验证关键靶点SLC2A1的功能 | 研究主要依赖生物信息学分析,实验验证部分相对有限 | 探索溶酶体相关基因在肺腺癌预后分层和治疗靶点开发中的应用价值 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序, western blotting, PCR, 集落形成实验, Transwell实验 | LASSO-Cox回归模型, 列线图诊断模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
10304 | 2025-10-07 |
Identification of M2 macrophage markers for predicting outcome and therapeutic response in osteosarcoma: Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104855
PMID:40092698
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,识别骨肉瘤中M2巨噬细胞标志物并构建风险评分模型,用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序识别骨肉瘤M2巨噬细胞标志物,发现8个新的M2巨噬细胞标志基因,并构建了能预测免疫治疗反应的风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别骨肉瘤M2巨噬细胞标志物,构建预后预测模型并评估免疫治疗反应 | 骨肉瘤患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,轨迹分析,细胞通讯分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个骨肉瘤数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10305 | 2025-10-07 |
T cell receptor usage and epitope specificity amongst CD8+ and CD4+ SARS-CoV-2-specific T cells
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1510436
PMID:40092978
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研究论文 | 本研究分析了COVID-19康复者中SARS-CoV-2特异性CD8+和CD4+ T细胞的表位特异性、T细胞受体使用和表型变化 | 首次系统揭示SARS-CoV-2特异性T细胞长期动态变化,发现幼稚样T细胞可能代表具有多能性和自我更新能力的干细胞记忆T细胞,并鉴定出共享的公共TCR表位特异性库 | 样本量相对较小(28例),仅针对未接种疫苗的D614G变异株感染者,未评估对其他变异株的交叉反应性 | 探究SARS-CoV-2特异性T细胞的长期免疫反应特征和动态变化 | 28例未接种疫苗的COVID-19康复者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 28例COVID-19康复者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10306 | 2025-10-07 |
Metabolic pathway activation and immune microenvironment features in non-small cell lung cancer: insights from single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546764
PMID:40092988
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据研究非小细胞肺癌肿瘤微环境特征和代谢通路激活 | 首次在单细胞水平系统分析NSCLC中代谢通路激活与免疫微环境特征的关系,并构建具有强预测能力的风险特征 | 需要进一步探索这些代谢通路的具体机制及其在临床应用中的潜力 | 深入了解非小细胞肺癌肿瘤微环境及其代谢特征 | 非小细胞肺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | PCA,UMAP,WGCNA | 单细胞转录组数据 | 29,053个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10307 | 2025-10-07 |
Unveiling the immunological landscape of disseminated tuberculosis: a single-cell transcriptome perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1527592
PMID:40092995
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示播散性结核病的免疫学特征 | 首次结合单细胞RNA转录组和T细胞受体测序分析DTB患者,发现独特的TCR特征和MAIT细胞缺失现象 | 样本量较小(仅7例DTB患者),需更大规模研究验证 | 阐明播散性结核病的免疫发病机制 | 播散性结核病患者、潜伏结核感染者、活动性结核患者和健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 7例DTB患者+2例潜伏感染+3例活动性结核+2例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10308 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq to reveal the association and potential molecular mechanisms of metabolic reprogramming regulated by lactylation and chemotherapy resistance in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1513806
PMID:40093000
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示乳酸化修饰调控代谢重编程与卵巢癌化疗耐药性的关联及分子机制 | 首次发现ALDH1A1和S100A4两个乳酸化相关基因与卵巢癌化疗耐药性相关,并证实乳酸积累与耐药性的关联 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证分子机制 | 阐明卵巢癌化疗耐药性中乳酸化修饰的作用机制 | 卵巢癌组织和细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, 生存分析, 富集分析 | NA | 基因表达数据 | 铂耐药队列和敏感队列的卵巢癌组织及细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10309 | 2025-10-07 |
Identification of glycolysis-related gene signatures for prognosis and therapeutic targeting in idiopathic pulmonary fibrosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1486357
PMID:40093327
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了特发性肺纤维化中与糖酵解相关的基因标志物及其预后价值 | 首次系统识别特发性肺纤维化中糖酵解相关基因标志物,构建预后模型并验证其临床价值,同时发现潜在治疗靶点 | 研究基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;动物模型与人类疾病存在差异 | 探索特发性肺纤维化中糖酵解相关基因的预后价值和治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 | LASSO回归, SVM-RFE, 预后模型 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集和博来霉素诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10310 | 2025-10-07 |
Dehydrodiisoeugenol targets the PLK1-p53 axis to inhibit breast cancer cell cycle
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545498
PMID:40093330
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研究论文 | 本研究筛选出益智仁中主要抗乳腺癌活性成分脱氢二异丁香酚,并揭示其通过调控PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的机制 | 首次系统鉴定益智仁中抗乳腺癌主要活性成分DHIE,并阐明其通过PLK1-p53信号轴诱导细胞周期阻滞的新机制 | DHIE在不同乳腺癌亚型中调控p53的具体机制及与其他化疗药物相比的组合优势仍需进一步探索 | 探究益智仁抗乳腺癌的主要活性成分及其作用机制 | 乳腺癌细胞系和荷瘤小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌 | LC-MS, WGCNA, 网络药理学, 分子对接, 转录组测序, 免疫浸润分析, 单细胞测序, CCK-8, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
10311 | 2025-10-07 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
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综述 | 本文综述植物细菌病原体诊断技术的发展现状与未来展望 | 系统分析从传统培养方法到光谱技术和单细胞测序的诊断技术演进路径 | 光谱方法需要先验数据库且无法检测未知病原体 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的演进与未来发展 | 植物细菌病原体 | NA | NA | 微拉曼光谱,单细胞测序,合成生物学 | NA | 光谱数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
10312 | 2025-10-07 |
From Gene to Intervention: NLRC4 and WIPI1 Regulate Septic Acute Lung Injury Through Autophagy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S510691
PMID:40093959
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析发现NLRC4和WIPI1通过调控自噬通路影响脓毒症急性肺损伤的发病机制 | 首次揭示NLRC4和WIPI1作为关键差异表达自噬相关基因在脓毒症急性肺损伤中的调控作用,并发现WIPI1与非经典自噬通路的特殊关联 | 研究主要基于数据库分析和实验验证,临床转化应用仍需进一步探索 | 探究自噬相关基因在脓毒症急性肺损伤中的分子机制 | 人类样本数据集和实验模型 | 生物信息学 | 脓毒症急性肺损伤 | 微阵列分析,单细胞测序,流式细胞术,免疫荧光,qPCR,Western Blotting,siRNA | NA | 基因表达数据,单细胞数据 | 两个微阵列数据集(GSE33118和GSE131761)和三个单细胞测序数据集(SCP43,SCP548,SCP2156) | NA | 单细胞测序,微阵列 | NA | NA |
10313 | 2025-10-07 |
The aggrephagy-related gene TUBA1B influences clinical outcomes in glioma patients by regulating the cell cycle
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1531465
PMID:40094001
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研究论文 | 本研究通过识别胶质瘤中的聚集性自噬亚型并发现TUBA1B基因作为独立预后标志物,揭示了其在调控细胞周期和免疫微环境中的关键作用 | 首次将聚集性自噬相关基因TUBA1B与胶质瘤预后联系起来,并通过多组学分析和实验验证阐明了其通过细胞周期调控影响肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;动物模型数量有限 | 探索胶质瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 胶质瘤患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞测序,qRT-PCR,体外功能实验,小鼠异种移植模型 | 机器学习,多变量Cox回归,列线图模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的GBM和LGG样本,GEO数据库GSE167960单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
10314 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis of the dynamic role of STAR+ cells in regulating platinum-based chemotherapy responses and tumor microenvironment in serous ovarian carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545762
PMID:40098624
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAR+细胞是浆液性卵巢癌中一种新型癌症相关成纤维细胞亚型,能够增强铂类化疗敏感性 | 首次鉴定出STAR+细胞作为新型CAF亚型,发现其通过调节代谢通路和抑制WNT信号通路增强化疗敏感性 | STAR+细胞与肿瘤细胞相互作用的具体机制尚未完全阐明 | 探索CAF亚型与化疗敏感性之间的关系 | 浆液性卵巢癌患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 | 化疗敏感和化疗耐药的SOC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
10315 | 2025-10-07 |
Integrating machine learning and single-cell sequencing to identify shared biomarkers in type 1 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1543806
PMID:40098701
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研究论文 | 通过整合机器学习和单细胞测序技术识别1型糖尿病和肾透明细胞癌的共同生物标志物 | 首次结合WGCNA、LASSO和SVM算法从多组学数据中鉴定T1DM和ccRCC的共享枢纽基因,并利用单细胞测序解析其细胞特异性表达 | 基于公共数据集的分析需要进一步实验验证,临床样本规模有限 | 识别T1DM和ccRCC的共同生物标志物以促进高危人群的预防和早期检测 | 1型糖尿病和肾透明细胞癌的基因表达数据及临床样本 | 机器学习 | 糖尿病, 肾癌 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | WGCNA, LASSO, SVM | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10316 | 2025-10-07 |
STsisal: a reference-free deconvolution pipeline for spatial transcriptomics data
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1512435
PMID:40098978
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研究论文 | 开发了一种无需参考数据的空间转录组学反卷积方法STsisal | 提出了一种整合标记基因选择、混合比例分解和细胞类型特征矩阵分析的新型参考自由反卷积方法 | NA | 解决空间转录组学数据中缺乏单细胞分辨率的问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | SISAL算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10317 | 2025-10-07 |
Integration of single-nuclei and spatial transcriptomics to decipher tumor phenotype predictive of relapse-free survival in Wilms tumor
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1539897
PMID:40098972
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研究论文 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,鉴定与肾母细胞瘤复发相关的肿瘤亚型并构建预后预测模型 | 首次在肾母细胞瘤中识别出与不良无复发生存期相关的Scissor+肿瘤细胞亚型,并发现其对EGFR抑制剂的敏感性 | 基于公共数据库的回顾性研究,需要前瞻性临床验证 | 识别驱动肾母细胞瘤复发的分子特征并发现新的治疗靶点 | 肾母细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | 集成机器学习模型, Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
10318 | 2025-10-07 |
The Role of PLIN3 in Prognosis and Tumor-Associated Macrophage Infiltration: A Pan-Cancer Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S509245
PMID:40098998
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研究论文 | 通过泛癌分析探讨PLIN3在预后和肿瘤相关巨噬细胞浸润中的作用 | 首次系统评估PLIN3对肿瘤免疫微环境的影响及其作为免疫治疗反应预后指标的潜力 | 研究主要基于数据库分析,实验验证主要在肺腺癌细胞中进行 | 评估PLIN3作为癌症诊断和预后生物标志物的潜力及其对免疫细胞浸润的影响 | 多种正常和癌组织、肺腺癌细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多重荧光染色、分子对接 | 计算算法 | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、转录组数据 | 多个数据库中的多样化组织样本 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学,批量转录组学 | NA | NA |
10319 | 2025-10-07 |
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.12.626682
PMID:39713308
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研究论文 | 本研究揭示了STAT3功能获得性突变综合征中嘌呤信号通路异常与CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | 首次发现STAT3 GOF综合征中CD8+ T细胞存在嘌呤信号通路失调,具体表现为CD39表达上调而CD73和A2AR表达下调 | STAT3 GOF变异驱动病理的确切分子机制尚未完全阐明 | 探究STAT3功能获得性突变导致CD8+ T细胞失调的分子机制 | STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫调节疾病 | 单细胞RNA测序, 高维免疫分析, 功能评估 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | STAT3 GOF患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10320 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis
2024-12, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13982
PMID:38566468
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示种植体周围炎独特的免疫微环境特征 | 首次通过单细胞分析发现种植体周围炎中CXCL13+成纤维细胞亚群特异性增加,并揭示其通过CXCL8/CXCL6-CXCR2/CXCR1轴招募中性粒细胞的机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 揭示种植体周围炎的独特微环境特征 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的组织活检样本 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |