单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 10281 - 10300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10281 | 2024-08-25 |
Ligand-mediated PAI-1 inhibition in a mouse model of peritoneal carcinomatosis
2022-02-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100526
PMID:35243423
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研究论文 | 本研究通过功能和转录组实验，识别出STAT3信号通路在腹膜癌病（PC）中的关键作用，并通过综合分析公共数据库和临床队列数据，验证了基于PAI-1水平的分子分层在PC治疗中的潜在应用 | 首次揭示了PAI-1在腹膜癌病中的分泌来源及其作为预后生物标志物的潜力，并提出了基于旁分泌依赖性的治疗新策略 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的异种移植模型，需要进一步的临床试验验证 | 探索腹膜癌病中的关键信号通路及其治疗潜力 | 腹膜癌病细胞、STAT3信号通路、PAI-1水平 | 数字病理学 | 腹膜癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 临床队列研究涉及7,359例患者，前瞻性研究涉及149例患者 |
| 10282 | 2024-08-25 |
Novel Insights into the Stemness and Immune Privilege of Mesenchymal Stem Cells from Human Wharton Jelly by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Feb-14, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.934660
PMID:35153292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人脐带华通胶间充质干细胞（WJ-MSCs）的基因表达，以探讨其干细胞特性和免疫特性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了WJ-MSCs的基因表达异质性，并发现只有部分细胞具有真正的干细胞特性，同时质疑了WJ-MSCs的免疫特权 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境下的验证 | 探究WJ-MSCs的干细胞特性和免疫特性 | 人脐带华通胶间充质干细胞（WJ-MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的WJ-MSCs细胞数量未在摘要中明确提及 |
| 10283 | 2024-08-25 |
IQCELL: A platform for predicting the effect of gene perturbations on developmental trajectories using single-cell RNA-seq data
2022-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009907
PMID:35213533
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研究论文 | 本文介绍了一个名为IQCELL的平台，该平台利用单细胞RNA测序数据直接推断、模拟和研究可执行的逻辑基因调控网络（GRN） | IQCELL平台能够从单细胞RNA测序数据中直接推断出可执行的逻辑基因调控网络，并模拟基本假设以控制干细胞命运 | NA | 开发一个平台，用于从单细胞RNA测序数据中推断、模拟和研究可执行的基因调控网络 | 早期小鼠T细胞和红细胞发育的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 逻辑基因调控网络（GRN） | 单细胞RNA测序数据 | 早期小鼠T细胞和红细胞发育的数据 |
| 10284 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the multi-cellular ecosystem in different radiological components of pulmonary part-solid nodules
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.723
PMID:35184398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺部部分实性结节中不同放射学成分的多细胞生态系统 | 首次在单细胞分辨率下全面剖析了部分实性结节中磨玻璃和实性成分的多细胞生态系统，并揭示了恶性细胞和肿瘤微环境中关键信号通路的转录差异 | 研究样本量较小，仅包括12名未经治疗的患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨早期肺腺癌中不同放射学表型的肿瘤微环境和转录特征 | 肺部部分实性结节的磨玻璃和实性成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat v3.1.5 | 单细胞数据 | 12名患者的部分实性结节和5名患者的正常肺组织 |
| 10285 | 2024-08-25 |
Revealing the transcriptional heterogeneity of organ-specific metastasis in human gastric cancer using single-cell RNA Sequencing
2022-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.730
PMID:35184420
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人胃癌器官特异性转移的转录异质性 | 发现了与侵袭特征、腹腔内转移倾向、上皮-间质转化诱导的肿瘤干细胞表型或休眠样特征相关的恶性上皮亚群，并揭示了免疫和基质细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 解析胃癌及其转移的肿瘤内和肿瘤间异质性，识别有效的治疗靶点 | 来自6名患者的10个新鲜人体组织样本，包括原发肿瘤、邻近非肿瘤样本及不同器官或组织的转移瘤 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 407个样本的胃癌队列 |
| 10286 | 2024-08-25 |
Autism genes converge on asynchronous development of shared neuron classes
2022-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04358-6
PMID:35110736
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研究论文 | 本文利用人脑皮质类器官模型，通过单细胞RNA测序和蛋白质组分析，研究了三个自闭症谱系障碍（ASD）风险基因SUV420H1、ARID1B和CHD8的半合子不足对神经元发育的影响。 | 首次揭示了这些基因突变导致的特定神经元类型发育不同步，并展示了这些异常如何受个体基因组背景的精细调节。 | 研究主要集中在类器官模型上，可能与真实人脑环境存在差异。 | 探究自闭症谱系障碍风险基因在人脑皮质中的细胞类型特异性发育异常。 | 三个自闭症谱系障碍风险基因SUV420H1、ARID1B和CHD8的半合子不足对神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组分析 | NA | 细胞、蛋白质 | 超过745,000个细胞和多个来自不同捐赠者的细胞系 |
| 10287 | 2024-08-25 |
Adaptation of the Oxygen Sensing System during Lung Development
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/9714669
PMID:35242281
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研究论文 | 研究了在肺发育过程中氧气感应系统的适应性及其目标，即缺氧诱导因子（HIF）调控基因（HRGs） | 通过整合qPCR、免疫印迹、杂交和单细胞RNA测序数据，详细描绘了氧气感应系统在肺发育中的变化 | 系统性缺氧或roxadustat治疗仅显示出HRGs的有限反应 | 理解肺发育从囊状到肺泡阶段的氧气感应系统组件的相互作用，以对抗与早产相关的疾病 | 肺发育中的氧气感应系统和HIF调控基因 | NA | 早产相关疾病 | qPCR、免疫印迹、杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 10288 | 2024-08-25 |
Insights Gained and Future Outlook From scRNAseq Studies in Autoimmune Rheumatic Diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.849050
PMID:35251048
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在自身免疫性风湿病研究中的主要发现，并展望了新兴的单细胞技术（如免疫组库测序和空间转录组学）在扩展对免疫和基质细胞行为的理解方面的潜力。 | scRNAseq作为一种强大的新工具，能够评估风湿病中的生物异质性和单个细胞功能，揭示了新的细胞群和关键分子特征。 | 目前scRNAseq在风湿病领域的应用尚未充分利用新兴的单细胞技术，如免疫组库测序和空间转录组学。 | 探讨scRNAseq在自身免疫性风湿病研究中的应用，并展望新兴单细胞技术在扩展对免疫和基质细胞行为理解方面的潜力。 | 自身免疫性风湿病及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 10289 | 2024-08-25 |
A Necroptosis-Related Prognostic Model of Uveal Melanoma Was Constructed by Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.847624
PMID:35242144
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和加权共表达网络分析，构建了一个与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型 | 首次通过单细胞测序和加权共表达网络分析，构建了与坏死性凋亡相关的葡萄膜黑色素瘤预后模型，并通过细胞实验验证了模型中关键基因ITPA的作用 | NA | 研究坏死性凋亡在葡萄膜黑色素瘤中的临床意义，并构建预后模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其预后 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序分析，加权共表达网络分析 | COX回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库的GSE139829数据集和TCGA数据进行分析，具体样本数量未详细说明 |
| 10290 | 2024-08-25 |
The Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Atherosclerotic Disease
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.826103
PMID:35211529
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化疾病研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术深入分析动脉粥样硬化斑块的细胞组成，提供更精细的信息 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响我们对动脉粥样硬化的当前理解 | 动脉粥样硬化斑块的细胞组成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10291 | 2024-08-25 |
Myeloid Heterogeneity in Kidney Disease as Revealed through Single-Cell RNA Sequencing
2021-11-25, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0003682021
PMID:35372996
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示肾脏疾病中髓系细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术，能够以前所未有的分辨率和通量分析单个细胞的转录组，并生成细胞图谱 | NA | 探讨髓系细胞在肾脏健康和疾病中的作用，以及scRNA-seq技术在髓系细胞和肾脏研究中的应用 | 髓系细胞在肾脏疾病中的异质性 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 10292 | 2024-08-25 |
Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci
2021-Oct-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abh3768
PMID:34623901
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学和表观基因组学揭示了与生发中心相关的自身免疫风险位点的强烈病因 | 生成了人类扁桃体的单细胞转录组学和表观基因组学图谱，并利用这些数据解释了与自身免疫相关的遗传变异的潜在调控影响 | NA | 理解生发中心反应背后的基因调控原则，并解释与自身免疫相关的遗传变异的潜在调控影响 | 人类扁桃体的生发中心反应及其与自身免疫疾病的关系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学, 表观基因组学 | NA | 转录组, 表观基因组 | 人类扁桃体样本 |
| 10293 | 2024-08-25 |
Single cell analyses to understand the immune continuum in atherosclerosis
2021-08, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在理解动脉粥样硬化中免疫连续性的应用 | 介绍了单细胞技术如CyTOF、scRNA-seq和CITE-seq在解析动脉粥样硬化病变中细胞可塑性的价值 | 讨论了单细胞技术在应用于人类血管组织时面临的挑战，以及分离式单细胞方法的局限性 | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究中的应用，以实现针对心血管疾病的个性化治疗 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞及其在疾病进展中的结构和功能变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞质谱流式细胞术(CyTOF)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞转录组和表位索引测序(CITE-seq) | NA | 组织 | NA |
| 10294 | 2024-08-25 |
Role of Tim4 in the regulation of ABCA1+ adipose tissue macrophages and post-prandial cholesterol levels
2021-07-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24684-7
PMID:34290249
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研究论文 | 研究探讨了Tim4在调节ABCA1+脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇水平中的作用 | 首次揭示了Tim4作为餐后胆固醇运输和脂肪组织巨噬细胞功能的关键调节因子 | NA | 理解巨噬细胞脂质代谢的机制，以开发新的治疗方法 | 脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇水平 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定表达Lyve1、Tim4和ABCA1的脂肪组织巨噬细胞群体 |
| 10295 | 2024-08-25 |
Polar Gini Curve: A Technique to Discover Gene Expression Spatial Patterns from Single-cell RNA-seq Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.006
PMID:34958962
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研究论文 | 本文介绍了一种名为极性基尼曲线的方法，用于通过分析单细胞RNA测序数据来表征簇标记 | 极性基尼曲线结合基因表达和二维坐标信息，用于检测单细胞RNA测序数据中任何簇细胞的均匀性模式 | NA | 开发一种方法来表征单细胞RNA测序数据中的簇标记和空间基因表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的簇细胞和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 极性基尼曲线 | 基因表达数据 | 涉及多个模拟案例研究和实际的新生小鼠心脏细胞数据集 |
| 10296 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.09.008
PMID:34775075
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎27天龄的胸腰椎和肋骨原基细胞的转录组图谱 | 首次在全生物体层面分析了胸腰椎和肋骨原基相关基因的表达动态，并揭示了骨形成和血管生成在胸腰椎和肋骨发育中的耦合过程 | NA | 探究脊椎动物胸腰椎和肋骨原基发育中的胚胎骨形成和血管生成 | 猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个27天龄的猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 |
| 10297 | 2024-08-24 |
Identification and experimental validation of immune-related gene PPARG is involved in ulcerative colitis
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167300
PMID:38880160
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研究论文 | 本研究旨在深入理解溃疡性结肠炎（UC）的免疫学特征，并识别有价值的诊断和治疗生物标志物 | 通过生物信息学技术，本研究首次确定了PPARG作为UC的关键生物标志物，并验证了其在UC中的作用及其与巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 深入理解溃疡性结肠炎的免疫学特征并识别生物标志物 | 溃疡性结肠炎及其相关免疫基因PPARG | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序技术 | DNN | 基因表达数据 | UC数据集来自GEO数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 10298 | 2024-08-24 |
Exploring the role of DNMT1 in dental papilla cell fate specification during mouse tooth germ development through integrated single-cell transcriptomics and bulk RNA sequencing
2024-Sep, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2024.06.010
PMID:38942194
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组学和批量RNA测序技术，探索了DNMT1在小鼠牙胚发育中牙乳头细胞命运决定的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序相结合的方法，揭示了DNMT1在早期成牙本质细胞发育中的关键调控作用 | 研究主要集中在胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞，未来研究可以扩展到不同发育阶段和不同物种 | 探究牙齿发育过程中牙间充质细胞的调控机制，特别是成牙本质细胞分化和表观遗传调控的作用 | 小鼠牙胚中的牙间充质细胞和成牙本质细胞分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | 单细胞调控网络推理和聚类（SCENIC） | RNA | 胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞和分离的牙间充质细胞 |
| 10299 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.005
PMID:39059207
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了衰老肾脏早期阶段T细胞的分子表型和组成变化 | 首次详细描述了衰老肾脏中T细胞的分子状态变化和极化现象，并识别出特定亚群的T细胞 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类肾脏衰老的具体情况 | 探究肾脏衰老早期阶段免疫细胞的变化及其分子机制 | 衰老小鼠肾脏中的T细胞和其他免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 10300 | 2024-08-24 |
Resolution of Acinar Dedifferentiation Regulates Tissue Remodeling in Pancreatic Injury and Cancer Initiation
2024-Sep, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.04.031
PMID:38729450
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研究论文 | 本文通过比较转录组分析研究了胰腺损伤和癌症起始过程中腺泡细胞去分化调控的机制。 | 发现Sox4基因在胰腺腺泡细胞去分化过程中起到抑制作用，并揭示了其在维持组织稳态和肿瘤退化中的新功能。 | NA | 探讨胰腺腺泡细胞去分化在胰腺损伤和癌症起始中的作用及机制。 | 胰腺腺泡细胞去分化过程中的Sox4基因及其调控机制。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |