单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27648 篇文献,本页显示第 10281 - 10300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10281 2024-08-07
Single-cell RNA-Seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of skin macrophages in Vsir-/- murine psoriasis
2020, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示了Vsir-/-小鼠银屑病皮肤中巨噬细胞的转录组图谱和异质性 首次全面展示了Vsir psoriatic小鼠皮肤免疫细胞的单细胞景观,揭示了银屑病皮肤巨噬细胞的转录组图谱和表型异质性,并识别了其基因表达特征 NA 研究Vsir-/-小鼠银屑病皮肤炎症中涉及的免疫细胞亚群 Vsir psoriatic小鼠的皮肤免疫细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 23,258个细胞
10282 2024-08-07
More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling
2019, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞免疫图谱技术,揭示了个体B细胞中存在多种抗体的可能性 发现了单个B细胞中存在多种Ig特异性的现象,挑战了传统的“一个细胞一个抗体”规则和CSR机制 NA 验证和定义单细胞转录组水平上的经典免疫学概念 B细胞及其产生的抗体 免疫学 NA Chromium单细胞免疫图谱技术和Sanger测序 NA 转录组 数百至数千个单个B细胞
10283 2024-08-07
Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression
2024-Aug-02, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析了心脏粘液瘤组织中的75,641个细胞,揭示了粘液瘤细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 首次通过单细胞测序技术详细描述了心脏粘液瘤细胞的组成及其与免疫细胞的相互作用 NA 探究心脏粘液瘤的细胞组成及其与免疫微环境的相互作用 心脏粘液瘤组织中的细胞 数字病理学 心脏疾病 单细胞测序 NA 细胞 75,641个细胞
10284 2024-08-07
Advances in single-cell transcriptomics in animal research
2024-Aug-02, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1
综述 本文介绍了单细胞转录组技术的发展,并回顾了其在动物研究中的过程、进展和应用 单细胞转录组技术为研究动物不同组织/器官的高通量单细胞基因表达提供了有效方法,能够识别细胞类型/亚型及其标记基因,推断细胞命运轨迹,并揭示细胞间的相互作用 讨论了单细胞转录组技术在当前阶段的局限性和展望 旨在通过单细胞转录组技术深入理解动物营养与健康、生殖性能、遗传学和不同畜种的疾病模型 动物研究中的不同组织/器官的单细胞 生物技术 NA 单细胞转录组技术 NA 转录组数据 基于大量案例积累的实践经验
10285 2024-08-07
Single-cell RNA-seq reveals novel interaction between muscle satellite cells and fibro-adipogenic progenitors mediated with FGF7 signalling
2024-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肌肉卫星细胞与成纤维脂肪前体细胞之间通过FGF7信号传导的新型相互作用 首次揭示了FGF7在肌肉卫星细胞与成纤维脂肪前体细胞相互作用中的作用,并通过实验验证了FGF7对肌肉卫星细胞增殖的促进作用 研究主要集中在猪模型上,需要进一步在其他物种中验证结果 探索肌肉卫星细胞与微环境细胞的相互作用,特别是与成纤维脂肪前体细胞的相互作用 肌肉卫星细胞和成纤维脂肪前体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 猪的长背肌和比目鱼肌样本
10286 2024-08-07
Generation of human vascularized and chambered cardiac organoids for cardiac disease modelling and drug evaluation
2024-Aug, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本文介绍了一种新方法,通过结合人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的血管球和直接分化的hiPSC心肌细胞,生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官(vcCOs),并探讨了其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 本文创新性地开发了一种三步法,用于生成具有心室样结构和血管化的复杂vcCOs,这些vcCOs显示出高自发跳动比率和多细胞类型组成。 尽管vcCOs在心脏疾病模型和药物评估中显示出潜力,但其低重复性、有限血管化和心室形成困难等问题仍需进一步解决。 研究目的是开发一种新方法,用于生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官,并探索其在心脏疾病模型和药物筛选中的应用。 研究对象包括人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官(vcCOs)及其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 细胞 vcCOs中包含六种细胞类型,包括心肌细胞、心脏前体细胞、内皮细胞、成纤维细胞等
10287 2024-08-07
Interleukin-35 alleviates neuropathic pain and induces an anti-inflammatory shift in spinal microglia in nerve-injured male mice
2024-Aug-01, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究探讨了白细胞介素-35(IL-35)对神经损伤雄性小鼠的疼痛行为、脊髓小胶质细胞表型的影响及其体外小胶质细胞培养中的作用。 研究发现IL-35能显著减轻雄性小鼠的机械性疼痛过敏,并诱导脊髓小胶质细胞向抗炎表型转变,表明IL-35可能成为针对性别特异性的神经痛免疫调节治疗新策略。 研究主要集中在雄性小鼠,对雌性小鼠的效果较弱,性别差异的影响需要进一步研究。 研究IL-35在神经痛中的作用及其对脊髓小胶质细胞的影响。 神经损伤的雄性小鼠及其脊髓小胶质细胞。 NA 神经痛 NA NA 转录组数据 涉及雄性和雌性小鼠的实验样本。
10288 2024-08-07
Establishment of a CD8+ T cells-related prognostic risk model for acral melanoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI) IF:2.0Q3
研究论文 本研究基于单细胞和批量RNA测序数据,建立了与肢端黑色素瘤预后相关的CD8+ T细胞风险模型。 首次利用单细胞RNA测序技术探索肢端黑色素瘤中免疫细胞的组成差异,并构建了基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后风险评分模型。 研究主要基于TCGA-SKCM队列,可能需要进一步的跨队列验证以增强模型的泛化能力。 旨在通过识别CD8+ T细胞相关基因的表达水平,建立肢端黑色素瘤患者的预后模型。 研究对象为肢端黑色素瘤中的CD8+ T细胞及其相关基因。 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 Lasso-Cox方法 RNA测序数据 使用了TCGA-SKCM队列的数据,具体样本数量未在摘要中明确。
10289 2024-08-07
Single-cell Atlas of Penile Cancer Reveals TP53 Mutations as a Driver of an Aggressive Phenotype, Irrespective of Human Papillomavirus Status, and Provides Clues for Treatment Personalization
2024-Aug, European urology IF:25.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了阴茎鳞状细胞癌(PSCC)中TP53失活突变与人类乳头瘤病毒(HPV)状态对肿瘤微环境转录组差异的影响 首次使用单细胞RNA测序技术构建了阴茎癌的细胞图谱,揭示了TP53突变与HPV状态对PSCC生物学特性的影响 单细胞RNA测序分析存在样本量较小的问题,需要在大规模PSCC队列中验证这些特征 描述基于TP53失活突变和HPV状态的PSCC微环境中的转录组差异 阴茎鳞状细胞癌(PSCC)及其微环境中的细胞亚型 数字病理学 阴茎癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 包括6个HPV+ TP53野生型(WT)、6个HPV- TP53WT和4个TP53失活(LOF)PSCC样本及6个对照样本,以及541名PSCC患者的生存数据
10290 2024-08-07
Tropism for ciliated cells is the dominant driver of influenza viral burst size in the human airway
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究了不同上皮细胞类型对流感病毒在人呼吸道中的复制动力学和负担的影响 揭示了纤毛细胞在流感病毒爆发规模中的主导作用,并发现感染的分泌细胞与总体病毒输出减少相关 NA 探究不同上皮细胞类型对流感病毒复制动力学和负担的影响 人呼吸道中的不同上皮细胞类型 NA 流感 单细胞RNA测序 NA RNA 多个供体和30种独立分化条件下的原代人呼吸道培养物
10291 2024-08-07
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2024-Jul-30, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析牙龈组织,揭示了与中性粒细胞外陷阱(NETs)相关的中性粒细胞亚群在牙周免疫调节中的作用 首次构建了牙周微环境的单细胞图谱,并识别出与NETs相关的中性粒细胞亚群(NrNeu),揭示了牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs生成的具体机制 NA 展示NETs在牙周免疫病理中的重要功能和特定机制 牙龈组织中的中性粒细胞及其在牙周炎中的作用 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本
10292 2024-08-07
Fatecode enables cell fate regulator prediction using classification-supervised autoencoder perturbation
2024-Jul-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为Fatecode的计算方法,用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞命运调控因子 Fatecode利用深度学习分类监督自编码器学习单细胞RNA测序数据的潜在表示,并通过在潜在表示上进行模拟扰动实验来预测基因 NA 加速疾病或损伤后的恢复 细胞命运调控因子 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 自编码器 基因表达数据 不同生物的血液和大脑发育的单细胞RNA测序数据
10293 2024-08-07
Directly selecting cell-type marker genes for single-cell clustering analyses
2024-Jul-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文介绍了一种名为Festem的统计方法,用于直接选择细胞类型标记基因进行单细胞聚类分析 Festem方法能够区分具有异质性分布的标记基因,这些基因对细胞聚类具有信息性,且能高精度地选择标记基因 NA 开发一种新的统计方法,用于直接选择细胞类型标记基因,以提高单细胞RNA测序研究中的细胞类型识别准确性 单细胞RNA测序数据中的细胞类型及其标记基因 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 一个大型的肝内胆管癌数据集
10294 2024-08-07
Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes IF:6.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10295 2024-08-07
An attenuated lymphocytic choriomeningitis virus vector enhances tumor control in mice partly via IFN-I
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究报道了一种基于减毒淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(r3LCMV)的非裂解性病毒载体在多种肿瘤模型中显著增强肿瘤控制和提高生存率的效果 首次展示了r3LCMV病毒载体在免疫缺陷小鼠模型中的肿瘤控制效果,并揭示了宿主内在的IFN-I在其抗肿瘤功效中的关键作用 文章未明确提及具体的局限性 探索和验证新型病毒载体在癌症治疗中的应用效果 肿瘤模型中的小鼠 NA 癌症 单细胞RNA测序 NA RNA 多个肿瘤模型中的小鼠
10296 2024-08-07
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-Jun-06, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本文通过使用多种遗传工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学,展示了PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎发展中的关键作用,并证明了PI3Kα抑制剂alpelisib在不同小鼠模型中改善肾小球病变和肾功能的效果。 首次揭示了PI3Kα抑制剂在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的双重作用,不仅影响足细胞,还影响免疫系统。 研究主要基于小鼠模型和从活动性狼疮性肾炎患者中分离的人淋巴细胞,尚未在更广泛的人类患者群体中进行验证。 探讨PIK3CA抑制在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的作用及其机制。 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞。 NA 肾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA RNA 多种遗传工程小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞
10297 2024-08-07
Single-cell transcriptomic analysis deciphers heterogenous cancer stem-like cells in colorectal cancer and their organ-specific metastasis
2024-02-23, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和空间转录组分析,揭示了结直肠癌中异质性癌症干细胞样细胞及其器官特异性转移的机制 首次通过综合分析揭示了结直肠癌中具有高PTPRO和ASCL2表达的干细胞样细胞群是转移的关键,并展示了这些细胞群在肝脏和卵巢转移中的特异性 NA 揭示结直肠癌中异质性癌症细胞的类型及其器官特异性转移的机制 结直肠癌原发肿瘤及肝脏和卵巢转移中的单细胞转录组 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及结直肠癌原发肿瘤及肝脏和卵巢转移的样本
10298 2024-08-07
AGBL4 promotes malignant progression of glioblastoma via modulation of MMP-1 and inflammatory pathways
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了AGBL4在胶质母细胞瘤(GBM)恶性进展中的作用及其与炎症途径的关联 发现AGBL4通过调节MMP-1和炎症途径促进GBM的恶性进展,并建立了一个新的调控轴 NA 阐明GBM的分子机制,特别是AGBL4与炎症途径的关系,以发现可行的治疗靶点 AGBL4在GBM中的表达及其对细胞增殖、迁移、侵袭和炎症反应的影响 数字病理学 脑肿瘤 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
10299 2024-08-07
NNMT enriches for AQP5+ cancer stem cells to drive malignant progression in early gastric cardia adenocarcinoma
2023-12-07, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探索早期胃食管腺癌(EGCA)的细胞和分子异质性 本研究首次揭示了NNMT+/AQP5+细胞群在EGCA恶性进展中的作用,并提出了可能的早期诊断和治疗策略 NA 深入理解早期胃食管腺癌的异质性及其恶性进展机制 早期胃食管腺癌及其配对的非恶性活检样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 95,551个细胞
10300 2024-08-07
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 研究通过长期谱系追踪和单细胞RNA测序分析,揭示了表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞在正常稳态中的作用及其在Kras驱动的癌变中的保护作用 首次定义了表达Tff2的胰腺腺泡过渡放大前体细胞(TAP),并揭示其在Kras驱动的癌变中的保护作用 NA 探讨胰腺腺泡前体细胞在正常稳态及癌变过程中的作用 表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
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