单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 10261 - 10280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10261 | 2024-08-25 |
Single-cell transcriptome analysis revealed heterogeneity in glycolysis and identified IGF2 as a therapeutic target for ovarian cancer subtypes
2024-Jul-31, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12688-7
PMID:39085784
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了卵巢癌中糖酵解的异质性，并确定IGF2为治疗卵巢癌亚型的潜在靶点 | 开发了基于糖酵解评分的新型卵巢癌亚型，并建立了稳定的预后模型 | NA | 探索卵巢癌的分子机制和个性化治疗途径 | 卵巢癌及其亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85种机器学习组合 |
| 10262 | 2024-08-25 |
Immunosuppressive CD29+ Treg accumulation in the liver in mice on checkpoint inhibitor therapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330024
PMID:37770128
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研究论文 | 本研究使用流式细胞术和单细胞RNA测序技术，探讨了免疫检查点抑制剂治疗前后小鼠肝脏中调节性T细胞（Tregs）的特征和变化 | 发现肝脏中的CD29+ Tregs在免疫检查点抑制剂治疗后数量翻倍，且这种扩张并非由PD-1表达的Tregs主导，而是CD29+ Tregs的特异性反应 | NA | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对肝脏中调节性T细胞的影响及其在肿瘤免疫抵抗中的作用 | 小鼠肝脏中的调节性T细胞（Tregs）及其亚群CD29+ Tregs | 免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠肝脏和脾脏中的Tregs |
| 10263 | 2024-08-25 |
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01767-y
PMID:37231261
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为'桥接整合'的方法，用于跨模态整合单细胞数据集，使用多组学数据集作为分子桥接。 | 引入了'桥接整合'方法，通过多组学数据集的细胞元素构建字典，实现不同模态数据的整合和共享空间转换。 | NA | 开发一种新的方法来整合和比较不同分子模态的单细胞数据集。 | 单细胞测序数据集，包括转录组数据、染色质可及性、组蛋白修饰、DNA甲基化和蛋白质水平。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 字典学习 | 多组学数据 | 860万个人类免疫细胞 |
| 10264 | 2024-08-25 |
Prediction Model for Therapeutic Responses in Ovarian Cancer Patients using Paclitaxel-resistant Immune-related lncRNAs
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于紫杉醇耐药免疫相关长链非编码RNAs（lncRNAs）的卵巢癌患者治疗反应预测模型 | 首次构建了包含9个紫杉醇耐药免疫相关lncRNAs的预测模型，用于预测卵巢癌患者的免疫治疗和化疗反应及预后 | NA | 开发一种预测卵巢癌患者治疗反应的模型 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归分析 | RNA序列数据 | 186个差异表达的紫杉醇耐药lncRNAs和225个免疫相关lncRNAs |
| 10265 | 2024-08-25 |
Multi-transcriptomics analysis of microvascular invasion-related malignant cells and development of a machine learning-based prognostic model in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1436131
PMID:39176099
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索肝细胞癌中与微血管侵犯相关的恶性细胞，并开发了一种基于机器学习的预后模型 | 本研究首次通过综合多组学分析揭示了与微血管侵犯相关的恶性细胞的生物学功能，并开发了一种新的预后模型 | NA | 探索肝细胞癌中微血管侵犯的机制并开发预后模型 | 肝细胞癌中的微血管侵犯相关恶性细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq | 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 使用TCGA和HCCDB的bulk RNA-seq数据，GEO数据库的单细胞RNA-seq数据，以及CNCB数据库的空间转录组数据 |
| 10266 | 2024-08-25 |
Revealing the regulation of allergic asthma airway epithelial cell inflammation by STEAP4 targeting MIF through machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1427352
PMID:39176391
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和单细胞测序分析，揭示了STEAP4通过调控MIF在过敏性哮喘气道上皮细胞炎症中的作用。 | 首次发现STEAP4在过敏性哮喘中的作用，并通过机器学习和单细胞测序技术验证了其调控MIF的机制。 | 研究主要基于数据库中的微阵列数据和动物模型，尚未在人体中进行直接验证。 | 探索过敏性哮喘气道上皮细胞炎症的调控机制。 | 过敏性哮喘患者的气道上皮细胞。 | 机器学习 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 微阵列数据 | 包括哮喘患者和健康个体的气道上皮样本，以及哮喘小鼠模型。 |
| 10267 | 2024-08-25 |
Behind the Indolent Facade: Uncovering the Molecular Features and Malignancy Potential in Lung Minimally Invasive Adenocarcinoma by Single-Cell Transcriptomics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303753
PMID:37991139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺微小侵袭性腺癌（MIA）的分子特征及其恶性潜能 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了MIA与侵袭性腺癌（IA）之间的联系和异质性，并发现了可能导致MIA恶性进展的机制 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肺微小侵袭性腺癌的分子特征及其恶性潜能 | 肺微小侵袭性腺癌（MIA）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 156,447个细胞，来自三位同步多发性肺腺癌患者的MIA和IA肿瘤样本、外周血单个核细胞及邻近正常组织样本 |
| 10268 | 2024-08-25 |
Single-Cell Analysis Reveals Malignant Cells Reshape the Cellular Landscape and Foster an Immunosuppressive Microenvironment of Extranodal NK/T-Cell Lymphoma
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303913
PMID:37949673
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，揭示了恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下解析了外周NK/T细胞淋巴瘤肿瘤微环境的异质组成，强调了携带EBV编码LMP1的恶性NK细胞在重塑细胞景观和促进免疫抑制微环境中的重要作用 | NA | 更好地理解外周NK/T细胞淋巴瘤的异质性起源 | 外周NK/T细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个患者队列 |
| 10269 | 2024-08-25 |
Single-Cell RNA-Sequencing Provides Insight into Skeletal Muscle Evolution during the Selection of Muscle Characteristics
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305080
PMID:37870215
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）探讨了人工选择对猪骨骼肌细胞特征的影响 | 本研究首次提供了全景式的肌肉常驻细胞特征，并识别了新的和品种特异性的细胞类型，以及它们在伪时间轨迹上的分布 | NA | 探究人工选择对骨骼肌细胞特征的影响及其机制 | 猪的骨骼肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及不同品种的猪的骨骼肌细胞 |
| 10270 | 2024-08-25 |
Identification and Characterization of CD8+ CD27+ CXCR3- T Cell Dysregulation and Progression-Associated Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus
2023-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202300123
PMID:37875396
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术、流式细胞术和单细胞RNA测序，全面分析了263例临床外周血样本中系统性红斑狼疮（SLE）患者的免疫细胞失调情况，并探讨了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE病理和疾病进展中的作用。 | 本研究首次详细描述了CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在SLE中的失调情况及其与疾病活动性的关联，并构建了动态网络生物标志物（DNB）模型，用于预测SLE的疾病进展。 | NA | 探讨CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的失调情况及其作为疾病进展相关生物标志物的潜力。 | CD8+ CD27+ CXCR3- T细胞在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其作为生物标志物的可能性。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式细胞术、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动态网络生物标志物（DNB）模型 | 外周血样本 | 263例临床外周血样本，包括活动性SLE（aSLE）、缓解期SLE（rSLE）和健康对照（HCs） |
| 10271 | 2024-08-25 |
Loss of ATOH1 in Pit Cell Drives Stemness and Progression of Gastric Adenocarcinoma by Activating AKT/mTOR Signaling through GAS1
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301977
PMID:37824217
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研究论文 | 研究探讨了ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其通过GAS1激活AKT/mTOR信号通路促进胃腺癌进展的机制 | 首次揭示了ATOH1通过调控GAS1和RET/AKT/mTOR信号通路影响胃癌干细胞的维持和化疗耐药性 | 研究主要基于小鼠模型和组织样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 阐明ATOH1在胃癌干细胞维持中的作用及其分子机制 | 胃癌干细胞及胃腺癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括小鼠模型和胃腺癌组织样本 |
| 10272 | 2024-08-25 |
A single-cell transcriptomic landscape of innate and adaptive intratumoral immunity in triple negative breast cancer during chemo- and immunotherapies
2022-Mar-08, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-00893-x
PMID:35260564
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估了两种三阴性乳腺癌小鼠模型在未治疗及化疗或免疫治疗（单独或联合使用）后的肿瘤微环境中的免疫景观 | 首次提供了化疗和免疫治疗在三阴性乳腺癌中主要免疫细胞群体的清晰概览 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 探讨化疗和免疫治疗在三阴性乳腺癌中的免疫反应 | 三阴性乳腺癌小鼠模型的肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两种三阴性乳腺癌小鼠模型 |
| 10273 | 2024-08-25 |
Single-cell Iso-Sequencing enables rapid genome annotation for scRNAseq analysis
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyac017
PMID:35143654
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研究论文 | 本文展示了单细胞等位序列测序（Iso-Sequencing）与单细胞RNA测序结合使用，能快速提升3'-UTR注释的效率 | 首次证明单细胞等位序列测序能显著提高3'-UTR注释的完整性，从而改善单细胞RNA测序数据的解读 | 研究仅基于刺鱼（Gasterosteus aculeatus）的数据，其普适性有待进一步验证 | 探索单细胞等位序列测序在提升单细胞RNA测序基因注释准确性方面的应用 | 刺鱼（Gasterosteus aculeatus）的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用刺鱼的胚胎单细胞等位序列测序数据和已发表的成体批量Iso-Seq数据 |
| 10274 | 2024-08-25 |
Make war not love: The neural substrate underlying a state-dependent switch in female social behavior
2022-03-02, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.12.002
PMID:34982958
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了雌性小鼠腹侧内侧下丘脑（VMHvl）中两种不同的雌激素受体-1阳性神经元亚型，这些亚型分别控制着雌性小鼠的性接受性和攻击性行为 | 首次阐明了雌性小鼠在不同生殖状态下对同种刺激产生不同行为反应的神经机制 | NA | 探究雌性小鼠在不同生殖状态下社会行为的神经基础 | 雌性小鼠的神经元亚型及其在不同生殖状态下的行为控制 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 神经元活动数据 | NA |
| 10275 | 2024-08-25 |
Single-cell gene fusion detection by scFusion
2022-02-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28661-6
PMID:35228538
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基因融合检测计算工具scFusion，并通过模拟和真实数据集评估了其性能 | scFusion能够高效且敏感地检测基因融合，具有较低的假发现率，并能在单细胞水平上检测到其他方法无法发现的融合事件 | NA | 开发和评估一种新的计算工具，用于在单细胞水平上检测基因融合 | 基因融合在肿瘤发生和进展中的作用 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 五个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 10276 | 2024-08-25 |
Klf4 methylated by Prmt1 restrains the commitment of primitive endoderm
2022-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac054
PMID:35137179
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研究论文 | 研究报告了Prmt1在原始内胚层（PrE）形成中的重要作用，以及Prmt1介导的Klf4甲基化在细胞命运决定中的机制 | 首次揭示了Prmt1通过甲基化Klf4来调控原始内胚层形成的分子机制 | NA | 探索哺乳动物胚胎发育早期原始内胚层形成的分子机制 | Prmt1在原始内胚层形成中的作用及Klf4甲基化的影响 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） |
| 10277 | 2024-08-25 |
Single-cell transcriptomics analysis reveals intratumoral heterogeneity and identifies a gene signature associated with prognosis of hepatocellular carcinoma
2022-02-25, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212560
PMID:35169832
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌患者的肿瘤组织，揭示了肿瘤内异质性并识别出与肝细胞癌预后相关的基因特征 | 首次在单细胞水平上揭示了肝细胞癌的肿瘤内异质性，并识别出与预后相关的基因特征 | 研究仅基于一名肝细胞癌患者的样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 揭示肝细胞癌的肿瘤内异质性并识别与预后相关的基因特征 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 5753个细胞，来自一名肝细胞癌患者 |
| 10278 | 2024-08-25 |
A Primer for Single-Cell Sequencing in Non-Model Organisms
2022-02-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13020380
PMID:35205423
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研究论文 | 本文介绍了在非模式生物中进行单细胞测序研究的一般工作流程和注意事项 | 探讨了在非模式生物中应用单细胞测序技术的可能性，这有助于深入理解基因型与表型之间的关系及生物变异的基础 | 研究仅限于多细胞动物 | 探索在非模式生物中应用单细胞测序技术，以解决传统模式生物无法触及的问题 | 非模式生物中的单细胞测序 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10279 | 2024-08-25 |
scInTime: A Computational Method Leveraging Single-Cell Trajectory and Gene Regulatory Networks to Identify Master Regulators of Cellular Differentiation
2022-02-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13020371
PMID:35205415
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scInTime的无监督机器学习框架，该框架结合单细胞基因调控网络（scGRNs）和推断的细胞轨迹，用于识别细胞分化的主调控基因 | scInTime框架通过整合不同伪时间点的基因调控网络信息，提供了更易解释的轨迹推断结果 | NA | 开发一种新的计算方法，通过结合单细胞轨迹和基因调控网络来识别细胞分化的主调控基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化主调控基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 10280 | 2024-08-25 |
T-cell dysfunction in the glioblastoma microenvironment is mediated by myeloid cells releasing interleukin-10
2022-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28523-1
PMID:35177622
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研究论文 | 本文通过应用一个集成空间解析和单细胞基因表达数据的计算多维模型，研究了胶质母细胞瘤微环境中T细胞功能障碍的原因 | 本文首次展示了通过集成单细胞和空间转录组学数据的多维模型来探究肿瘤免疫微环境 | NA | 研究胶质母细胞瘤微环境中T细胞功能障碍的机制 | 胶质母细胞瘤中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞和空间转录组学 | 多维模型 | 基因表达数据 | 45,615个免疫细胞来自12个肿瘤样本 |