单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10261 - 10280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10261 | 2025-10-07 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Feb-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5921338/v1
PMID:40060050
|
研究论文 | 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析单细胞技术产生的细胞组成差异数据 | 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据，并能在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验，通过多元方法提高检测效力 | NA | 开发统计分析方法以识别细胞类型频率的变化 | 单细胞RNA测序数据集（涉及衰老、结核感染T细胞、前列腺癌骨转移和SARS-CoV-2感染） | 生物信息学 | 前列腺癌, 结核病, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10262 | 2025-10-07 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639959
PMID:40060489
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研究论文 | 评估小鼠大脑单细胞和单核RNA测序图谱中细胞簇的可重复性 | 使用全转录组邻域投票方法识别了2009对相互匹配的细胞簇对，并发现这些簇在多个物种数据集中具有一致的空间定位和协调的基因表达 | 下丘脑的高度异质性限制了细胞簇的可重复性，区分相近细胞簇比区分大多数其他簇更具挑战性 | 评估单细胞和单核RNA测序研究中细胞簇的生物学稳健性和可重复性 | 小鼠大脑细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 邻域投票算法 | 基因表达数据 | 超过400万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 10263 | 2025-10-07 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 通过单细胞转录组元分析开发细胞类型无关的转录组特征，实现神经发育的跨数据集统一比较 | 开发了细胞类型无关的发育年龄预测模型，在人类和小鼠大脑中均表现出良好泛化能力 | NA | 建立统一的神经发育比较框架，预测细胞发育状态 | 人类和小鼠大脑发育细胞、人类神经类器官 | 生物信息学 | 神经发育疾病 | 单细胞转录组测序 | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10264 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of semaphorins family genes in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1536545
PMID:40103807
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和机器学习方法，构建了结直肠癌中信号素家族基因相关的预后评分系统 | 开发了包含10种机器学习算法及其101种组合的新型计算框架来构建SRS评分，并首次在结直肠癌中系统评估信号素家族基因的预后价值 | 研究样本量未明确说明，需要进一步验证SRS评分在独立队列中的临床应用价值 | 评估信号素家族基因在结直肠癌中的预后价值和免疫治疗意义 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞实验 | 10种机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10265 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of shoot apex reveals the mechanism of cyclin regulating cell division via auxin signaling pathway in Populus alba
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1555388
PMID:40104035
|
研究论文 | 通过白杨茎尖单细胞RNA测序揭示了细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控细胞分裂的机制 | 首次在单细胞水平解析白杨茎尖发育过程中细胞周期蛋白和生长素信号通路的协同调控网络 | 研究仅基于两个生物学重复，样本量相对有限 | 探究细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控白杨叶片发育的分子机制 | 白杨(Populus alba)茎尖组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 扫描电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 29,011个细胞（来自两个生物学重复） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10266 | 2025-10-07 |
Multi-omics approach reveals the impact of prognosis model-related genes on the tumor microenvironment in medulloblastoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1477617
PMID:40104502
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法开发了髓母细胞瘤肿瘤微环境风险评分模型，用于预测患者预后并阐明生物学机制 | 首次构建了基于8个关键基因的TMErisk评分模型，并通过单细胞多组学和空间转录组学验证了模型基因在肿瘤微环境中的表达动态和空间分布 | 研究样本量有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发髓母细胞瘤肿瘤微环境相关风险评分模型并探索其生物学机制 | 髓母细胞瘤患者样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组分析 | WGCNA，LASSO-COX，COX回归模型 | 基因表达数据，表观遗传数据，空间分布数据 | 322例天坛医院样本和763例GSE85217数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10267 | 2025-10-07 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-Dec-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
|
综述 | 探讨造血干细胞异质性及年龄相关血小板分化偏倚对骨髓移植和血液疾病的影响 | 揭示血小板偏倚造血干细胞在衰老过程中的扩增现象及其跨物种进化保守性 | 当前研究方法存在局限性，需进一步优化技术手段 | 优化造血干细胞疗法并改善血液疾病临床结局 | 造血干细胞及其血小板分化偏倚现象 | 单细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序,分子条形码 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10268 | 2025-10-07 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
|
研究论文 | 本研究通过局部控制递送IL-4评估其在牙周病小鼠模型中减少炎症性骨丢失的效果 | 首次将IL-4封装于可生物降解聚合物载体中进行局部持续递送，并证明其能促进牙周组织修复和骨再生 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 评估靶向巨噬细胞的控释药物递送策略在慢性炎症治疗中的可行性 | 牙周病小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 免疫治疗 | 牙周病 | 单细胞RNA测序，药物控释技术 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10269 | 2025-10-07 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-Sep-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
|
评论 | 讨论MYCT1蛋白通过调控内吞作用和环境感知在造血干细胞维持中的新发现及其对造血干细胞和基因治疗的影响 | 揭示了MYCT1蛋白作为造血干细胞环境感知和干细胞特性维持的关键调控因子，这一机制先前未知 | 评论性文章，未进行原始实验研究，主要基于对已有研究的分析和讨论 | 探讨造血干细胞体外培养的瓶颈问题及新发现对细胞治疗和基因治疗的应用价值 | 造血干细胞，特别是脐带血造血干细胞 | 细胞生物学 | 血液系统疾病 | 基因敲降，过表达，单细胞RNA测序，移植实验 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10270 | 2025-10-07 |
In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer
2024-Sep-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406325121
PMID:39298484
|
研究论文 | 通过体内CRISPR筛选鉴定Mga作为三阴性乳腺癌的免疫治疗靶点 | 使用七种同源肿瘤模型进行迭代体内CRISPR筛选，识别跨癌症类型的核心和背景依赖性免疫逃逸通路 | Mga调节肿瘤免疫景观的确切机制需要进一步研究 | 识别肿瘤内在免疫调节因子和有效的抗癌治疗靶点 | 三阴性乳腺癌(TNBC)和七种同源肿瘤模型 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR筛选, 转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 七种同源肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10271 | 2025-10-07 |
A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis
2024-Sep, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103
PMID:39094968
|
综述 | 提供单细胞RNA测序数据质量控制与下游分析的实用指南 | 系统性地提出单细胞分析中高质量细胞筛选标准和分析流程的规范化指南 | NA | 改善单细胞分析质量，为研究人员提供标准化分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10272 | 2025-10-07 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-Aug-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
|
综述 | 本文综述了硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理作用和药理机制 | 重点关注硫化氢通过蛋白质硫巯基化修饰调控心脏代谢疾病的新机制，并探讨新兴技术在相关研究中的应用前景 | 主要基于现有文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 探讨硫化氢在心脏代谢疾病中的治疗潜力及其药理作用机制 | 内源性硫化氢及其供体在细胞、动物和临床研究中的作用 | 药理学 | 心脏代谢疾病 | 多组学分析、肠道菌群分析、类器官、单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10273 | 2025-10-07 |
Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660
PMID:38587552
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肿瘤单细胞数据与类器官共培养实验，揭示了胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞与上皮细胞上皮-间质转化和炎症状态的关联 | 引入从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习方法，用于细胞间相互作用的实验验证 | NA | 识别肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本和类器官共培养系统 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，迁移学习，类器官共培养 | 迁移学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10274 | 2025-10-07 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585298
PMID:38559060
|
研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 首次将长读长单细胞RNA测序技术应用于研究BTK抑制剂治疗中出现的突变亚克隆，能够更全面地分析转录本覆盖度 | 研究样本量较小（仅6名患者），且仅在部分患者中观察到突变亚克隆的转录组差异 | 探究BTK抑制剂治疗中突变亚克隆的扩张机制和转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者中的癌症亚克隆 | 单细胞测序 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，DNA测序数据 | 6名获得BTK抑制剂治疗期间出现突变的CLL患者 | NA | 单细胞RNA测序，长读长测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 10275 | 2025-10-07 |
Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05289-6
PMID:36198802
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞不同亚群在肝癌发生中的双重作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定肝星状细胞亚群，并发现其从肝癌保护向促进的动态转换机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究肝星状细胞在肝细胞癌发生发展过程中的功能作用 | 肝星状细胞亚群及其与肝细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，遗传消融技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类肝星状细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10276 | 2025-10-07 |
Redefining inflammatory macrophage phenotypes across stages and tissues by single-cell transcriptomics
2022-04-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abo4652
PMID:35427177
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学重新定义不同阶段和组织中的炎症巨噬细胞表型 | 利用单细胞转录组数据识别单核细胞衍生巨噬细胞的主要活化路径，为炎症组织巨噬细胞提供新框架 | NA | 建立炎症巨噬细胞表型的分类框架 | 单核细胞衍生巨噬细胞和炎症组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10277 | 2025-10-07 |
Environments Tune and Select Cellular Diversity
2017-09, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2017.07.006
PMID:28774723
|
研究论文 | 探讨单细胞测序技术揭示的细胞间表达变异及其在细胞间传递的机制 | 应用系统生物学方法结合机制与统计模型解析表型多样性的驱动因素 | NA | 阐明环境因素如何调控和选择细胞多样性 | 单细胞表达变异与表型多样性 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | 机制模型、统计模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10278 | 2025-03-20 |
Targeting the histone reader ZMYND8 inhibits antiandrogen-induced neuroendocrine tumor transdifferentiation of prostate cancer
2025-Mar-18, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00928-z
PMID:40102673
|
研究论文 | 本文通过CRISPR‒Cas9筛选与单细胞RNA测序追踪肿瘤转变，揭示了抗雄激素治疗诱导的ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用 | 揭示了ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用，并开发了iZMYND8-34小分子抑制剂以阻断这一过程 | NA | 研究抗雄激素治疗诱导的前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化的分子机制 | 前列腺癌神经内分泌肿瘤 | 表观遗传学 | 前列腺癌 | CRISPR‒Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10279 | 2025-03-20 |
Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in the Study of Central Nervous System Diseases
2024-Jun, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-023-01207-3
PMID:38133792
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞测序技术能够对混合细胞群体中的单个细胞进行精确分析，并从中枢神经系统的不同空间位置、时间阶段和细胞类型中收集细胞，从而发现与特定疾病相关的细胞亚群及其相关基因 | NA | 探索单细胞测序技术在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统中的细胞，包括神经元和胶质细胞（如星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞） | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10280 | 2025-03-20 |
FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice
2023-04-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167816
PMID:37092548
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研究论文 | 本研究揭示了细胞外基质Lama4在调节淋巴结导管中的特定作用，并探讨了FRC移植对Lama4缺陷小鼠淋巴结导管缺陷的修复作用 | 首次揭示了FRC衍生的Lama4在维持导管纤维完整性中的关键作用，并展示了通过FRC移植修复Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管结构和功能的创新方法 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨FRC衍生的Lama4在调节淋巴结导管结构和功能中的作用，并评估FRC移植对Lama4缺陷小鼠的修复效果 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结导管 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结组织 | NA | NA | NA | NA |