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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10221 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1527036
PMID:40110199
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了膀胱癌中双硫死亡相关lncRNAs的调控网络和预后模型 | 首次将双硫死亡与lncRNAs结合构建膀胱癌预后模型,并揭示其与免疫状态和治疗反应的关系 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡相关lncRNAs作为膀胱癌预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, Cox回归 | 预后模型, nomogram | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
10222 | 2025-10-07 |
Aspartate beta-hydroxylase is a prognostic factor in gallbladder cancer with the function of promoting tumorigenesis and chemoresistance
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1452345
PMID:40110547
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研究论文 | 本研究探讨天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)在胆囊癌中的促癌作用及化疗耐药机制 | 首次通过孟德尔随机化方法确认ASPH是胆囊癌的致病基因,并发现其通过调控免疫检查点和上皮间质转化促进肿瘤进展 | 研究样本量有限(215例),且主要基于回顾性分析 | 探索胆囊癌的新型生物标志物及其在肿瘤发生和化疗耐药中的作用机制 | 胆囊癌患者组织样本和单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 胆囊癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 单细胞测序数据 | 215例胆囊癌患者 | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |
10223 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of stem cells from human exfoliated deciduous teeth investigating functional heterogeneity in immunomodulation
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82734-8
PMID:39732760
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人脱落乳牙干细胞在免疫调节中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示SHED不同分化状态下的免疫调节功能异质性,并与其他人源MSCs进行功能比较 | 仅进行体外实验验证,缺乏体内实验数据支持 | 探究人脱落乳牙干细胞的免疫调节功能异质性 | 人脱落乳牙干细胞(SHED) | 单细胞组学 | 炎症性疾病,自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10224 | 2025-10-07 |
Extrasinusoidal macrophages are a distinct subset of immunologically active dural macrophages
2024-12-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh1129
PMID:39705337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术鉴定并表征了硬脑膜外窦巨噬细胞这一独特的免疫活性细胞亚群 | 首次发现硬脑膜外窦巨噬细胞在起源、扩增动力学和转录谱方面与软脑膜和中枢神经系统实质巨噬细胞存在显著差异,并揭示其在自身免疫性神经炎症中执行粒细胞凋亡清除功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类硬脑膜巨噬细胞的特性和功能仍需进一步验证 | 探究硬脑膜外窦巨噬细胞的细胞和功能异质性 | 小鼠硬脑膜巨噬细胞 | 免疫学 | 自身免疫性神经炎症 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 共聚焦成像, 克隆分析, 转基因小鼠系 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10225 | 2025-10-07 |
New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia
2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae054
PMID:38332750
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研究论文 | 通过肝脏细针穿刺活检结合单细胞组学技术,深入评估赞比亚人群肝内免疫特征 | 首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合,实现肝内免疫细胞的深度纵向评估 | 样本量有限,仅包含赞比亚特定人群,未涉及其他地区人群 | 探索乙型肝炎病毒免疫学特征,为治愈策略提供依据 | 未经治疗的慢性HBV感染成人患者(包括HIV共感染者)及急性HBV感染者 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 117例入组样本和47例纵向随访样本(1年随访) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10226 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of the endothelin system in the kidneys of mice, rats, and humans
2024-07-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20240768
PMID:38904098
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫定位技术对小鼠、大鼠和人类肾脏中的内皮素系统进行全面分析 | 首次结合单细胞RNA测序数据和免疫定位技术,跨物种比较肾脏内皮素系统的表达特征 | 商业抗体在不同物种间效果不一致,RNA表达水平与蛋白质水平并不总是相关 | 表征人类和啮齿类动物肾脏中内皮素系统的表达特征 | 人类、大鼠和小鼠的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定位数据 | 多物种肾脏样本(人类活体供者活检组织、大鼠和小鼠肾脏样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10227 | 2025-10-07 |
Heart failure promotes multimorbidity through innate immune memory
2024-05-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade3814
PMID:38787963
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研究论文 | 本研究揭示了心力衰竭通过改变造血干细胞表观基因组驱动多病共存的新机制 | 首次发现心力衰竭通过抑制TGF-β信号通路改变造血干细胞的表观遗传状态,形成天然免疫记忆,从而促进多病共存 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究心力衰竭促进多病共存的分子机制 | 心力衰竭小鼠模型及其造血干细胞 | 基础医学研究 | 心血管疾病 | 骨髓移植、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10228 | 2025-10-07 |
Gene networks and systems biology in Alzheimer's disease: Insights from multi-omics approaches
2024-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13790
PMID:38534018
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综述 | 本文综述了多组学方法在阿尔茨海默病基因网络和系统生物学研究中的应用与发现 | 整合单细胞组学和空间组学技术,在单细胞分辨率和空间维度上研究阿尔茨海默病的基因调控网络 | NA | 全面理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病相关的基因网络和分子机制 | 系统生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,空间组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
10229 | 2025-10-07 |
Clonal differences underlie variable responses to sequential and prolonged treatment
2024-Mar-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.01.011
PMID:38401539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和条形码技术追踪耐药克隆在连续治疗过程中的变化,揭示了克隆间基因表达差异导致的不同治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序与克隆条形码技术,系统追踪耐药克隆在连续和长期治疗过程中的命运差异 | 未明确说明研究涉及的癌症类型和具体样本数量 | 探究癌症细胞克隆差异如何影响连续治疗反应,为靶向最侵袭性耐药克隆的优化治疗策略提供依据 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 克隆条形码 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10230 | 2025-10-07 |
Response to tumor-infiltrating lymphocyte adoptive therapy is associated with preexisting CD8+ T-myeloid cell networks in melanoma
2024-02-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg7995
PMID:38306416
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研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤患者接受肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法前后的样本,揭示了治疗反应与预先存在的CD8+T细胞-髓系细胞网络之间的关联 | 首次系统揭示了TIL-ACT治疗反应与基线肿瘤微环境中T细胞-髓系细胞网络的关系,并识别了潜在的生物标志物 | 样本量较小(仅13例患者),且为单中心研究 | 探索肿瘤浸润淋巴细胞过继疗法治疗反应的生物学机制和预测标志物 | 转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 空间蛋白质组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质空间分布数据 | 13例转移性黑色素瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
10231 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of IL-23 inhibition in cutaneous psoriasis distinguishes clinical response
2024-01-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adi2848
PMID:38277466
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析银屑病患者皮肤免疫细胞,揭示IL-23抑制治疗的临床反应机制 | 首次在单细胞水平建立银屑病IL-23抑制治疗的临床反应图谱,发现治疗抵抗性T17细胞活化和不可逆免疫异常状态 | 样本量有限,未明确不可逆免疫异常的分子机制 | 解析IL-23信号阻断治疗银屑病的临床反应机制 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 银屑病患者皮肤样本(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
10232 | 2025-10-07 |
Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response
2024-01-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930
PMID:38215193
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研究论文 | 本研究揭示了簇细胞和成纤维细胞通过激活ILC2介导的2型免疫反应促进胸腺再生的新机制 | 首次发现胸腺簇细胞和成纤维细胞通过产生警报素IL-25和IL-33激活ILC2,进而促进胸腺上皮细胞分化的再生机制 | 研究仅使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型,未验证其他应激模型 | 探究胸腺再生过程中非T细胞的造血细胞如何参与调控机制 | 小鼠胸腺组织中的造血细胞(不包括T细胞),特别是ILC2、簇细胞和成纤维细胞 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 地塞米松诱导胸腺萎缩的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10233 | 2025-10-07 |
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298133
PMID:38363768
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研究论文 | 本研究通过敲低clusterin(CLU)基因,探讨其对血管性血友病因子(VWF)在脐静脉内皮细胞中表达和分泌的影响 | 首次基于单细胞RNA测序分析发现CLU作为VWF的潜在调节因子,并通过两种基因敲低方法验证其在VWF调控中的作用 | 研究仅使用脐静脉内皮细胞系,未在更多细胞类型或体内模型中验证 | 探究clusterin在血管性血友病因子调控中的作用机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 细胞生物学 | 血管性血友病 | 单细胞RNA测序, siRNA, CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10234 | 2025-10-07 |
Ornithine decarboxylase supports ILC3 responses in infectious and autoimmune colitis through positive regulation of IL-22 transcription
2022-Nov-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214900119
PMID:36279426
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研究论文 | 本研究揭示了鸟氨酸脱羧酶通过调节IL-22转录支持ILC3细胞在感染性和自身免疫性结肠炎中的免疫应答 | 首次发现ILC3细胞具有独特的多胺生物合成代谢特征,并证明ODC1通过正调控IL-22转录影响肠道免疫防御和自身免疫性结肠炎 | 研究主要基于小鼠模型,人类ILC3细胞中多胺代谢的作用仍需验证 | 探究ILC3细胞的代谢特征及其在肠道免疫应答中的作用机制 | 第3组固有淋巴细胞(ILC3s)及其代谢途径 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 小鼠肠道ILC细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10235 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided engineering of mitochondrial therapies for intervertebral disc degeneration by regulating mtDNA/SPARC-STING signaling
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.036
PMID:40104024
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序指导工程化线粒体疗法治疗椎间盘退变 | 首次利用单细胞RNA测序指导开发针对椎间盘退变的线粒体移植疗法,并工程化具有抗氧化和抗炎活性的多生物活性生物疗法 | 研究主要基于动物模型验证,尚未进行人体临床试验 | 开发针对椎间盘退变的新型线粒体疗法 | 人类髓核组织、髓核细胞和大鼠椎间盘退变模型 | 单细胞测序 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类髓核组织和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10236 | 2025-10-07 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
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研究论文 | 本研究探讨SPRY1在皮肤衰老中的作用,特别是其对巨噬细胞M1极化的调控及其在黑色素瘤预后中的潜在价值 | 首次揭示SPRY1通过调控巨噬细胞M1极化促进皮肤衰老的机制,并发现其在黑色素瘤预后中的临床意义 | 缺乏体内实验验证,需要进一步研究其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤衰老中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 皮肤衰老和黑色素瘤 | 单细胞测序,WGCNA,qRT-PCR,CCK-8检测,ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 来自GTEx和GEO数据库的数据集,以及细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10237 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10238 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的区室化特征 | 首次发现嗅觉上皮细胞和呼吸上皮细胞对I型和III型干扰素的反应存在明显区室化差异 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的情况仍需验证 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 | 小鼠鼻上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10239 | 2025-10-07 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较抗体依赖性增强感染与传统感染方式下登革病毒感染人类巨噬细胞的免疫转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示ADE感染与传统感染在转录组层面的差异,发现ADE感染导致干扰素信号抑制和炎症趋化因子转录下调 | 研究仅针对DENV-2血清型,未涵盖所有登革病毒血清型;使用单核细胞来源的巨噬细胞可能不能完全代表体内情况 | 阐明抗体依赖性增强感染在登革病毒致病机制中的细胞内在调控机制 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10240 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体,开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究,仅使用选定基因面板(150种mRNA物种) | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题,定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体,包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |