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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10201 | 2025-10-07 |
Targeting glycolysis in esophageal squamous cell carcinoma: single-cell and multi-omics insights for risk stratification and personalized therapy
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1559546
PMID:40115255
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和多组学方法研究食管鳞状细胞癌中糖酵解代谢的作用机制,并开发风险分层模型 | 首次在ESCC中整合单细胞转录组学和多组学数据识别糖酵解活性细胞亚型,并建立基于七基因的糖酵解相关风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索糖酵解在食管鳞状细胞癌进展中的作用机制,开发风险分层和个性化治疗策略 | 食管鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析, Western blotting | 非负矩阵分解(NMF), Cox回归 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库的食管鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
10202 | 2025-10-07 |
Identification and validation of up-regulated TNFAIP6 in osteoarthritis with type 2 diabetes mellitus
2024-12-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82985-5
PMID:39733138
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研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定并验证了TNFAIP6作为2型糖尿病相关骨关节炎的关键上调基因 | 首次在转录水平系统研究T2DM与OA的关联,发现TNFAIP6作为前肥大软骨细胞标志物在T2DM相关OA中的新作用机制 | 研究样本来源为公共数据库,实验验证仅限于大鼠软骨细胞和人类关节软骨 | 探索2型糖尿病促进骨关节炎进展的分子机制 | 骨关节炎和2型糖尿病患者的基因表达数据、大鼠软骨细胞、人类关节软骨 | 生物信息学 | 骨关节炎, 2型糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
10203 | 2025-10-07 |
A prognostic molecular signature of hepatic steatosis is spatially heterogeneous and dynamic in human liver
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101871
PMID:39657669
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研究论文 | 本研究通过整合临床表型、循环蛋白质组学和组织转录组学,识别出肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 发现肝脏脂肪变性的分子特征具有空间异质性和动态性,并建立了与脂肪肝疾病相关的循环多蛋白特征 | NA | 识别肝脏脂肪变性的动态功能生物标志物 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 多模态成像,蛋白质组学分析,空间转录组学 | NA | 图像,蛋白质组数据,转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组分析 | NA | 人源化'芯片肝脏'模型 |
10204 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant nivolumab or nivolumab plus ipilimumab in early-stage triple-negative breast cancer: a phase 2 adaptive trial
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03249-3
PMID:39284953
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研究论文 | 评估早期三阴性乳腺癌患者使用纳武利尤单抗或纳武利尤单抗联合伊匹木单抗新辅助免疫治疗的疗效和安全性 | 首次探索在不联合化疗的情况下,单独使用免疫检查点抑制剂作为早期三阴性乳腺癌新辅助治疗的可行性 | 样本量较小,为II期适应性试验,需要更大规模研究验证 | 评估新辅助免疫治疗在早期三阴性乳腺癌中的疗效和安全性 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 临床医学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 45例患者(队列A:15例,队列B:15例,队列C:15例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10205 | 2025-10-07 |
Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages
2024-07-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981
PMID:39058763
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和高维流式细胞术揭示了胰腺导管腺癌中单细胞向肿瘤相关巨噬细胞的转化过程 | 首次在胰腺导管腺癌模型中系统描绘了单细胞向肿瘤相关巨噬细胞分化的动态过程,发现了一个短暂存在的中间TAM群体及其产生的两个终末分化TAM谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞的起源、分化过程及其在肿瘤发展中的演变 | 胰腺导管腺癌小鼠模型和人类PDAC患者样本中的单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 诱导性单核细胞命运图谱小鼠和人类PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10206 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics unravels palmitoylation and zonation-dependent gene regulation by AEG-1 in mouse liver
2024-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107322
PMID:38677511
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示AEG-1蛋白棕榈酰化修饰及肝脏分区对基因调控的影响 | 首次结合空间转录组学技术解析AEG-1棕榈酰化修饰在肝脏分区特异性基因调控中的作用机制 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明棕榈酰化如何影响AEG-1介导的基因调控与肝脏分区的关系 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S基因敲入小鼠的肝脏组织 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和肝细胞癌 | 空间转录组学 | 基因敲入小鼠模型 | 空间转录组数据 | AEG-1-WT和AEG-1-C75S同窝小鼠肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10207 | 2025-10-07 |
Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity
2024-03-29, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643
PMID:38330141
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研究论文 | 本研究鉴定了一种随年龄增长而扩增的CD4+ T细胞新亚群——年龄相关T辅助细胞(TA细胞),并揭示了其在自身免疫疾病中的作用机制 | 首次发现并命名了年龄相关的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群(TA细胞),揭示了其同时具有细胞毒性和B细胞辅助功能的双重特性,并证明ZEB2转录因子调控这些功能 | 样本量相对有限(354例),且主要基于流式细胞术和bulk RNA测序技术,可能需要单细胞水平的功能验证 | 探究衰老与自身免疫疾病之间的关联机制 | 354名自身免疫疾病患者和健康对照者的CD4 T细胞亚群 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 354例(自身免疫疾病患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
10208 | 2025-10-07 |
Increased Chemokine Production is a Hallmark of Rhesus Macaque Natural Killer Cells Mediating Robust Anti-HIV Envelope-Specific Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity
2024, Pathogens & immunity
DOI:10.20411/pai.v10i1.734
PMID:39911143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析恒河猴自然杀伤细胞在介导抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能异质性 | 首次在单细胞水平揭示CD107a+恒河猴NK细胞亚群具有更强的趋化因子产生能力 | 研究仅限于恒河猴模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究恒河猴自然杀伤细胞在抗HIV抗体依赖性细胞毒性反应中的功能特征 | 恒河猴自然杀伤细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10209 | 2025-10-07 |
APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids
2023-08-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03444-y
PMID:37605285
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研究论文 | 本研究通过人类iPSC来源的脑类器官探究APOE缺失对神经分化和胆固醇生物合成的影响 | 首次在人类iPSC来源的脑类器官模型中系统研究APOE缺失对脑稳态的影响,并发现其通过EIF2和Wnt/β-catenin信号通路调节细胞组成和脂质代谢 | 研究仅使用体外脑类器官模型,未在体内验证结果 | 探究APOE基因在脑稳态中的作用及其作为阿尔茨海默病最强遗传风险因子的机制 | 人类iPSC来源的脑类器官 | 干细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 亲代iPSC系及其同基因APOE缺陷系衍生的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10210 | 2025-10-07 |
Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells From Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway
2025-May, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24657
PMID:39916387
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研究论文 | 本研究利用小鸡兴奋性毒性视网膜损伤模型,探讨了伊布地特对视网膜神经元的保护作用及其机制 | 首次发现伊布地特通过抑制磷酸二酯酶激活mTOR通路,对视网膜双极细胞具有特异性保护作用 | 研究仅使用动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探究伊布地特在兴奋性毒性视网膜损伤中的神经保护作用机制 | 小鸡视网膜神经元,特别是双极细胞和Müller胶质细胞 | 神经科学 | 视网膜神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 光谱域光学相干断层扫描(SD-OCT), 视网膜电图 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 电生理数据 | 小鸡视网膜损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10211 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals ECM remodeling-tumor stiffness-FAK as a key driver of vestibular schwannoma progression
2025-Apr, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102730
PMID:39988022
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示细胞外基质重塑-肿瘤硬度-FAK信号通路是前庭神经鞘瘤进展的关键驱动因素 | 首次在单细胞水平揭示前庭神经鞘瘤进展与机械刺激反应和神经营养因子信号通路的关联,并明确ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号轴的作用机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内验证和临床前研究 | 探究肿瘤硬度-FAK信号通路在前庭神经鞘瘤进展中的作用机制 | 前庭神经鞘瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10212 | 2025-10-07 |
Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11075-6
PMID:40113718
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序技术筛选脓毒症治疗核心基因 | 首次将网络药理学与单细胞RNA测序相结合,在细胞水平定位金银花治疗脓毒症的潜在靶点基因 | 需要进一步的实验验证网络药理学预测结果 | 阐明金银花治疗脓毒症的分子机制并筛选核心治疗靶点 | 脓毒症患者血液样本和金银花活性成分 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序,单细胞RNA测序,网络药理学,meta分析 | NA | 基因表达数据 | 22例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
10213 | 2025-10-07 |
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11086-3
PMID:40113719
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研究论文 | 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 | 首次通过单细胞分析揭示凝血通路在胶质母细胞瘤内皮细胞中的显著激活,并构建了基于五个凝血相关基因的风险特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索凝血相关基因在胶质母细胞瘤中的作用机制及其临床意义 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, SNP分析, 拷贝数变异分析, 免疫组织化学, CCK8实验, 伤口愈合实验 | LASSO回归, 随机生存森林分析, 无监督聚类 | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA队列461例GBM患者,CGGA693队列,IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10214 | 2025-10-07 |
SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues
2025-Mar-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101235
PMID:40112778
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研究论文 | SPARROW是一种计算框架,通过联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入和软聚类,实现健康与疾病组织中微环境区域特异性细胞状态的发现 | 将细胞类型推断和细胞邻域识别整合为联合学习过程,在共享潜在空间中整合空间转录组和单细胞RNA测序数据 | 未在摘要中明确说明方法的具体限制 | 开发能够跨尺度、样本和条件全面表征组织特征的计算方法 | 人类和小鼠组织样本,特别是人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 潜在嵌入学习,软聚类 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
10215 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调,并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限,临床样本仅30例,且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本(包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据,空间转录组数据 | 总计982个样本(TCGA 644例,GTEx 308例,临床样本30例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
10216 | 2025-03-22 |
Spatial transcriptomics reveals differential inflammatory pathways in discoid lupus erythematosus and lichen planus
2025-Mar-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10217 | 2025-10-07 |
[Nafamostat Mesylate Alleviates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in a Rat Model Through HMGB1 Modulation: An Omics Analysis -Based Study of the Protective Effect and the Mechanisms Involved]
2025-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250160506
PMID:40109453
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研究论文 | 本研究通过组学分析探讨甲磺酸萘莫司他在大鼠肾脏缺血再灌注损伤模型中的保护作用及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和HMGB1调控机制研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用 | 样本量较小(每组7只大鼠),仅观察24小时时间点,机制研究仍需进一步验证 | 研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及分子机制 | 健康雄性Sprague-Dawley大鼠 | NA | 肾脏缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blotting, HE染色, TUNEL染色 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织病理学图像 | 21只SD大鼠(每组7只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序 |
10218 | 2025-10-07 |
Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling
2025-Jan-09, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04326-2
PMID:39789409
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研究论文 | 本研究通过荧光标记技术识别了新生小鼠脑室下区的星形胶质细胞前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号调控其迁移过程 | 首次发现tdTomato标记的胶质前体细胞亚群,并证明谷氨酸信号通过离子型谷氨酸受体和谷氨酸转运体调控其向皮层的迁移 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类相关性需进一步验证;体外器官型切片培养可能无法完全模拟体内环境 | 探究星形胶质细胞前体细胞的发育起源和迁移调控机制 | 新生小鼠脑室下区的胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光,器官型切片培养 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 新生小鼠(PND1-PND7)脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10219 | 2025-10-07 |
LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer
2025-Jan, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01025-z
PMID:39743630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的机制 | 首次发现LKB1失活通过引起全基因组DNA低甲基化驱动AR非依赖性谱系可塑性,并提出靶向DNA低甲基化的治疗策略 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,在人类患者中的临床验证仍需进一步研究 | 探索雄激素受体非依赖性谱系可塑性的分子机制并开发潜在治疗策略 | 人类和小鼠前列腺癌样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,全基因组亚硫酸氢盐测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
10220 | 2025-10-07 |
Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504390
PMID:40109658
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研究论文 | 通过机器学习方法识别和评估脂质运载蛋白-2在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法系统性地识别LCN2作为中性粒细胞诱导SAE的关键基因 | 研究主要基于动物模型,需要在人类患者中进行进一步验证 | 识别脓毒症相关脑病的关键基因并探索潜在靶向治疗 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 行为测试 | 四种二分类机器学习算法, AddModuleScore算法, CellCall算法 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 行为学数据 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |