单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10181 - 10200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10181 | 2025-10-07 |
Integrated temporal transcriptional and epigenetic single-cell analysis reveals the intrarenal immune characteristics in an early-stage model of IgA nephropathy during its acute injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1405748
PMID:39493754
|
研究论文 | 通过整合时间序列的单细胞转录组和表观基因组分析，揭示IgA肾病早期急性损伤阶段的肾内免疫特征 | 首次在IgA肾病模型中联合应用纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，识别了具有独特表观遗传特征的巨噬细胞亚群和早期效应T细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证；样本量相对有限（每组4-5只小鼠） | 阐明IgA肾病早期急性损伤阶段的免疫细胞动态变化和分子机制 | 小鼠肾脏CD45+免疫细胞和肾脏细胞 | 单细胞多组学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 每组4-5只小鼠，共分析72304个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 10182 | 2025-10-07 |
Single-Cell and Population Transcriptomics Reveal Pan-epithelial Remodeling in Type 2-High Asthma
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107872
PMID:32640237
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13诱导的全上皮细胞重塑机制 | 发现IL-13在所有上皮细胞类型中诱导黏液分泌程序，导致黏液和防御分泌细胞转化为具有新生黏蛋白产生和分泌能力的化生状态 | 研究主要基于体外细胞培养模型，需要在更多临床样本中验证 | 探究2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13对气道上皮细胞的影响机制 | 人气道上皮细胞培养物和儿童哮喘患者的鼻气道上皮 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10183 | 2025-10-07 |
Cancer‑associated fibroblasts: a pivotal regulator of tumor microenvironment in the context of radiotherapy
2025-Mar-20, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02138-7
PMID:40114180
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在放疗背景下对肿瘤微环境的调控作用 | 系统阐述了放疗对CAFs表型和功能的影响及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用机制 | 放疗对CAFs的影响以及受辐射CAFs对肿瘤进展和TME的作用尚未完全明确 | 探讨CAFs在放疗背景下的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10184 | 2025-10-07 |
Knowledge of the genetics of human pain gained over the last decade from next-generation sequencing
2025-Apr, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107667
PMID:39988004
|
综述 | 本文总结了近十年来利用二代测序技术在人类疼痛遗传学领域取得的研究进展 | 揭示了疼痛相关基因的新型突变谱、发现了关键的可变剪接事件、开发了基于NGS的疼痛预测模型，并构建了神经病理性疼痛体感系统图谱 | 面临复杂数据分析的挑战和罕见遗传变异生物学功能解读的困难 | 探索人类疼痛的遗传学基础并推动个性化疼痛管理 | 疼痛相关基因和遗传变异 | 基因组学 | 疼痛相关疾病 | 二代测序，单细胞转录组学 | 分类器 | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 二代测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10185 | 2025-10-07 |
Insights into the single-cell transcriptome characteristics of porcine endometrium with embryo loss
2025-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402212RR
PMID:40105155
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了猪胚胎丢失子宫内膜的分子特征和细胞异质性 | 首次构建了猪围植入期胚胎丢失与成功妊娠子宫内膜的单细胞转录组图谱，识别了22种细胞亚群并揭示了细胞通讯差异 | 样本数量有限，研究仅关注围植入期，未涵盖整个妊娠过程 | 探究胚胎丢失过程中子宫内膜微环境的分子机制 | 猪子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎丢失和成功妊娠的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10186 | 2025-10-07 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胰胆管合流异常中细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平揭示PBM的细胞组成差异，发现成纤维细胞通过WNT和TWEAK信号通路驱动纤维化的新机制 | 样本量较小（仅6例患者），需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胆管组织 | 数字病理学 | 胰胆管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例PBM，3例非PBM） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10187 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2025-Mar-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100796
PMID:40111904
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术，识别出再生原基中的13个不同细胞群，并发现体腔上皮具有多能性 | 研究仅限于海参这一特定物种，且对某些细胞群体的功能验证仍需进一步实验 | 探究海参肠道再生过程中细胞分子特征和再生机制 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，杂交链式反应荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10188 | 2025-10-07 |
Bioinformatic analysis of serpina1 expression in papillary thyroid carcinoma and its potential association with Hashimoto's thyroiditis
2025-Mar-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02079-0
PMID:40106166
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探讨SERPINA1在甲状腺乳头状癌中的表达及其与桥本甲状腺炎的潜在关联 | 首次在单细胞水平系统揭示SERPINA1在甲状腺乳头状癌不同细胞亚群中的表达特征及其与桥本甲状腺炎的相互作用机制 | 研究结果基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索SERPINA1基因在甲状腺乳头状癌中的作用及其与桥本甲状腺炎的关系 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 转录组分析, 单细胞转录组分析, 基因集变异分析 | Wilcoxon检验, CIBERSORT, CellChat | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的甲状腺乳头状癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10189 | 2025-10-07 |
CHI3L1: a key driver in gastritis-to-cancer transformation
2025-Mar-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06352-2
PMID:40108688
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了胃炎向胃癌转化过程中的关键驱动基因CHI3L1，并验证了其通过激活CD44-β-catenin通路促进恶性转化的机制 | 首次系统识别胃炎向胃癌转化过程中的12个驱动基因，并确定CHI3L1为核心驱动因子，阐明其通过CD44-β-catenin通路促进恶性转化的新机制 | 研究主要基于已有数据集和实验模型，需要进一步临床验证 | 阐明胃癌发生发展的分子机制并寻找早期诊断生物标志物 | 胃癌及其前驱病变胃炎 | 机器学习 | 胃癌 | 机器学习，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | 早期诊断模型 | 基因表达数据，组织微阵列，细胞和类器官模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10190 | 2025-10-07 |
Screening and analysis of programmed cell death related genes and targeted drugs in sepsis
2025-Mar-19, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00403-w
PMID:40108736
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别脓毒症中程序性细胞死亡相关基因并探索潜在治疗药物 | 首次整合WGCNA、LASSO、随机森林和孟德尔随机化方法系统分析脓毒症中PCD相关基因，并构建TF-miRNA-枢纽基因网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证 | 识别脓毒症诊断相关的程序性细胞死亡基因并探索潜在治疗药物 | 脓毒症患者的基因表达数据和血液细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，WGCNA，LASSO，随机森林，CIBERSORT，孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10191 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals CD8 + T cell heterogeneity and identifies a prognostic signature in cervical cancer
2025-Mar-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13901-x
PMID:40102789
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈癌中CD8+T细胞的异质性并构建预后风险模型 | 首次系统描绘宫颈癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹和调控网络，并建立基于CD8+T细胞特征的预后模型 | NA | 表征宫颈鳞癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹、调控网络和细胞间通讯，构建基于CD8+T细胞转录组特征的预后风险模型 | 宫颈癌肿瘤样本中的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 整合TCGA和GEO数据库的宫颈癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10192 | 2025-10-07 |
Increased melanin induces aberrant keratinocyte - melanocyte - basal - fibroblast cell communication and fibrogenesis by inducing iron overload and ferroptosis resistance in keloids
2025-Mar-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02116-z
PMID:40102920
|
研究论文 | 本研究探讨黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡能力促进瘢痕疙瘩中成纤维细胞纤维化的机制 | 首次揭示黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡促进瘢痕疙瘩纤维化的新机制，并发现MITF抑制剂ML329的治疗潜力 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人体中的治疗效果需要进一步验证 | 研究黑色素在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞纤维化中的作用机制，并评估干预黑色素的治疗潜力 | 瘢痕疙瘩患者的皮肤组织、黑色素细胞、角质形成细胞、成纤维细胞以及瘢痕疙瘩裸鼠模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序, Masson-Fontana染色, 批量测序, Perl's染色, 细胞活力检测, 脂质ROS检测, 丙二醛检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像, 细胞功能检测数据 | 瘢痕疙瘩患者组织和细胞, 瘢痕疙瘩裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10193 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the heterogeneity and intercellular communication of cancer-associated fibroblasts in gastric cancer
2025-Mar-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06376-8
PMID:40102930
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示胃癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯 | 首次在胃癌中整合单细胞测序与空间转录组数据，系统鉴定六种CAF亚群并揭示其与恶性上皮细胞的空间互作关系 | 样本量有限（24例），缺乏功能性实验验证 | 解析胃癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯网络 | 胃癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | Seurat, CellChat | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 24例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10194 | 2025-10-07 |
SAMD4A inhibits abdominal aortic aneurysm development and VSMC phenotypic transformation through targeting KDM2B
2025-Mar-11, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.018
PMID:40081568
|
研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白SAMD4A通过靶向KDM2B抑制腹主动脉瘤发展和血管平滑肌细胞表型转化的机制 | 首次发现SAMD4A在腹主动脉瘤中的保护作用及其通过调控KDM2B影响血管平滑肌细胞表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究SAMD4A是否抑制血管平滑肌细胞表型转化并抑制腹主动脉瘤形成 | 血管平滑肌细胞和腹主动脉瘤小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA免疫沉淀测序,染色质免疫沉淀-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据,RNA-seq数据,ChIP-qPCR数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10195 | 2025-10-07 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4397799/v1
PMID:40092444
|
研究论文 | 本研究验证了血流紊乱与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫细胞的机制 | 首次通过遗传谱系示踪模型证实了血流紊乱诱导内皮细胞重编程（FIRE）假说，发现了内皮细胞向免疫样细胞（EndIT）和泡沫细胞（EndFT）的新型转分化过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过重新分析公开数据集获得验证 | 探究血流紊乱和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10196 | 2025-10-07 |
Single-Cell Landscape of Bronchoalveolar Lavage Fluid Identifies Specific Neutrophils during Septic Immunosuppression
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406218
PMID:39887584
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者支气管肺泡灌洗液，揭示了中性粒细胞驱动的肺部免疫抑制程序 | 首次在脓毒症免疫抑制期发现CXCR2和CD274IL1RN中性粒细胞亚群的显著增加及其发育轨迹 | 研究样本量有限，主要关注肺部免疫细胞，未涉及其他器官的免疫抑制机制 | 探索脓毒症免疫抑制期间肺部免疫细胞的分子特征和机制 | 脓毒症患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10197 | 2025-10-07 |
Lepidopteran scale cells derive from sensory organ precursors through a canonical lineage
2025-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204501
PMID:40052482
|
研究论文 | 本研究通过发育生物学和转录组学证据证明鳞翅目昆虫的鳞片细胞来源于感觉器官前体细胞 | 首次通过活体成像和单细胞转录组测序证明鳞翅目鳞片与果蝇机械感刚毛的同源发育路径，并发现新的转录因子pdm3参与鳞片分化 | 研究主要聚焦早期蛹期翅膀发育，未涵盖所有鳞片类型和发育阶段 | 探究鳞翅目昆虫鳞片细胞的发育起源和分子机制 | 鳞翅目昆虫（蝴蝶和蛾类）的翅膀鳞片细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞核RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 早期蛹期翅膀组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10198 | 2025-10-07 |
Aberrant Hematopoiesis and CD8+ T-Cell Activation in Thymoma-Associated Pure Red Cell Aplasia
2025-Mar, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.70046
PMID:40109027
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫机制 | 首次在单细胞水平揭示胸腺瘤-PRCA患者骨髓中CD8+T细胞异常激活导致红细胞生成障碍的机制 | 样本量较小且为观察性研究，需进一步验证因果关系 | 阐明胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫发病机制 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者的骨髓细胞及外周血CD8+T细胞 | 单细胞组学 | 纯红细胞再生障碍 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据, 流式细胞数据, 细胞因子数据 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10199 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals disease-specific CD8+ T cell clonal expansion and a high frequency of transcriptionally distinct double-negative T cells in diabetic NOD mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317987
PMID:40106422
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示糖尿病NOD小鼠中疾病特异性CD8+ T细胞克隆扩增和转录独特双阴性T细胞的高频出现 | 首次在单细胞分辨率下同时分析T细胞转录组和T细胞受体库，发现疾病依赖性CD8+ T细胞发育和独特双阴性T细胞群体 | 研究结果需要未来进一步验证，未在人类样本中确认发现 | 识别与1型糖尿病进展相关的T细胞克隆扩增和转录组特征 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的外周血和胰岛T细胞 | 单细胞基因组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | NOD小鼠纵向收集的外周血和胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10200 | 2025-10-07 |
A single-cell RNA sequencing atlas of the healthy canine lung: a foundation for comparative studies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1501603
PMID:40114924
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建健康犬肺组织的细胞图谱，为比较研究提供基础 | 首次系统描绘健康犬肺组织的单细胞转录组图谱，发现46个转录特征不同的细胞亚群，包括罕见细胞类型 | 仅使用4只犬的样本，样本量有限 | 建立健康犬肺组织的单细胞转录组参考图谱，为肺部疾病研究提供分子基础 | 健康犬肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只犬的26,278个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序 |