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当前共找到 38530 篇文献,本页显示第 1001 - 1020 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1001 2026-04-07
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2025-01-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了胰岛素信号通路通过调控R2反转录转座子表达,在果蝇生殖系中协调跨代核糖体DNA拷贝数维持的机制 首次发现胰岛素受体作为R2表达的主要抑制因子,并揭示了饮食调控通过胰岛素通路影响rDNA拷贝数扩张的跨代遗传机制 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性仍需验证 探究生殖系中核糖体DNA拷贝数维持的调控机制 果蝇雄性生殖干细胞及其核糖体DNA 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1002 2026-04-07
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文开发了一种从保存在Allprotect® Tissue Reagent中的人类骨骼肌组织中获取高质量细胞和细胞核的优化方法,用于单细胞RNA测序和单核RNA测序 开发了一种从存档组织(特别是保存在核酸稳定保存剂中的骨骼肌)中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了新鲜起始材料需求的障碍 流式细胞分选虽然能富集更高质量的细胞和细胞核,但会导致总体输入材料减少 优化单细胞RNA测序和单核RNA测序方法,以从存档组织中获取高质量基因组材料 人类骨骼肌组织 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
1003 2026-04-07
Application of Spatial Transcriptomics in Digestive System Tumors
2024-12-27, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文综述了空间转录组学技术在消化系统肿瘤研究中的应用,包括其在探索肿瘤空间结构、异质性、肿瘤微环境及细胞间相互作用方面的作用,以及在诊断、预后和治疗中的潜力 强调了空间转录组学与单细胞RNA测序、人工智能和机器学习相结合在消化系统肿瘤研究中的重要性 NA 总结空间转录组学在消化系统肿瘤研究中的最新进展、应用前景和技术挑战 消化系统肿瘤 数字病理学 消化系统肿瘤 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
1004 2026-04-07
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,分析了免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏、肿瘤和血液中的免疫反应 首次在irMyocarditis患者中同时分析心脏、肿瘤和血液的免疫反应,揭示了心脏扩增的T细胞克隆与肿瘤组织中的T细胞克隆重叠度低,并发现血液中循环CD8 T细胞存在心脏扩增TCR与致命病例相关 样本量相对有限(28例患者),且未明确心脏自身抗原的具体靶点 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者的心脏组织、肿瘤组织和血液样本 单细胞组学 心肌炎 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,显微镜技术,蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据,显微图像,蛋白质数据 28名irMyocarditis患者和41名未受影响个体的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1005 2026-04-07
Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution
2024-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究利用碱基编辑器启用的DNA条形码系统,在小鼠肠道肿瘤发生模型中绘制单细胞谱系图,揭示了结直肠癌前病变的多克隆起源和向单克隆的转变过程 首次在体内模型中系统性地描绘了结直肠癌前病变的单细胞进化谱系,并提出了多克隆向单克隆转变的模型 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究结直肠癌前病变的起源和进化机制 小鼠肠道组织(正常、炎症和肿瘤)以及人类散发性结直肠息肉 癌症生物学 结直肠癌 碱基编辑器启用的DNA条形码系统、单细胞RNA测序、bulk全外显子组测序、单腺体全基因组测序 NA 单细胞谱系数据、基因组数据、转录组数据 260,922个单细胞来自小鼠正常、炎症和肿瘤肠道组织 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
1006 2026-04-07
Preparation of Frozen Non-Human Primate Fetal Islets for Combined Single Nuclei RNA-Sequencing and ATAC-Sequencing, and Bulk Metabolomics
2024-11-08, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本研究提出了一种方法,用于从冷冻非人灵长类胎儿胰岛组织中同时进行单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学分析 开发了一种整合单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学的多组学方法,适用于稀缺样本,并避免了批次效应 方法依赖于冷冻组织,可能不适用于新鲜样本,且具体应用限于非人灵长类胎儿胰岛 研究代谢在通过表观遗传修饰建立细胞身份中的作用,并开发多组学技术以分析稀缺样本 非人灵长类胎儿胰岛组织 单细胞多组学 NA 单核RNA测序, ATAC测序, 毛细管电泳-质谱 NA RNA序列数据, ATAC序列数据, 代谢物数据 跨越两年收集的冷冻非人灵长类胎儿胰岛样本 NA 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 批量代谢组学 NA NA
1007 2026-04-07
Gene regulatory mechanisms of T cell exhaustion in diffuse large B cell lymphoma based on single-cell transcriptome data
2024-11, Leukemia research IF:2.1Q3
研究论文 本研究利用公共单细胞转录组数据,全面分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中T细胞耗竭的基因调控机制 首次在DLBCL中基于单细胞转录组数据系统识别了耗竭T细胞的亚型、基因表达特征及关键基因ID3的上调,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络以揭示核心调控蛋白 研究依赖于公共数据,未进行独立实验验证;样本量有限,可能影响结果的普适性;未深入探讨ID3基因的具体功能机制 探究DLBCL中T细胞耗竭的分子机制,以寻找新的治疗靶点 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者及正常扁桃体组织中的T细胞 数字病理学 淋巴瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA-seq数据 未明确具体样本数量,但使用了公共单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1008 2026-04-07
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-06, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病(AML)与T细胞的相互作用,揭示了AML对T细胞杀伤敏感或抵抗的转录程序,并发现ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 利用单细胞RNA-seq技术首次在AML与T细胞相互作用前后进行转录组分析,识别出与患者生存相关的抵抗程序,并验证ICAM1作为免疫突触关键成分在T细胞杀伤中的触发作用 AML异质性意味着多种因素可能影响其对T细胞杀伤的敏感性,研究可能未涵盖所有决定因素 探究AML对T细胞杀伤的敏感性和抵抗机制,以及ICAM1在T细胞介导的AML杀伤中的作用 原发性AML患者样本、人工程细胞毒性CD4 T细胞、原代离体分离的CD8 T细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及原发性AML患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1009 2026-04-07
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-06, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过对14例髓外多发性骨髓瘤肿瘤样本进行全面的二代测序分析,揭示了其关键分子特征和肿瘤微环境 这是迄今为止最全面的EMM肿瘤二代测序分析,首次报告了EMM的肿瘤微环境特征,并首次开展了EMM的纵向研究以追踪从诊断到复发的分子变化 样本量较小(N=14),可能限制结果的普遍性 探究髓外多发性骨髓瘤的分子特征、肿瘤微环境及其与疾病发展和免疫治疗反应的关系 髓外多发性骨髓瘤肿瘤样本 NA 多发性骨髓瘤 二代测序,单细胞测序 NA 基因组测序数据,单细胞测序数据 14例EMM肿瘤样本,并利用大型CoMMpass数据集进行验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1010 2026-04-07
STAT3 protects hematopoietic stem cells by preventing activation of a deleterious autocrine type-I interferon response
2024-05, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过混合骨髓嵌合小鼠模型,揭示了STAT3通过抑制有害的自分泌I型干扰素反应来保护造血干细胞功能 开发了可避免系统性炎症的混合骨髓嵌合小鼠模型,首次证明STAT3通过抑制自分泌I型干扰素反应维持造血干细胞功能 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类造血干细胞中验证;嵌合模型可能无法完全模拟生理状态 探究STAT3在造血干细胞中的内在调控机制及其对干细胞功能的影响 造血干细胞和祖细胞(HSPCs),特别是Lin⁻c-kit⁺Sca-1⁺骨髓细胞 血液学与干细胞生物学 血液系统疾病 单细胞RNA测序,骨髓移植实验,免疫荧光染色 混合骨髓嵌合小鼠模型 单细胞转录组数据,表型数据 未明确具体样本数量,使用嵌合小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1011 2026-04-07
A novel subpopulation of monocytes with a strong interferon signature indicated by SIGLEC-1 is present in patients with in recent-onset type 1 diabetes
2024-04, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在成人隐匿性自身免疫性糖尿病和1型糖尿病患者中发现了一群具有强干扰素特征、以SIGLEC-1为标志的新型单核细胞亚群,并探讨了其在疾病发生中的作用 首次在1型糖尿病相关患者中鉴定出一个以SIGLEC-1为标志、具有强干扰素特征的新型经典单核细胞亚群,并证实其与疾病活动度相关且能加速NOD小鼠糖尿病发病 样本量相对较小(特别是scRNA-seq部分),研究队列主要基于LADA和儿科1型糖尿病患者,结果在更广泛的1型糖尿病群体中的普适性有待进一步验证 探索1型糖尿病起始阶段的致病性免疫反应,寻找新的免疫学靶点用于1型糖尿病的预防和治疗 成人隐匿性自身免疫性糖尿病患者、成人发病的2型糖尿病患者、健康成人、儿科1型糖尿病患者、健康儿童以及非肥胖糖尿病小鼠的外周血和胰腺组织 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞过继转移实验, 清除实验 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 人类:scRNA-seq(4例LADA患者+4例健康对照);流式验证队列(54例LADA+17例T2D+26例健康成人;15例儿科T1D+15例健康儿童)。小鼠:NOD小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1012 2026-04-07
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过创建小鼠-大鼠嵌合体,探索了其骨髓中富含的肺细胞谱系前体细胞在辐射诱导肺损伤修复中的作用 利用跨物种嵌合体技术生成富含呼吸系统前体细胞的骨髓移植,首次证明这些细胞能贡献于肺内皮细胞和基质细胞 研究仅在小鼠模型中进行,尚未验证在人类或临床环境中的适用性 开发一种能促进辐射诱导肺损伤后肺修复的新型骨髓移植方法 小鼠-大鼠嵌合体的骨髓细胞及其在辐射诱导肺损伤小鼠模型中的移植效果 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、免疫染色和流式细胞术数据 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠-大鼠嵌合体及移植实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1013 2026-04-07
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病(AML)与T细胞间的相互作用,揭示了ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用及其与患者预后的关联 首次在单细胞水平上系统解析AML与T细胞相互作用的转录组特征,并发现ICAM1作为免疫突触关键成分在AML免疫杀伤中的决定性作用 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本量相对有限;未涵盖所有AML亚型 探究AML对T细胞杀伤抵抗的机制,并寻找影响患者预后的关键分子 原发性AML患者样本和人类工程化CD4+ T细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用原发性AML患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1014 2026-04-07
Molecular and spatial profiling of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-03-03, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和多重荧光原位杂交技术,揭示了小鼠丘脑室旁核的分子多样性和空间组织特征 首次识别了五种分子上不同的PVT神经元亚型,并发现了以前未知的分子梯度组织模式,提供了对PVT与皮层连接的新见解 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;单核RNA测序可能无法完全捕获所有细胞类型的转录组信息 阐明丘脑室旁核的分子身份和空间分布,以理解其功能多样性 小鼠丘脑室旁核的神经元 神经科学 NA 单核RNA测序,多重荧光原位杂交 NA RNA序列数据,图像数据 未明确指定样本数量,但基于小鼠脑组织 NA 单核RNA测序 NA NA
1015 2026-04-07
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了脑干发育过程中神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号在星形胶质细胞成熟和突触精细化中的关键作用 首次在单细胞水平上解析了脑干MNTB区域各主要细胞类型的转录谱,并发现了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号网络对星形胶质细胞成熟、神经元周围网络结构和突触精细化的调控机制 研究主要聚焦于脑干MNTB区域,结果可能不适用于其他脑区;单细胞RNA测序技术虽然能揭示细胞异质性,但可能无法完全捕捉低丰度基因表达或瞬态信号事件 探究脑干发育过程中细胞间信号传导对神经组织成熟和突触精细化的调控机制 小鼠脑干内侧斜方体核(MNTB)的主要细胞类型,包括神经元、星形胶质细胞和血管相关细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1016 2026-04-07
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,表征了重症哮喘患者外周血单个核细胞在Poly I:C刺激下的免疫反应模型 首次结合两种互补的单细胞技术(DropSeq scRNA-Seq和CyTOF)来表征重症哮喘患者PBMCs对TLR3激动剂Poly I:C的反应,揭示了基线状态下的促炎特征和刺激后强烈的干扰素通路诱导 样本量相对较小(5名SA患者和3名健康对照),且为体外模型,可能无法完全反映体内复杂的免疫微环境 表征重症哮喘患者外周血单个核细胞对TLR3激动剂Poly I:C刺激的免疫反应,以评估哮喘相关的干扰素反应缺陷 重症哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 8名个体(5名重症哮喘患者,3名健康对照)的PBMCs;scRNA-Seq分析9414个细胞,CyTOF分析160,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq DropSeq NA
1017 2026-04-07
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了BatchBench,一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具,通过整合多个数据集进行性能分析 仅评估了八种方法,可能未涵盖所有现有技术,且依赖于特定数据集 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 多个已研究的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1018 2026-04-07
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统,用于单细胞转录组分析,并展示了其在细胞周期研究中的应用 开发了一种新型微流控系统,具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率,且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置,支持不同缓冲液和条形码珠设置 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证,以及与其他现有平台的直接比较数据 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统,以促进细胞分辨率下的转录组学研究 异步人类和小鼠细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA mRNA序列数据 约50,000个单细胞或细胞核 NA 单细胞RNA-seq Nadia Instrument 基于液滴的微流控系统,支持3' mRNA捕获,可与Nadia Innovate模块结合使用
1019 2026-04-07
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质,并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序样本量相对较小 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响,并鉴定关键致病细胞亚群 CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 免疫学 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 基因工程小鼠模型(具体数量未明确)、人类脑脊液样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1020 2026-04-07
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术,分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组,揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型,包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型,并发现了新的转录因子表达模式 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本;功能验证实验有限 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 小鼠肾脏厚壁升支(CTAL)和远端曲小管(DCT)区域的细胞 单细胞转录组学 肾脏疾病 单细胞RNA-seq,FACS(荧光激活细胞分选) 无监督聚类分析 转录组数据 9099个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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