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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-05-10 |
Intervention of Tanshinone IIA on the PGK1-PDHK1 Pathway to Reprogram Macrophage Phenotype After Myocardial Infarction
2024-12, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07520-6
PMID:37991600
|
研究论文 | 探讨丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1通路调控心肌梗死后巨噬细胞能量代谢及表型转化的作用机制 | 首次揭示丹参酮IIA通过PGK1-PDHK1信号通路调控巨噬细胞能量代谢模式，进而影响其表型极化，为心肌梗死治疗提供新靶点 | 未明确丹参酮IIA对PGK1的直接结合方式及临床转化效果 | 研究丹参酮IIA是否通过调控巨噬细胞能量代谢影响其表型变化，并探索其在心肌梗死治疗中的潜力 | 心肌梗死模型小鼠及巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、RNA-seq、RT-PCR、ELISA、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像 | 未明确样本数量，涉及小鼠心肌梗死模型及巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2026-05-10 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 利用多组学整合分析揭示肺组织中Asorin在肺动脉高压中的保护作用 | 首次通过最大规模的PAH肺组织生物库多中心数据整合，结合转录组、基因组、单细胞和药理学分析，发现ASPN基因在PAH中的保护性角色并验证其治疗潜力 | 未明确提及限制，但可能涉及样本量虽大但仍有限，后续需进一步动物和人体验证 | 通过多组学整合阐明肺动脉高压（PAH）的病理机制，并识别潜在保护性靶点 | 人类PAH肺组织样本（96例患者和52例对照）及Sugen-缺氧大鼠模型 | 机器学习 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 贝叶斯调控网络, 药物转录组学 | 贝叶斯调控网络 | 基因表达数据, 基因组数据, 单细胞数据, 临床表型数据 | 96例PAH肺组织样本和52例对照肺组织样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1003 | 2026-05-10 |
Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis
2024-Sep-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97662
PMID:39324575
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研究论文 | 发现肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）通过GDNF-BDNF轴感知并修复周围神经损伤 | 首次揭示FAPs在周围神经再生中的先前未被认识的作用，以及其通过GDNF-BDNF轴响应损伤的分子机制 | 未提及明显局限性 | 研究FAPs如何感知解剖上遥远的周围神经损伤及其对神经再生的直接贡献 | 肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）和周围神经损伤 | NA | 周围神经损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（包括年轻和年老小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1004 | 2026-05-10 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 研究组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其通过调控巨噬细胞极化抑制牙槽骨丢失的机制 | 首次探讨JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调控作用及其对牙槽骨丢失的保护机制 | 研究结果主要基于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体体内直接验证；且样本量较小 | 探究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调控牙周炎的潜在机制 | 人牙龈组织样本（健康与炎症各9例）、小鼠牙周炎模型、巨噬细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组化、Western blotting、免疫荧光染色、siRNA转染 | NA | 基因表达数据、组织样本数据 | 9例健康牙龈组织、9例炎症牙龈组织；小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1005 | 2026-05-10 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Aug-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析人牙槽骨炎症微环境中肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱以阐明其自然转归的潜在结局 | 首次通过单细胞RNA测序构建了人牙槽骨不同类型肉芽组织的单细胞图谱，揭示了炎症肉芽组织在自然消退后与修复性肉芽组织在细胞组成和基因表达上的相似性，并鉴定了与炎症调控和血管生成相关的关键基因（如Igbp5、Zfp36、Timp3等） | 未提供明确的局限性描述 | 探究人牙槽窝肉芽组织的细胞组成和异质性，构建单细胞转录组图谱，以揭示炎症微环境中肉芽组织自然转归的潜在结局 | 人牙槽窝肉芽组织样本（来自牙周炎拔牙后行延迟位点保存或自体牙移植的12名患者） | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、HE染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个牙槽窝肉芽组织样本，共捕获20,448个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1006 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
|
research paper | 利用单细胞和空间转录组学技术，构建了健康与干燥综合征（SjD）患者唾液腺的细胞图谱，发现GZMK+CD8+ T细胞靶向特定的浆液黏液腺泡细胞亚群，揭示了SjD的病理机制 | 首次鉴定出新的浆液黏液腺泡细胞类型，并发现GZMK+CD8+ T细胞在SjD中特异性靶向该细胞群体，展示了免疫反应对高分泌腺泡细胞的影响 | NA | 阐明Sjögren病中免疫反应对唾液腺细胞类型的影响及具体细胞亚群的病理学作用 | 人类小唾液腺组织中的细胞类型，包括腺泡细胞和免疫细胞 | machine learning, digital pathology | Sjögren病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 人类小唾液腺组织样本（健康与SjD患者） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1007 | 2026-05-10 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-04, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文提出一个多物种、多组学的元分析框架，以促进心血管再生靶点的发现 | 提出基于单细胞RNA测序技术的多物种、多组学元分析框架，整合跨物种、跨发育阶段的心脏健康与损伤研究数据，驱动心血管再生新靶点的发现 | NA | 提出策略性框架以识别促进心血管再生的新靶点 | 健康与受伤心脏的多物种研究，涵盖不同发育阶段 | 机器学习和生物信息学 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序 | 元分析框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2024-08-08 |
Using advanced spatial and single-cell transcriptomics to characterize the human endometrium
2021-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00982-0
PMID:34857955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1009 | 2026-05-09 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Jul, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和实验验证，发现免疫基因MMP9是TCDD暴露相关动脉粥样硬化的关键介质 | 首次通过系统生物信息学分析与实验结合，揭示MMP9作为TCDD暴露诱导动脉粥样硬化的核心免疫基因及其调控通路 | 主要依赖公开数据库和计算机模拟，体外模型仅涉及HUVEC细胞，缺乏体内动物模型验证 | 探索TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制，为环境相关动脉粥样硬化的风险评估、早期诊断和靶向干预提供新见解和候选靶点 | TCDD暴露相关动脉粥样硬化 | 网络毒理学 | 心血管疾病 | 网络毒理学, RT-qPCR, Western blot, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习, SHAP, WGCNA, 伪时间分析 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1010 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Jun, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞的激活蛋白-1协同激活 | 首次通过空间转录组学分析揭示慢性肺移植功能障碍（CLAD）中上皮和内皮细胞AP-1靶基因（如JUNB和FOS）的协同上调，以及抗纤维化基因的下调，提供了CLAD发病机制的新见解 | 未提及明确限制，但可能包括样本量有限或缺乏功能验证实验 | 阐明慢性肺移植功能障碍中特定基因表达谱及其在发病机制中的作用 | 人类肺组织，包括CLAD患者、非CLAD移植受体和未移植对照组 | 数字病理学 | 慢性肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本，包括CLAD患者、非CLAD移植受体和未移植对照组 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1011 | 2026-05-09 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
|
研究论文 | 利用空间和单细胞转录组学等技术揭示母体阿片类药物使用障碍和丙型肝炎感染对胎盘免疫景观和结构的影响 | 首次综合运用流式细胞术、组织学、空间和单细胞转录组学，系统研究母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和功能的影响，并根据丙型肝炎感染状态进一步分层分析 | 未明确提及局限性 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘组织的影响及其潜在机制 | 胎盘组织 | 机器学习 | NA | 流式细胞术, 组织学, 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1012 | 2026-05-09 |
Focal adhesion proteins confer smooth muscle anoikis resistance and protection against aortic aneurysm and dissection
2026-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195291
PMID:41874580
|
研究论文 | 本研究探究黏着斑蛋白在平滑肌细胞失巢凋亡抵抗及防止主动脉瘤和夹层中的作用 | 发现黏着斑蛋白（如FAK、VCL、ILK）通过非激酶活性依赖的方式保护平滑肌细胞免受失巢凋亡，从而抑制胸主动脉瘤和夹层进展 | 主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步验证人类患者中的机制 | 明确平滑肌细胞黏着斑蛋白在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的功能 | 人类胸主动脉瘤样本、平滑肌细胞特异性Ptk2、Vcl和Ilk基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，小鼠模型，免疫印迹，细胞凋亡检测 | NA | 基因表达数据，组织病理图像 | 人类胸主动脉瘤样本及基因敲除小鼠队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析人类TAA主动脉样本 |
| 1013 | 2026-05-09 |
Distinct single-cell cellular states and ecosystems linked to HPV status distinguish therapeutic vulnerability of head and neck squamous cell carcinoma
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10213-z
PMID:42098219
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research paper | 使用EcoTyper框架分析HPV感染对头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中细胞状态和生态系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示HPV相关HNSCC中46种独特细胞状态和生态型，并关联预后与药物敏感性 | 尚未验证细胞状态在更大样本队列中的临床可重复性及机制细节 | 阐明HPV感染如何塑造HNSCC肿瘤微环境的细胞异质性和生态系统 | HPV阳性和阴性头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达 |
| 1014 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics defines IM-crypt as a premalignant niche with bidirectional divergence in early gastric carcinogenesis
2026-May-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10179-y
PMID:42098407
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研究论文 | 利用空间转录组学定义IM隐窝为早期胃癌发生过程中具有双向分化的癌前微环境 | 首次通过空间转录组学在人类胃组织疾病进展过程中识别出OLFM4阳性过渡亚群，揭示了肠化生隐窝作为癌前微环境且具有向不同肠分化程序的双向转录轨迹，并发现USF2相关调控网络在隐窝和癌症区域的共享活性 | 未明确说明局限性 | 阐明早期胃癌发生过程中恶性转化和亚型分化的空间起源 | 人类胃组织样本，涵盖从胃炎、肠化生到早期胃癌的疾病进展阶段 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 涵盖疾病进展的不同阶段的人类胃组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 1015 | 2026-05-09 |
10 × Genomics Flex Gene Expression is a powerful tool for single-cell transcriptomics of xenografts models
2026-May-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04092-0
PMID:42098734
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研究论文 | 该研究展示了10× Genomics Flex基因表达方案能有效分析异种移植模型中的单细胞转录组，通过组合人源和鼠源探针实现物种特异的细胞图谱 | 首次证明在单次反应中同时使用人鼠两种探针集可对混合细胞异种移植样本进行单细胞转录组分析，无需流式分选即可获得干净的物种特异性数据 | NA | 验证10× Genomics Flex基因表达方案在异种移植模型单细胞转录组研究中的适用性 | 异种移植样本中的人源和鼠源混合细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Flex | 10× Genomics Flex基因表达方案，基于探针的固定或冷冻样本处理方法 |
| 1016 | 2026-05-09 |
Cross-Species Plant Single-Cell Analysis: Community Challenges and Shared Solutions
2026-May-08, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag218
PMID:42099283
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综述 | 报告了2025年植物单细胞分析暑期研讨会的成果，包括社区面临的挑战和解决方案，并建立了PlantSCHub社区门户以支持可重复的植物单细胞分析 | 通过研讨会形式系统梳理植物单细胞分析的五大优先挑战领域，并提出跨物种整合、多模态轨迹与基因调控网络推断、空间锚定可视化以及AI科学家代理等概念路线图 | 未具体说明局限性 | 推动植物单细胞分析领域从孤立研究转变为互操作、不断发展的生态系统，加速发现和作物改良 | 植物单细胞分析社区的需求和解决方案 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 深度生成模型, AI基础模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1017 | 2026-05-09 |
EssentCell: Discovering Essential Evolutionary Relations in Noisy Single-Cell Data
2026-May-07, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3691222
PMID:42096398
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研究论文 | 提出EssentCell算法，通过整数线性规划识别噪声单细胞数据中所有最优进化关系中的本质关系 | 首次关注单细胞测序数据中多个最优完美系统发育树间的本质关系，而非仅重建单一树 | 未明确讨论算法在大规模数据集上的计算效率及对噪声水平的鲁棒性 | 在考虑假阳性率约束下，从噪声单细胞数据矩阵中寻找最小翻转问题的最优解中的本质进化关系 | 肿瘤细胞单细胞测序数据中的突变矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | 整数线性规划 | 二元突变矩阵 | 多个数据集（具体样本量未说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1018 | 2026-05-09 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-May-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
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研究论文 | 开发了名为TranscriptFormer的生成式基础模型，基于多达1.12亿个细胞、跨越12个物种（涵盖15.3亿年进化历程）进行训练，实现了跨物种细胞类型分类、零样本疾病状态识别以及系统发育关系的自然涌现 | 首次训练跨越15.3亿年进化历程的跨物种单细胞基础模型，零样本识别人类疾病状态，且在不依赖显式训练的情况下从表示中自然涌现发育轨迹与系统发育关系 | 未提及具体限制 | 建立跨物种单细胞转录组定量分析与比较细胞生物学的通用框架 | 12个物种的细胞（跨越15.3亿年进化历程） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型（Transformer架构的变体） | 基因表达数据 | 1.12亿个细胞，12个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2026-05-09 |
SCOTCH: isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2026-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72665-5
PMID:42098110
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研究论文 | 提出了SCOTCH，一个端到端、平台无关的分析流程，用于从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征 | 通过非重叠子外显子组合建模、动态阈值分配、整合读段覆盖与现有注释优化子外显子边界以及迭代聚类重构新转录本，比现有拼接图方法更可靠地恢复真实新异构体，并具有poly(A)感知过滤减少假阳性 | NA | 开发一种从长读长单细胞RNA测序数据中进行异构体表征的平台无关流程 | 人类血液和脑类器官数据集中的细胞类型特异性转录组谱和新异构体 | 计算生物学 | NA | 长读长单细胞RNA测序（lr-scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 多平台人类血液和脑类器官数据集 | 牛津纳米孔科技（ONT）, 太平洋生物科学（PacBio）, 10x Genomics, Parse Biosciences, BGI | 单细胞RNA测序 | 纳米孔测序仪（MinION, PromethION）, PacBio测序仪（Sequel, Revio）, 10x Chromium, Parse Biosciences分区生物试剂盒 | NA |
| 1020 | 2026-05-09 |
Refinement of renal T lymphocytes enrichment strategies: advancing the in-depth study of renal immune responses
2026-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51954-5
PMID:42098282
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研究论文 | 优化从小鼠和人类肾脏中分离和纯化T淋巴细胞的方案，以提高细胞产量和存活率，并应用于肾脏疾病研究 | 首次系统评估不同组织破碎、酶消化和Percoll梯度离心条件，优化出机械剪切结合0.2% IV型胶原酶和0.02% DNase I消化45分钟，再经33-80% Percoll梯度离心的高效方案 | 该方案主要基于小鼠和人类肾脏组织，对不同物种或病理条件下的适用性需进一步验证；单细胞测序分析仅使用公共数据库数据，未进行独立验证 | 建立优化的肾脏T淋巴细胞分离纯化方案，支持肾脏免疫反应的深入研究 | 小鼠和人类肾脏组织中的T淋巴细胞，包括CD4 T细胞、CD8 T细胞和双阴性T细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 小鼠肾脏组织（缺血再灌注损伤、肾纤维化、顺铂诱导急性肾损伤模型）及正常人类肾脏组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA-seq数据作为补充参考 |