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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-05-23 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
|
综述 | 本文综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA,并探讨了环境因素、诊断工具和治疗策略 | 整合了表观遗传学与遗传风险、环境触发因素及精准治疗策略的联系,并强调了单细胞表观基因组学和空间转录组学等新型诊断工具的应用潜力 | 临床前模型的预测价值有限,且表观遗传谱存在个体差异,限制了研究结果的转化 | 阐明表观遗传调控在银屑病病理生理中的核心作用,并探索其作为精准医学框架的桥梁价值 | 银屑病相关的表观遗传机制(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA)及环境因素(紫外线、空气污染) | 自然语言处理 | 银屑病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1002 | 2026-05-23 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据,识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 首次结合批量微阵列与单细胞RNA测序数据,发现PRC1和POLR3H作为乳腺癌转移的新型预后标志物 | 未提供具体局限信息 | 识别乳腺癌转移的预后相关基因标志物 | 乳腺癌转移相关的差异表达基因及其在恶性上皮和EMT细胞中的表达 | 机器学习 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公共微阵列数据集(GSE14776、GSE103357、GSE32489)及一个单细胞RNA测序数据集(GSE180286) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1003 | 2026-05-23 |
Chemotherapy-induced reactive myelopoiesis promotes expansion of immunosuppressive neutrophil-like monocytes in mice and humans
2026-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198360
PMID:41945895
|
研究论文 | 化疗诱导的反应性骨髓生成促进免疫抑制性中性粒细胞样单核细胞在小鼠和人类中扩增 | 通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,揭示化疗药物环磷酰胺诱导骨髓生成产生中性粒细胞样单核细胞(NeuMo)的分子特征,并确认其在人类中的保守免疫调节反馈机制 | 对CTX诱导的骨髓生成的分子机制理解仍有限,且NeuMo细胞在肿瘤对化学免疫治疗反应中的临床意义尚待进一步研究 | 研究化疗诱导的反应性骨髓生成及其对免疫抑制性单核细胞扩增的影响 | 化疗(环磷酰胺)处理的小鼠和接受含环磷酰胺化疗的淋巴瘤患者 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠骨髓单核细胞(具体数量未说明),公共数据库中化疗治疗的癌症患者数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 1004 | 2026-05-23 |
Inhibiting VTCN1 overcomes immunosuppression in colorectal cancer to activate T cells via galectin-3
2026-05-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00323.2025
PMID:41778365
|
研究论文 | 通过整合多组学分析,揭示VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌免疫抑制中的作用,并验证VTCN1抑制剂SGN-B7H4可恢复T细胞功能并抑制肿瘤进展 | 首次阐明VTCN1通过调控半乳糖凝集素3介导T细胞功能障碍的免疫检查点机制,并证明靶向该通路可逆转结直肠癌免疫治疗耐药 | 未明确提及研究局限性 | 探索VTCN1-半乳糖凝集素3轴在结直肠癌免疫抑制中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞及T细胞(包括小鼠模型和细胞实验) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 多组学数据(单细胞、转录组、蛋白质组) | 体外实验:结直肠癌细胞系;体内实验:小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1005 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveals that air-liquid interface culture promotes goblet cell differentiation and inhibits glycolysis in organoid cell monolayers
2026-05-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00251.2025
PMID:41830459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示气液界面培养促进肠道类器官单层中杯状细胞分化并抑制糖酵解 | 首次利用单细胞RNA测序系统比较了浸没培养和气液界面培养条件下兔盲肠类器官的细胞异质性,发现ALI培养能显著增强分泌谱系分化并更接近体内转录组特征 | BEST4细胞在类器官中未能检测到,表明ALI条件仍无法完全重现体内所有上皮细胞类型 | 阐明气液界面培养对肠道类器官上皮细胞类型特异性基因表达的影响及代谢机制 | 兔盲肠来源的类器官单层细胞(浸没培养和气液界面培养)及体内兔盲肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 兔盲肠类器官样本(浸没和气液界面两种条件)及体内兔盲肠上皮样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 1006 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1007 | 2026-05-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals HMGA2 involvement in neoplastic aggressiveness and endothelial cell senescence in chondrosarcoma
2026-Apr-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10188-x
PMID:41964890
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HMGA2在软骨肉瘤肿瘤侵袭性和内皮细胞衰老中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的细胞异质性,发现HMGA2调控恶性表型并与不良预后相关,同时揭示SPP1和HBEGF在肿瘤细胞与内皮细胞通讯中的新机制 | 研究基于有限临床样本,公共数据集验证可能受批次效应影响,功能实验仅在体外和动物模型中进行 | 解析软骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性,寻找潜在治疗靶点 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织的临床样本 | 单细胞转录组学 | 软骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 高低级别软骨肉瘤、内生软骨瘤和瘤旁组织临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2026-05-23 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合体内外模型,揭示了DUSP5通过抑制肿瘤浸润巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号通路及破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5正反馈回路来抑制食管鳞癌进展的分子机制 | 首次阐明DUSP5在食管鳞癌中充当肿瘤抑制因子,并发现其受ERK1/2下游转录因子ELK1负调控,形成致癌性反馈回路;同时揭示了APOC⁺巨噬细胞通过AREG-EGFR轴促进肿瘤生长的免疫微环境机制 | 未明确提及具体研究限制 | 探究DUSP5在食管鳞癌中的功能及肿瘤免疫微环境中的调控机制 | 食管鳞癌细胞系、小鼠异种移植模型及致癌物诱导的DUSP5敲除小鼠 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、细胞增殖/凋亡/迁移检测、小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组分析、基因表达谱 | 单细胞转录组数据、临床组织样本数据 | 未明确提及样本量,涉及多个细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1009 | 2026-05-23 |
Functional analysis of the human miRNome in non-small cell lung cancer unveils a novel miR-92b-3p/NOTCH3 axis that drives tumor progression
2026-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08709-x
PMID:41951596
|
研究论文 | 通过功能性miRNA筛选发现miR-92b-3p/NOTCH3轴驱动非小细胞肺癌进展 | 首次对肺腺癌中人类miRNome进行系统性功能筛选,并发现驱动肿瘤进展的新miR-92b-3p/NOTCH3轴 | NA | 系统鉴定与肺腺癌进展相关的功能性miRNA及其机制 | 肺腺癌细胞系及患者样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 慢病毒miRNA筛选, RNA-seq, 空间转录组学 | 风险评分模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA-LUAD队列及内部空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1010 | 2026-05-23 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
|
研究论文 | 该论文揭示了SIRT1通过KU70介导的非同源末端连接修复途径维持精原干细胞基因组稳定性的机制 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路,并发现SIRT1-KU70轴是保护雄性生育力的潜在靶点 | 主要基于体外实验和小鼠模型,人体样本验证有限,且未深入探讨SIRT1其他下游靶点 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答中的作用机制及其对雄性生育力的影响 | 非阻塞性无精子症患者的精原干细胞及小鼠精原干细胞模型 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类睾丸单细胞RNA测序数据集(非阻塞性无精子症患者与对照),以及梗阻性无精子症患者睾丸切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'RNA-seq |
| 1011 | 2026-05-23 |
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00521-9
PMID:41927532
|
研究论文 | 通过空间分辨的成骨细胞追踪转录组学揭示TGF-β作为骨质疏松症中硬骨素联合治疗靶点 | 首次结合成骨细胞特异性谱系追踪与空间分辨激光激活细胞分选技术,在静态骨表面解析成骨细胞状态并发现TGF-β信号调节成骨细胞活化 | 实验仅限于小鼠模型,未在人体中验证;长期疗效和安全性需进一步评估 | 解析成骨细胞动态转变机制,探索骨质疏松症双靶治疗策略 | 成骨细胞活化与静止状态转换及TGF-β信号调控作用 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 空间分辨转录组学, 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(后肢卸载模型) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间分辨激光激活细胞分选(SLACS)系统 |
| 1012 | 2026-05-23 |
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04374-3
PMID:41925746
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研究论文 | 本研究建立了一个综合计算框架,整合27种癌症类型的多组学数据,利用空间转录组学解码免疫相关非编码RNA调控网络,发现SNHG6-BIRC5轴是肺腺癌“免疫冷”表型的关键驱动因子,并开发了泛癌XGBoost模型用于预测免疫治疗反应 | 首次将空间转录组学与多组学分析结合,系统鉴定免疫排斥的空间驱动因素,并开发了优于PD-L1的泛癌XGBoost预测模型 | 文中未明确提及研究局限性 | 利用空间转录组学和机器学习方法,揭示免疫排斥的空间驱动因素,并开发预测免疫治疗反应的泛癌模型 | 27种癌症类型的肿瘤样本,重点为肺腺癌样本 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 空间转录组学, CRISPR-Cas9筛选 | XGBoost | 图像 | 27种癌症类型的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1013 | 2026-05-23 |
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s41747-026-00687-1
PMID:41926011
|
研究论文 | 研究了肝脏射频消融术后远处肝组织的细胞、转录和翻译激活情况 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,全面揭示了射频消融术后肝脏远处区域在转录和翻译水平上的广泛细胞激活现象 | 研究仅使用小鼠模型,且样本量较小(两只治疗小鼠和一只对照),可能无法完全代表人类肝脏的生物学反应 | 探究射频消融对整个肝脏的细胞、转录和翻译激活程度 | 健康肝脏的小鼠模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 射频消融, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析(SomaLogic) | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 两只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠进行射频消融,一只进行假手术对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1014 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophage-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析臭氧暴露小鼠肺泡巨噬细胞的浓度依赖性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组变化和功能调节 | 信息不足,未提及 | 探究肺泡巨噬细胞在臭氧暴露下的浓度依赖性反应机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1015 | 2026-05-23 |
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2025
PMID:41556834
|
研究论文 | 本研究利用iPSC来源的气道上皮模型,探索CFTR调节剂ETI对SARS-CoV-2感染和炎症的保护作用 | 首次揭示CFTR调节剂ETI不仅对囊性纤维化(CF)患者气道有保护作用,对非CF气道同样有效,并通过单细胞RNA测序阐明其增强I型干扰素信号和抗病毒基因表达的机制 | NA | 探究CFTR遗传和化学修正如何降低气道对SARS-CoV-2的易感性 | 诱导多能干细胞(iPSC)来源的囊性纤维化气道上皮模型及其等基因CFTR修正细胞 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 1016 | 2026-05-23 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
|
研究论文 | 利用空间转录组数据和生成式AI模型Tera-MIND预测并可视化脑部血管结构 | 首次利用空间转录组数据和生成式AI模型(Tera-MIND)从基因共表达模式预测脑部血管空间组织,无需额外组织处理 | NA | 预测脑部血管的空间组织,探索生成式AI在生物结构模拟中的应用潜力 | 小鼠大脑中的血管网络结构 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型(Diffusion model) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1017 | 2026-05-23 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
|
研究论文 | 利用两个大型欧洲前瞻性队列数据进行孟德尔随机化分析,评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统验证原发肿瘤与继发性恶性肿瘤的因果关系,并使用单细胞测序分析揭示PLK1癌症干细胞可能是驱动因素 | 研究仅基于欧洲人群,可能限制结果的普遍性;此外,因果关系的机制尚未完全阐明 | 评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关联,为癌症幸存者的随访策略优化提供证据 | 来自UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型)的欧洲人群数据 | 机器学习 | 胃癌,食管癌,直肠癌 | NGS,单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,临床数据 | 两个队列包含31种和28种癌症类型,具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1018 | 2026-05-23 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
|
研究论文 | 提出了一个基于异构图的框架HarveST,用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据,以识别空间域和标记基因 | 首次将异构图学习框架应用于空间转录组学,结合自监督学习和部分监督细化双重训练策略,并引入随机游走重启算法识别空间域特异性的空间可变基因 | 暂未在标题和摘要中提及具体限制 | 开发一种能够精确识别空间域和标记基因的计算方法,以解决空间转录组学中的主要挑战 | 人类皮层组织、小鼠嗅球及肿瘤微环境中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据 | 涵盖人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1019 | 2026-05-23 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
|
研究论文 | 本研究通过整合八个独立队列,利用深度学习算法从CT图像中自动提取92项身体成分参数,揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结局及分子背景的关联 | 首次全面分析多维身体成分与NSCLC免疫治疗结局的关联,并揭示性别差异和不同脂肪分布区域对免疫微环境的影响 | 未明确指出具体局限性 | 探究多维身体成分与NSCLC免疫治疗预后及分子机制的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习、RNA-seq、单细胞RNA-seq | 深度学习算法 | CT影像 | 2,132例非小细胞肺癌患者(8个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1020 | 2026-05-23 |
Multi-omics integration reveals ANXA6-high γδ T cell-endothelial communication as a potential link between periodontitis and MASLD
2026-Mar-25, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00690-7
PMID:41876560
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研究论文 | 通过整合多组学策略揭示ANXA6高表达γδ T细胞与内皮细胞的通讯可能是牙周炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病的潜在联系 | 首次将ANXA6高表达γδ T细胞与内皮细胞的免疫-血管相互作用作为两种炎症性疾病共病的共同免疫特征,并整合多种组学数据(包括空间转录组和单细胞分析)进行系统性验证 | 具体局限性未在摘要中明确说明,可能需要进一步实验验证跨疾病共病的分子机制 | 探索牙周炎与代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病的分子基础,并发现潜在的治疗靶点 | 牙周炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病患者的相关组织(如牙龈和肝脏)样本 | 机器学习 | 牙周炎, 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |