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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-10-05 |
RNA velocity and beyond: Current advances in modeling single-cell transcriptional dynamics
2025-Sep-18, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.08.005
PMID:40973591
|
综述 | 本文综述了RNA Velocity及其扩展方法在单细胞转录动力学建模中的最新进展 | 系统梳理了RNA Velocity从基础原理到第二代计算工具的发展历程，并重点介绍了在过敏和免疫学研究中的创新应用 | 讨论了RNA Velocity分析当前面临的挑战和剩余限制 | 探索单细胞转录动力学的建模方法及其在生物学研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据及其在细胞分化、重编程和疾病进展等动态过程中的应用 | 生物信息学 | 过敏性和免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | Velocyto, scVelo, dynamo, CellRank, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 1002 | 2025-10-05 |
TissueMosaic: Self-supervised learning of tissue representations enables differential spatial transcriptomics across samples
2025-Sep-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101394
PMID:40925368
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研究论文 | 提出了一种自监督卷积神经网络TissueMosaic，用于从空间转录组数据中学习组织架构表示并比较不同样本间的差异 | 开发了首个基于组织架构基序的自监督学习方法，能够将组织结构与基因表达联系起来，提高空间差异表达分析的信噪比 | 未提及具体的技术限制或数据集局限性 | 开发计算方法以连接细胞状态与其微环境，并比较不同样本和条件下的空间转录组关系 | 多样本空间转录组数据集中的组织架构基序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 自监督卷积神经网络(CNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1003 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomic analysis reveals lack of response to PD-1 blockade in recurrent glioblastoma
2025-Sep-17, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02937-9
PMID:40960500
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现复发性胶质母细胞瘤对PD-1阻断治疗缺乏响应 | 首次使用空间转录组学技术分析PD-1阻断后胶质母细胞瘤中肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的转录组变化 | 样本量相对较小(26例患者)，仅检测了空间转录组水平的变化 | 研究PD-1阻断治疗在复发性胶质母细胞瘤中对肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的影响 | 26例匹配的原发性和复发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学，Digital Spatial Profiling | NA | 空间转录组数据 | 26例患者(16例接受纳武利尤单抗治疗) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | Digital Spatial Profiling平台，使用FFPE肿瘤样本，针对SOX2⁺肿瘤细胞和IBA1⁺肿瘤相关巨噬细胞区域进行分析 |
| 1004 | 2025-10-05 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2025-Sep-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101368
PMID:40812311
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研究论文 | 开发机器学习框架利用等位基因包含数据识别抗体序列约束 | 首次利用等位基因包含这一罕见事件作为数据源训练机器学习模型预测抗体序列约束 | NA | 识别违反表达要求和脱靶反应性限制的抗体序列 | 人类B细胞抗体轻链和重链序列 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1005 | 2025-10-05 |
Epithelial cell-derived lumican modulates extracellular matrix dynamics in early-life airways disease
2025-Sep-17, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.030
PMID:40972979
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研究论文 | 本研究揭示了上皮细胞来源的lumican在早期生命气道疾病中调节细胞外基质动态变化的新机制 | 首次发现lumican在儿童喘息和哮喘气道重塑中的关键作用，并阐明其通过改变成纤维细胞功能影响胶原蛋白组织 | 研究样本量有限，机制研究主要在动物模型中进行，需要进一步验证 | 探究早期生命气道疾病中细胞外基质改变机制 | 学龄前喘息儿童(1-5岁)、学龄期哮喘儿童(6-16岁)和HDM暴露新生小鼠 | 数字病理学 | 哮喘 | 空间转录组学,共聚焦显微镜,二次谐波产生显微镜 | NA | 转录组数据,图像数据 | 儿童气道活检样本和HDM暴露新生小鼠肺组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2025-10-05 |
Automating classification of treatment responses to combined targeted therapy and immunotherapy in HCC
2025-Sep-17, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf031
PMID:40974077
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研究论文 | 开发多模态CNN-Transformer模型预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的疗效反应 | 首次构建融合影像和临床特征的多模态深度学习模型，并采用两阶段3D U-Net自动分割系统减少人工干预偏差 | 样本量有限（训练队列181例，验证队列30例），且主要针对无法手术的晚期HCC患者 | 预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的治疗反应 | 晚期肝细胞癌患者 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，磁共振成像 | CNN-Transformer，3D U-Net | 影像，临床数据 | 训练队列181例，验证队列30例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2025-10-05 |
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Sep-17, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf130
PMID:40974094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，鉴定CD39+T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 | 首次聚焦CD39+T细胞在类风湿关节炎中的作用，发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 | 未明确说明样本规模和研究人群特征，需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 | 识别类风湿关节炎的诊断和治疗生物标志物 | 类风湿关节炎患者的CD39+T细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2025-10-05 |
Effects of Oligolysine-Polyethylene Glycol Coating on the Biodistribution of Wireframe DNA Origami Nanosheets in Zebrafish Embryos
2025-Sep-16, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c05801
PMID:40900000
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼胚胎模型分析寡聚赖氨酸-聚乙二醇涂层对线框DNA折纸纳米片生物分布的影响 | 首次结合长期高分辨率活体成像和单细胞RNA测序，在斑马鱼胚胎中研究DNA折纸纳米结构的生物分布和清除机制 | 研究仅限于斑马鱼胚胎模型，结果向其他生物系统的推广性有待验证 | 探究K-PEG涂层对DNA折纸纳米结构在生物体内分布和清除的影响 | 斑马鱼胚胎 | 纳米生物技术 | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | 图像，基因表达数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1009 | 2025-10-05 |
Transcriptional states of lung cancer microenvironment reveal macrophage subtype dynamics linked to disease progression
2025-Sep-16, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf253
PMID:40972001
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据分析，揭示了肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞亚型的动态变化与疾病进展的关系 | 建立了7种巨噬细胞亚型的精细分类系统，发现脂质相关TAMs随疾病进展而扩增并具有免疫抑制特性，提出了脂质相关与组织驻留TAMs比率作为预后指标 | 空间转录组分析依赖于反卷积技术推断细胞类型组成，对精细TAM亚群分析的准确性存在依赖 | 解析肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 分层分类, 基于细胞的基因评分 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 大型癌症队列数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1010 | 2025-10-05 |
Endothelial plasticity in atrial fibrosis by integrating single-cell sequencing and genetic lineage tracing
2025-Sep-15, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf372
PMID:40626706
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和遗传谱系追踪技术，揭示了内皮细胞通过TGF-β1调控心房纤维化的新机制 | 首次发现间充质活化内皮细胞(EndoMA)通过分泌TGF-β1促进成纤维细胞功能，而非通过完全的内皮-成纤维细胞转分化 | 未观察到完全的内皮-成纤维细胞转分化过程，机制研究仍需深入 | 阐明内皮细胞在心房纤维化中的具体作用机制 | 人心房组织、Cdh5-CreERT2;RFP基因工程小鼠、人原代心房内皮细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 免疫荧光, 高内涵筛选 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 窦性心律和房颤患者的心房组织，基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1011 | 2025-10-05 |
Infusion of peripheral blood mononuclear cell alleviates amyloid accumulation and cognitive deficits in Alzheimer's disease
2025-Sep-12, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf193
PMID:40971495
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研究论文 | 本研究探讨外周血单个核细胞对阿尔茨海默病淀粉样蛋白积累和认知缺陷的改善作用 | 首次发现外周血单个核细胞移植可减少AD小鼠Aβ斑块和p-Tau沉积并改善认知功能，鉴定JUN基因为AD诊断关键标志物 | 样本量有限，未深入探讨PBMCs作用机制，临床转化需进一步验证 | 探究外周血单个核细胞在阿尔茨海默病中的作用及潜在治疗价值 | 健康对照和AD患者的外周血单个核细胞，野生型小鼠和AD模型小鼠 | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，ROC曲线分析，GO和KEGG通路分析 | NA | 基因表达数据，认知行为数据，病理染色数据 | 健康对照和AD患者PBMCs样本，9月龄和6月龄AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1012 | 2025-10-05 |
OPIOID-EXPRESSING B CELLS SILENCE TUMOR-INFILTRATING NOCICEPTOR NEURONS
2025-Sep-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7389517/v1
PMID:40951290
|
研究论文 | 本研究揭示了阿片类药物通过调节B细胞产生的痛敏肽/孤啡肽(N/OFQ)来影响肿瘤浸润伤害感受神经元活性的新机制 | 首次发现B细胞是N/OFQ的主要来源，并阐明了N/OFQ-OPRL1和CGRP-RAMP1信号通路在调节肿瘤疼痛和抗肿瘤免疫中的相互作用 | 研究主要基于头颈鳞癌和黑色素瘤模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症疼痛与抗肿瘤免疫之间的分子机制 | 头颈鳞状细胞癌患者、黑色素瘤患者、口腔鳞癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 动物模型, 细胞共培养 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据, 临床数据, 行为学数据 | 头颈癌患者回顾性分析, 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1013 | 2025-10-05 |
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
PMID:40950474
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法揭示了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式和发育谱系特征 | 首次系统描绘MAEL基因在人类大脑发育过程中的进化起源、时空表达模式，并在人类脑积水组织中直接验证其表达降低 | MAEL基因在常用模式生物中序列同源性低，限制了体外和体内机制研究的适用性 | 阐明MAEL基因在脑积水和发育中人类大脑中的进化、时间、发育和谱系表达特征 | 人类大脑组织，包括发育中大脑和脑积水患者手术获取的皮质组织 | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序，整合基因组学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 49个大脑区域的单细胞RNA测序数据，加上手术获取的脑积水原代皮质组织 | Allen Institute | 单细胞RNA测序 | NA | 发育中人类大脑图谱的单细胞RNA测序数据 |
| 1014 | 2025-10-05 |
Exploring mechanisms of britannin against colorectal cancer based on experimentally validated network pharmacology
2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-03995-2
PMID:40080155
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研究论文 | 本研究通过实验验证的网络药理学方法探讨了旋覆花素对结直肠癌的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究旋覆花素的抗结直肠癌机制，并发现其对巨噬细胞极化的调控作用 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步验证具体分子靶点 | 探索旋覆花素治疗结直肠癌的作用机制 | 结直肠癌细胞和肿瘤微环境 | 网络药理学 | 结直肠癌 | 网络药理学,单细胞RNA测序,CIBERSORT分析,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1015 | 2025-10-05 |
Mapping molecular landscapes in triple-negative breast cancer: insights from spatial transcriptomics
2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04057-3
PMID:40119898
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综述 | 本文综述了空间转录组学在三阴性乳腺癌肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 整合空间转录组学与蛋白质组学、成像质谱流式技术，结合AI进行空间分析，推动精准医疗和生物标志物发现 | 需要进一步发展ST技术、计算工具和多中心合作才能将空间转录组学整合到临床常规实践中 | 探讨空间转录组学在三阴性乳腺癌研究中的应用价值 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | AI-based spatial analysis | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1016 | 2025-10-05 |
Anti-Peptidylarginine Deiminase 4 Autoantibodies Derived From Patients With Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎患者来源的抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 首次证明抗PAD4抗体可直接结合单核细胞并触发炎症级联反应，促进T细胞活化和滑膜成纤维细胞炎症表型 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型和体外细胞培养，需要进一步验证在人类患者中的直接病理机制 | 阐明抗PAD4自身抗体在类风湿关节炎发病机制中的具体作用 | 类风湿关节炎患者、胶原诱导性关节炎小鼠模型、人类单核细胞和滑膜成纤维细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、流式细胞术 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及患者来源的抗体、小鼠模型和人类细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2025-10-05 |
Single-cell epigenetics and multiomics analysis in kidney research
2025-Sep, Clinical and experimental nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s10157-025-02679-8
PMID:40281349
|
综述 | 概述单细胞分析技术，重点关注新兴表观基因组学和多组学方法及其在肾脏研究中的应用 | 整合表观基因组与转录组的单细胞多组学分析，揭示驱动细胞异质性的基因调控机制 | NA | 促进肾脏疾病新型生物标志物和治疗靶点的发现及临床转化 | 健康与疾病状态下的肾脏细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1018 | 2025-10-05 |
Rigor and Reproducibility of Spatial Transcriptomics Performed on Clinically Sourced Human Tissues
2025-Sep, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104190
PMID:40311874
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研究论文 | 评估临床来源人类组织中空间转录组学技术的严谨性和可重复性 | 首次系统评估数字空间分析技术在临床样本中的技术性能，并比较多细胞与单细胞分辨率方法的优劣 | 主要关注肾脏组织，可能不适用于所有组织类型 | 验证空间转录组学技术在临床研究和诊断中的应用可行性 | 临床来源的人类肾脏组织和活检样本 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，数字空间分析，单分子成像 | NA | 基因表达空间定位数据 | 临床来源的人类肾脏组织和活检样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 数字空间分析平台，单分子成像仪 | 数字空间分析技术，单细胞分辨率空间转录组学平台 |
| 1019 | 2025-10-05 |
Colorectal Liver Metastasis Pathomics Model: Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis With Pathomics for Predicting Liver Metastasis in Colorectal Cancer
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100805
PMID:40473111
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研究论文 | 本研究开发了一种结直肠癌肝转移病理组学模型，通过整合单细胞转录组、空间转录组分析和病理组学来预测结直肠癌肝转移风险 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组分析识别出肝转移触发恶性细胞，并开发了基于弱监督学习的深度学习模型预测肝转移风险 | 模型在外部验证集表现存在差异（AUC 0.72-0.89），需要进一步验证和优化 | 提高结直肠癌肝转移风险的识别和预测能力 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 批量RNA测序 | ResNet18, 一类逻辑回归算法 | 全切片图像, 转录组数据 | 癌症基因组图谱-结直肠癌组织学图像内部测试集及两个外部独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1020 | 2025-10-05 |
High-Dimensional Analysis of Type 2 Lymphocyte Dynamics During Mepolizumab or Dupilumab Treatment in Severe Asthma
2025-Sep, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16633
PMID:40566935
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术分析美泊利单抗和度普利尤单抗治疗对重症哮喘患者2型淋巴细胞的影响 | 首次系统揭示美泊利单抗通过改变2型淋巴细胞的组织归巢受体表达和细胞因子产生能力来减轻气道炎症的新机制 | 样本量较小（特别是度普利尤单抗组仅7例），单细胞RNA测序样本量有限（n=3） | 探究2型生物制剂对重症哮喘患者循环淋巴细胞的影响机制 | 40例重症哮喘患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 高参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 细胞刺激实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 40例患者（美泊利单抗33例，度普利尤单抗7例），治疗前及治疗后4、12个月采样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |