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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-03-06 |
IL4I1⁺ Macrophages and TDO2⁺ Myofibroblasts Drive AhR-Mediated Immunosuppression and Ferroptosis Resistance in Solid Predominant Lung Adenocarcinoma
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513606
PMID:41431173
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研究论文 | 本研究揭示了在实体型肺腺癌中,IL4I1⁺巨噬细胞和TDO2⁺肌成纤维细胞通过AhR信号通路协同建立免疫抑制和抗铁死亡微环境的机制 | 首次整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出IL4I1⁺ TAMs和TDO2⁺ myCAFs在实体型肺腺癌中的特异性富集及其空间共定位,并阐明了它们通过AhR信号介导免疫抑制和铁死亡抵抗的协同机制 | 研究主要基于转录组和代谢组数据,缺乏对AhR信号通路下游具体效应分子的全面功能验证;体内治疗模型的长期疗效和潜在毒性需进一步评估 | 探究实体型肺腺癌预后不良和治疗抵抗的潜在机制,并开发新的治疗策略 | 肺腺癌(LUAD)患者肿瘤组织,特别是实体型肺腺癌亚型 | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 色氨酸代谢组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及肺腺癌患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2026-03-06 |
Nuclear Factor I-B Delays Liver Fibrosis by Inhibiting Chemokine Ligand 5 Transcription
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511311
PMID:41436407
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研究论文 | 本文揭示了核因子I-B通过抑制趋化因子配体5的转录来延缓肝纤维化的机制 | 首次发现NFIB在肝星状细胞激活过程中显著下调,并阐明NFIB通过直接结合CCL5启动子区域抑制其表达,从而减轻肝纤维化的新轴心作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床组织样本,缺乏在人体中的直接干预验证 | 探究NFIB在肝星状细胞分化和肝纤维化进程中的作用机制 | 肝星状细胞、小鼠肝纤维化模型、MASH患者的肝组织 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序、RNA测序 | NA | 测序数据、组织样本 | MASH肝纤维化患者的肝组织及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1003 | 2026-03-06 |
Remodeling of non-coding RNA regulatory networks: Decoding the pathological mechanisms and new therapeutic paradigms of cardiovascular diseases
2026-Mar, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2025.12.007
PMID:41447890
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综述 | 本文系统总结了非编码RNA在心血管疾病中的表达谱和多层调控机制,并探讨了其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 提出了一个整合网络拓扑、竞争性内源RNA动力学、外泌体运输时空梯度及能量/化学计量约束的分析框架,以统一解释多种心血管疾病的机制 | 基于非编码RNA的疗法在实际应用中面临递送效率低、功能冗余和微环境依赖性等挑战 | 解码非编码RNA调控网络在心血管疾病中的病理机制,并探索新的治疗范式 | 心血管疾病,包括先天性心脏病、动脉粥样硬化、心肌病、心力衰竭和心律失常 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞多组学、空间转录组学、CRISPR-dCas9系统、深度学习 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1004 | 2026-03-06 |
HiST: Histological Images Reconstruct Tumor Spatial Transcriptomics via MultiScale Fusion Deep Learning
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514351
PMID:41487073
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研究论文 | 本研究开发了一个名为HiST的多尺度卷积深度学习框架,用于从组织学图像重建空间转录组数据 | 首次提出利用多尺度融合深度学习框架,直接从组织学图像高精度预测空间基因表达谱,性能优于现有模型约两倍 | 研究仅基于五种癌症类型的数据进行验证,尚未在更广泛的癌症类型或更大规模临床队列中测试 | 解决空间转录组技术成本高昂的问题,通过深度学习从常规组织学图像重建空间分子信息 | 肿瘤组织学图像与空间基因表达谱的对应关系 | 数字病理 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 多尺度卷积神经网络 | 图像 | 五种癌症类型的样本(包括乳腺癌等) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1005 | 2026-03-06 |
Senescent Synovial Intimal Fibroblasts Aggravate Osteoarthritis by Regulating Macrophage Polarization and Chondrocyte Phenotype Through ANGPTL4-α5β1 Axis
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518056
PMID:41572561
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研究论文 | 本研究探讨了衰老的滑膜内膜成纤维细胞通过ANGPTL4-α5β1轴调控巨噬细胞极化和软骨细胞表型,从而加剧骨关节炎的机制 | 识别了滑膜内膜成纤维细胞中特定的衰老亚群,并揭示了转录因子EGR1和ATF3调控其衰老相关通路,以及通过ANGPTL4的旁分泌作用促进M1巨噬细胞极化和软骨退变 | NA | 研究滑膜细胞衰老的机制及其对关节内细胞间通讯的影响 | 滑膜内膜成纤维细胞、巨噬细胞、软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 多重免疫荧光、基因调控网络重建、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1006 | 2026-03-06 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study From Single-Cell to Survival Analysis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71049
PMID:41772406
|
研究论文 | 本研究应用机器学习分析单细胞RNA测序数据,揭示结直肠癌中基因表达与免疫浸润的关联,并识别新的分子亚型和生物标志物 | 首次将机器学习整合到单细胞RNA测序分析中,以揭示结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的复杂相互作用,并发现两个新的分子亚型 | 未明确提及样本量或数据来源的具体限制,且模型在临床实践中的应用潜力仍需进一步验证 | 研究结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的分子机制,以识别生物标志物和免疫治疗靶点 | 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、生存分析、基因集富集分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2026-03-06 |
Deciphering the Impact of RAC1-SPTAN1 in ARPKD Cystogenesis Using Multifaceted Models
2026-Feb-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524001
PMID:41742835
|
研究论文 | 本研究通过多模型方法揭示了SPTAN1在常染色体隐性多囊肾病囊肿发生中的核心作用,并探索了表观基因组编辑作为潜在治疗策略 | 首次将SPTAN1确定为ARPKD中RAC1激活和囊肿病理的关键调节因子,并利用CRISPR激活技术恢复SPTAN1表达以缓解囊肿表型 | 研究主要基于模型系统(类器官和小鼠),在人类患者中的直接验证仍需进一步开展 | 阐明ARPKD囊肿发生的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | ARPKD患者肾脏样本、转基因小鼠、肾脏类器官芯片模型 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA-seq、CRISPR激活、转录组学、活体成像 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 包括患者肾脏样本、转基因小鼠和肾脏类器官模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2026-03-06 |
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Feb-26, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scMAG的多阶段深度融合框架,用于整合单细胞多组学数据,通过多核流形保持和门控优化策略提高聚类精度和数据可视化效果 | 创新性地引入了多阶段特征深度融合形式化方法,结合组学多核流形保持和引导门控优化策略,自适应平衡多组学共享信号和模态特异性信号 | NA | 提高单细胞多组学数据的聚类准确性和数据可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、抗体衍生标签(ADT) | 多阶段深度融合框架 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1009 | 2026-03-06 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Feb-25, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
|
研究论文 | 本文提出了一种用于研究人类组织驻留记忆T细胞(TRMs)的体外模型系统协议 | 开发了一种通过共培养系统诱导TRM样T细胞的人类鼻上皮模型 | NA | 研究人类组织驻留记忆T细胞的诱导与分析 | 人类鼻上皮模型与自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1010 | 2026-03-06 |
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013636
PMID:41735000
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗法疗效的主要障碍,并开发了具有增强ADCC活性的αTIGIT-IgG1抗体以特异性清除该Treg亚群,从而显著提升抗肿瘤效果 | 首次将TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内Tregs确定为TIGIT阻断疗法的主要限制因素,并设计了具有增强ADCC活性的αTIGIT抗体以特异性清除该亚群,从而释放效应T细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,其临床转化效果和长期安全性仍需在更大规模的临床试验中验证 | 克服当前基于TIGIT阻断的癌症免疫疗法的局限性,提升其抗肿瘤疗效 | 肿瘤微环境中的调节性T细胞(Tregs)、效应T细胞(特别是干细胞样CD4+ T细胞和CD8+ T细胞)以及TIGIT和CD226的相互作用 | 免疫肿瘤学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR测序(scTCR-seq)、癌症基因组图谱(TCGA)批量RNA-seq、流式细胞术、生物层干涉测量法、体外ADCC测定 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、批量RNA-seq数据、流式细胞术数据 | 小鼠模型(MC38肿瘤接种的人源化TIGIT敲入小鼠)和患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1011 | 2026-03-06 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多个不同的施万细胞亚型,包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型,并确定了SPP1信号通路作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性尚需进一步验证 | 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞 | 单细胞组学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1012 | 2026-03-06 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells, improving radiation efficacy
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
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研究论文 | 本研究探讨了IL-21与放疗联合应用如何通过增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞的细胞毒性来改善癌症治疗效果 | 首次揭示了IL-21与放疗在增强肿瘤微环境激活和CD8+ T细胞功能方面的协同作用,并通过单细胞转录组测序提供了机制性见解 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 | 评估IL-21作为放疗佐剂在增强抗肿瘤免疫反应中的潜力 | 人类癌症数据库、组织微阵列、小鼠肿瘤模型、人源化小鼠以及食管癌患者的样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症(包括食管癌) | 单细胞转录组测序、组织微阵列分析 | NA | 转录组数据、组织图像数据 | 涉及人类数据库、小鼠模型、人源化小鼠及患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1013 | 2026-03-06 |
Single-cell capture of on-ART SIV transcription reveals TGF-β-mediated metabolic control of viral latency
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198810
PMID:41729081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、代谢分析和流式细胞术,探讨了galunisertib阻断TGF-β如何通过代谢重编程激活SIV潜伏感染细胞的机制 | 开发了新型敏感的SIV转录捕获检测方法,首次在单细胞水平揭示了TGF-β通过代谢抑制调控SIV潜伏的机制 | 研究样本仅来自ART治疗的SIV感染猕猴,未涉及人类HIV感染模型,且样本量相对有限 | 探究TGF-β阻断剂galunisertib激活SIV潜伏感染的分子和代谢机制 | ART治疗的SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 代谢分析, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢数据, 流式细胞数据 | 来自SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本,其中检测到127个SIV表达细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2026-03-06 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合适应性免疫受体测序,揭示了皮肤莱姆病中CD8+GZMK+IFNG+ T细胞作为关键免疫群体的作用 | 识别了在皮肤莱姆病病变中克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞亚群,并揭示了其炎症潜能和早期防御功能 | NA | 探究皮肤莱姆病中T细胞对伯氏疏螺旋体感染的免疫反应 | 皮肤莱姆病患者的红斑移行病变和自体未受累皮肤样本 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序,适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩展的样本量(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1015 | 2026-03-06 |
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.02.029
PMID:41709577
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新系统 | 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学及多重免疫荧光,实现高分辨率空间多组学分析,并构建了基于微尺度(1毫米)的空间多模态评分系统 | 研究依赖于特定技术平台,且样本量虽较大但可能仍需在更广泛人群中验证 | 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 | 肝内胆管癌(iCCA)患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 | NA | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 训练队列155名患者,验证队列214名患者 | NA | 单细胞RNA-seq、空间蛋白质组学、批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 1016 | 2026-03-06 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 本研究结合组织病理学、空间转录组学和单核RNA测序,揭示了人类小脑中Bergmann胶质细胞(BG)的时空发育图谱 | 首次系统描绘了人类小脑BG的发育时间线和分子特征,挑战了BG在妊娠晚期才出现的传统观点,并发现包括lamina dissecans在内的三层组织结构可能是人类特有的 | 研究主要基于发育中的人类小脑样本,未直接验证BG在神经发育障碍中的具体作用机制 | 阐明人类小脑Bergmann胶质细胞的发育过程、分子特征及其在神经发育中的潜在作用 | 人类发育中小脑组织,以及小鼠、雪貂和狨猴的小脑组织作为比较 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 组织病理学分析、空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 图像、空间转录组数据、单核RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量,但涵盖了多个发育时间点(如11-12PCW、17PCW等)的人类小脑样本,以及小鼠、雪貂和狨猴的样本 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2026-03-06 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-Feb-14, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
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研究论文 | 本研究探讨了血小板反应蛋白-1在不同细胞类型中对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 | 首次通过细胞特异性敲除模型揭示髓系细胞来源的TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注了特定细胞类型 | 研究TSP1在不同细胞类型中对腹主动脉瘤破裂的调控机制 | 高胆固醇血症小鼠模型中的腹主动脉瘤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1018 | 2026-03-06 |
Tumor-immune-neural circuit disrupts energy homeostasis in cancer cachexia
2026-Feb-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.01.014
PMID:41687610
|
研究论文 | 本研究揭示了一种由肿瘤-免疫-神经回路驱动的癌症恶病质新机制,该机制以生长分化因子15(GDF15)为核心 | 首次发现并阐明了一个以GDF15为中心的肿瘤-免疫-神经回路,揭示了肿瘤信号、巨噬细胞来源的GDF15与神经通路之间的非细胞自主性机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,其发现向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 | 探究癌症恶病质和厌食症的潜在分子与神经环路机制,以寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌、肺癌和皮肤癌的基因工程小鼠模型 | 癌症生物学与神经免疫学 | 癌症恶病质 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2026-03-06 |
Spatiotemporal cell type deconvolution leveraging tissue structure
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705204
PMID:41727148
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaDecoder的新方法,用于基于空间转录组学数据进行细胞类型反卷积,该方法能有效利用3D组织结构信息 | 提出了一种并行化的矩阵分解方法,通过自适应推断的3D邻域高斯核有效利用组织结构,并考虑了单细胞参考谱的变异性和批次效应 | 未在摘要中明确说明 | 改进空间转录组学中的细胞类型反卷积,以揭示空间细胞类型分布并支持下游分析 | 空间转录组学数据(spot-based)和单细胞RNA-seq参考图谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 矩阵分解 | 空间转录组学数据,单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1020 | 2026-03-06 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 本研究提出了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术,通过结合组织膨胀与测序方法,实现了亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组空间分析 | 将组织膨胀技术与Seq-Scope结合,突破了传统测序空间转录组学的光学分辨率限制,首次在测序方法中实现亚微米级分辨率,并能同时分析核与细胞质转录组差异 | NA | 开发超高分辨率空间组学技术,用于研究细胞结构、功能和疾病机制 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 结合组织膨胀的Seq-Scope改进平台,支持亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组分析 |