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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-11-25 |
Prediction of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma and immune microenvironment infiltration based on single-cell sequencing and RNA-Seq integration
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04094-7
PMID:41276703
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-Seq数据,识别肝细胞癌的预后生物标志物并探索其在免疫微环境浸润中的作用 | 首次构建肝细胞癌单细胞转录组图谱,整合多组学数据识别T细胞相关预后基因,建立风险分层模型 | 样本量相对有限(8个肿瘤样本和7个正常组织样本),需要更大规模验证 | 识别肝细胞癌预后生物标志物并探索免疫微环境浸润特征 | 肝细胞癌患者组织样本中的T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | 15个组织样本(8个肿瘤,7个正常),包含53,477个细胞,其中12,333个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2025-11-25 |
Influenza virus and Staphylococcus aureus super-infection disrupts spatially coordinated cellular immunity in the mouse lung
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09268-1
PMID:41276707
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染如何破坏小鼠肺部免疫细胞的空间协调 | 首次采用空间转录组学平台系统表征超级感染期间免疫细胞的协调机制,填补了传统研究对免疫细胞空间背景认识的空白 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究流感病毒与细菌超级感染对肺部免疫细胞空间分布和功能协调的影响机制 | 小鼠肺部组织及其中免疫细胞(中性粒细胞、间质巨噬细胞、CD4 T细胞、B细胞、树突状细胞) | 空间转录组学 | 肺部感染 | 空间转录组学、免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 超级感染组、单纯流感感染组和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染组的小鼠肺部样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1003 | 2025-11-25 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性及功能特征 | 首次在结肠癌中系统鉴定SPP1+巨噬细胞亚型,揭示其通过代谢重编程和基质互作促进肿瘤进展的新机制 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞亚群的功能异质性 | 结肠癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析、转录因子网络分析、细胞通讯分析、计算机模拟基因敲除 | 单细胞转录组数据 | 3例结肠癌患者的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1004 | 2025-11-25 |
Machine learning multiomics Deciphers GRHL2 associated tumor microenvironment evolution guiding precision therapeutics in breast cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04120-8
PMID:41276739
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据全面解析GRHL2在乳腺癌中的预后和免疫学意义 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据系统揭示GRHL2在乳腺癌肿瘤微环境演变中的作用 | GRHL2在乳腺癌中的具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明GRHL2在乳腺癌预后和免疫调节中的功能 | 乳腺癌患者的多组学数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | CoxBoost回归,InferCNV | RNA测序数据 | 多个队列的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1005 | 2025-11-25 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
|
研究论文 | 本研究开发了一种多酶纳米催化剂系统,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 首次设计单原子纳米酶Co-SAE表面修饰胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin,同时靶向胰腺腺泡细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于实验模型验证,尚未进行临床试验 | 开发新型纳米催化疗法治疗急性胰腺炎 | 胰腺腺泡细胞和急性胰腺炎动物模型 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、生化指标 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1006 | 2025-11-25 |
Midkine-Mediated Microglia Activation after Renal Injury Promotes Cognitive Impairment Following Ischemic Renal Injury
2025-Nov-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507832
PMID:41276912
|
研究论文 | 本研究探讨了肾脏损伤后上调的midkine通过激活小胶质细胞导致认知功能障碍的机制 | 首次揭示了MDK-LRP1轴在肾脏缺血损伤后认知功能障碍中的关键介导作用 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索缺血性肾损伤后认知功能障碍的分子机制 | 小鼠模型中的肾脏组织和海马体 | 神经科学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,配体-受体相互作用分析,shRNA腺病毒 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1007 | 2025-11-25 |
Sympathovagal crosstalk: Y2-receptor blockade enhances vagal effects which in turn reduce NPY levels via muscarinic receptor activation
2025-Nov-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf180
PMID:41052902
|
研究论文 | 本研究通过体内外实验揭示了迷走神经刺激通过M2受体机制降低神经肽Y水平,且Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 首次在体内证实迷走神经激活通过突触前交感M2受体机制降低间质NPY水平,并发现Y2受体阻断可增强迷走神经效应 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体验证 | 探究迷走神经刺激降低神经肽Y的机制及Y2受体阻断对自主神经平衡的调节作用 | 大鼠星状神经节细胞、猪模型 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、场刺激、实时间质NPY水平检测 | 动物模型 | 基因表达数据、电生理数据、血流动力学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2025-11-25 |
Multi-omics analysis reveals the heterogeneity and interactions among stromal and tumor cells in gastric cancer
2025-Nov-22, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102614
PMID:41275708
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌中基质细胞与肿瘤细胞的异质性及其相互作用 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学,首次系统描绘胃癌中癌症相关成纤维细胞和平滑肌细胞的异质性谱系及其与肿瘤细胞的互作网络 | 需要进一步的实验验证配体-受体对和空间决定因素 | 研究胃癌中基质细胞与肿瘤细胞的异质性及相互作用,识别潜在治疗靶点 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞、平滑肌细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹推断, 调控子活性映射, 配体-受体互作建模 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1009 | 2025-11-25 |
Dynamic transcriptional immune landscape in response to NK-cell therapy combined with gemcitabine plus S-1 in advanced pancreatic cancer: a phase 1b/2 trial
2025-Nov-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02488-1
PMID:41266303
|
研究论文 | 评估异体NK细胞疗法联合吉西他滨和S-1治疗晚期胰腺癌的安全性、有效性及动态免疫应答特征 | 首次在人体试验中通过纵向单细胞RNA测序揭示NK细胞疗法联合化疗的动态免疫景观变化 | 样本量较小(24例患者),需进一步临床验证 | 探索NK细胞联合化疗治疗晚期胰腺癌的免疫机制和临床效果 | 晚期胰腺癌患者 | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体Vβ组库测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据 | 24例患者,19对配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量TCR测序 | NA | NA |
| 1010 | 2025-11-25 |
Tripotent Lgr5 stem cells in the posterior tongue generate lingual, taste, and salivary gland lineages
2025-Nov-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65140-0
PMID:41271704
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠舌后部轮廓乳头和叶状乳头中Lgr5阳性干细胞具有生成味蕾、唾液腺和非味觉舌表面上皮的三向分化潜能 | 首次发现舌后部Lgr5阳性干细胞具有三向分化能力,能够共同生成味觉感受单元中的味蕾和唾液腺细胞 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索舌后部味蕾与唾液腺的发育关系及干细胞起源 | 小鼠舌后部轮廓乳头和叶状乳头组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠舌后部组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1011 | 2025-11-25 |
Integrated analysis reveals survival-related genes promoting cholangiocarcinoma progression via G2/M cell cycle, with validation of cyclin B1 in tumor proliferation
2025-Nov-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25299-4
PMID:41272097
|
研究论文 | 通过整合分析发现促进胆管癌进展的生存相关基因及其在G2/M细胞周期中的作用,并验证了cyclin B1在肿瘤增殖中的功能 | 首次定义了促进胆管癌进展的G2/M期基因模块并绘制了其单细胞动态图谱,揭示了CCNB1作为治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系模型 | 识别驱动胆管癌进展的生存相关基因并解析其调控网络 | 胆管癌患者样本和HuCCT1/RBE细胞系 | 生物信息学 | 胆管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | limma, WGCNA, PPI分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA-CHOL和GEO队列的批量转录组数据,GSE138709单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1012 | 2025-11-25 |
Towards the Generation of a Laser Capture Microdissection-Based Human Hair Follicle Transcriptome Atlas
2025-Nov-21, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.006
PMID:41275906
|
研究论文 | 本研究利用激光捕获显微切割结合RNA测序技术,构建了人类生长期毛囊八个不同区域的转录组图谱 | 首次系统性地揭示了人类生长期毛囊各区域的转录组特征,发现了新的区域特异性标志物,并构建了目前尚不可用的毛囊转录组图谱 | 研究仅针对生长期VI毛囊,未涵盖其他毛囊周期阶段 | 构建人类毛囊不同区域的转录组图谱,为毛囊疾病治疗提供基础 | 人类生长期VI毛囊的八个特定区域 | 转录组学 | 毛囊疾病 | 激光捕获显微切割, RNA测序, 原位杂交 | PCA, CellChat分析 | 转录组数据 | 人类毛囊八个区域的组织样本 | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 1013 | 2025-11-25 |
Epigenetic conservation infers that colorectal cancer progenitors retain the phenotypic plasticity of normal colon
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24703-3
PMID:41266495
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和DNA甲基化分析探讨结直肠癌前体细胞是否保留正常结肠的表型可塑性 | 提出定量可塑性信号框架,将表观遗传变异性与基因表达变异性相关联 | 仅分析两个结直肠癌样本,样本量有限 | 研究结直肠癌进展过程中是否保留正常结肠的表型可塑性 | 结直肠癌组织和正常结肠组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 2个结直肠癌样本和多个外部单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2025-11-25 |
Machine learning-enhanced discovery of a basement membrane-related gene signature in glioblastoma via single-cell and Spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06918-0
PMID:41267067
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学结合机器学习方法,构建了胶质母细胞瘤中基底膜相关基因特征的风险模型 | 首次通过机器学习组合方法构建基底膜相关基因特征风险模型,并利用单细胞和空间转录组学验证其在胶质母细胞瘤中的表达特征 | 研究样本数量有限,仅包含四个队列的胶质母细胞瘤患者数据 | 探索胶质母细胞瘤与基底膜之间的分子关联,建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 二元分类机器学习 | 基因表达数据 | 四个患者队列,包含来自17名患者的42个独立验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1015 | 2025-11-25 |
Microplastic exposure elicits sex-specific atherosclerosis development in lean low-density lipoprotein receptor-deficient mice
2025-Nov-17, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109938
PMID:41275764
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研究论文 | 本研究探讨环境相关剂量微塑料暴露对低密度脂蛋白受体缺陷小鼠动脉粥样硬化发展的性别特异性影响 | 首次揭示微塑料暴露在非肥胖状态下对动脉粥样硬化发展的性别特异性效应,并通过单细胞RNA测序阐明其细胞机制 | 研究使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;样本量未明确说明 | 探究微塑料暴露对心血管系统的影响及其在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠的原代内皮细胞和人内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,体外细胞培养 | 动物模型 | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1016 | 2025-11-25 |
Immune cell-specific gene expression and its causal role in osteoporosis and bone mineral density: Insights from single-cell eQTL and GWAS data integration
2025-Nov-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045869
PMID:41239652
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研究论文 | 通过整合单细胞eQTL和GWAS数据,系统研究免疫细胞特异性基因表达与骨质疏松症风险的因果关系 | 首次在免疫细胞亚型水平上探索基因表达与骨质疏松症的因果关联,识别出7个关键基因 | 研究结果需要进一步实验验证,样本量可能限制统计功效 | 探究免疫细胞特异性基因表达在骨质疏松症发病机制中的因果作用 | 骨质疏松症患者和骨矿物质密度相关数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, Steiger方向性检验, 共定位分析 | 基因组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2025-11-25 |
Unraveling Traditional Chinese Medicine with single-cell RNA sequencing: Current applications and future frontiers
2025-Nov-13, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157556
PMID:41275745
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在中医药研究中的当前应用与未来发展方向 | 首次系统总结scRNA-seq技术在中医药多组分、多靶点机制解析和异质性证候研究中的桥梁作用 | 仅纳入截至2025年6月的研究,且排除了仅使用公共数据集进行数据挖掘的研究 | 探讨单细胞RNA测序技术在中医药研究中的应用价值与发展前景 | 中医药相关研究,包括肿瘤、炎症与自身免疫疾病、心脑血管疾病等领域 | 自然语言处理 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1018 | 2025-11-25 |
Ferroptosis and the cGAS-STING pathway into precision nano-immuno-theranostics: A mechanistic paradigm for reversing drug resistance in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-12, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101326
PMID:41275854
|
综述 | 探讨铁死亡与cGAS-STING通路在精准纳米免疫诊疗中的应用,作为逆转肝细胞癌耐药性的新策略 | 提出铁死亡与STING通路双向协同机制,将'冷'肿瘤转化为'热'治疗靶点,实现78-91%肿瘤抑制率 | 临床转化面临制造可扩展性、监管审批、生物标志物分层和长期安全性评估等挑战 | 开发克服肝细胞癌多药耐药性的精准纳米免疫诊疗平台 | 肝细胞癌及其耐药机制 | 精准医疗 | 肝细胞癌 | 空间转录组学,多组学分析 | NA | NA | 临床前模型数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1019 | 2025-11-25 |
Disease duration impacts intestinal gene expression profiles in Crohn's disease but not in ulcerative colitis
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf179
PMID:41063393
|
研究论文 | 本研究探讨疾病持续时间对克罗恩病和溃疡性结肠炎患者肠道基因表达谱的影响差异 | 首次系统比较疾病持续时间对两种主要炎症性肠病肠道转录组的不同影响,并识别出与疾病持续时间相关的共享基因特征和通路 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 理解克罗恩病和溃疡性结肠炎中疾病持续时间相关的肠道转录组变化 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠道组织 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | RNA测序,单细胞RNA测序,差异表达分析,通路分析 | NA | 基因表达数据 | MSCCR队列:498例CD患者和421例UC患者;SPARC IBD队列:777例CD患者和440例UC患者;单细胞RNA测序:18例CD患者 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1020 | 2025-11-25 |
Lateral plate mesoderm directs human amnion and ventral skin organoid formation
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.685987
PMID:41278640
|
研究论文 | 本研究通过调控细胞组成和信号环境,成功构建了模拟腹侧皮肤和人类羊膜组织的类器官模型 | 首次利用侧板中胚层祖细胞生成腹侧皮肤类器官,并通过信号调控将其重编程为羊膜样组织 | NA | 研究人类胚胎-胚外界面发育过程,为先天性皮肤和羊膜疾病提供新见解 | 人类皮肤类器官和羊膜样组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |