单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39398 篇文献,本页显示第 1001 - 1020 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1001 2026-05-04
IRF7 orchestrates maladaptive smooth muscle cell phenotype switching in atherosclerosis
2026-Mar, Precision clinical medicine IF:5.1Q1
研究论文 通过分析谱系追踪小鼠的单细胞RNA测序数据,发现IRF7是驱动动脉粥样硬化中平滑肌细胞向促炎性巨噬细胞样细胞转分化的关键转录因子,并验证了其在体内对斑块进展和稳定性的调控作用 首次揭示IRF7作为主转录调控因子,协调平滑肌细胞通过'干细胞-内皮-单核细胞'中间状态向促炎性巨噬细胞样亚群转化的恶性表型转换机制 未提及具体限制 阐明驱动动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞向致病状态(如巨噬细胞样细胞)转化的分子机制 平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转换及IRF7的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 谱系追踪小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1002 2026-05-04
stGrads: decoding spatial gene expression gradients through proximity-driven analysis in complex tissues
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出stGrads计算框架,通过邻近驱动分析解码复杂组织中的空间基因表达梯度 首次将空间邻近建模与基于衰减的信号传播相结合,在基因表达和细胞组成水平上表征特定细胞类型诱导的空间梯度 未明确说明局限性 开发一种通用且高效的计算工具,用于表征复杂组织环境中的空间相互作用和功能响应 多种空间转录组数据集中的组织样本 计算机视觉、机器学习 NA 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 多个空间转录组数据集(具体数量未说明) NA 空间转录组学 NA NA
1003 2026-05-04
Nanoparticle-Mediated PPAR Modulation of Macrophage Polarization in Radiation Enteritis: A Narrative Review
2026, Drug design, development and therapy
综述 本文探讨了巨噬细胞极化与PPAR信号在放射性肠炎中的分子机制,综述了PPAR靶向治疗及纳米递送策略 系统整合了放射性肠炎中PPAR调节巨噬细胞极化的分子机制、纳米递送技术和多组学方法,提出了精准纳米药物的开发方向 作为叙述性综述,缺乏原始实验数据验证,未对纳入文献进行系统性偏倚评估 阐明放射性肠炎中PPAR信号调控巨噬细胞极化的机制,并综述靶向治疗与纳米递送策略 放射性肠炎中的巨噬细胞和PPAR信号通路 机器学习 放射性肠炎 单细胞转录组学、空间组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1004 2026-05-04
Gut-Brain Axis Dysregulation in Inflammatory Bowel Disease: Implications for Coagulation Abnormalities and Extraintestinal Manifestations
2026, International journal of general medicine IF:2.1Q2
综述 探讨炎症性肠病中肠-脑轴失调对凝血异常及肠外表现的影响 提出通过整合多组学分析和人工智能辅助系统来管理IBD相关凝血功能障碍的新范式 缺乏严格随机对照试验的验证,肠-脑-肝轴对凝血的调控机制尚未阐明 阐明肠-脑轴在IBD相关凝血异常和肠外表现中的作用机制并探索新的管理策略 炎症性肠病(IBD)患者 机器学习 炎症性肠病 多组学分析,宏基因组学,代谢组学,单细胞转录组学 NA 宏基因组数据,代谢组数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1005 2026-05-04
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity IF:2.8Q3
研究论文 通过多组学整合策略,结合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据,开发机器学习预测模型,揭示狼疮性肾炎的关键细胞驱动因子和潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA-seq与大规模批量RNA-seq数据,利用非负矩阵分解定义免疫元程序,并通过CellChat解码细胞间通讯网络,开发基于先天免疫、昼夜节律等通路的399种机器学习预测模型 分子对接模拟仅提供结构基础,需进一步实验验证CYBB与地塞米松的相互作用 利用多组学方法阐明狼疮性肾炎的细胞和分子机制,并开发精准诊断模型 狼疮性肾炎患者的肾脏活检组织及批量RNA-seq队列数据 机器学习 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序、批量RNA-seq、非负矩阵分解、CellChat、分子对接 机器学习(399种模型) 单细胞转录组数据、批量转录组数据 单细胞RNA-seq样本及多个独立批量RNA-seq队列(具体样本量未说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1006 2026-05-04
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-02-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠的分泌细胞(潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞),发现黏蛋白2(MUC2)和MHC II分子的缺失导致小鼠对轮状病毒感染产生罕见的抵抗力 首次揭示杯状细胞产物MUC2与MHC II分子在轮状病毒易感性中的未知关联,并发现分泌细胞缺失可赋予小鼠罕见的抗感染能力 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类轮状病毒感染的机制;未明确MUC2和MHC II在抗病毒中的协同作用细节 探究肠道分泌细胞(尤其是杯状细胞)在轮状病毒感染发病机制中的作用 Atoh1条件性敲除小鼠(缺乏潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞)及MUC2或MHC II缺陷小鼠 分子生物学 轮状病毒感染 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 Atoh1条件性敲除小鼠模型、MUC2敲除小鼠模型、MHC II敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 多种基因修饰小鼠品系,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1007 2026-05-04
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 首次开发RAS剂量递增模型,揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型,并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 未明确说明局限性 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1008 2026-05-04
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱,发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞(OSCs),其具有高趋化活性,可招募间充质干细胞,参与骨重塑中的逆转阶段 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群(骨静细胞),并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力,揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验,骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制,探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 人皮质骨(正常、感染和重建状态)样本,以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 数字病理学, 机器学习 骨髓炎, 骨延迟愈合 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞转录组)、图像(免疫荧光、生物发光成像) 人皮质骨样本(具体数量未提及,包含正常、感染和重建三种状态),小鼠模型样本(正常骨折和骨髓炎骨折模型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1009 2026-05-04
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物,构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型,并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 未提及具体的局限性 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解,开发预后模型并识别新的治疗靶点 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS 机器学习 骨肉瘤 RNA测序、单细胞RNA测序 机器学习算法 RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 11例骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1010 2026-05-04
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 结合混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序方法(dual perturb-seq),高通量鉴定弓形虫效应蛋白并揭示其调控宿主细胞转录的机制 首次将混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序结合为dual perturb-seq技术,实现高通量鉴定病原体效应蛋白并直接从转录组数据推断其功能 方法在弓形虫特定效应蛋白的验证上仍有待进一步扩展至其他病原体系统 高通量鉴定细胞内病原体产生的、靶向宿主细胞转录的效应蛋白及其功能 弓形虫及其感染宿主细胞 数字病理学 弓形虫病 CRISPR敲除筛选、单细胞RNA测序、dual perturb-seq NA 单细胞转录组数据 弓形虫混合CRISPR敲除文库感染宿主细胞后的单细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1011 2026-05-04
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 利用单细胞测序技术探究轮状病毒感染后肠道上皮的细胞特异性修复机制及簇细胞的感染情况 首次发现轮状病毒感染可感染簇细胞,并揭示簇细胞通过干扰素相关通路应对病毒感染;同时发现特定细胞亚群增殖频率增加并伴随隐窝扩张和不成熟肠细胞增多 未阐明簇细胞感染在肠道修复中的具体功能角色,且仅基于轮状病毒模型,其他病原体相关修复机制需进一步验证 在单细胞水平上探索轮状病毒引起的肠道上皮损伤后再生修复的转录反应 轮状病毒感染的肠道上皮细胞(包括簇细胞、肠干细胞、不成熟肠细胞等特定亚群) 数字病理学 轮状病毒感染相关肠道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 轮状病毒感染小鼠的肠道上皮细胞样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1012 2026-05-03
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
research paper 通过血浆蛋白质组学鉴定TAOK3作为类风湿关节炎活动性的潜在生物标志物和新治疗靶点 首次发现TAOK3与活动性类风湿关节炎的骨破坏相关,并验证其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 研究样本量有限,功能研究主要在体外和动物模型中进行,需进一步临床验证 识别与活动性类风湿关节炎骨破坏相关的新型生物标志物和治疗靶点 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞、胶原诱导关节炎小鼠模型 machine learning 类风湿关节炎 蛋白质组学、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、多重免疫组化 NA 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 160例RA患者和40例健康对照,两个独立验证队列(N1=50, N2=10) NA NA NA NA
1013 2026-05-03
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调节全身炎症反应发挥保护作用 首次发现脑脊液接触核在脓毒症免疫调节中的关键作用,并通过单细胞RNA测序鉴定其调控系统性炎症的关键组分 未明确脑脊液接触核调控免疫下游的具体分子通路,且动物模型可能不完全反映人类脓毒症复杂性 探究脑脊液接触核在脓毒症中调控全身炎症的机制 脓毒症小鼠模型的脑脊液接触核 神经免疫学 脓毒症 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 化学遗传学 NA 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像, 细胞因子水平 脓毒症小鼠模型(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1014 2026-05-03
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 鉴定出一种CD57+CD8+ T细胞亚群,该亚群通过细胞毒性作用与系统性硬化症相关纤维化肺病相关联 首次发现并表征了CD57+效应记忆T细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中显著扩增,并明确其与CD155/CD226共刺激通路介导的细胞毒性功能之间的关联 未提及 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者外周血T细胞,以及独立患者肺组织样本 数字病理学 间质性肺病,系统性硬化症 单细胞RNA测序,免疫染色 NA 基因表达数据,组织图像 包括系统性硬化症伴间质性肺病患者、系统性硬化症不伴间质性肺病患者及对照个体的血液样本,以及独立患者的肺活检或外植体样本;同时分析多个间质性肺病队列的公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1015 2026-05-03
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-May, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 探讨衰老和癌症中细胞间通信的局部和全局空间视角,重点分析配体-受体相互作用和器官内及器官间通信推断工具 首次系统整合衰老和癌症转移过程中配体-受体相互作用,并综述器官内和器官间通信推断工具,揭示局部和全局通信机制对疾病进程的协同影响 未提供具体实验验证或定量分析,仅基于现有文献总结,缺乏对新通信轴线的实证数据支撑 阐明衰老和癌症进展中细胞间通信的动态变化及其在组织微环境重塑中的作用,探索潜在治疗靶点 衰老和癌症转移过程中的细胞间相互作用,包括器官内和器官间通信 单细胞与空间转录组学 衰老相关疾病、癌症 NA NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1016 2026-05-03
SPT6 maintains epidermal homeostasis by inhibiting an NF-κB-positive feedback loop to prevent excessive inflammation
2026-May, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 研究SPT6通过抑制RELA基因增强子来阻断NF-κB正反馈环路,维持表皮免疫稳态和防止过度炎症的机制 首次发现SPT6作为转录延伸因子,通过结合RELA基因增强子抑制NF-κB正反馈环路,在表皮干细胞和祖细胞中主动抑制促炎信号通路以维持免疫静息状态 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,需在人类皮肤疾病中进一步验证 探讨SPT6在表皮免疫稳态维持中的作用及其分子机制 表皮干细胞和祖细胞(EPSCs)、角质形成细胞 分子生物学 银屑病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 条件性敲除小鼠模型(K14-CreERT; Supt6) 单细胞转录组数据 条件性敲除小鼠(K14-CreERT; Supt6) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1017 2026-05-03
Plasma ceramide mediates the association of peripheral T cells with Alzheimer's disease
2026-May, Journal of advanced research IF:11.4Q1
research paper 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了阿尔茨海默病(AD)进展中外周T细胞亚群的动态变化,并发现血浆神经酰胺介导了CD4效应记忆(EM)T细胞与AD风险之间的关联 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和孟德尔随机化方法,揭示CD4 EM和CD8 CM T细胞通过神经酰胺代谢途径影响AD风险,并提出免疫代谢通路的新机制 研究主要基于小鼠模型和人群遗传数据,可能无法完全反映人类复杂疾病中的免疫-代谢相互作用,且神经酰胺介导效应仅占11.20%,其他潜在介质未充分探索 确定外周T细胞亚群对AD风险的因果贡献,并探究血液代谢物是否介导这种关联 阿尔茨海默病(AD)患者和APP/PS1小鼠模型中的T细胞亚群及血液代谢物 machine learning 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,流式细胞术,孟德尔随机化 NA 单细胞基因表达数据,流式细胞术数据,遗传变异数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
1018 2026-05-03
Lung-Targeted HGF mRNA Restores Alveolar Structure in Experimental Emphysema
2026-May-01, The European respiratory journal
研究论文 通过临床阶段SM92脂质纳米颗粒递送HGF mRNA,在实验性肺气肿模型中恢复肺泡结构 首次利用临床阶段SM92脂质纳米颗粒平台实现HGF mRNA的靶向肺部递送,并证明通过雾化和气管内滴注两种方式均能有效治疗肺气肿,通过激活肺泡II型细胞内源性修复通路 研究仅限于小鼠模型和患者来源肺类器官,临床转化性需进一步验证 评估HGF mRNA疗法在肺气肿治疗中的可行性和疗效 人类数据集、肺组织样本、弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型、患者来源肺类器官 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病,肺气肿 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、图像、文本 人类数据集和肺组织样本,以及弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型,具体数量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1019 2026-05-03
The role of CD34-high endothelial cells and FGF2 in vasa vasorum angiogenesis of Takayasu arteritis
2026-May-01, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 研究CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎血管外膜新生血管中的作用 首次在TAK患者主动脉壁中鉴定出CD34hi_ECs的显著扩增,并揭示FGF2-FGFR1轴可能介导TAK中的病理性血管新生 样本量较小,仅纳入3名TAK患者和3名对照进行scRNA-seq分析 探讨CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎病理性血管外膜新生血管及炎症进展中的作用 Takayasu动脉炎患者和健康对照者的主动脉组织和血清 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞因子微球阵列 NA 基因表达数据,图像数据 3名TAK患者和3名对照用于scRNA-seq和免疫组化,48名TAK患者和24名健康对照用于血清细胞因子测量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1020 2026-05-03
CD109 is associated with an immunosuppressive microenvironment and M2 macrophage polarization: pan-cancer analysis and functional validation
2026-May-01, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 通过泛癌分析及功能验证揭示了CD109与免疫抑制微环境和M2型巨噬细胞极化的关联 首次在泛癌水平系统评估CD109的表达、预后相关性及免疫调节作用,并结合单细胞RNA测序和体外功能验证阐明其与M2型巨噬细胞极化和免疫抑制微环境的关系 巨噬细胞相关功能效应仅在肺癌模型中验证,仍需在其他肿瘤类型中进一步研究 探讨CD109在多种癌症中的预后价值及其免疫调节作用 CD109基因及其在肿瘤免疫微环境中的角色 生物信息学 泛癌,非小细胞肺癌 RNA-seq,单细胞RNA测序,siRNA敲低,共培养实验,流式细胞术,qPCR,ELISA,迁移实验 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 GTEx和TCGA数据库中的多癌种样本,以及非小细胞肺癌队列的单细胞RNA测序样本 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部