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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-07-01 |
Airway epithelial heterogeneity and mucus plugging in asthmatic bronchioles
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202409-1849OC
PMID:40986379
|
研究论文 | 探讨哮喘细支气管上皮异质性与黏液栓形成的关系 | 首次通过空间转录组学和多重免疫表型分析揭示哮喘细支气管中MUC5AC高表达细胞生态位的异质性分布及其与上皮重塑的关系 | 样本量有限，研究仅针对严重哮喘和致死性哮喘患者，可能不适用于轻度或中度哮喘人群 | 验证哮喘细支气管存在上皮生物学紊乱导致MUC5AC主导的黏液栓形成的假说 | 严重哮喘、致死性哮喘患者及对照组的肺组织样本 | 空间转录组学, 数字病理学 | 哮喘 | 空间转录组学, RNA原位杂交, 免疫组化, 多重免疫表型分析, 细胞培养 | NA | 图像, 文本, 转录组数据 | 严重哮喘、致死性哮喘及对照组患者的肺组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析 |
| 1002 | 2026-07-01 |
Transcriptomic characters of cochlear vascular cells with pericyte-driven angiogenetic activity
2026-Jan-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8535400/v1
PMID:41646339
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析成年小鼠耳蜗血管细胞转录组特征，发现周细胞驱动的血管生成活性 | 首次揭示周细胞在耳蜗血管中具有尖端细胞转化能力，并定义了两类周细胞亚型的分子特征和空间分布 | 研究主要基于小鼠模型，且未在活体实验中验证周细胞向尖端细胞转化的功能意义 | 探究耳蜗血管细胞（内皮细胞和周细胞）的转录组特征及其在血管生成中的作用 | 成年小鼠耳蜗血管壁细胞（内皮细胞和周细胞） | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠耳蜗组织（具体样本量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1003 | 2026-07-01 |
Fibroblast-specific Deletion of Yap/Taz Impairs Mouse Postnatal Dermal Development by Suppressing Collagen Production and Deposition
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.19.700422
PMID:41648482
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研究论文 | 本研究通过成纤维细胞特异性敲除Yap/Taz基因，探究其在小鼠出生后真皮发育中通过抑制胶原蛋白合成和沉积所起的关键作用 | 首次揭示Yap/Taz在真皮成纤维细胞细胞外基质调控中的重要作用，并利用RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学方法深入阐明其分子机制 | 未明确描述研究的局限性 | 探究Hippo通路效应因子YAP和TAZ在出生后皮肤真皮发育及细胞外基质稳态调控中的作用 | 小鼠出生后皮肤真皮及成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | Yap/Taz条件性敲除小鼠皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1004 | 2026-07-01 |
Macrophage Niche Reconstitution Reveals Dynamic Transcriptional and Communication Networks Renal Macrophage-Epithelial Communication
2026-Jan-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8467072/v1
PMID:41646422
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研究论文 | 通过诱导性细胞消融模型和单细胞RNA测序，揭示肾脏驻留巨噬细胞生态位再生过程中巨噬细胞-上皮细胞的动态转录和通信网络 | 首次利用诱导性hCD59中间溶素消融系统实现肾脏驻留巨噬细胞的快速特异性清除，并结合纵向单细胞RNA测序和整合分析，揭示巨噬细胞再生过程中的瞬时损伤适应转录程序及Spp1/骨桥蛋白的关键作用 | 未明确提及但可能包括：模型为小鼠急性消融，与人类病理生理的相关性需进一步验证；功能验证仅针对Spp1，其他关键信号通路的体内功能有待深入探索 | 阐明肾脏驻留巨噬细胞在急性消融后生态位再生的细胞和分子机制，特别是上皮-免疫互作如何协调巨噬细胞补充 | 小鼠肾脏驻留巨噬细胞及其与上皮细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,诱导性细胞消融 | 无特定模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本，基线及消融后第1、3、7天 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1005 | 2026-07-01 |
SegJointGene: joint cell segmentation and spatial gene prioritization by information entropy guided convolutional neural networks
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698474
PMID:41542426
|
研究论文 | 提出了SegJointGene，一种信息熵引导的卷积神经网络框架，用于同时进行细胞分割和空间基因优先级排序 | 创新性地将分子信息（基因或蛋白表达）整合到细胞分割中，并设计了信息熵引导的卷积神经网络和计算信息丢弃评分，用于识别对细胞类型特异性分割重要的基因 | 没有明确提及限制，但可能依赖于核染色和分子数据的整合，计算上仍有挑战 | 开发一种深度学习方法，通过整合核染色图像与空间基因或蛋白表达数据，实现细胞分割和空间基因优先级排序的联合优化 | 小鼠海马体、全脑不同区域的空间转录组数据，以及人类扁桃体的空间蛋白质组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 卷积神经网络 | 图像 | 小鼠海马体、全脑不同区域和人类扁桃体样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2026-07-01 |
A Metastasis-competent CAF Subpopulation Defined by MFAP5⁺THY1⁺ Co-expression Drives Prostate Cancer Metastasis via EMT Activation
2026, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据，鉴定并功能表征了由MFAP5⁺THY1⁺共表达定义的前列腺癌转移能力相关成纤维细胞（CAF）亚群，其通过激活AKT/EMT通路促进转移 | 首次鉴定MFAP5⁺THY1⁺共表达的CAF亚群作为前列腺癌转移能力的关键驱动者，并发现THY1作为空间锚点促进MFAP5检测，将CAF异质性与临床预后风险联系起来 | 需要在多中心队列中进一步验证其临床独立性 | 鉴定和功能表征前列腺癌中具有转移能力的CAF亚群，并评估其作为预测转移进展的生物标志物的潜力 | 前列腺癌患者肿瘤微环境中的成纤维细胞（CAFs） | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个前列腺癌标本中的1214个CAFs，以及78个组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1007 | 2026-07-01 |
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-01, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70123
PMID:41577652
|
研究论文 | 开发了一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术，实现靶向大分子递送和体内功能研究 | 开发了一种微创、原位的小鼠小肠注射技术，绕过胃部屏障实现局部肠腔递送，并能递送功能性蛋白TAT-EGFP至肠上皮细胞，传统口服灌胃无法实现 | 未明确提及局限性，但可能包括侵入性操作带来的潜在影响及小鼠与人类之间的物种差异 | 开发并验证一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术，以规避胃部降解，实现靶向大分子递送和体内功能研究 | 小鼠小肠及其肠上皮细胞 | 其他（体内药物递送技术） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠上皮细胞的单细胞RNA测序 |
| 1008 | 2026-07-01 |
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-12, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202501-0217OC
PMID:40758632
|
research paper | 通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎的外周免疫全景 | 首次构建了涵盖不同严重程度细菌性肺炎患者外周血免疫细胞的单细胞转录组图谱，并系统揭示了疾病严重程度相关的免疫细胞重塑机制，如经典单核细胞对细胞因子风暴的调控、CD8 T细胞衰竭及体液免疫的作用 | 未提及具体局限性 | 解析细菌性肺炎发病和免疫应答机制中驱动疾病严重程度的关键细胞和分子因素，为免疫调节治疗提供潜在靶点 | 100名个体的外周血免疫细胞，包括39名重症、31名轻度和30名健康对照 | single-cell genomics | bacterial pneumonia | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100份外周血样本（39名重症、31名轻症、30名健康对照） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1009 | 2026-07-01 |
SMURF: soft-segmentation for single-cell reconstruction and topological analysis of spatial transcriptomic data
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656357
PMID:40502153
|
研究论文 | SMURF是一种用于空间转录组数据单细胞重建和拓扑分析的软分割算法 | 提出了一种跨平台的软分割算法SMURF，不仅能准确将mRNA分配到单个细胞，还能将复杂组织结构投影到笛卡尔坐标上，揭示细胞类型组织和基因表达梯度 | NA | 开发一种新的计算方法，用于高分辨率空间转录组数据中准确将转录本分配到单个细胞，并分析复杂组织结构 | 空间转录组数据中的单个细胞和组织架构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 软分割算法 | 图像与空间转录组数据 | 跨多个组织和平台的多重样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1010 | 2026-07-01 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-11, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
|
研究论文 | 评估奥克雷珠单抗治疗复发缓解型多发性硬化症期间B细胞亚群的早期变化，特别是对IgA B细胞的保留作用 | 首次通过光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示奥克雷珠单抗治疗在保留IgA B细胞的同时导致B细胞功能持久损伤，并发现治疗后B细胞恢复呈现炎症和迁移表型 | 样本量较小（18名患者和10名健康志愿者），停药后B细胞重建分析仅3例患者 | 探究奥克雷珠单抗在多发性硬化症中的作用机制及疾病病理生理学 | 复发缓解型多发性硬化症患者和健康志愿者 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据，基因表达数据 | 18名患者（治疗前后及停药后），10名健康志愿者，3名停药患者（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1011 | 2026-07-01 |
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679856
PMID:41256671
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研究论文 | 通过纵向分析揭示NDMA诱导的DNA甲基化损伤导致肝癌的早期分子事件，包括持续的干扰素信号和克隆扩增 | 首次通过纵向多组学分析（表型组、转录组、磷酸化蛋白质组）描绘NDMA暴露后从早期DNA损伤响应到数月后肝癌发生的完整分子级联事件，并发现持续的干扰素信号作为主导激活通路与克隆扩增相关 | 未明确提及局限性，但可能包括小鼠模型与人类的差异、单一致癌物暴露场景的局限性 | 阐明NDMA诱导肝癌进展的分子机制，识别早期生物标志物和疾病缓解策略 | 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 磷酸化蛋白质组学, 转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | 未明确样本数量，涉及野生型和MGMT缺陷小鼠的纵向分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1012 | 2026-07-01 |
spammR: an R package designed for analysis and integration of spatial multi-omic measurements
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672472
PMID:40909542
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研究论文 | 提出了一个用于分析和整合空间多组学测量的R包spammR，特别针对质谱衍生数据 | spammR专注解决质谱空间组学数据的小样本量、空间稀疏性和高缺失率问题，采用完全数据驱动方法，无需先验知识 | 目前主要针对质谱衍生空间组学数据，在其他平台适用性有待验证 | 开发一个通用的空间多组学分析工具，填补质谱空间组学数据分析工具的空白 | 空间多组学测量数据，包括转录本、蛋白质、代谢物和翻译后修饰的空间分布 | 机器学习 | NA | 质谱成像 | NA | 空间组学数据（质谱成像数据） | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
| 1013 | 2026-07-01 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in a mouse model of ALS
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.21.671404
PMID:40909710
|
研究论文 | 通过对SOD1-G93A ALS小鼠模型的脊髓运动神经元进行纵向单核转录组和染色质可及性分析，揭示了运动神经元退化和选择性易感性的分子决定因素，发现了一种新的疾病相关运动神经元状态（DAMNs） | 首次识别出ALS中易感运动神经元的一种新型细胞状态“疾病相关运动神经元”（DAMNs），并揭示了驱动健康细胞向该状态转变的转录因子调控网络，同时利用空间转录组学发现疾病早期反应性胶质细胞与运动神经元的空间邻近性 | 基于小鼠模型，人类对应基因组区域与ALS遗传风险变异的相关性仍需进一步验证 | 理解ALS中运动神经元退化和选择性易感性的分子机制 | SOD1-G93A ALS小鼠模型的脊髓运动神经元（特别是易感的α运动神经元和抵抗性亚型） | 机器学习, 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | 转录因子调控网络模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | SOD1-G93A ALS小鼠模型在多个时间点的脊髓组织样本（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序和ATAC测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1014 | 2026-07-01 |
A single-cell transcriptomic atlas of the pigtail macaque placenta in late gestation
2025-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.15.669966
PMID:40894803
|
研究论文 | 构建了妊娠晚期猪尾猕猴胎盘的单细胞转录组图谱 | 首次构建了猪尾猕猴胎盘三个组织（绒毛膜绒毛、羊膜绒毛膜和母体蜕膜）的单细胞RNA-Seq图谱，并揭示了与人类胎盘高度相似的细胞组成 | 未明确说明局限性 | 比较非人灵长类与人类胎盘在单细胞水平上的细胞类型和功能相似性 | 妊娠晚期猪尾猕猴母胎界面的三个组织：绒毛膜绒毛、羊膜绒毛膜和母体蜕膜 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA-Seq文库构建及Seurat数据分析流程 |
| 1015 | 2026-07-01 |
Molecular Subtypes and Risk Prediction Model Based on Malignant Cell Differentiation Trajectories in Breast Cancer
2025-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70680
PMID:40778650
|
研究论文 | 基于乳腺癌恶性细胞分化轨迹构建分子亚型及风险预测模型 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组和大量RNA测序数据，首次基于恶性细胞分化轨迹构建乳腺癌分子分型系统（四种亚型）并建立预后模型，同时识别骨转移相关调控网络和潜在药物 | 预后模型的准确性中等（AUC=0.708），可能需要更多独立验证 | 揭示乳腺癌恶性细胞分化轨迹与分子异质性，构建新的分子分型系统和预后预测模型 | 乳腺癌（BRCA）患者的肿瘤组织样本，包括TCGA-BRCA队列的1097个大量RNA测序样本、单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、大量RNA测序、UMAP分析、Monocle 2伪时间分析、LASSO回归 | Cox比例风险模型、LASSO回归模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 1097个TCGA-BRCA大量RNA测序样本，2493个恶性斑点（空间转录组），单细胞RNA测序样本数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学 |
| 1016 | 2026-07-01 |
The Key Role of COA6 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Metabolic Reprogramming and Regulation of the Immune Microenvironment
2025-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70685
PMID:40596639
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研究论文 | 研究了COA6在胰腺导管腺癌中的代谢重编程及免疫微环境调节作用 | 首次通过SMR/HEIDI分析结合多数据库识别COA6为PDAC关键基因，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建细胞相互作用网络 | 需要进一步研究开发靶向COA6的疗法 | 探索COA6在胰腺导管腺癌代谢重编程和免疫微环境调节中的作用及治疗潜力 | 胰腺导管腺癌细胞系SW1990和PANC-1 | 机器学习和数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | SMR/HEIDI分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、药物预测与分子对接 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | SW1990和PANC-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1017 | 2026-07-01 |
Global Thyroid Cancer Patterns and Predictive Analytics: Integrating Machine Learning for Advanced Diagnostic Modelling
2025-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70676
PMID:40596746
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法，分析甲状腺癌的分子特征并验证诊断标志物，以促进早期检测和靶向治疗开发 | 结合单细胞转录组学和计算诊断算法（如Ridge、Lasso惩罚回归模型），揭示以骨髓细胞为中心的通讯网络在甲状腺癌发展中的关键作用 | 需要在前瞻性、多样化的患者群体中进行验证以确认临床实用性并优化实施策略 | 探究甲状腺癌的分子发病机制并验证诊断标志物 | 甲状腺癌标本及其非恶性相邻组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学、定量PCR、ELISA | Ridge回归、Lasso回归 | 基因表达数据、转录组数据、细胞因子浓度数据 | GSE27155外部验证数据集及其他甲状腺癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高分辨率单细胞转录组学 |
| 1018 | 2026-07-01 |
Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy
2025-06-04, Neuroreport
IF:1.6Q4
DOI:10.1097/WNR.0000000000002168
PMID:40298633
|
研究论文 | 结合孟德尔随机化与单细胞测序数据，分析趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的作用和潜在调控机制 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据结合，系统评估趋化因子受体相关基因与癫痫的因果关系，并鉴定关键基因及潜在治疗药物 | 样本量可能有限，且研究基于公开数据集，需进一步验证关键基因和免疫细胞在癫痫中的功能 | 探索趋化因子和趋化因子受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制 | 趋化因子受体相关基因及癫痫患者单细胞数据中的细胞类型 | 机器学习 | 癫痫 | RNA-seq | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量，但涉及六种细胞簇的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1019 | 2026-07-01 |
Machine Learning-Assisted Analysis of the Oral Cancer Immune Microenvironment: From Single-Cell Level to Prognostic Model Construction
2025-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70637
PMID:40457149
|
研究论文 | 利用机器学习方法结合单细胞测序数据分析口腔癌免疫微环境，构建免疫浸润预测模型以指导个性化治疗和预后评估 | 将单细胞测序与多种机器学习算法（Lasso回归、随机森林、梯度提升机）联合应用，深入解析口腔癌免疫微环境异质性并构建可靠的预后模型 | 未明确说明外部验证集的规模及模型在真实临床场景中的应用验证，且C-index仅提供于补充材料中，正文缺乏具体数值 | 构建基于免疫浸润的口腔癌预后预测模型，为个性化治疗和预后评估提供理论依据 | 口腔癌患者的临床基因组数据和单细胞测序数据 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞测序 | Lasso回归、随机森林、梯度提升机 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1020 | 2026-07-01 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微观与宏观状态的演变 | 建立理论框架解释离散疾病表型在单细胞尺度隐藏但在宏观水平清晰显现的机制，利用状态转移理论揭示细胞类型特异性贡献 | 未明确提及 | 阐明单细胞数据中离散疾病定义状态的形成机制 | 慢性髓系白血病（CML）进展模型 | 自然语言处理 | 白血病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |