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当前共找到 34772 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-12-19 |
scPlantLLM: A Foundation Model for Exploring Single-cell Expression Atlases in Plants
2025-07-11, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024
PMID:40094454
|
研究论文 | 本文开发了一个名为scPlantLLM的Transformer基础模型，用于处理和分析植物单细胞RNA测序数据，以解决批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战 | 开发了首个针对植物单细胞数据的Transformer基础模型，采用包含掩码语言建模和细胞类型注释任务的顺序预训练策略，在零样本学习场景下实现了高达0.91的准确率 | 模型主要基于拟南芥数据集进行验证，在其他植物系统中的泛化能力有待进一步评估 | 开发一个先进的计算模型，以解决植物单细胞RNA测序数据分析中的关键挑战，包括批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断 | 植物单细胞RNA测序数据，特别是拟南芥的单细胞表达图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | 数百万个植物单细胞数据点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2025-12-19 |
Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes
2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426339122
PMID:40526717
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Sp140L是一种疱疹病毒限制因子，能抑制病毒转录并激活干扰素刺激基因 | 首次揭示Sp140L作为疱疹病毒限制因子，并发现其连接病毒DNA感知与转录抑制至干扰素非依赖性先天免疫反应 | 研究主要基于EBV感染的B细胞模型，其他细胞类型或体内环境的适用性需进一步验证 | 探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制，并鉴定新的宿主限制因子 | EBV感染的B细胞及疱疹病毒Saimiri的ORF3蛋白 | 单细胞组学 | 病毒感染（EBV相关疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EBNA-LP敲除（LPKO）感染的B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1003 | 2025-12-19 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了THY-Tau22小鼠模型中tau蛋白病的性别和年龄依赖性转录组变化 | 首次在THY-Tau22小鼠模型中系统揭示了tau蛋白病相关的性别特异性转录组变化及其年龄依赖性演化 | 研究仅基于小鼠模型，人类数据的验证有限，且样本年龄点较少 | 探究阿尔茨海默病相关tau蛋白病中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性及年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1004 | 2025-12-19 |
Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model
2025-Apr-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052024
PMID:40114603
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，揭示了人类常染色体显性多囊肾病（ADPKD）肾脏中微血管异常的早期特征，并在Pkd1突变小鼠模型中验证了这些发现 | 首次结合单细胞转录组学、几何拓扑分析和动脉自旋标记磁共振成像，系统描述了ADPKD肾脏微血管异常的分子特征和时空动态，并证实其在人类和小鼠模型中的一致性 | 研究主要基于晚期人类ADPKD样本和Pkd1突变小鼠模型，可能无法完全反映疾病早期阶段的血管变化，且样本量有限 | 探究ADPKD肾脏微血管异常的发病机制和早期特征，为血管靶向治疗提供依据 | 人类ADPKD肾脏组织、Pkd1突变小鼠的肾脏（包括出生后和胎儿期） | 数字病理学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞转录组学、三维成像、几何拓扑分析、分形分析、多模态磁共振成像、动脉自旋标记 | Pkd1突变小鼠模型 | 转录组数据、图像数据、磁共振成像数据 | 人类ADPKD肾脏样本（晚期囊性病理和排泄功能衰竭）、Pkd1突变小鼠肾脏样本（出生后和胎儿期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1005 | 2025-12-19 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
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综述 | 本文综述了T细胞受体（TCR）测序技术、计算工具及多样性指标，以解析免疫库在健康和疾病中的动态 | 整合了高通量测序技术与计算工具，用于TCR库的聚类、特异性预测及多样性分析，推动个性化免疫治疗 | NA | 综述T细胞受体测序技术、计算工具及多样性指标，以促进免疫库在疾病和治疗中的研究 | T细胞受体（TCR）库 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1006 | 2025-12-18 |
Magnifying Glass on Sinonasal NUT Carcinoma Heterogeneity via Spatial Transcriptomics
2026-Jan, Head & neck
DOI:10.1002/hed.28231
PMID:40621801
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索了鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 | 首次将空间转录组学应用于罕见的鼻窦NUT癌，揭示了肿瘤内和肿瘤间的细胞类型多样性 | 样本量较小（仅3例），行为相关性仅为推测性 | 通过空间转录组学分析鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 | 3例鼻窦NUT癌的福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 数字病理学 | 鼻窦NUT癌 | 空间转录组学测序 | 图神经网络 | 空间转录组数据 | 3例鼻窦NUT癌组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium Spatial Gene Expression分析 |
| 1007 | 2025-12-18 |
Contribution of S1pr1 -featured astrocyte subpopulation to cisplatin-induced neuropathic pain in male mice
2026-Jan-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003780
PMID:40899794
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了顺铂诱导的神经病理性疼痛中S1pr1高表达星形胶质细胞亚群的作用及其与Wnt信号通路的关联 | 首次在顺铂诱导的神经病理性疼痛模型中，利用单细胞转录组学识别出S1pr1高表达星形胶质细胞亚群，并发现其通过Wnt信号通路（特别是FGFR3）介导疼痛机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及雌性动物或人类样本，可能限制结果的普适性 | 探究顺铂诱导的神经病理性疼痛（CIPN）中S1PR1下游的分子机制 | 雄性小鼠脊髓组织 | 单细胞转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但基于雄性小鼠脊髓单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1008 | 2025-12-18 |
Current Knowledge and Future Directions for Cyclospora cayetanensis Research and Its Surrogates
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70327
PMID:41347294
|
综述 | 本文回顾了环孢子虫的当前研究现状，包括其发生、传播、检测方法、宿主-寄生虫相互作用、遗传学和补救策略，并评估了使用替代生物来填补研究空白 | 评估了替代生物在环孢子虫研究中的应用，并探讨了新兴工具如宏基因组学、单细胞测序和AI驱动的生物信息学在克服研究障碍方面的潜力 | 替代生物无法完全复制环孢子虫的生物学特性，限制了基于替代研究的可转化性，且基因组组装存在空白，限制了系统发育和功能分析 | 提高环孢子虫的检测能力、风险评估并指导政策制定，以减轻环孢子虫病的公共卫生负担 | 环孢子虫及其替代生物（如艾美球虫和隐孢子虫） | NA | 环孢子虫病 | 分子检测、宏基因组学、单细胞测序、AI驱动的生物信息学 | NA | 基因组数据、环境样本数据、食品样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1009 | 2025-12-18 |
A New Orthotopic Mouse Model of Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan, Head & neck
DOI:10.1002/hed.70001
PMID:40785350
|
研究论文 | 本研究建立了一种新型且可重复的喉鳞状细胞癌原位小鼠模型，用于促进喉癌相关研究 | 开发了一种新型原位小鼠模型，能更真实地模拟人体免疫系统反应和肿瘤生物学演化过程 | NA | 建立喉鳞状细胞癌的原位小鼠模型，以研究喉癌的分子机制 | C57BL/6小鼠（n=16）和喉癌患者样本 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序，磁共振成像，光学体内三维成像，HE染色 | NA | 图像，测序数据 | 16只小鼠，15例成功模型，以及喉癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1010 | 2025-12-18 |
Exploring Single-Cell and Multi-Omics Technologies and Their Role in Unravelling Tumor Heterogeneity of Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-17, Journal of liver cancer
DOI:10.17998/jlc.2025.11.29
PMID:41402037
|
综述 | 本文综述了单细胞和多组学技术在揭示肝细胞癌肿瘤异质性中的变革性作用 | 强调了单细胞和空间组学技术如何通过高分辨率分析重塑HCC研究，推动生物标志物、治疗靶点和患者分层策略的发现 | 高成本、技术要求高以及可及性有限，特别是在资源有限的环境中，是其广泛应用的主要障碍 | 探讨单细胞和多组学技术在解析肝细胞癌肿瘤异质性中的作用 | 肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、表观基因组学、多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1011 | 2025-12-18 |
NAMPT inhibition uncovers therapeutic vulnerabilities to venetoclax and chemotherapy in acute myelogenous leukemia
2025-Dec-16, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2025.2571199
PMID:41401031
|
研究论文 | 本研究揭示了抑制NAMPT可增强AML细胞对venetoclax和化疗药物的敏感性 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了NAMPT抑制诱导BCL2适应性上调的生存机制，并提出了NAMPT与BCL2双重抑制的协同治疗策略 | 研究为临床前实验，尚未在临床试验中验证其安全性和有效性 | 探索NAMPT抑制在急性髓系白血病治疗中的潜在作用及联合治疗策略 | 急性髓系白血病细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, BH3分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1012 | 2025-12-18 |
Decreased scleral Wnt5ahi fibroblasts exacerbate myopia progression by disrupting extracellular matrix homeostasis in mice
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67246-x
PMID:41402314
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠巩膜中Wnt5a高表达成纤维细胞减少与形觉剥夺性近视进展的关联，并发现Wnt5a信号通路通过调控Sparc基因影响细胞外基质稳态 | 首次在单细胞水平上鉴定出巩膜中Wnt5a高表达成纤维细胞亚群，并阐明其通过Wnt5a-Sparc轴调控胶原蛋白稳态在近视进展中的关键作用 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；实验基于AAV介导的基因敲低，可能无法完全模拟生理条件下的基因功能 | 探究巩膜成纤维细胞表型异质性与形觉剥夺性近视发病机制的关联 | 雄性小鼠的巩膜组织 | 单细胞组学 | 近视 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性小鼠巩膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1013 | 2025-12-18 |
Comprehensive snRNA-Seq Datasets of Human and Mouse Podocytopathy Integrated with GWAS of Microalbuminuria
2025-Dec-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06427-1
PMID:41402390
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研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠足细胞病的单核RNA测序数据集与微量白蛋白尿的全基因组关联研究，生成了足细胞损伤相关的单细胞分辨率肾脏图谱，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次生成了人类和小鼠足细胞病的全面单细胞分辨率肾脏图谱，并结合GWAS数据识别与足细胞损伤相关的潜在治疗靶点 | 足细胞捕获在单细胞测序中仍有限制，可能导致数据集的不完整性 | 研究足细胞损伤在肾小球疾病中的作用，并探索与微量白蛋白尿相关的分子机制和治疗靶点 | 人类足细胞病患者肾脏组织和小鼠足细胞损伤模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单核RNA测序（snRNA-Seq），全基因组关联研究（GWAS） | NA | 单细胞RNA测序数据，GWAS数据 | 人类五种类型足细胞病的肾脏组织样本，以及两种小鼠足细胞损伤模型 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 1014 | 2025-12-18 |
Transgelin defines pro-tumorigenic cancer-associated fibroblasts in pancreatic cancer
2025-Dec-16, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03299-5
PMID:41402556
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了胰腺癌中肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的异质性，并识别出转胶蛋白作为促肿瘤进展的关键介质 | 首次结合scATAC-seq和scRNA-seq在KPC小鼠模型中系统表征myCAF的异质性，并发现TAGLN表达与不良预后相关，为靶向治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；TAGLN的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的功能角色 | KPC小鼠胰腺组织及TCGA数据库中的PDAC样本 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞染色质可及性数据、单细胞转录组数据 | KPC小鼠胰腺组织（具体数量未明确）及TCGA人类PDAC样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1015 | 2025-12-18 |
Single-cell analysis indicating CCR8 modulates CD8+ tissue-resident memory T cells to attenuates rejection in transplantation
2025-Dec-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-32785-2
PMID:41402575
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CCR8在调节CD8+组织驻留记忆T细胞中的作用，并探索了其作为减轻移植排斥新靶点的潜力 | 首次在移植排斥背景下，通过单细胞RNA测序等技术，揭示了CCR8对CD8+ TRM细胞积累和功能的调控作用，并阐明了其通过破坏巨噬细胞-T细胞相互作用来减轻排斥的机制 | 研究主要基于小鼠皮肤移植模型，其在人类器官移植中的直接适用性仍需进一步验证；CCR8靶向治疗的具体临床转化路径和潜在副作用尚未明确 | 探究CCR8在移植排斥过程中对CD8+组织驻留记忆T细胞的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | CD8+组织驻留记忆T细胞、CCR8趋化因子受体、皮肤移植模型中的免疫细胞相互作用 | 单细胞组学、免疫学 | 移植排斥 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠皮肤移植模型的多时间点分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1016 | 2025-12-18 |
Integrating RNA-seq and Single-Cell RNA-seq to Uncover Transcriptional Signature of Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11310-0
PMID:41402612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1017 | 2025-12-18 |
Characterization of T cell markers in endometrial carcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04289-y
PMID:41402657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定子宫内膜癌中的T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个八基因预测模型，用于预测患者预后、免疫治疗反应和药物敏感性 | 利用单细胞RNA测序数据识别T细胞标记基因，并首次基于这些基因构建了一个高精度的子宫内膜癌预后预测模型，该模型与免疫功能和治疗反应相关 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 构建基于T细胞标记基因的子宫内膜癌预后预测模型，并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | RNA测序数据, 临床数据 | 544名子宫内膜癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1018 | 2025-12-18 |
Establishment of a novel brainstem ischemic dysphagia model: single-cell sequencing reveals the molecular mechanisms underlying mPES intervention
2025-Dec-16, Journal of neuroengineering and rehabilitation
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12984-025-01841-3
PMID:41402839
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研究论文 | 本研究通过建立一种新型脑干缺血性吞咽困难大鼠模型，并利用单细胞转录组学探索改良咽部电刺激治疗的分子机制 | 首次创建了脑干缺血诱导的吞咽困难动物模型，相比传统的皮质卒中模型更贴近临床实际，并应用单细胞测序技术揭示了mPES治疗的潜在分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证；单细胞测序结果仅为相关性分析，缺乏直接的机制验证实验 | 建立新型脑干缺血性吞咽困难动物模型并探索改良咽部电刺激的治疗机制 | 大鼠脑干缺血模型 | 数字病理学 | 脑卒中后吞咽困难 | 单细胞转录组测序，MRI，病理学检查，视频荧光吞咽研究 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据，行为学数据 | 未明确说明具体样本数量的大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2025-12-18 |
A proteogenomic gene signature defines prognostic subgroups highlighting PI3K/AKT/mTOR signaling pathway as a therapeutic vulnerability in myeloid malignancies
2025-Dec-16, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02568-3
PMID:41402890
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研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和基因组学数据，开发了一个预后基因签名，用于风险分层，并识别了PI3K/AKT/mTOR信号通路作为髓系恶性肿瘤的治疗脆弱性 | 利用双向孟德尔随机化分析确立MPN为AML的前体，整合血浆蛋白质组学数据识别风险介质，并开发了一个新的预后蛋白质基因组基因签名 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步的前瞻性验证；单细胞RNA测序数据仅作为补充证据，未进行深入功能验证 | 探索髓系恶性肿瘤（如AML和MPN）的转化机制、预后因素及治疗靶点 | 急性髓系白血病（AML）、骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者及细胞系模型 | 生物信息学 | 髓系恶性肿瘤 | 双向孟德尔随机化分析、血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、药物基因组学分析 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | BEAT-AML队列和TCGA-LAML队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1020 | 2025-12-18 |
POU5F1 upregulates SPP1 to sustain stem-like traits and malignant phenotypes via JAK1/STAT3 in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004469
PMID:41403335
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研究论文 | 本研究揭示了POU5F1通过上调SPP1并激活JAK1/STAT3信号通路，维持透明细胞肾细胞癌的干细胞样特性和恶性表型 | 首次系统验证了POU5F1-SPP1-JAK1/STAT3轴在ccRCC中的作用机制，为同时靶向肿瘤细胞和癌症干细胞提供了新的治疗策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本量有限（30对组织），需要更大规模的临床验证 | 探究SPP1在透明细胞肾细胞癌中的功能及其上游调控机制 | 透明细胞肾细胞癌组织样本（30对）、786-O/769-P细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq、功能实验（增殖、迁移、肿瘤球形成）、分子机制研究（ChIP、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测）、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床生存数据 | 30对ccRCC组织样本、2种细胞系（786-O/769-P）、裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |