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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-06-05 |
Heterogeneity and dynamics of DENV-specific CD8 + T cells in dengue infection
2026-Jun-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73491-5
PMID:42236711
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的异质性和动态变化,揭示不同疾病严重程度相关的细胞亚群 | 首次利用HLA四聚体结合单细胞RNA测序,系统描绘了DENV特异性CD8+ T细胞在登革感染中的表型异质性,并发现与疾病严重程度相关的特定细胞亚群和转录组特征 | NA | 探究DENV特异性CD8+ T细胞的表型异质性如何与登革疾病严重程度相关 | DENV特异性CD8+ T细胞,通过HLA四聚体从登革患者外周血中识别 | 单细胞组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于板的单细胞RNA测序(plate-based single-cell RNA sequencing) |
| 1002 | 2026-06-05 |
privateST: a feasible framework for privacy-preserving spatial transcriptomics prediction from histopathology images
2026-Jun-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55961-4
PMID:42236846
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研究论文 | 提出一种基于同态加密的隐私保护框架,用于从组织病理学图像预测空间转录组学 | 首次将同态加密应用于空间转录组学预测,通过下采样、辅助基因集预测和架构调整实现隐私保护下的高精度预测任务 | 输入图像经下采样后分辨率降低,可能影响空间信息的精细捕捉;仅验证100个目标基因的场景 | 实现跨机构数据共享时保护隐私的空间转录组学预测 | 空间转录组学预测模型及组织病理学图像 | 数字病理学、隐私保护机器学习 | 一般性肿瘤研究(未指定具体疾病) | 空间转录组学预测 | 改进的ResNet-18架构 | 组织病理学图像 | 未明确说明样本数量(间接涉及100个目标基因和150个辅助基因) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1003 | 2026-06-05 |
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jun-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02316-x
PMID:42237030
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研究论文 | 该研究通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选,为中脑和后脑类器官工程提供指导 | 结合单细胞转录组和可及染色质测序,构建多组学图谱,并通过多重筛选揭示形态发生素对类器官模型的扩展作用 | 未明确提及其局限性 | 绘制中脑和后脑类器官的细胞组成和调控机制,并筛选形态发生素以改进模型 | 中脑和后脑类器官模型中的细胞类型及调节机制 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序和可及染色质测序 | NA | 转录组和染色质数据 | 涉及中脑和后脑类器官模型中的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1004 | 2026-06-05 |
Dopamine inhibits retinal pathological neovascularization in the oxygen-induced retinopathy mouse model
2026-Jun-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70080
PMID:42237060
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研究论文 | 通过氧气诱导视网膜病变小鼠模型,研究多巴胺抑制视网膜病理性新生血管的机制 | 首次整合单细胞RNA测序与Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠模型,揭示多巴胺通过Müller细胞中Drd2信号调控HIF-α和VEGF-A合成,从而抑制病理性血管生成的机制 | NA | 探究多巴胺及其受体在视网膜病理性新生血管中的作用机制 | 氧气诱导视网膜病变小鼠模型及Müller细胞特异性Drd2基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 1005 | 2026-06-05 |
CIITA/PRMT5 promote CD4+Gzma+ T cell activation via H3R2me2-mediated endothelial expression of MHC class II in smoking-induced atherosclerosis
2026-Jun-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04975-w
PMID:42237295
|
研究论文 | 该研究揭示了吸烟通过CIITA/PRMT5介导的H3R2me2修饰促进内皮细胞MHC II表达,进而激活CD4+Gzma+ T细胞从而加剧动脉粥样硬化进展的免疫机制 | 首次发现CIITA与PRMT5相互作用通过H3R2对称二甲基化修饰调控MHC II表达,并阐明CD4+Gzma+ T细胞亚群在吸烟相关动脉粥样硬化中的关键致病作用 | 研究主要在ApoEKO小鼠模型和体外细胞实验中验证,缺乏临床样本的进一步验证 | 探究吸烟促进动脉粥样硬化进展中CD4+Gzma+ T细胞活化的免疫分子机制 | ApoEKO小鼠、小鼠动脉内皮细胞、人冠状动脉内皮细胞 | 免疫学与心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1006 | 2026-06-05 |
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00998-9
PMID:42237414
|
研究论文 | 通过四例新病例的临床和初步功能研究,将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来 | 首次将IARS基因双等位突变确立为儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症的新致病基因,并揭示了单核细胞/巨噬细胞谱系的内在缺陷可能参与表面活性物质清除障碍的免疫相关致病机制 | 病例数量有限,仅四例;功能研究尚属初步阶段,未深入验证具体分子机制 | 探究IARS基因双等位突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症的关联及其潜在致病机制 | 四名表现为进行性儿童间质性肺病/肺泡蛋白沉积症并伴肺外表现(生长迟缓、智力障碍、肌张力低下和肝病)的儿科患者 | 数字病理学 | 儿童间质性肺病,肺泡蛋白沉积症 | 全外显子测序,AlphaFold蛋白结构预测,PAS和ORO染色,Western blot,透射电镜,单细胞RNA测序 | AlphaFold | 基因组数据,蛋白质结构数据,染色图像,电镜图像,单细胞转录组数据 | 四名儿科患者 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 1007 | 2026-06-05 |
Loss of miR-29a/b1 Cluster Reprograms the Tumor Microenvironment and Contributes to Immunosuppression in Lung Cancer
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
|
研究论文 | 该研究探讨了miR-29a/b1簇缺失如何重编程肿瘤微环境并促进肺癌免疫抑制 | 首次揭示miR-29家族通过调控ATX及其他靶基因影响肿瘤微环境和抗肿瘤免疫通路,与免疫检查点抑制剂反应相关 | NA | 探究miR-29在肺癌免疫检查点抑制剂耐药中的作用机制 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型及肺腺癌患者肿瘤样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及公共数据库中的肺腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2026-06-05 |
Activated PIK3CD drives marginal zone B cell development from early transitional progenitors by enhancing ADAM10 expression
2026-Jun-02, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02241-6
PMID:42228175
|
研究论文 | 通过小鼠模型和单细胞测序技术,揭示激活的PI3Kδ通过增强ADAM10表达促进边缘区B细胞从早期过渡前体细胞发育的机制 | 首次发现过度活跃的P110δ在B细胞发育的T1阶段即通过上调表面ADAM10水平促进脾脏边缘区B细胞前体扩增,并利用单细胞RNA测序揭示T1阶段的差异性细胞分化 | 从较浅的视角揭示了APDS中边缘区B细胞发育失衡的机制,仅为未来靶向自身免疫性B细胞策略的初步研究平台 | 探究激活的PI3Kδ信号在脾脏边缘区B细胞发育中的具体作用机制 | 激活的PI3Kδ综合征小鼠模型中的脾脏边缘区B细胞及其前体 | 机器学习 | 原发性免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1009 | 2026-06-05 |
Network Methods for Diagonal Integration of Unpaired Single-Cell Multi-Omics Data: A Review
2026-Jun-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag353
PMID:42234838
|
综述 | 综述了用于非配对单细胞多组学数据对角集成的网络方法,涵盖从转录组学骨架构建到跨模态整合的完整计算流程 | 首次聚焦于非配对单细胞蛋白质组学数据的对角集成挑战,系统总结了生成式蛋白质组翻译、归纳先验嵌入和基于扰动的因果基准测试三大未来发展方向 | 未提供新的软件或算法实现,基准资源表仅作为补充材料提供 | 综述用于非配对单细胞多组学数据(特别是scMS与单细胞转录组)对角集成的网络方法 | 非配对的单细胞转录组与蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞质谱法 | 图神经网络, 生成模型, 概率图模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1010 | 2026-06-05 |
ADAM12-programmed ECM-CAF remodeling activates PI3K-AKT and enforces an immune-excluded microenvironment to drive bladder cancer progression and therapy resistance
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112398
PMID:41651177
|
研究论文 | 通过多组学分析探究ADAM12介导的ECM-CAF重塑在膀胱癌进展和治疗抵抗中的作用机制 | 首次整合单细胞转录组、成纤维细胞GWAS数据及多平台数据,系统揭示ADAM12作为基质驱动因子连接基质重塑、PI3K-AKT信号通路与膀胱癌免疫抑制的分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明膀胱癌中肿瘤相关成纤维细胞介导的基质重塑的致病机制及潜在治疗靶点 | 膀胱癌组织、细胞系和小鼠模型 | 计算机视觉 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA和GEO数据集 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1011 | 2026-06-05 |
Serum procalcitonin: A novel tumor biomarker for diagnosis and disease monitoring in fibrolamellar hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.01.015
PMID:41654224
|
研究论文 | 本研究探讨血清降钙素原作为纤维板层肝细胞癌的一种新型肿瘤生物标志物,用于诊断和疾病监测 | 首次证实降钙素原在纤维板层癌患者血清中显著升高,且具有高度敏感性和特异性,可作为该罕见肝癌的诊断和治疗监测生物标志物 | 样本量较小,需在更大规模和更多样化的队列中进行前瞻性研究以完善诊断阈值并确认特异性 | 评估血清降钙素原作为纤维板层癌诊断和监测生物标志物的潜力 | 纤维板层癌患者、肝细胞癌患者、胆管癌患者、肝硬化患者 | 机器学习 | 肝癌 | RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 图像 | 18例纤维板层癌患者34份样本,64例肝细胞癌患者,24例胆管癌患者,20例肝硬化患者;27例纤维板层癌肿瘤、331例肝细胞癌肿瘤、39例胆管癌肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤、55例非肿瘤肝脏样本用于RNA测序;3例纤维板层癌肿瘤用于空间转录组学;13例纤维板层癌肿瘤和34例其他原发或继发性肝癌用于免疫组织化学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1012 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Jun, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性肺移植功能障碍中内皮和上皮细胞协同激活蛋白-1的激活 | 首次通过空间转录组学分析,发现CLAD中上皮和内皮细胞中AP-1靶基因(如JUNB和FOS)显著上调,并揭示两者在促炎和促纤维化基因网络中的协同作用 | 未提及明确限制;可能受限于样本量较小或空间分辨率不足(根据常识推断) | 探究慢性肺移植功能障碍(CLAD)中细胞特异的基因表达谱及其分子机制 | 人类肺组织样本,包括CLAD患者、非CLAD移植接受者和非移植对照组 | 数字病理学 | 慢性肺移植功能障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1013 | 2026-06-05 |
Multi-omics reveals that CTHRC1 secreted by cancer-associated fibroblasts promotes EMT by ITGA5/PI3K/AKT signaling pathway in HNSCC
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112409
PMID:41651176
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研究论文 | 通过多组学分析揭示头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞分泌的CTHRC1通过ITGA5/PI3K/AKT信号通路促进上皮间质转化 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了CTHRC1+ CAFs在HNSCC中的空间分布及其通过ITGA5/PI3K/AKT信号轴促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞的关键功能分子及其在肿瘤进展中的作用机制 | 头颈鳞癌细胞及癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和多个GEO队列数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1014 | 2026-06-05 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于多组学分析,探讨MYB基因在三阴性乳腺癌中的潜在治疗靶点作用,重点关注PI3K/AKT信号通路 | 首次通过整合113种算法组合、多组学数据(转录组、单细胞RNA测序、空间转录组)和分子对接模拟,系统揭示MYB基因在TNBC与Non-TNBC预后差异中的关键角色,并发现桃红四物汤主要成分与MYB的强结合能力 | 研究主要基于公共数据库数据分析,缺乏独立临床队列验证;分子对接模拟结果需要后续实验验证;桃红四物汤成分与MYB结合的体内外功能验证尚未开展 | 探究PI3K/AKT信号通路中关键基因导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1015 | 2026-06-05 |
Fibroblasts as regulators of lung immunity, repair and fibrosis
2026-Jun, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-026-01268-4
PMID:41680464
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综述 | 探讨成纤维细胞在肺部免疫、修复和纤维化中的调节作用,重点关注单细胞测序技术揭示的成纤维细胞异质性和功能多样性 | 整合免疫学、力学和代谢调节因子对成纤维细胞功能的影响,揭示慢性炎症、免疫功能障碍、组织生物力学改变和代谢应激如何破坏基质调节平衡导致进行性纤维化 | 未提供 | 研究成纤维细胞在纤维化间质性肺病中的调节机制及其在健康与疾病状态下的核心调控程序 | 成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 1016 | 2026-06-05 |
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Jun, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251410040
PMID:41696806
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究血管基底膜层粘连蛋白对脑微血管功能区域化的调控作用 | 首次揭示层粘连蛋白α4和α5缺失对脑微血管内皮细胞动脉标记物表达及毛细血管后微静脉特性的调控效应,并发现层粘连蛋白α5的补偿性上调增强血管连接蛋白表达和收缩性 | NA | 探究基底膜层粘连蛋白是否影响脑血管的区域差异性,并揭示其分子机制 | 缺乏主要血管层粘连蛋白(层粘连蛋白α4和α5)的小鼠及其野生型同窝对照的脑血管 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺乏层粘连蛋白α4和α5的小鼠及其野生型同窝对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1017 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1018 | 2026-06-05 |
Ustekinumab resistance in individuals with ulcerative colitis is associated with an alteration of a subset of proinflammatory mucosal regulatory T cells
2026-Jun-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag059
PMID:41984825
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研究论文 | 探讨乌司奴单抗治疗溃疡性结肠炎患者耐药性与黏膜调节性T细胞亚群改变的关系 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、多参数流式细胞术和空间转录组学等多模态方法,首次揭示了黏膜调节性T细胞表型和转录特征与乌司奴单抗治疗响应性的关联,并鉴定出OX40、GITR、GPR15和PIM2等关键分子作为潜在生物标志物 | 样本量较小,亚组分析中仅部分患者进行了多参数流式细胞术和空间转录组学检测,研究仅在单中心进行,需要更大规模多中心队列验证 | 阐明与乌司奴单抗治疗响应性相关的黏膜免疫变化,为治疗决策提供指导 | 接受乌司奴单抗治疗的溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,多参数流式细胞术,空间转录组学,免疫组化 | NA | 基因表达数据,图像 | 接受乌司奴单抗治疗的患者队列,包括响应者和非响应者,具体数量未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'文库制备和测序,10x Visium空间转录组学分析 |
| 1019 | 2026-06-05 |
A velocity-informed framework for resolving functional stratification in rare human stem cells
2026-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02956-9
PMID:42014860
|
研究论文 | 本研究提出一种速度信息框架,通过整合单细胞RNA测序与RNA速度分析,解析超罕见干细胞(如人脐带血中极小胚胎样干细胞VSELs)的功能分层,鉴定出两种动力学不同的亚群 | 创新性地将RNA速度动力学建模应用于极稀有静止干细胞群的功能分层分析,突破了传统分析方法受低细胞数和功能不可及性限制的局限 | 未提及框架在其他超罕见干细胞类型中的验证效果以及潜在的技术噪声对结果的影响 | 开发可推广的动力学分析框架,以解析传统方法难处理的稀有干细胞异质性和状态转变 | 人脐带血中的极小胚胎样干细胞(VSELs),包括CD34⁺和CD133⁺亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 人脐带血样本中的超罕见VSELs(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1020 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人支气管上皮细胞类型对氯化镉的差异化反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术在高分辨率下解析人支气管上皮不同细胞类型对有毒化合物氯化镉的急性反应,发现了传统批量分析无法捕捉的细胞类型特异性转录特征 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织对有毒化合物急性反应中的附加价值 | 人支气管上皮细胞(纤毛细胞、分泌细胞、基底细胞) | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自3名独立供体的完全分化黏膜纤毛上皮,共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |