单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 10161 - 10180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10161 | 2024-08-09 |
Machine learning-based biomarker screening for acute myeloid leukemia prognosis and therapy from diverse cell-death patterns
2024-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68755-3
PMID:39090256
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研究论文 | 本文利用13种程序性细胞死亡途径和73种机器学习组合，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）临床结果和药物反应的6基因指数（PPCDI） | 开发了一种新的6基因指数（PPCDI），该指数通过综合分析多种程序性细胞死亡途径，显示出预测AML患者临床预后和药物敏感性表型的潜力 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测急性髓系白血病的临床预后和药物反应 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-AML、Tyner和GSE37642-GPL96队列的bulk RNA测序和单细胞RNA测序转录组数据以及匹配的临床病理信息 |
| 10162 | 2024-08-09 |
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies
2024-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02717-4
PMID:38783165
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研究论文 | 本文探讨了腹膜表面恶性肿瘤（PSMs）中与转移相关的成纤维细胞（MAFs）的作用及其异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫调节性癌相关成纤维细胞（iCAFs）在PSMs中的普遍性，并探讨了其他主要亚型如肌成纤维细胞样CAFs（myCAFs）和基质CAFs（mCAFs）的分布 | NA | 旨在理解腹膜MAFs与肿瘤细胞间的复杂相互作用，以开发针对性和局部治疗策略，改善PSMs患者的治疗效果 | 腹膜表面恶性肿瘤中的转移相关成纤维细胞及其亚型 | NA | 腹膜表面恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 10163 | 2024-08-09 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
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研究论文 | 本文全面分析了猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的单细胞转录组，识别了胚胎中的四种不同谱系和子宫内膜中的13种细胞类型，并开发了一种新工具ExtraCellTalk来生成母胎交叉对话的动态图谱。 | 本文开发了新工具ExtraCellTalk，并识别了跨物种保守的RBP4/STRA6通路，为胚胎植入过程中的母胎交叉对话提供了新的见解。 | NA | 研究胚胎植入过程中胚胎与母体的动态交叉对话。 | 猪胚胎植入期胚胎和母体子宫内膜的细胞类型及其基因表达。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的细胞样本 |
| 10164 | 2024-08-09 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究旨在探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制，通过分析不同时间点的转录组数据和单细胞测序数据，鉴定了与时间序列相关的差异表达基因，并验证了SPOCK2在脓毒症心肌病中的保护作用 | 通过加权基因共表达网络分析、时间序列分析和差异表达分析，结合单细胞测序数据，鉴定了特定于内皮细胞的差异表达基因 | NA | 探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制 | 内皮细胞在脓毒症诱导的心肌病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用GSE171546数据分析了不同时间点的转录组数据，GSE207363数据用于单细胞测序分析 |
| 10165 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic insights into chemotherapy-induced remodeling of the osteosarcoma tumor microenvironment
2024-Jul-20, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05787-2
PMID:39033089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗前后骨肉瘤患者的肿瘤样本，揭示了化疗对肿瘤微环境的复杂影响 | 研究发现化疗导致骨肉瘤细胞表达更多与干细胞相关的基因，并增强了癌症相关成纤维细胞的能力，同时增加了内皮细胞的数量但降低了其分化能力 | NA | 深入了解化疗如何重塑骨肉瘤的局部环境，以推进骨肉瘤治疗方案的发展 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化疗前后收集的骨肉瘤患者肿瘤样本 |
| 10166 | 2024-08-09 |
Therapeutic potential of the secreted Kazal-type serine protease inhibitor SPINK4 in colitis
2024-Jul-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50048-y
PMID:38997284
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了炎症性肠病早期黏膜损伤与杯状细胞（GC）耗竭的关系，发现Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂SPINK4在结肠炎肠道中的动态调节与疾病活动平行，并探讨了其在结肠炎治疗中的潜在治疗作用。 | 发现SPINK4在结肠炎中的动态调节，并证实其与现有TNF-α抑制剂infliximab在治疗结肠炎中的协同作用，以及通过Kazal样基序调节EGFR-Wnt/β-catenin和Hippo通路促进GC分化。 | NA | 探讨SPINK4在炎症性肠病中的作用及其作为治疗和诊断标志物的潜力。 | SPINK4在结肠炎中的调节及其治疗潜力。 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | NA | Spink4条件性敲除小鼠及健康对照 |
| 10167 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq revealed heterogeneous responses and functional differentiation of hemocytes against white spot syndrome virus infection in Litopenaeus vannamei
2024-Mar-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01805-23
PMID:38323810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了白斑综合症病毒（WSSV）感染的南美白对虾血细胞的转录组图谱，并与健康血细胞的数据进行对比，揭示了血细胞在抗病毒免疫反应中的异质性响应和功能分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了南美白对虾血细胞在WSSV感染后的异质性响应和功能分化过程 | NA | 探究南美白对虾血细胞在白斑综合症病毒感染后的免疫响应和功能分化 | 南美白对虾的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和WSSV感染的血细胞共16个转录不同的细胞簇 |
| 10168 | 2024-08-09 |
TREX1 is required for microglial cholesterol homeostasis and oligodendrocyte terminal differentiation in human neural assembloids
2024-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02348-w
PMID:38129659
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研究论文 | 研究探讨了TREX1基因在人神经集合体中对小胶质细胞胆固醇稳态和少突胶质细胞终末分化的作用 | 首次揭示了TREX1在人小胶质细胞中的功能，包括影响胆固醇代谢和少突胶质细胞的分化 | NA | 探究TREX1基因在人小胶质细胞生物学中的作用及其对神经发育和疾病的影响 | 人胚胎干细胞衍生的工程化小胶质细胞样细胞、集合体中的小胶质细胞和少突胶质细胞 | NA | Aicardi-Goutières综合征 | 单细胞转录组学、光学和透射电子显微镜 | NA | 转录组数据 | 三个月大的集合体 |
| 10169 | 2024-08-09 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物代谢产物尸胺是否通过组胺H4受体（H4R）和瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）介导小鼠的瘙痒反应 | 首次发现尸胺可能作为H4R的内源性配体，并通过H4R/TRPV1信号通路在初级感觉神经元中诱导瘙痒 | NA | 研究尸胺在生理和病理条件下是否调节疼痛或瘙痒 | 尸胺对小鼠瘙痒反应的影响及其分子机制 | NA | NA | 分子对接模拟、scRNA-Seq数据分析、钙成像分析、膜片钳记录 | NA | 基因表达数据、钙成像数据、电生理数据 | 小鼠模型 |
| 10170 | 2024-08-09 |
Identification of CGNL1 as a diagnostic marker in fibroblasts of diabetic foot ulcers: Insights from single cell RNA sequencing and bulk sequencing data
2024 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320241265945
PMID:39102374
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研究论文 | 本研究旨在探索糖尿病足溃疡（DFUs）中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 通过单细胞RNA测序和批量测序数据，本研究首次确定了CGNL1作为成纤维细胞中的一个独特诊断标志物，并揭示了其在促炎性成纤维细胞中的正相关性 | NA | 探索糖尿病足溃疡中成纤维细胞亚型的独特转录特征及铁死亡的作用 | 糖尿病足溃疡中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 83529个单细胞转录组来自足部样本 |
| 10171 | 2024-08-09 |
Deciphering the immune-metabolic nexus in sepsis: a single-cell sequencing analysis of neutrophil heterogeneity and risk stratification
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398719
PMID:39108261
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了脓毒症中的免疫细胞景观及其与代谢途径的关联，揭示了中性粒细胞在脓毒症代谢紊乱中的作用及其异质性 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术，本研究首次揭示了脓毒症中中性粒细胞的复杂交互作用和其在代谢紊乱中的关键角色，并开发了一种新的风险评分模型用于预测脓毒症预后 | NA | 旨在深入理解脓毒症中的免疫代谢相互作用，并开发新的预后和治疗策略 | 脓毒症中的免疫细胞和代谢途径 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 10172 | 2024-08-09 |
Concurrent delivery of immune checkpoint blockade modulates T cell dynamics to enhance neoantigen vaccine-generated antitumor immunity
2022-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00352-7
PMID:35393580
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研究论文 | 本文研究了新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤特异性T细胞反应的影响 | 通过单细胞测序揭示了联合治疗诱导的特定CD8 T细胞群体的特征，这些细胞具有活跃的趋化因子信号、较低的共抑制受体表达和较高的细胞毒性 | NA | 探讨新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤控制的有效性及其机制 | 新抗原疫苗生成的T细胞与免疫检查点阻断的协同作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 超过100,000个T细胞 |
| 10173 | 2024-08-09 |
Blocking LAIR1 signaling in immune cells inhibits tumor development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996026
PMID:36211388
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研究论文 | 本文研究了通过阻断免疫细胞中的LAIR1信号来抑制肿瘤发展的效果 | 开发了特异性的拮抗性抗LAIR1单克隆抗体，并研究了其在癌症治疗中的免疫激活作用 | NA | 探索新的癌症免疫学分子靶点和治疗策略 | 免疫细胞中的LAIR1信号阻断对肿瘤发展的影响 | 癌症免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了同源人类LAIR1转基因小鼠模型 |
| 10174 | 2024-08-09 |
Research Techniques Made Simple: Use of Imaging Mass Cytometry for Dermatological Research and Clinical Applications
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.12.008
PMID:33752807
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研究论文 | 本文介绍了成像质谱流式细胞术（IMC）在皮肤病学研究和临床应用中的潜力 | IMC技术能够同时分析多达40种蛋白质标记物，生成高维图像，保留组织结构和细胞间空间关系 | NA | 强调IMC在皮肤病学研究和临床应用中的潜在用途 | 皮肤病学领域的组织和细胞 | 数字病理学 | NA | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | NA |
| 10175 | 2024-08-09 |
Leukocyte dynamics after intracerebral hemorrhage in a living patient reveal rapid adaptations to tissue milieu
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145857
PMID:33749664
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对一名参与微创手术联合溶栓治疗脑内出血试验的患者进行了血液和脑血肿流出物的纵向分析，揭示了脑内出血后白细胞的动态适应性变化 | 首次在单细胞分辨率下描述了活体患者脑内出血期间的局部细胞反应 | 仅基于单一病例的研究，可能缺乏普遍性 | 探索脑内出血后脑部免疫反应的动态变化 | 脑内出血患者的血液和脑血肿流出物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例 |
| 10176 | 2024-08-09 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
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研究论文 | 研究旨在描述母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫系统的调节作用 | 研究仅限于第三孕期的新生儿，且未观察到垂直传播 | 探究母体SARS-CoV-2感染对胎儿及儿童健康的潜在影响 | 母体SARS-CoV-2感染的第三孕期新生儿及其脐带血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA | 母体感染SARS-CoV-2的新生儿脐带血单个核细胞 |
| 10177 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics
2021-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063027
PMID:33809675
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术研究了健康和疾病状态下大脑中微胶质细胞的多样性 | 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，揭示了微胶质细胞在生理和病理条件下的未被发现的异质性 | NA | 总结单细胞组学研究在微胶质细胞功能多样性方面的发现，并探讨其在未来免疫调节治疗设计中的重要性 | 大脑中的微胶质细胞及其在健康和疾病状态下的多样性 | NA | 神经退行性疾病，中风，抑郁症，脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 数千个单个细胞 |
| 10178 | 2024-08-09 |
Efficient IL-2R signaling differentially affects the stability, function, and composition of the regulatory T-cell pool
2021-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00599-z
PMID:33408345
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研究论文 | 研究通过分析一种自发突变小鼠品系，探讨了IL-2R信号在调节Treg细胞稳定性、功能及其组成中的作用 | 首次揭示了IL-2R信号的部分丧失如何影响Treg细胞池的维持、异质性和抑制功能 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨IL-2R信号在不同条件下对Treg细胞稳态、谱系稳定性和功能的影响 | Treg细胞及其在非炎症和炎症环境下的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Cd25小鼠的Treg细胞 |
| 10179 | 2024-08-09 |
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0605-1
PMID:32690972
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Augur的方法，用于在单细胞数据中优先考虑对生物扰动最敏感的细胞类型 | Augur采用机器学习框架量化高维空间中扰动和未扰动细胞的可分离性，并在单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据集上验证了其方法，显示出优于基于差异基因表达的现有方法 | NA | 开发和验证一种新的方法来优先考虑单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 单细胞数据 | 涉及小鼠脊髓神经刺激后的神经回路样本 |
| 10180 | 2024-08-09 |
The use and limitations of single-cell mass cytometry for studying human microglia function
2020-11, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.12909
PMID:33058349
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综述 | 本文综述了单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）和成像质谱流式细胞术（IMC）在研究人小胶质细胞功能中的应用及其局限性 | 介绍了CyTOF和IMC技术在单细胞水平上对高维度蛋白质表达的分析能力，以及它们在结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行综合分析时的优势 | 讨论了CyTOF和IMC技术的局限性及未来发展方向 | 总结近期使用CyTOF和IMC技术研究人小胶质细胞（huMG）的进展 | 人小胶质细胞在健康和疾病大脑中的功能 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 蛋白质表达数据 | 涉及超过60个目标分子的高通量定量分析 |