单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10121 - 10140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10121 | 2024-08-04 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
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研究论文 | 这篇论文探讨了人类心包生物学在心脏发育和疾病中的原则 | 该研究首次生成了具有自我组织能力的人类多能干细胞衍生的心包内体，揭示了心包和心肌的形态、分子和功能模式 | 该研究未明确提及限制因素 | 了解心包在心脏发育和疾病过程中的功能及其机制 | 研究对象为人类胚胎发育中心包细胞系和心肌细胞类型 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组学 | 自我组织体 | NA | NA |
| 10122 | 2024-08-04 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
|
研究论文 | 本文提出了一种算法SEACells，用于从单细胞基因组数据推断转录组和表观基因组细胞状态 | SEACells通过克服单细胞数据的稀疏性，识别细胞状态的分类，而保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 探索单细胞数据的细胞状态及其在相关疾病研究中的应用 | 单细胞基因组数据中的细胞状态 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 聚类算法 | 基因组数据 | 分析了多个数据集中的单细胞样本，包括COVID-19患者队列 |
| 10123 | 2024-08-05 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
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研究论文 | 本研究生成了人类视网膜类器官发展的多模态时空表型 | 开发了一种工具包，用于可视化前体细胞和神经元的位置以及细胞外和亚细胞组分的空间排列 | 缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量 | 研究人类视网膜类器官的发育和疾病 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和主要成年的视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据和空间分割的细胞核数据 | 时间序列数据集和主要成人视网膜组织 |
| 10124 | 2024-08-04 |
IL-33 Expression Is Lower in Current Smokers at both Transcriptomic and Protein Levels
2023-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202210-1881OC
PMID:37708400
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研究论文 | 这项研究探讨吸烟状态对IL-33表达的影响。 | 本研究首次显示吸烟会导致IL-33在转录组和蛋白水平上的减少，特别是在当前吸烟者中。 | 研究主要集中在COPD患者身上，可能不适用于其他疾病。 | 了解吸烟状态如何影响IL-33的表达情况。 | 研究对象为肺气道中的IL-33表达水平和吸烟状态。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq, 西方印迹分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 生物组织样本 | 涉及八个独立的转录组研究和来自COPD患者的肺组织样本 |
| 10125 | 2024-08-05 |
Construction of Prediction Model for Atrial Fibrillation with Valvular Heart Disease Based on Machine Learning
2022-Jul, Reviews in cardiovascular medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.31083/j.rcm2307247
PMID:39076905
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研究论文 | 本研究探讨了瓣膜性心脏病进展的分子机制并提供了房颤-瓣膜性心脏病的候选治疗靶点 | 使用机器学习方法筛选了与AF-VHD相关的核心基因，为房颤的生物标志物和治疗靶点提供了新的见解 | 未提及具体的样本特征和临床数据的多样性 | 探讨瓣膜性心脏病进展的分子机制 | 重点分析与房颤-瓣膜性心脏病相关的核心基因 | 机器学习 | 房颤 | RNA微阵列分析、机器学习、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 819个差异表达基因 |
| 10126 | 2024-08-05 |
The history and advances in cancer immunotherapy: understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications
2020-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-0488-6
PMID:32612154
|
评论 | 本文回顾了癌症免疫治疗的历史和最新进展，重点关注肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义 | 本文强调了单细胞技术在全面分析肿瘤微环境中的应用，提供了肿瘤浸润免疫细胞功能多样性的见解 | 肿瘤微环境的高度异质性和动态特性阻碍了对肿瘤内免疫细胞的精确解析 | 阐明肿瘤浸润免疫细胞的特征并探讨其对癌症免疫治疗的影响 | 肿瘤浸润免疫细胞及其在癌症免疫治疗中的作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10127 | 2024-08-05 |
Unveiling functional heterogeneity in breast cancer multicellular tumor spheroids through single-cell RNA-seq
2020-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-69026-7
PMID:32728097
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌多细胞肿瘤球体中的功能异质性 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了不同细胞亚型之间的功能关系及其对肿瘤发展的促进作用 | 研究仅限于MCF7多细胞肿瘤球体模型，可能不适用于所有类型的乳腺癌 | 研究肿瘤细胞亚群间的功能关系及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌细胞系MCF7的多细胞肿瘤球体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MCF7多细胞肿瘤球体的单细胞样本，两个时间点的分析 |
| 10128 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
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研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |
| 10129 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Leukocyte Diversity in Atherosclerotic Mouse Aortas
2020-07-17, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316903
PMID:32673538
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meta-analysis | 这项综合性荟萃分析确认了动脉粥样硬化小鼠主动脉中的四种已知巨噬细胞亚群，并识别出一种新型巨噬细胞亚群 | 本研究识别出一种类似腔巨噬细胞的新型巨噬细胞亚群，并揭示了一些长期存在的争议 | 本研究克服了个别研究因实验方法而造成的某些细胞群体的过度或不足表示 | 分析动脉粥样硬化小鼠主动脉中的白细胞多样性 | 动脉粥样硬化小鼠主动脉中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质量细胞术 | NA | RNA序列数据、细胞表面表型数据 | 9个单细胞RNA测序研究和2个质量细胞术研究 |
| 10130 | 2024-08-05 |
CD70 expression determines the therapeutic efficacy of expanded human regulatory T cells
2020-07-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1097-8
PMID:32665635
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研究论文 | 本文揭示了CD70表达对扩展人类调节性T细胞（Tregs）治疗效果的影响 | 发现经过长期体外刺激后，人类Tregs表现出稳定的CD70表达，而CD27表达减少，这显著影响其调节功能 | 研究主要集中于体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨CD70在调节性T细胞治疗中的作用 | 扩展的人类调节性T细胞及其对常规T细胞的共刺激能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 人类外周血中的调节性T细胞 |
| 10131 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell RNAseq identifies transitional states of T cells associated with hepatocellular carcinoma
2020-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.133
PMID:32659053
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研究论文 | 该文章分析了与肝细胞癌相关的T细胞过渡状态的单细胞RNAseq数据 | 文章揭示了T细胞功能耗竭的渐进过程及其基因表达特征，提供了免疫治疗的新见解 | 研究主要基于手术切除样本，可能无法完全代表所有HCC患者的T细胞状态 | 探讨肝细胞癌患者T细胞亚群的多样性及其在肿瘤免疫环境中的作用 | 研究对象为235例手术切除的肝细胞癌患者的样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 235例肝细胞癌患者的手术切除样本 |
| 10132 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human embryos reveals diverse patterns of aneuploidy and mosaicism
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262774.120
PMID:32641298
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组数据分析人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体的多样性模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据对人类胚胎中的镶嵌非整倍体进行广泛量化分析 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能无法全面代表所有胚胎情况 | 量化人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体现象 | 74个人类胚胎，从囊胚阶段到晚期筛选的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 74个人类胚胎 |
| 10133 | 2024-08-05 |
FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00216
PMID:32194545
|
研究论文 | 介绍了一种名为FB5P-seq的基于FACS的单细胞RNA序列技术，用于分析B细胞和T细胞的转录组及抗原受体库 | FB5P-seq是一种新颖的、经济高效的单细胞RNA-seq方法，能够实现转录组和成对的BCR或TCR库的综合分析 | NA | 本研究旨在通过新方法分析适应性免疫系统中的B细胞和T细胞的转录组和抗原受体 | 研究对象为表型定义的B细胞和T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | FB5P-seq | NA | 转录组数据 | 应用于人类扁桃体B细胞亚群和外周血抗原特异性CD4 T细胞 |
| 10134 | 2024-08-04 |
Dissecting prostate Cancer: Single-Cell insight into Macrophage Diversity, molecular Prognosticators, and the role of Peptidylprolyl Isomerase F
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112599
PMID:38959543
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中的单细胞转录组学，确定了巨噬细胞的异质性及其预后基因标记。 | 揭示了前列腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性和功能特化，并识别了与预后相关的基因，特别是PPIF的作用。 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据，可能存在选择偏倚或数据完整性的问题。 | 研究前列腺癌中的肿瘤微环境及其与巨噬细胞的相互作用，识别潜在的预后基因。 | 前列腺癌的单细胞转录组学数据以及与巨噬细胞相关的基因。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 分析了9,178个细胞，归类为10种主要细胞类型 |
| 10135 | 2024-08-04 |
CYP24A1 affected macrophage polarization through degradation of vitamin D as a candidate biomarker for ovarian cancer prognosis
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112575
PMID:38963981
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研究论文 | 本研究探讨了CYP24A1如何通过维生素D降解影响巨噬细胞极化，并作为卵巢癌预后候选生物标志物。 | 发现CYP24A1通过调节巨噬细胞极化与维生素D的相互作用，促进卵巢癌的恶性进展。 | 研究在体外构建了异种移植模型，但缺乏临床样本验证。 | 旨在筛选与卵巢癌预后相关的线粒体相关基因。 | 主要研究CYP24A1在卵巢癌细胞中的表达及其功能。 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA卵巢癌数据进行分析 |
| 10136 | 2024-08-05 |
The complex association between the immune system and the skeletal system in osteoporosis: A study of single-cell RNA sequencing
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112611
PMID:38976947
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统与骨骼系统在骨质疏松症中的复杂关系 | 揭示了特定细胞亚群及其细胞间相互作用在骨质疏松症发病机制中的关键角色 | 缺乏对临床样本的广泛验证以增强研究结果的适用性 | 探索免疫系统与骨骼系统之间的生态联系以寻找临床预防和治疗的新策略 | 以人类腰椎层组织为研究对象，进行了单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类腰椎层组织的质量控制单细胞样本 |
| 10137 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional landscape of intestinal diseases (Review)
2024-09, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2024.13281
PMID:38994768
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综述 | 本文总结了空间转录组学在肠道疾病中的应用。 | 通过空间转录组技术，深入揭示了肠道中细胞、基因、蛋白及信号之间的相互作用。 | NA | 探讨空间转录组学如何帮助理解与胃肠道相关的疾病机制。 | 肠道中的不同细胞类型及其相互作用。 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 空间转录组学(ST) | NA | NA | NA |
| 10138 | 2024-08-05 |
From genes to therapy: A comprehensive exploration of congenital heart disease through the lens of genetics and emerging technologies
2024-Sep, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102726
PMID:38944223
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综述 | 本研究全面探索了先天性心脏病(CHD)的遗传学和新兴技术。 | 探讨了单基因和多基因因素对CHD的影响，并强调了新兴技术在该领域的变革性影响。 | 关于CHD病因的主要部分仍然不清楚，且研究可能未覆盖所有相关因素。 | 提升对先天性心脏病遗传机制的理解，以改善诊断和开发新疗法。 | 先天性心脏病的遗传学及其相关的疾病机制。 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 靶向新一代测序(NGS)、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、人诱导多能干细胞(hiPSCs) | NA | NA | NA |
| 10139 | 2024-08-05 |
Correlation of Professional Antigen-Presenting Tbet+CD11c+ B Cells With Bone Destruction in Untreated Rheumatoid Arthritis
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42857
PMID:38570939
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研究论文 | 本研究探讨了Tbet+CD11c+ B细胞与未治疗的类风湿关节炎（RA）患者骨破坏之间的关联 | 首次揭示了Tbet+CD11c+ B细胞在未治疗RA中的功能特性及其对骨破坏的促进作用 | 样本量较小，且仅涉及未治疗RA患者，可能影响结果的广泛性 | 研究CD21-/low Tbet+CD11c+ MBCs与骨破坏及其他临床参数的关联 | 未治疗的类风湿关节炎患者的外周血记忆B细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序和V(D)J测序 | NA | 血液样本 | 36个来自未治疗RA患者的样本 |
| 10140 | 2024-08-05 |
Vaccine Therapy for Heart Failure Targeting the Inflammatory Cytokine Igfbp7
2024-Jul-30, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了针对炎性细胞因子Igfbp7的疫苗治疗心力衰竭的效果 | 提出了通过疫苗靶向Igfbp7改善老化内皮细胞引起的心脏功能障碍的创新方法 | 研究主要在小鼠模型上进行，临床应用的验证尚未完成 | 探究炎性细胞因子Igfbp7在心力衰竭中的作用及其作为疫苗靶点的可能性 | 研究对象为小鼠模型和心力衰竭患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、毛细管电泳-飞行时间-质谱系统 | AAV9（腺相关病毒血清型9） | 组织样本 | 使用了小鼠模型和心力衰竭患者的组织样本 |