单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10121 2024-08-16
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫内生长受限(IUGR)新生猪肝脏细胞的景观,揭示了性别依赖的IUGR诱导的肝脏损伤模式 首次探索了利用早期发育可塑性逆转不良胎儿编程结果的可能性,并发现了Apolipoprotein A4(APOA4)作为IUGR男性中对抗缺氧的保护性反应的新型生物标志物 研究仅限于猪模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 研究宫内生长受限对新生儿肝脏功能的影响及性别差异 宫内生长受限的新生猪 NA 肝脏疾病 scRNA-seq NA 细胞 来自同一胎儿的猪仔
10122 2024-08-16
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,在多时间点肺转移小鼠模型中鉴定并表征了食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)。 本研究首次鉴定出ESCC中的转移起始细胞,并识别出一组7个转移起始标志基因(MIS),这些基因在功能研究和生物信息学分析中显示出对早期转移微环境的潜在重塑作用。 本研究主要基于小鼠模型和临床样本,未来需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 旨在鉴定和表征食管鳞状细胞癌中的转移起始细胞,并探索其在早期转移中的作用。 食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)及其相关标志基因。 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个时间点的肺转移小鼠模型中的ESCC细胞
10123 2024-08-16
Mapping the unicellular transcriptome of the ascending thoracic aorta to changes in mechanosensing and mechanoadaptation during aging
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 研究揭示了随着年龄增长,升主动脉的单细胞转录组变化及其在机械感应和机械适应性中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了升主动脉在衰老过程中的细胞衰老、重塑和炎症反应的变化 研究主要集中在升主动脉,对其他部位的主动脉变化未进行详细探讨 探索年龄增长对升主动脉机械感应和适应性的分子机制 升主动脉的单细胞转录组及其在衰老过程中的变化 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 老年和年轻升主动脉组织的单细胞样本
10124 2024-08-16
CD58 Alterations Govern Antitumor Immune Responses by Inducing PDL1 and IDO in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2024-Jul-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过多种测序技术分析CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的基因特征,发现CD58的遗传改变与治疗反应和生存率降低相关,并揭示了CD58通过调控PDL1和IDO表达影响肿瘤免疫逃逸的机制。 首次全面分析了CD58在DLBCL中的基因特征及其对免疫反应的影响,揭示了CD58通过激活LYN/CD22/SHP1轴抑制JAK2/STAT1通路,从而调控PDL1和IDO表达的新机制。 研究主要集中在基因和分子层面,未涉及临床试验验证CD58相关治疗策略的有效性。 探究CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用及其对免疫反应的影响,为改善患者治疗提供潜在靶点和策略。 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者中的CD58基因及其表达。 免疫学 淋巴瘤 下一代测序(NGS)、RNA测序(RNA-seq)、全外显子测序、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据 所有入组的DLBCL患者
10125 2024-08-16
Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome
2024-Jul, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 本文通过滴液单细胞RNA测序和基于泛基因组的计算分析,开发了微生物组单细胞转录组学,以揭示瘤胃微生物组的功能异质性 本文开发了一种新的微生物组单细胞转录组学方法,并构建了瘤胃微生物组的单细胞转录组图谱 NA 揭示复杂群落和环境中单个微生物的活性 瘤胃微生物组的功能异质性 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 包括174,531个微生物细胞和2,534个物种
10126 2024-08-16
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-Jun-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过靶向单细胞RNA测序分析,揭示了小鼠海马齿状回早期新生期神经干细胞发育为成年状态的分子级联反应 首次详细描述了神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的多步骤过程及其关键里程碑,包括静息前自噬爆发和细胞活性氧水平升高 NA 揭示神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的过程、里程碑和机制 小鼠海马齿状回中的神经干细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
10127 2024-08-16
DNMT1-targeting remodeling global DNA hypomethylation for enhanced tumor suppression and circumvented toxicity in oral squamous cell carcinoma
2024-May-16, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过靶向DNMT1调控口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的全局DNA低甲基化,以增强肿瘤抑制并减少毒性 本研究首次揭示了DNMT1调控的全新全局DNA低甲基化模式,通过平衡信号协同作用来增强抗癌效果并减少潜在毒性 NA 探讨DNMT1在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对全局DNA甲基化的影响 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 shRNA敲低技术,DNA甲基化微阵列,单细胞RNA测序 NA DNA甲基化数据,RNA序列数据 包括体外口腔癌细胞和异种移植OSCC小鼠模型
10128 2024-08-16
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
研究论文 本文通过跨物种单细胞RNA测序分析,揭示了METTL16在胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)中的高表达及其在细胞周期进展中的关键作用。 首次发现METTL16通过m6A修饰调控细胞周期转录因子mybl2b,并通过METTL16-mA-MYBL2-IGF2BP1轴在人类中保守控制G1/S进展。 NA 阐明METTL16介导的m6A修饰在早期胚胎发育中对HSPC细胞周期进展的关键功能。 胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及其细胞周期进展。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及斑马鱼和人类样本
10129 2024-08-16
Primary nasal viral infection rewires the tissue-scale memory response
2024-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化,揭示了组织层面记忆反应的重塑 首次详细描述了初次感染后鼻黏膜中细胞类型、亚型和状态的逐步变化,以及再次感染时加速和协调的髓样和淋巴样细胞反应 NA 探讨初次病毒感染如何塑造组织层面的记忆反应,为鼻靶向治疗和疫苗的合理设计提供依据 小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 三个不同区域的鼻黏膜样本,包括初次和再次流感感染前后的样本
10130 2024-08-16
Single-cell profiling reveals immune aberrations in progressive idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-29, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,详细描述了特发性肺纤维化患者外周血免疫系统的变化 首次在单细胞分辨率下详细描述了特发性肺纤维化患者外周血细胞群体的变化,并揭示了与疾病进展和生存率相关的免疫细胞亚群 NA 提供特发性肺纤维化稳定期和进展期外周免疫系统的变化图谱 特发性肺纤维化患者的外周血单个核细胞 数字病理学 肺纤维化 10x Chromium 5' 单细胞RNA测序 NA 细胞 38份外周血单个核细胞样本,来自25名特发性肺纤维化患者和13名匹配的对照
10131 2024-08-16
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测,研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联,并识别了潜在的治疗靶点 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对,为治疗提供潜在靶点 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多个癌症队列的基因表达数据
10132 2024-08-16
High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells
2021-09-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法,用于固定、通透和分选的单细胞的液滴RNA测序,适用于甲醛固定的细胞。 FD-seq方法在固定和通透处理后能保持RNA完整性和相对基因表达水平,且能检测到比甲醇固定更多的基因和转录本。 NA 开发一种新的高通量单细胞RNA测序方法,以克服现有方法在处理甲醛固定细胞时的限制。 甲醛固定的单细胞,特别是支持人类肿瘤病毒KSHV裂解再激活的稀有细胞亚群和感染人类冠状病毒OC43的细胞。 基因组学 肿瘤病毒感染 RNA测序 NA RNA 文中未具体说明样本数量
10133 2024-08-16
Fifty Generations of Amitosis: Tracing Asymmetric Allele Segregation in Polyploid Cells with Single-Cell DNA Sequencing
2021-Sep-17, Microorganisms IF:4.1Q2
研究论文 研究利用单细胞全基因组测序技术,追踪多倍体细胞中不对称等位基因分离的现象,特别是在50次无丝分裂后的情况 首次使用单细胞全基因组测序技术研究无丝分裂对等位基因分离的影响,并通过数学模型验证实验结果 研究依赖于特定生物模型和特定的基因组特征,可能限制了结果的普遍性 探讨无丝分裂在生物医学和进化生物学中的意义 多倍体细胞中的不对称等位基因分离 NA NA 单细胞全基因组测序 数学模型 基因组数据 涉及多个细胞样本,具体数量未明确
10134 2024-08-16
Hippocampal glucose uptake as a surrogate of metabolic change of microglia in Alzheimer's disease
2021-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文研究了阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取之间的关系 发现海马体葡萄糖摄取可以作为评估微胶质细胞介导炎症的可行成像生物标志物 NA 研究阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取的关系 阿尔茨海默病中的微胶质细胞和海马体葡萄糖代谢 数字病理学 阿尔茨海默病 FDG PET, 单细胞RNA测序 NA 图像, 生物标志物 8个月和12个月大的5xFAD小鼠模型, 以及来自阿尔茨海默病神经影像倡议的人脑FDG PET数据
10135 2024-08-16
A systematic dissection of human primary osteoblasts in vivo at single-cell resolution
2021-08-24, Aging
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术对从一名31岁男性髋关节置换术后新鲜分离的人类原代成骨细胞进行了系统的细胞分类学剖析 首次在单细胞水平上识别出三种不同的人类原代成骨细胞亚型,包括前成骨细胞、成熟成骨细胞和一个未确定的稀有成骨细胞亚群,并揭示了这些亚型在骨形成、血管生成和造血调节中的潜在生物学功能 研究样本仅来自一名31岁男性,可能限制了结果的普遍性 旨在揭示人类原代成骨细胞的细胞异质性和潜在生物学功能 人类原代成骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 一名31岁男性
10136 2024-08-16
Current Methodological Challenges of Single-Cell and Single-Nucleus RNA-Sequencing in Glomerular Diseases
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
综述 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的方法学挑战 介绍了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的应用前景 肾小球细胞的分离困难,依赖于多种因素,如组织材料少、细胞分离协议不统一等 探讨单细胞转录组学实验在肾小球疾病研究中的技术挑战 肾小球疾病 数字病理学 肾小球疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) NA 转录组数据 需要多个样本以识别肾小球细胞
10137 2024-08-16
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究使用多色荧光杂交技术,首次展示了模式鱼(Medaka)垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱,并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 NA 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布,以更好地理解其生理功能 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 数字病理学 NA 多色荧光杂交技术,免疫荧光技术,单细胞转录组学分析 NA 图像 成年Medaka鱼
10138 2024-08-16
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织,识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞,这些细胞与免疫调节高度相关,并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 研究样本量较小,仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者,可能影响结果的普遍性 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境,并识别新的炎症促进细胞亚群 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序 NA 转录组 10名牙周炎患者和10名健康志愿者
10139 2024-08-16
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746,通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障,增加脑内精氨酸水平,并与PD-1抑制剂联合使用,显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 NA 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 数字病理学 脑肿瘤 RNA测序 NA RNA 涉及人及小鼠的胶质瘤样本
10140 2024-08-16
Single Cell Transcriptome Helps Better Understanding Crosstalk in Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病(DKD)中细胞间对话方面的最新进展 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术深入理解DKD在细胞水平上的异质性和遗传易感性 NA 旨在回顾单细胞转录组分析在DKD中的最新进展,特别是肾内或肾外细胞间的对话 糖尿病肾病(DKD)中的细胞间对话、细胞靶点和潜在治疗策略 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 NA
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