单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10101 - 10120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10101 | 2025-10-07 |
B-cell depletion limits HTLV-1-infected T-cell expansion and ameliorate HTLV-1-associated myelopathy
2024-Oct, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52190
PMID:39186315
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床试验证明B细胞耗竭可限制HTLV-1感染T细胞的扩增并改善HTLV-1相关脊髓病 | 首次提出通过靶向B细胞治疗HAM的创新策略，揭示了HTLV-1感染B细胞并促进T细胞增殖的新机制 | 样本量有限（14例临床试验患者），需要更大规模研究验证疗效 | 探索HAM的发病机制并评估利妥昔单抗治疗HAM患者的疗效 | HTLV-1相关脊髓病患者的外周血单个核细胞和临床病例 | 单细胞测序分析 | HTLV-1相关脊髓病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 14例HAM患者参与临床试验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10102 | 2025-10-07 |
An initial game-theoretic assessment of enhanced tissue preparation and imaging protocols for improved deep learning inference of spatial transcriptomics from tissue morphology
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae476
PMID:39367648
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研究论文 | 本研究通过改进组织制备和成像方案，评估其对基于深度学习的空间转录组学形态学推断性能的影响 | 首次从博弈论角度评估组织处理标准化对空间转录组学深度学习模型性能的边际效益 | 研究样本量有限（仅13例结直肠癌患者），需要更大规模验证 | 探索优化组织制备和成像方案对空间转录组学形态学推断模型性能的提升效果 | 13例病理T分期III期结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | Inceptionv3 | 全切片图像 | 13例结直肠癌患者 | 10x Genomics, Leica | 空间转录组学 | Visium CytAssist, Leica Bond | Visium CytAssist检测，自动化苏木精-伊红染色，40×分辨率成像 |
| 10103 | 2025-10-07 |
An integrated single-cell reference atlas of the human endometrium
2024-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01873-w
PMID:39198675
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研究论文 | 构建了一个高分辨率的人类子宫内膜单细胞参考图谱，整合了63位女性的单细胞转录组数据 | 首次创建了人类子宫内膜细胞图谱(HECA)，识别了先前未报告的细胞类型，并通过空间转录组学进行原位定位验证 | 样本数量相对有限(63位女性)，需要进一步扩大样本规模验证发现 | 建立人类子宫内膜的高分辨率单细胞参考图谱，研究子宫内膜生理和疾病机制 | 人类子宫内膜组织，包括患有和未患有子宫内膜异位症的女性 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序，空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 313,527个细胞(单细胞数据集)，312,246个细胞核(单核数据集)，来自63位捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，单核RNA-seq | NA | NA |
| 10104 | 2025-10-07 |
scDAPP: a comprehensive single-cell transcriptomics analysis pipeline optimized for cross-group comparison
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae134
PMID:39345754
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研究论文 | 开发了一个针对跨组比较优化的单细胞转录组学综合分析流程scDAPP | 首个专门针对跨组比较设计的自动化单细胞转录组分析流程，采用数据学习参数进行预处理并使用经过基准测试的软件 | NA | 开发标准化、自动化的单细胞转录组数据分析流程以解决跨组比较的复杂需求 | 单细胞或单核转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10105 | 2025-10-07 |
Molecular and network disruptions in neurodevelopment uncovered by single cell transcriptomics analysis of CHD8 heterozygous cerebral organoids
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34862
PMID:39149047
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CHD8杂合脑类器官，揭示神经发育过程中的分子和网络紊乱 | 首次在脑类器官模型中系统研究CHD8单倍体不足对早期神经发育的影响，发现细胞组成变化和细胞间通讯紊乱 | 研究基于体外脑类器官模型，可能与体内真实神经发育存在差异 | 研究CHD8基因在神经和大脑发育中的分子和细胞功能，并探索其与自闭症谱系障碍临床表现的关联 | CHD8杂合敲除的脑类器官及其同基因对照 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10106 | 2025-10-07 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
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综述 | 探讨单细胞RNA测序在细菌表型异质性研究中的应用与前景 | 首次系统阐述单细胞转录组学在微生物群体表型异质性研究中的创新应用 | 作为综述文章未涉及原始实验数据 | 解析细菌转录异质性及其生态学意义 | 微生物群体和细菌细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10107 | 2025-10-07 |
m6A is required for resolving progenitor identity during planarian stem cell differentiation
2022-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021109895
PMID:35971838
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研究论文 | 本研究揭示了m6A mRNA修饰在涡虫干细胞分化和组织稳态中的关键作用 | 首次发现m6A修饰与染色质修饰复合体NuRD之间的功能联系，并证明m6A在细胞命运决定中的必要性 | 研究仅限于涡虫模型，在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究m6A mRNA修饰在干细胞分化和组织再生中的功能机制 | 涡虫干细胞（新生细胞）及其分化过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，基因表达数据集分析 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞进行单细胞RNA测序，分析超过1,000个基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10108 | 2025-10-07 |
Macrophage-specific inhibition of the histone demethylase JMJD3 decreases STING and pathologic inflammation in diabetic wound repair
2022-11, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-022-00919-5
PMID:36127466
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现JMJD3在糖尿病伤口巨噬细胞中表达升高，并通过纳米颗粒特异性抑制JMJD3可改善糖尿病伤口修复 | 首次揭示JMJD3通过调控STING基因表达影响糖尿病伤口巨噬细胞的炎症状态，并提出巨噬细胞特异性靶向治疗策略 | 研究主要关注巨噬细胞特异性机制，其他细胞类型在糖尿病伤口修复中的作用未充分探讨 | 探究JMJD3在糖尿病伤口修复中调控巨噬细胞炎症反应的分子机制 | 人类糖尿病伤口组织、小鼠糖尿病伤口模型、巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类糖尿病伤口样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10109 | 2025-10-07 |
Venus: An efficient virus infection detection and fusion site discovery method using single-cell and bulk RNA-seq data
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010636
PMID:36301997
|
研究论文 | 开发了一种名为Venus的高效计算方法，用于检测病毒感染并发现病毒整合位点 | 提出首个能够同时处理单细胞和批量组织RNA-seq数据的病毒检测与整合位点发现流程 | NA | 开发高效的病毒检测和整合位点发现计算方法 | 病毒感染的组织/细胞类型 | 生物信息学 | 病毒感染 | RNA-seq | 计算流程 | RNA-seq数据 | 多种病毒数据集（HBV-肝细胞癌、HIV感染等） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10110 | 2025-10-07 |
Molecular hallmarks of heterochronic parabiosis at single-cell resolution
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04461-2
PMID:35236985
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析20个器官，揭示异种共生模型中年轻和老年血液对不同细胞类型的特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统研究异种共生对多种器官细胞类型的影响，发现线粒体功能在复苏过程中的关键作用 | 研究主要关注基因表达变化，对具体分子机制和长期效果仍需进一步验证 | 探索血液因子对衰老过程的影响及潜在复苏机制 | 小鼠20个器官中的多种细胞类型 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 异种共生模型 | 单细胞转录组数据 | 20个器官的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10111 | 2025-10-07 |
Erythroblastic island: the niche for erythroid terminal differentiation and beyond
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000228
PMID:40129604
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综述 | 本文总结了红系造血岛作为红细胞终末分化微环境的最新研究进展，并探讨其潜在的免疫功能和异质性特征 | 挑战了红系造血岛仅支持红细胞分化的传统观点，发现促红细胞生成素受体可作为其巨噬细胞新标志物，并首次确认中性粒细胞为红系造血岛的新细胞组分 | 尚未明确免疫倾向性幼红细胞是否及如何在红系造血岛中成熟 | 探讨红系造血岛的细胞组成异质性和潜在免疫功能 | 红系造血岛及其包含的巨噬细胞、幼红细胞和中性粒细胞等细胞组分 | NA | NA | 谱系追踪小鼠模型、成像流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10112 | 2025-10-07 |
Inhibition of stromal MAOA leading activation of WNT5A enhance prostate cancer immunotherapy by involving the transition of cancer-associated fibroblasts
2025-Mar-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010555
PMID:40121032
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研究论文 | 本研究揭示了基质细胞中MAOA通过WNT5A调控前列腺癌免疫微环境的新机制 | 首次发现抑制基质MAOA可通过WNT5A激活CD8+ T细胞，并与免疫检查点抑制剂产生协同抗肿瘤效应 | MAOA与肿瘤免疫微环境相互作用的详细机制尚未完全阐明 | 探究基质MAOA在前列腺癌免疫治疗中的作用机制 | 前列腺癌基质细胞、CD8+ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、体外共培养、小鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10113 | 2025-10-07 |
Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the roles of neutrophils in pediatric Crohn's disease
2025-Mar-22, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-03961-x
PMID:40121337
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示中性粒细胞在儿童克罗恩病中的关键作用 | 首次在儿童克罗恩病中系统揭示中性粒细胞表型转变及其在细胞间通讯中的主导作用 | 样本来源仅限于回肠和结肠活检样本，未涉及其他肠道部位 | 探索儿童克罗恩病的分子机制、诊断标志物和治疗靶点 | 儿童克罗恩病患者、溃疡性结肠炎患者和健康对照的肠道活检样本 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10114 | 2025-10-07 |
Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies
2025-Mar-13, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps8020031
PMID:40126249
|
研究论文 | 本研究优化了HCR v3.0方案，实现了非洲蝴蝶幼虫全脑组织中十个基因表达域的单细胞分辨率空间定位 | 首次在蝴蝶幼虫全脑组织中应用HCR v3.0技术，实现了多基因表达的空间可视化 | 仅针对固定脑组织进行基因表达定位，未涉及动态行为过程中的实时变化 | 探索蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的基因表达空间分布模式 | 非洲蝴蝶（Bicyclus anynana）幼虫的完整脑组织 | 空间转录组学 | NA | 杂交链式反应3.0（HCR v3.0） | NA | RNA分子空间表达图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 优化了聚丙烯酰胺凝胶包埋、固定和样品透化步骤的HCR v3.0方案 |
| 10115 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer
2025-Mar-10, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11020024
PMID:40126348
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用与进展 | 聚焦单细胞水平揭示非编码RNA异质性，整合生物信息学方法与实验验证 | 作为综述文章，不包含原始实验数据验证 | 探讨单细胞生物信息学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用 | 结直肠癌中的非编码RNA | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10116 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions
2025-Mar-04, Ultrastructural pathology
IF:1.1Q4
DOI:10.1080/01913123.2025.2468708
PMID:39985165
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性中系膜细胞的基因表达和细胞通路变化 | 首次在人类肾小球中揭示淀粉样轻链与系膜细胞相互作用过程中的基因表达谱和激活的细胞通路 | 样本量较小（仅5例肾活检样本），需要更大规模研究验证 | 寻找肾小球AL-淀粉样变性的新型治疗干预靶点 | 肾小球淀粉样变性患者的肾活检组织中的系膜细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 5例不同阶段肾小球淀粉样变性活检样本与正常对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10117 | 2025-10-07 |
Esr1-Dependent Signaling and Transcriptional Maturation in the Medial Preoptic Area of the Hypothalamus Shapes the Development of Mating Behavior during Adolescence
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640339
PMID:40060480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了下丘脑内侧视前区在青春期发育过程中对交配行为形成的分子机制 | 首次揭示Esr1在MPOA区GABA能神经元转录成熟过程中的关键作用，并发现其调控性别特异性基因调控网络 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究青春期神经系统发育过程中激素信号调控交配行为形成的分子机制 | 青春期发育过程中的雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 青春期发育不同阶段的雄性和雌性小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10118 | 2025-10-07 |
CD271 regulates osteogenic differentiation of ectomesenchymal stem cells via the RhoA/ROCK signaling pathway
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114068
PMID:39826451
|
研究论文 | 本研究探讨了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控外间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示CD271通过调控RhoA/ROCK信号通路影响外间充质干细胞的成骨分化过程 | NA | 研究CD271对外间充质干细胞成骨分化的影响及其分子机制 | 外间充质干细胞(EMSCs)和CD271缺陷小鼠 | 干细胞生物学 | 颌骨发育异常 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CD271缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10119 | 2025-10-07 |
Arctiin alleviates knee osteoarthritis by suppressing chondrocyte oxidative stress induced by accumulated iron via AKT/NRF2/HO-1 signaling pathway
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83383-7
PMID:39738432
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研究论文 | 本研究探讨牛蒡苷通过AKT/NRF2/HO-1信号通路减轻铁过载诱导的软骨细胞氧化应激，从而缓解膝骨关节炎 | 首次揭示牛蒡苷通过调节铁代谢和激活AKT/NRF2/HO-1通路同时抑制软骨细胞凋亡和铁死亡的双重保护机制 | 未明确牛蒡苷的具体分子靶点及其在人体中的安全有效性 | 探究牛蒡苷对铁过载所致膝骨关节炎的治疗作用及分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞及疾病模型 | 分子生物学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, CCK-8检测, 流式细胞术, 荧光检测, Q-RTPCR, Western Blotting, 显微CT, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据, 影像数据, 组织学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10120 | 2025-10-07 |
Integrated analyses of Mendelian randomization, eQTL, and single-cell transcriptome identify CCN3 as a potential biomarker in aortic dissection
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83611-0
PMID:39738466
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、eQTL和单细胞转录组分析，鉴定CCN3作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 首次结合多种分析方法系统筛选主动脉夹层相关血浆分泌蛋白，发现CCN3在mRNA和血浆水平均下调并可能具有保护作用 | 当前AD与血浆蛋白水平相关性研究稀缺且缺乏特异性，样本量有限 | 探索血浆分泌蛋白作为主动脉夹层的潜在生物标志物 | 主动脉夹层患者与正常个体的基因表达和血浆蛋白水平 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究,eQTL分析,单细胞转录组测序,qPCR,酶联免疫吸附试验 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,蛋白质数据 | 三个GEO数据集的患者样本和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |