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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10081 | 2025-10-07 |
The role of TRAF2 in pan-cancer revealed by integrating informatics and experimental validation
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1563435
PMID:40144665
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示TRAF2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统整合多组学数据和实验验证,全面揭示TRAF2在泛癌中的表达特征、表观遗传调控、免疫微环境作用及其在肝细胞癌中的功能 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证主要集中在肝细胞癌,需要更多癌症类型的实验验证 | 阐明TRAF2在癌症发生发展中的作用机制及其临床意义 | 人类正常组织和肿瘤组织,肝细胞癌细胞系HepG2 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析,单细胞测序,免疫荧光染色,siRNA敲低 | Cox回归分析,Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据,表观遗传数据,单细胞测序数据,免疫组化数据 | 多个公共数据库的泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,免疫荧光,基因敲低 | NA | NA |
10082 | 2025-10-07 |
IKKε-deficient macrophages impede cardiac repair after myocardial infarction by enhancing the macrophage-myofibroblast transition
2024-Sep, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01304-0
PMID:39261656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和磷酸化蛋白阵列技术,揭示了IKKε缺失通过增强巨噬细胞-肌成纤维细胞转化导致心肌梗死后心脏修复障碍的机制 | 首次发现IKKε-p38轴通过调控巨噬细胞-肌成纤维细胞转化影响心肌梗死后的心脏修复过程 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究IKKε在心肌梗死后炎症反应和心脏修复中的调控作用 | 心肌梗死小鼠模型中的心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白阵列 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | IKKε敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10083 | 2025-10-07 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-Jun-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
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研究论文 | 本研究揭示了FGF受体通过MAPK p38信号通路介导囊性纤维化气道上皮细胞衰老的机制 | 首次发现FGFR4和FGFR1在CF气道上皮细胞衰老中的关键作用,并证明抑制FGFR可改善黏液纤毛清除功能 | 研究主要基于体外和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究囊性纤维化气道上皮细胞衰老的分子机制及潜在治疗策略 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系、Cftr基因敲除大鼠 | 单细胞测序 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 非CF和CF供体的人原代支气管上皮细胞、CF细胞系、Cftr-/-大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10084 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of murine bladder cancer identifies sex-specific transcriptional signatures with prognostic relevance
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107703
PMID:37701814
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠膀胱癌模型,识别具有预后相关性的性别特异性转录特征 | 首次在单细胞水平系统比较雄性和雌性膀胱癌肿瘤微环境的转录差异,并验证了BBN模型在研究人类膀胱癌性别差异中的相关性 | 研究基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 探究膀胱癌性别差异的分子机制并识别预后相关标志物 | BBN诱导的小鼠膀胱癌模型 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | BBN诱导的小鼠膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10085 | 2025-10-07 |
Transcriptional Signatures of Hippocampal Tau Pathology in Primary Age-Related Tauopathy and Alzheimer's Disease
2023-Sep-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.09.12.23295440
PMID:37745408
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析海马区tau病理相关的转录特征,比较原发性年龄相关tau病和阿尔茨海默病的分子变化 | 首次在PART和AD中识别出与神经元内tau病理相关的两个新型基因表达特征,并发现两种疾病具有相似的转录变化 | 样本量较小(仅16例),仅关注海马CA1锥体神经元,结果需要在更大样本和更广泛脑区验证 | 探索PART和AD中神经元内tau病理相关的分子变化及其相似性 | 人类海马组织样本,包括6例PART、6例AD和4例对照病例 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例人类海马组织样本(6例PART、6例AD、4例对照) | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
10086 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome reveals cell division-regulated hub genes in the unicellular eukaryote Paramecium
2023-Jun, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2023.125978
PMID:37080141
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了草履虫细胞分裂过程中关键调控基因的表达模式 | 首次在单细胞真核生物草履虫中利用单细胞转录组技术系统揭示细胞分裂相关枢纽基因 | 研究仅限于Paramecium cf. multimicronucleatum物种,未验证枢纽基因的具体功能机制 | 探索纤毛虫细胞分裂过程中的分子调控机制 | Paramecium cf. multimicronucleatum(多小核草履虫)细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
10087 | 2025-10-07 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 开发了一种基于甘露醇的缓冲液,可提高高盐度海洋细胞单细胞RNA测序的质量 | 首次提出使用添加D-甘露醇的低盐度磷酸盐缓冲液(PBS-M)来解决海洋生物细胞因高盐度环境与scRNA-seq不兼容的问题 | 仅在海鞘血细胞中进行了验证,尚未在其他海洋生物中广泛测试 | 改进海洋生物单细胞RNA测序的技术方法 | 海鞘血细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
10088 | 2025-10-07 |
Ageing hallmarks exhibit organ-specific temporal signatures
2020-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2499-y
PMID:32669715
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研究论文 | 通过多器官转录组和血浆蛋白质组分析揭示小鼠衰老过程中器官特异性时间特征 | 首次在完整生命周期内对17个器官进行系统性衰老动态分析,发现基因表达变化的线性与非线性模式 | 研究仅限于小鼠模型,人类衰老过程可能存在差异 | 阐明衰老过程中器官间和器官内分子变化的时空动态特征 | 小鼠(Mus musculus)的17个器官和血浆样本 | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 10个年龄点的多器官样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
10089 | 2025-10-07 |
Single-cell insights into HNSCC tumor heterogeneity and programmed cell death pathways
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102341
PMID:40068384
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示头颈部鳞状细胞癌肿瘤异质性,识别C2 MALAT1+肿瘤亚群的独特特征并开发新型预后模型 | 首次利用单细胞测序系统分析HNSCC肿瘤亚群,发现C2 MALAT1+肿瘤亚群具有最低的CytoTRACE评分和独特的程序性死亡通路表达特征,并建立了基于MALAT1肿瘤风险评分的新型预后模型 | 未明确说明样本规模和具体实验验证细节 | 解析HNSCC肿瘤异质性,识别治疗靶点并优化预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤细胞亚群,特别是C2 MALAT1+肿瘤亚群 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析,干性分析,LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10090 | 2025-10-07 |
Pathogenesis of systemic sclerosis: an integrative review of recent advances
2025-Apr-01, Journal of rheumatic diseases
IF:2.2Q3
DOI:10.4078/jrd.2024.0129
PMID:40134549
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综述 | 系统性硬化症的发病机制整合性综述,涵盖最新研究进展 | 强调从基础研究向精准治疗方法的转变,整合多组学数据探索致病细胞亚型 | NA | 探讨系统性硬化症的发病机制和精准治疗方向 | 系统性硬化症的病理机制和治疗方法 | NA | 系统性硬化症 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 基因组, 蛋白质组, 表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10091 | 2025-10-07 |
MrgD as a Novel Modeling and Treatment Target for Pulmonary Hypertension
2025-Mar-27, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322337
PMID:40143817
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研究论文 | 本研究探讨了MrgD受体在肺动脉高压中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示MrgD在肺动脉高压中的保护作用及其通过PIM1/AKT/MAZ信号通路调控血管重塑的新机制 | 研究主要基于动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究MrgD在肺动脉高压发病机制中的作用及治疗靶点价值 | 肺动脉高压动物模型(Sugen5416+缺氧、野百合碱诱导)、基因敲除小鼠、人肺动脉平滑肌细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序、RNA测序、基因敲除、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种肺动脉高压动物模型及人肺动脉平滑肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
10092 | 2025-10-07 |
Phosphodiesterase 5 inactivation in vascular smooth muscle cells aggravates aortic aneurysm and dissection
2025-Mar-27, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6411
PMID:40145405
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研究论文 | 本研究探讨血管平滑肌细胞中PDE5A失活对主动脉瘤和夹层的影响机制 | 首次揭示血管平滑肌细胞特异性PDE5A缺失通过cGMP/PKG信号通路加剧主动脉瘤和夹层的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明血管平滑肌细胞中PDE5A在主动脉瘤和夹层发病机制中的具体作用 | 人类和小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, western blotting, 免疫荧光, 免疫组织化学染色 | 基因敲除小鼠模型, 基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像, 蛋白质印迹数据 | 人类和小鼠主动脉组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10093 | 2025-10-07 |
CellPhoneDB v5: inferring cell-cell communication from single-cell multiomics data
2025-Mar-25, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01137-1
PMID:40133495
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研究论文 | 介绍CellPhoneDB v5生物信息学工具包,用于从单细胞多组学数据推断细胞间通讯 | 扩展了配体-受体相互作用数据库,增加了约1000个非肽类配体介导的相互作用;引入了可根据实验设计定制查询的新方法;整合了空间转录组学和染色质可及性数据的新策略;新增了交互式可视化模块 | 需要基本的Python知识,协议执行时间约15分钟 | 开发改进细胞间通讯推断的生物信息学工具 | 单细胞多组学数据中的细胞间通讯 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学分析,空间转录组学,单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞基因组学数据,空间转录组学数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
10094 | 2025-10-07 |
RBAD: the first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2025-Mar-25, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01165
PMID:40145964
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研究论文 | 开发首个专注于阿尔茨海默病患者血液RNA变化的数据库RBAD | 首个专门研究阿尔茨海默病血液RNA变化的网络分析平台,包含超过20,000个血液特征 | NA | 研究阿尔茨海默病患者血液RNA变化及其临床相关性 | 阿尔茨海默病患者和小鼠模型的血液样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1468个血液样本(包含人类和小鼠研究) | NA | bulk RNA-seq, microRNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
10095 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the post-spinal cord injury dorsal root ganglia in cynomolgus monkeys: elucidation of the cellular immune microenvironment of the central nervous system
2025-Mar-25, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00974
PMID:40145972
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食蟹猴脊髓损伤后背根神经节的细胞免疫微环境 | 首次对食蟹猴脊髓损伤后背根神经节进行全面的单细胞转录组分析,揭示了巨噬细胞亚群在轴突再生中的关键作用 | 研究仅针对食蟹猴模型,样本数量有限,需要进一步验证 | 阐明脊髓损伤后背根神经节免疫细胞微环境的变化及其对轴突再生的影响 | 食蟹猴脊髓损伤模型中的背根神经节和脊髓细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食蟹猴中胸段挫伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10096 | 2025-10-07 |
EGFR-mediated local invasiveness and response to Cetuximab in head and neck cancer
2025-Mar-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02290-1
PMID:40121428
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研究论文 | 本研究通过功能基因图谱分析揭示了头颈癌中EGFR介导的局部侵袭基因调控网络及其与西妥昔单抗疗效的关系 | 首次构建了头颈癌局部侵袭基因调控网络(invGRN),发现INHBA和SNAI2作为核心枢纽,并证实SPHK1共抑制可增强西妥昔单抗的侵袭阻断效果 | 研究基于细胞3D模型和公共数据库,需要进一步临床验证 | 探索EGFR驱动头颈癌进展的分子网络机制,寻找联合治疗靶点和预测标志物 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系、患者来源异种移植模型(PDX)和R/M-HNSCC患者 | 癌症生物学 | 头颈癌 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 光转换示踪技术 | 3D细胞模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,包含细胞模型、PDX模型和患者数据 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
10097 | 2025-10-07 |
Sox9 and nuclear factor I transcription factors regulate the timing of neurogenesis and ependymal maturation in dopamine progenitors
2025-Mar-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204421
PMID:39995267
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研究论文 | 本研究探讨Sox9和核因子I转录因子在中脑多巴胺神经元前体细胞周期停滞和室管膜细胞成熟过程中的调控作用 | 首次揭示Sox9和核因子I转录因子在调控中脑多巴胺神经元前体细胞向G0期退出和室管膜细胞成熟时序中的关键作用 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段,对成年后这些细胞的长期功能需要进一步验证 | 阐明中脑多巴胺神经元前体细胞发育过程中细胞周期退出和分化的分子调控机制 | 中脑多巴胺神经元前体细胞和室管膜细胞 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 不同胚胎发育阶段的中脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10098 | 2025-10-07 |
Utilizing sc-linker to integrate single-cell RNA sequencing and human genetics to identify cell types and driver genes associated with non-small cell lung cancer
2025-Jan-23, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13525-1
PMID:39849454
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和人类遗传学数据,识别与非小细胞肺癌相关的细胞类型和驱动基因 | 使用sc-linker框架首次整合scRNA-seq、表观基因组SNP-基因映射和GWAS汇总统计数据,识别肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 研究主要基于计算分析,需要实验验证来确认RAB31的功能作用 | 识别与非小细胞肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 非小细胞肺癌患者和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, 表观基因组分析 | sc-linker框架, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10099 | 2025-10-07 |
The multi-target mechanism of action of Selaginella doederleinii Hieron in the treatment of nasopharyngeal carcinoma: a network pharmacology and multi-omics analysis
2025-01-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83921-3
PMID:39747499
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研究论文 | 通过网络药理学和多组学分析探讨卷柏治疗鼻咽癌的多靶点作用机制 | 首次结合网络药理学、多组学分析和分子对接技术系统揭示卷柏治疗鼻咽癌的多靶点协同作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索卷柏治疗鼻咽癌的作用机制 | 卷柏活性成分及其与鼻咽癌相关靶点的相互作用 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 网络药理学, WGCNA分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 蛋白互作网络, 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据, 化合物靶点数据 | GSE53819数据集及多个数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
10100 | 2025-10-07 |
Discrepancies between human and murine model cerebral aneurysms at single-cell resolution
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1512938
PMID:40134579
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析比较人类与小鼠模型脑动脉瘤的细胞和分子差异 | 首次在单细胞分辨率系统比较人类与小鼠脑动脉瘤模型的细胞表型和分子特征差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA测序数据集,缺乏实验验证 | 探究人类与小鼠脑动脉瘤模型在细胞和分子水平的差异 | 人类和小鼠模型的脑动脉瘤组织 | 单细胞组学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 轨迹分析, 基因调控网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |