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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10061 - 10080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10061 | 2025-04-19 |
Decoding B Cells in Autoimmune Diseases Through ScRNA + BCR-Seq: Current Knowledge and Future Directions
2025-04-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14070539
PMID:40214492
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq)在自身免疫性疾病中B细胞免疫病理机制研究中的应用 | 揭示了B细胞亚群转录组与B细胞受体(BCR)克隆之间的动态关联，并探讨了双BCR B细胞和B/T双表型细胞在自身免疫中的潜在作用 | NA | 推动自身免疫性疾病多组学研究和精准治疗范式的创新 | B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | scRNA-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10062 | 2025-10-07 |
Lipid metabolism-related genes are involved in the formation of macrophage extracellular traps in allergic airway inflammation
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00319-5
PMID:39789299
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了脂质代谢基因ABCA1在巨噬细胞胞外诱捕网形成中的作用 | 首次发现脂质代谢基因ABCA1参与巨噬细胞胞外诱捕网的形成过程 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仍需进一步完善 | 探究脂质代谢在过敏性气道炎症中巨噬细胞胞外诱捕网形成的作用机制 | 巨噬细胞和哮喘患者样本 | 生物信息学 | 哮喘 | WGCNA, LASSO回归, 免疫浸润分析, 单细胞转录组分析, 免疫荧光, SYTOX Green染色, Western blot | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GEO数据集(GSE40885, GSE42606, GSE27066, GSE137268, GSE256534)和Tabula Muris数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10063 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of autophagy status and its relationship with immunity and inflammation in ischemic stroke through integrated transcriptomic and single-cell sequencing
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00320-y
PMID:39827328
|
研究论文 | 通过整合转录组和单细胞测序技术，全面分析缺血性脑卒中中自噬状态及其与免疫和炎症的关系 | 首次系统揭示缺血性脑卒中患者自噬状态受抑制，发现两种具有不同基因表达模式和免疫细胞浸润的IS亚型，并通过单细胞测序证实过氧化物酶体自噬下调 | 研究结果仍需在更大规模队列中进一步验证，自噬相关基因的具体调控机制有待深入探索 | 探究自噬和自噬相关基因在缺血性脑卒中中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者和IS小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, WGCNA | 机器学习预测模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | GEO数据库IS数据集、外部验证队列和IS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 10064 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of genetic variability and functional traits in lung adenocarcinoma epithelial cells via single-cell RNA sequencing, GWAS, bayesian deconvolution, and machine learning
2025-Apr, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01621-2
PMID:39992528
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究、贝叶斯反卷积和机器学习技术，研究肺腺癌上皮细胞的遗传变异和功能特征 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究通过贝叶斯反卷积和机器学习方法相结合，系统分析肺腺癌上皮细胞的遗传和功能复杂性 | NA | 揭示肺腺癌的遗传和功能复杂性，探索肿瘤进展机制和免疫-上皮细胞相互作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 贝叶斯反卷积, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10065 | 2025-04-19 |
HISSTA: a human in situ single-cell transcriptome atlas
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf142
PMID:40163697
|
research paper | 介绍了一个名为HISSTA的数据库，用于存储和分析人类组织中的单细胞分辨率原位转录组数据 | HISSTA数据库首次整合了多种高分辨率原位成像技术生成的数据，并提供了交互式可视化工具 | NA | 构建一个全面的单细胞分辨率原位转录组数据库，以促进生物学和医学研究 | 人类组织中的单细胞转录组数据 | digital pathology | NA | MERFISH, CosMx SMI, Xenium | NA | spatial transcriptome data | 112个样本，2800万个细胞，覆盖16种组织类型，来自63项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 10066 | 2025-04-19 |
uHAF: a unified hierarchical annotation framework for cell type standardization and harmonization
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf149
PMID:40172934
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研究论文 | 开发了一个统一的层次注释框架uHAF，用于标准化和协调单细胞转录组学中的细胞类型注释 | 提出了一个包含器官特异性层次细胞类型树和基于大型语言模型的映射工具的统一框架，以解决单细胞转录组学中细胞类型注释不一致的问题 | NA | 解决单细胞转录组学中细胞类型注释不一致的问题，促进数据整合和机器学习应用 | 单细胞转录组学中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学，大型语言模型 | GPT-4 | 单细胞转录组数据 | 涵盖38个器官的标准化层次参考 | NA | NA | NA | NA |
| 10067 | 2025-04-19 |
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2025-Mar-13, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001302
PMID:40080840
|
研究论文 | 本研究探讨了Pre-B-cell白血病转录因子1（PBX1）在肝纤维化中的作用及其通过IL-7信号通路激活肝星状细胞（HSC）的机制 | 揭示了PBX1在HSC激活中的新作用，并提出了靶向IL-7信号通路干预肝纤维化的概念验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本相关性研究较少 | 探究PBX1在肝纤维化中的作用及其分子机制 | 肝星状细胞（HSC）和小鼠模型 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA-seq、Ingenuity通路分析、报告基因检测、染色质免疫沉淀检测 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和肝硬化患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10068 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物，并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型，体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制，建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10069 | 2025-04-19 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Circadian Rhythm Disruption-Related Genes Associated with Prognosis and Drug Resistance in Colorectal Cancer Patients
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S499806
PMID:40241740
|
研究论文 | 本研究通过整合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq数据，揭示了结直肠癌中昼夜节律紊乱相关基因与预后及药物耐药性的关联 | 首次系统揭示了CRDGs在结直肠癌中的表达特征及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | 研究结果需要更多数据集进行验证 | 探索昼夜节律相关基因在结直肠癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq, Bulk RNA-Seq, WGCNA, GSEA | 预后模型 | RNA测序数据 | GSE178318数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10070 | 2025-04-19 |
An Integrative Analysis of Transcriptome Combined with Machine Learning and Single-Cell RNA-Seq for the Common Biomarkers in Crohn's Disease and Kidney Stone Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S502513
PMID:40242727
|
research paper | 该研究通过整合转录组分析、机器学习和单细胞RNA测序技术，寻找克罗恩病和肾结石病的共同生物标志物 | 结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别克罗恩病与肾结石病的共同生物标志物，并构建诊断模型 | 研究样本量有限，仅使用了GEO数据库中的三个克罗恩病和一个肾结石病数据集 | 寻找能够预测克罗恩病伴随肾结石病的生物标志物 | 克罗恩病(CD)和肾结石病(KSD)患者 | 生物信息学 | 克罗恩病, 肾结石病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习算法(未指定具体模型), 列线图(nomogram) | 基因表达数据 | 四个GEO数据集(三个CD数据集和一个KSD数据集) | NA | NA | NA | NA |
| 10071 | 2025-04-19 |
Cross one single body 49 tissues single-cell transcriptome reveals detailed macrophage heterogeneity during pig pregnancy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574120
PMID:40242774
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术，研究了健康怀孕猪49个组织中巨噬细胞的异质性 | 首次在单个健康怀孕猪的49个组织中构建了巨噬细胞的单细胞转录组图谱，揭示了巨噬细胞在组织和物种间的分子差异和共性 | 研究仅基于单个怀孕猪的样本，可能限制了结果的普遍性 | 理解怀孕期间巨噬细胞的多样性和组织特异性适应 | 健康怀孕猪的49个组织中的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 114,881个巨噬细胞来自49个组织/器官的一个健康怀孕猪 | NA | NA | NA | NA |
| 10072 | 2025-10-07 |
PPARγ-dependent remodeling of translational machinery in adipose progenitors is impaired in obesity
2024-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114945
PMID:39579770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和核糖体分析揭示了PPARγ激动剂如何通过调控翻译机制促进肥胖状态下脂肪组织的可塑性 | 首次发现PPARγ直接调控核糖体因子表达并通过促进特定mRNA的翻译选择性来增强脂肪生成 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究PPARγ激动剂在肥胖状态下对脂肪组织前体细胞翻译机制的重塑作用 | 肥胖小鼠的基质血管组分细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序, 核糖体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖小鼠的腹股沟和附睾脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10073 | 2025-10-07 |
PIEZO-dependent mechanosensing is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance
2024-11-29, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj7615
PMID:39607940
|
研究论文 | 本研究揭示了PIEZO机械敏感通道通过感知细胞外机械刺激调控肠道干细胞命运决定和维持的机制 | 首次在体内证实PIEZO通道在肠道干细胞机械感知中的关键作用，并建立了从机械信号感知到干细胞功能调控的完整机制通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类肠道干细胞中的适用性需要进一步验证 | 探究肠道干细胞如何感知机械信号并维持稳态 | 小鼠肠道干细胞及其微环境 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小鼠遗传学，生物工程基质，拉伸装置 | NA | 基因表达数据，机械性能测量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10074 | 2025-10-07 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传调控异常 | 首次系统研究AD外周免疫系统的表观遗传变化，发现CD8 T细胞中CXCR3基因启动子的顺式调控元件和单核细胞中AD特异的RELA转录因子结合位点 | 外周免疫系统研究相对有限，样本规模未明确说明 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录调控改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞（CD8 T细胞和单核细胞） | 表观遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，转座酶可及染色质测定，RNA测序 | NA | 表观遗传数据，转录组数据 | NA | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10075 | 2025-10-07 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
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综述 | 探讨阿尔茨海默病性别差异的潜在生物学机制 | 整合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术，系统研究性别差异在阿尔茨海默病中的作用机制 | NA | 理解阿尔茨海默病性别差异的生物学基础 | 阿尔茨海默病发病机制中的性别相关因素 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 10076 | 2025-04-18 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
|
研究论文 | 研究Zika病毒prM蛋白上的S139N突变如何将免疫反应从亚洲株转变为当代株 | 首次使用单细胞测序技术系统评估三种ZIKV株（亚洲祖先株FSS13025/2010、S139N突变株FSS13025-S139N和当代株GZ01/2016）诱导的免疫反应，并发现S139N突变株的免疫谱与当代株相似 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本 | 探究Zika病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应模式的影响及其与神经损伤的关系 | Zika病毒株（FSS13025/2010、FSS13025-S139N、GZ01/2016）和1日龄小鼠 | 病毒学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序技术 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 三种ZIKV株感染的1日龄小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 10077 | 2025-04-18 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序技术，揭示了CD44+肿瘤细胞在结直肠癌前沿通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在结直肠癌前沿形成独特的环状结构，并通过PTN信号诱导CAFs表型转变 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，人类结直肠癌的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤异质性如何影响结直肠癌的空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析(ST)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌模型和未明确数量的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10078 | 2025-04-18 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性乙型肝炎患者中单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞中LMO2的高表达可能与单核细胞扩增有关，并识别了一个新的单核细胞-血小板聚集体(MPA)亚群，该亚群在肝纤维化早期可能发挥重要作用 | 研究样本量有限，且未探讨MPA在肝纤维化后期的潜在作用 | 探究慢性乙型肝炎患者中单核细胞异质性及其在肝纤维化中的作用机制 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎和肝纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组(具体数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
| 10079 | 2025-04-18 |
Identification of Novel Protein Biomarkers for Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Integrating Human Plasma Proteome with Genome
2025-Apr-17, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01226-8
PMID:40240670
|
研究论文 | 本研究通过整合人类血浆蛋白质组与基因组数据，识别出与肝内胆管癌(ICC)潜在相关的蛋白质生物标志物 | 首次对ICC进行蛋白质组-MR分析，揭示了其复杂的遗传结构，并鉴定出5种与疾病有潜在因果关联的新型血液蛋白 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能在其他人群中的普适性有待验证 | 发现ICC的潜在治疗和诊断靶点 | 肝内胆管癌(ICC)相关蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组范围孟德尔随机化(MR)、ELISA、scRNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据 | 来自deCODE血浆蛋白质组GWAS和欧洲meta分析的遗传数据，TCGA和GTEx数据库样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10080 | 2025-04-18 |
Single-cell hdWGCNA reveals a novel diagnostic model and signature genes of macrophages associated with chronic obstructive pulmonary disease
2025-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02025-4
PMID:40244418
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，揭示了慢性阻塞性肺病（COPD）中巨噬细胞亚群的诊断模型和特征基因 | 首次使用hdWGCNA方法识别与COPD相关的巨噬细胞亚群及其特征基因，并构建了基于机器学习的临床诊断模型 | 研究样本量未明确说明，且仅基于RNA测序数据，缺乏实验验证 | 探索COPD的免疫机制并开发临床诊断模型 | 慢性阻塞性肺病（COPD）患者和正常个体的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA） | 随机森林（RF），卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |