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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10041 | 2025-10-07 |
Cellular Crosstalk Promotes Hepatic Progenitor Cell Proliferation and Stellate Cell Activation in 3D Co-culture
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101472
PMID:39892785
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研究论文 | 开发3D共培养系统研究肝祖细胞与星状细胞间的相互作用及其在肝损伤中的作用 | 建立首个能实时观察肝祖细胞增殖与星状细胞激活的3D共培养模型,并发现两种细胞需直接接触才能相互影响 | 研究主要基于小鼠细胞,人类样本验证有限;3D培养系统可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肝损伤过程中肝祖细胞与星状细胞间的功能相互作用机制 | 小鼠肝星状细胞和肝祖细胞(未分化肝内胆管细胞类器官) | 细胞生物学 | 肝纤维化 | 3D共培养、荧光标记、细胞分选、基因表达分析、空间转录组学 | 3D器官共培养系统 | 基因表达数据、形态学观察数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10042 | 2025-10-07 |
Exploring the impact of cuproptosis on prostate cancer prognosis via RNA methylation regulation based on single cell and bulk RNA sequencing data
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573611
PMID:40235543
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据探索铜死亡和RNA甲基化调控对前列腺癌预后的影响 | 首次将铜死亡与RNA甲基化调控因子结合构建前列腺癌预后模型,并通过单细胞测序揭示免疫特征 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索铜死亡和RNA甲基化调控在前列腺癌预后中的作用机制 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,免疫组化 | LASSO Cox回归模型 | 基因组数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA前列腺癌数据集及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
10043 | 2025-10-07 |
Unveiling purine metabolism dysregulation orchestrated immunosuppression in advanced pancreatic cancer and concentrating on the central role of NT5E
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569088
PMID:40236698
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示胰腺癌中嘌呤代谢失调如何促进免疫抑制微环境形成,并确定NT5E在此过程中的核心作用 | 首次在胰腺癌微环境中系统分析嘌呤代谢异质性,发现NT5E是逆转免疫抑制的关键靶点 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 探究胰腺癌嘌呤代谢重编程与免疫抑制微环境的关系 | 胰腺癌患者肿瘤微环境中的各类细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞共培养 | AUCell, Ucell, Cellchat | 转录组数据, 空间数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
10044 | 2025-10-07 |
PM2.5 exposure reprograms cell cycle dynamics in uterine immune cells at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561290
PMID:40236703
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PM2.5暴露对小鼠子宫免疫细胞周期动态的重编程作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示PM2.5暴露对子宫免疫细胞周期动态的细胞类型特异性影响 | 研究仅基于小鼠模型,样本量为9,000个细胞,需要进一步验证 | 探究PM2.5暴露对生殖系统免疫细胞周期调控的细胞机制 | 小鼠子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9,000个平衡细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10045 | 2025-10-07 |
Current insights into human pathogenic phenuiviruses and the host immune system
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2384563
PMID:39072499
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综述 | 本综述全面概述了人类致病性白纤病毒与宿主免疫系统的相互作用机制 | 系统整合了白纤病毒毒力因子与宿主免疫互作的最新研究进展,特别关注RVFV和SFTSV的免疫逃避机制 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 阐明人类致病性白纤病毒的宿主识别机制、免疫逃避策略和潜在治疗方法 | 人类致病性白纤病毒(特别是裂谷热病毒和发热伴血小板减少综合征病毒)及其与宿主免疫系统的相互作用 | NA | 病毒感染性疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、基因编辑、单克隆抗体技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
10046 | 2025-10-07 |
Hidden liver-joint axis: HBV infection causes rheumatoid arthritis via TRAFD1 with imbalance of HBV X protein and trans-ferulic acid
2024-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2024.2422540
PMID:39484999
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研究论文 | 本研究揭示了乙肝病毒通过TRAFD1介导的肝-关节轴机制导致类风湿关节炎的发病机制 | 首次发现HBV编码的HBx蛋白通过上调TRAFD1促进成纤维样滑膜细胞向肌成纤维细胞转化,并鉴定反式阿魏酸可抑制此过程 | 动物模型为CIA模型而非直接HBV感染模型,临床样本量未明确说明 | 探究乙肝病毒感染与类风湿关节炎之间的因果关系及分子机制 | 乙肝病毒感染者、类风湿关节炎患者、转基因小鼠模型、成纤维样滑膜细胞 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组测序、代谢组学、WGCNA | CIA小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、代谢组学 | NA | NA |
10047 | 2025-10-07 |
A targetable type III immune response with increase of IL-17A expressing CD4+ T cells is associated with immunotherapy-induced toxicity in melanoma
2024-09, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00810-4
PMID:39210005
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制,发现III型免疫反应和IL-17A表达CD4+T细胞与免疫治疗毒性相关 | 首次揭示了III型免疫反应特征和IL-17A表达CD4+T细胞在免疫治疗毒性中的作用,并提供了抗IL-17A治疗不良反应的概念验证证据 | 样本量有限,抗IL-17A治疗仅在两名患者中验证,需要更大规模的临床试验确认疗效 | 研究免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制 | 黑色素瘤患者接受免疫检查点抑制剂治疗期间出现不良反应的患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 蛋白质组学分析、多重细胞因子检测、流式细胞术、多重免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 血清蛋白质组数据、细胞因子数据、流式细胞数据、组织病理数据、空间转录组数据 | 未明确具体样本数量,包括血清样本、外周血样本、皮肤皮疹和结肠炎组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
10048 | 2025-10-07 |
The proteogenomic landscape of multiple myeloma reveals insights into disease biology and therapeutic opportunities
2024-08, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00784-3
PMID:38942927
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研究论文 | 通过蛋白质基因组学分析多发性骨髓瘤的疾病生物学特征和潜在治疗靶点 | 首次系统评估多发性骨髓瘤蛋白质组,整合磷酸化蛋白质组学、RNA测序和纳米孔DNA测序进行多组学分析 | 样本量相对有限(138例),需要进一步验证研究 | 探索多发性骨髓瘤的蛋白质基因组学特征以改善风险分层和发现新疗法 | 138例原发性患者来源的浆细胞恶性肿瘤,包括初治多发性骨髓瘤、浆细胞白血病和意义未明的单克隆丙种球蛋白病以及健康对照 | 癌症研究 | 多发性骨髓瘤 | 串联质量标签定量蛋白质组学、RNA测序、纳米孔DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、基因组数据 | 138例患者样本和健康对照 | Oxford Nanopore | 蛋白质组学、RNA测序、DNA测序、单细胞RNA测序 | 纳米孔测序 | 基于串联质量标签的定量全局(磷酸化)蛋白质组学 |
10049 | 2025-10-07 |
An atlas of transcribed enhancers across helper T cell diversity for decoding human diseases
2024-07-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add8394
PMID:38963856
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类CD4 T细胞中增强子RNA和其他编码/非编码RNA的转录起始位点图谱 | 首次在人类CD4 T细胞中定义了双向转录增强子的细胞类型特异性图谱,并揭示疾病遗传性在这些增强子中的富集 | NA | 解码转录增强子与人类疾病的关联 | 人类CD4 T细胞 | 生物信息学 | 免疫介导疾病 | 5'单细胞RNA测序,单细胞染色质分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10050 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.596911
PMID:38895265
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研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇的响应机制,发现其表型复制干扰素响应并识别出ELF3作为潜在的紫杉醇耐药生物标志物 | 首次发现紫杉醇治疗诱导的转录程序与干扰素响应高度相似,并通过单细胞RNA测序结合活细胞成像技术鉴定出ELF3等转录因子在细胞周期调控和紫杉醇耐药中的关键作用 | 研究主要基于体外细胞模型,临床样本验证有限,需要进一步体内实验和临床试验确认ELF3作为生物标志物的可靠性 | 探索三阴性乳腺癌细胞对紫杉醇治疗的分子响应机制,识别耐药相关因子 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 计算生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低,活细胞成像,转录因子富集分析 | NA | 单细胞转录组数据,公共患者数据,活细胞成像数据 | 未明确样本数量,使用TNBC细胞系和公共乳腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10051 | 2025-10-07 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.09.588557
PMID:38645223
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研究论文 | 本研究开发了一个动态平台来探究前列腺癌神经内分泌转化的分子机制 | 建立了能够模拟前列腺癌神经内分泌转化的动态模型,揭示了ASCL1在此过程中的关键作用 | 需要原生微环境支持,传统类器官培养无法复制这一过程 | 探究前列腺癌神经内分泌谱系可塑性的分子决定因素 | 小鼠前列腺类器官和神经内分泌前列腺癌模型 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光,空间转录组学,PrismSpot分析 | NA | 空间基因表达数据,免疫荧光图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10052 | 2025-10-07 |
Multiomic spatial landscape of innate immune cells at human central nervous system borders
2024-Jan, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02673-1
PMID:38123840
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研究论文 | 通过多组学方法全面表征人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的空间分布特征 | 首次结合单细胞RNA测序、飞行时间质谱流式和单细胞空间转录组学等技术,系统揭示人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的时空分布特征 | 样本数量相对有限,特别是干细胞移植患者仅15例 | 全面表征人类中枢神经系统边界先天免疫细胞的组成和分布 | 人类中枢神经系统边界免疫细胞,包括小胶质细胞和CNS相关巨噬细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式,单细胞空间转录组学,命运图谱,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 102名个体共356,000个转录组,15名干细胞移植患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,质谱流式 | NA | NA |
10053 | 2025-10-07 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.31.565031
PMID:37961519
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研究论文 | 本研究通过多组学技术分析乳腺癌亚型与起源细胞之间的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合染色质可及性和转录组数据,系统揭示乳腺癌亚型与特定起源细胞的谱系关系 | 样本量相对有限(37例患者),部分分子机制仍需进一步验证 | 阐明乳腺癌不同亚型的细胞起源及其转录调控网络 | 37名乳腺癌患者的61个样本(包括肿瘤和正常组织) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学,多重成像 | PAM50亚型分析算法,轨迹分析,调控网络分析 | 基因组,转录组,表观基因组,空间定位数据 | 37例乳腺癌患者的61个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核ATAC-seq,空间转录组学,多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA |
10054 | 2025-10-07 |
Nanoparticle-mediated sodium butyrate delivery for repairing hypoxic-ischemic brain injury in premature infants
2025-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101665
PMID:40230649
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研究论文 | 本研究开发了一种负载丁酸钠的磁性荧光纳米颗粒,通过调节Sp1和TGF-β1信号通路修复早产儿缺氧缺血性脑损伤 | 首次利用磁性荧光纳米颗粒递送丁酸钠,通过磁靶向和聚焦超声技术实现脑部精准给药,并阐明其通过Sp1/TGF-β1信号通路促进脑修复的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在临床患者中验证;纳米颗粒的长期生物安全性需要进一步评估 | 探索纳米颗粒介导的丁酸钠递送系统对早产儿缺氧缺血性脑损伤的修复机制 | 缺氧缺血性脑病早产儿模型小鼠 | 纳米医学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序, 高通量转录组分析, 非靶向代谢组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 | HIEP小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10055 | 2025-10-07 |
Regulatory role of CD177+ neutrophils in BMP signaling pathway and its implications for inflammatory bowel disease, sepsis, and intestinal tumors
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102336
PMID:40158420
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研究论文 | 本研究探讨CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对炎症性肠病、脓毒症和肠道肿瘤的影响 | 首次系统揭示CD177+中性粒细胞通过调控BMP信号通路在多种疾病中的关键作用机制 | 需要进一步的临床验证才能转化为有效治疗策略 | 探索CD177+中性粒细胞在BMP信号通路中的调控作用及其对疾病发生发展和治疗的影响 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学 | 炎症性肠病、脓毒症、肠道肿瘤 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR、流式细胞术、细胞培养 | WGCNA、差异表达分析、功能富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验数据 | GEO数据库中的IBD和脓毒症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
10056 | 2025-10-07 |
Dynamic changes of molecular pattern and cellular subpopulation in puncture-induced tendon injury model
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112034
PMID:40230536
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研究论文 | 本研究通过建立穿刺诱导的肌腱损伤模型,揭示了早期肌腱修复过程中的分子模式和细胞亚群动态变化 | 首次在多个时间点系统分析早期肌腱损伤的分子模式和细胞亚群,识别了7个特征基因集和15种参与修复的细胞类型 | 临床早期肌腱损伤样本获取困难,研究主要基于动物模型 | 探索早期肌腱修复的分子机制和细胞动态 | 穿刺诱导的肌腱损伤模型 | 单细胞组学 | 肌腱疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10057 | 2025-10-07 |
Senescent CD8+ T cells: a novel risk factor in atrial fibrillation
2025-Apr-15, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae222
PMID:39382426
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色流式细胞术发现衰老CD8+ T细胞是心房颤动的关键免疫特征,并揭示了其通过干扰素-γ诱导钙处理异常促进房颤的机制 | 首次将衰老CD8+ T细胞鉴定为房颤的新型风险因素,并揭示了其通过干扰素-γ诱导心肌细胞钙处理异常致心律失常的机制 | NA | 全面表征房颤中的免疫细胞特征并探究其潜在机制 | 房颤患者和非房颤对照人群的免疫细胞及hiPSC来源的心房肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多色流式细胞术, 心脏光学标测 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 电生理数据 | 房颤患者和非房颤对照人群的外周静脉和左心房样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10058 | 2025-10-07 |
Dual regulation of Atf3 and Lonp1 as therapeutic targets in cerebral ischaemia-reperfusion injury
2025-Apr-15, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2024-003324
PMID:40044488
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研究论文 | 本研究探讨了Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的双重调控机制及其治疗潜力 | 首次揭示Atf3通过调控Lonp1表达影响线粒体功能和神经元存活的分子机制 | NA | 研究Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 脑缺血再灌注损伤模型中的神经元 | 生物医学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10059 | 2025-10-07 |
Determinants of Response to Sequential Pembrolizumab with Trastuzumab plus Platinum/5-FU in HER2-Positive Gastric Cancer: A Phase II Chemoimmunotherapy Trial
2025-Apr-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3528
PMID:40100100
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研究论文 | 评估序贯使用帕博利珠单抗联合曲妥珠单抗加铂类/5-FU治疗HER2阳性胃癌的疗效和生物学机制 | 首次在HER2阳性胃癌中评估序贯免疫化疗方案,并通过多时间点活检揭示曲妥珠单抗诱导的NK细胞浸润和Fc受体介导的细胞毒性机制 | 样本量较小(16例患者),为单臂II期试验 | 评估序贯帕博利珠单抗联合曲妥珠单抗加铂类/5-FU在HER2阳性胃癌中的疗效和生物学决定因素 | 晚期HER2阳性胃食管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 16例治疗初治的转移性HER2阳性胃食管癌患者 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | NA |
10060 | 2025-10-07 |
Plasma CCL3 predicts adverse heart failure outcomes in patients with arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Apr-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04024-y
PMID:40223064
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研究论文 | 本研究探讨了致心律失常性心肌病(ACM)患者心肌纤维脂肪组织的特征及血浆趋化因子水平与心力衰竭负担的关系 | 首次发现ACM患者纤维脂肪组织中米色/棕色脂肪标志物表达升高,饱和甘油三酯水平增加,并通过单细胞RNA测序揭示了促炎巨噬细胞的明显积累 | 需要在更大规模和独立的队列中进行进一步验证 | 研究ACM患者纤维脂肪组织特征及血浆趋化因子水平与心力衰竭预后的关系 | 致心律失常性心肌病患者 | 心血管疾病研究 | 致心律失常性心肌病 | 实时定量PCR, 脂质组学分析(LC-MS), 单细胞RNA测序, 免疫染色, 酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 纤维脂肪组织样本: 正常对照10例, ACM患者24例; 单细胞RNA测序: 正常对照2例, ACM患者6例; 随访研究: ACM患者102例 | NA | 单细胞RNA测序, 脂质组学分析 | NA | NA |