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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10021 | 2025-10-07 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示寨卡病毒prM蛋白S139N突变如何改变免疫反应模式 | 首次发现S139N单点突变可使亚洲株免疫反应特征转变为当代流行株模式 | 研究仅使用1日龄小鼠模型,未在更成熟动物模型或人体中验证 | 探究寨卡病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应的影响 | 寨卡病毒感染的小鼠脑组织免疫细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1日龄小鼠感染三种寨卡病毒株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10022 | 2025-10-07 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了结直肠癌前缘CD44+肿瘤细胞通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在肿瘤前缘通过PTN信号诱导CAFs表型转换,揭示了肿瘤异质性在空间结构上的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限 | 探索结直肠癌异质性如何影响肿瘤空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床患者样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析, 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌模型和临床样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10023 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞-血小板聚集体(MPA)亚群,并揭示其通过CCL5信号通路促进肝纤维化的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现;机制研究主要基于体外实验 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎伴肝纤维化患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎、肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10024 | 2025-04-18 |
Identification of Novel Protein Biomarkers for Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Integrating Human Plasma Proteome with Genome
2025-Apr-17, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01226-8
PMID:40240670
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研究论文 | 本研究通过整合人类血浆蛋白质组与基因组数据,识别出与肝内胆管癌(ICC)潜在相关的蛋白质生物标志物 | 首次对ICC进行蛋白质组-MR分析,揭示了其复杂的遗传结构,并鉴定出5种与疾病有潜在因果关联的新型血液蛋白 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能在其他人群中的普适性有待验证 | 发现ICC的潜在治疗和诊断靶点 | 肝内胆管癌(ICC)相关蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组范围孟德尔随机化(MR)、ELISA、scRNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据 | 来自deCODE血浆蛋白质组GWAS和欧洲meta分析的遗传数据,TCGA和GTEx数据库样本 | NA | NA | NA | NA |
10025 | 2025-04-18 |
Single-cell hdWGCNA reveals a novel diagnostic model and signature genes of macrophages associated with chronic obstructive pulmonary disease
2025-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02025-4
PMID:40244418
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析,揭示了慢性阻塞性肺病(COPD)中巨噬细胞亚群的诊断模型和特征基因 | 首次使用hdWGCNA方法识别与COPD相关的巨噬细胞亚群及其特征基因,并构建了基于机器学习的临床诊断模型 | 研究样本量未明确说明,且仅基于RNA测序数据,缺乏实验验证 | 探索COPD的免疫机制并开发临床诊断模型 | 慢性阻塞性肺病(COPD)患者和正常个体的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA) | 随机森林(RF),卷积神经网络(CNN) | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
10026 | 2025-10-07 |
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-Apr-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00141-25
PMID:40130878
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新型长链非编码RNA VILMIR,发现其在主要呼吸道病毒感染中被诱导表达并调控宿主干扰素反应 | 首次发现并表征了VILMIR这一新型干扰素刺激基因,证明其在多种呼吸道病毒感染中均被上调表达并参与调控宿主抗病毒反应 | 需要进一步的机制研究来阐明VILMIR调控干扰素反应的具体分子机制 | 鉴定在人类主要呼吸道病毒感染中起关键作用的新型lncRNA靶标 | 人类上皮细胞系(A549)、免疫细胞系(SUP-T1、THP-1)、COVID-19患者支气管肺泡灌洗液样本 | 功能基因组学 | 呼吸道病毒感染 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多种人类细胞系和COVID-19患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
10027 | 2025-10-07 |
Virus-associated inflammation imprints an inflammatory profile on monocyte-derived macrophages in the human liver
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175241
PMID:40231469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性乙型肝炎患者肝脏中单核细胞来源的炎症性巨噬细胞的特征及其在炎症消退后的持续存在 | 首次在人类肝脏中鉴定出具有炎症转录特征的单核细胞来源巨噬细胞,并证明其在炎症消退后仍保留核心转录特征 | 研究样本仅限于慢性乙型肝炎患者,未涵盖其他病因的肝病 | 探究病毒相关炎症对肝脏巨噬细胞组成的重塑作用 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏组织和血液单核细胞 | 单细胞生物学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10028 | 2025-10-07 |
How is single-cell RNA sequencing contributing to the advancement of cancer therapeutics?
2025-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i4.103480
PMID:40235873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胃癌肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 利用scRNA-seq技术全面揭示胃癌不同阶段肿瘤微环境中的关键细胞相互作用 | NA | 探索单细胞RNA测序在癌症治疗进展中的贡献,特别关注胃癌治疗策略开发 | 胃癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10029 | 2025-10-07 |
Parallel comparison of T cell and B cell subpopulations of adenoid hypertrophy and tonsil hypertrophy of children
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58094-w
PMID:40229254
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的T细胞和B细胞亚群差异 | 首次在单细胞水平上平行比较AH和TH的免疫微环境差异,发现AH具有更多幼稚B细胞和调节性CD4 T细胞,但浆细胞较少 | 样本量相对有限,仅包含12对配对样本 | 探究儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的免疫微环境差异 | 1209名1-15岁被诊断为腺样体肥大的儿科患者,其中12对配对AH和TH样本 | 单细胞生物学 | 儿童耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1209名患者,12对配对AH和TH样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10030 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别胃癌循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过多组学整合方法识别出IQGAP1等8个胃癌生物标志物,并揭示IQGAP1在胃癌中的致癌作用 | NA | 识别胃癌诊断性循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 基因定量性状位点分析, 蛋白定量性状位点分析, 共定位分析, 孟德尔随机化 | NA | 血浆样本, 肿瘤组织样本, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10031 | 2025-10-07 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1RAP作为正常核型三重突变急性髓系白血病的免疫治疗靶点 | 首次通过多组学方法系统识别IL1RAP作为NKt-AML特异性表面抗原,并证明其可作为抗体-药物偶联物的潜在靶点 | 样本量有限(仅12例NKt-AML样本进行表面蛋白质组分析),需进一步验证 | 寻找NKt-AML特异性表面抗原以开发新型免疫疗法 | 原发性急性髓系白血病样本 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 100例原发性AML样本(表面蛋白质组),691例原发性AML样本(转录组),23例原发性AML样本(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10032 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
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研究论文 | 开发了一种名为miRTalk的新方法,用于从单细胞转录组数据推断细胞外囊泡来源的miRNA介导的细胞间通讯 | 首次提出通过细胞外囊泡来源的miRNA-靶标相互作用推断细胞间通讯的创新方法 | NA | 开发从单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯的计算方法 | 细胞外囊泡来源的miRNA及其靶标相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | miRTalk(专门开发的推断算法) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10033 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
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研究论文 | 通过生物信息学和免疫组化分析发现磷酸肌醇代谢和PNPLA7基因可作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次系统研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的作用,并发现PNPLA7作为新型生物标志物 | 基于公共数据库的分析,需要进一步实验验证 | 探讨磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的预后价值和治疗指导意义 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据,临床样本 | 公共数据库中的泌尿系统癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10034 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
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研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌肿瘤微环境开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 识别了12个独立预后基因并构建预后模型,首次揭示内皮细胞比例与患者预后的显著关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO回归,共识聚类,WGCNA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
10035 | 2025-10-07 |
Overcoming immunotherapy resistance in hepatocellular carcinoma by targeting myeloid IL-8/CXCR2 signaling
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.02.002
PMID:39916327
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研究论文 | 本研究通过靶向髓系IL-8/CXCR2信号通路克服肝细胞癌的免疫治疗耐药性 | 首次在单细胞水平揭示IL-8/CXCR2通路通过髓系抑制细胞介导免疫检查点抑制剂耐药机制,并验证CXCR2拮抗剂的联合治疗策略 | 研究样本量有限,主要基于临床前模型验证机制 | 阐明肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药机制并开发联合治疗策略 | 晚期肝细胞癌患者和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 原位小鼠模型 | 基因表达数据 | 晚期肝细胞癌患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10036 | 2025-10-07 |
The origin of patient-derived cancer organoids from pathologically undiagnosed specimen in patients with pancreatobiliary cancers
2025-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01026-5
PMID:39688793
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研究论文 | 本研究探讨了从病理学未确诊的胰胆管癌患者样本中建立患者来源癌症类器官的诊断潜力 | 首次证实从病理阴性样本建立的PDCOs能够代表患者癌组织的多组学特征,并展示其作为诊断工具的潜力 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模试验验证 | 评估患者来源癌症类器官在胰胆管癌诊断和研究中的应用价值 | 胰胆管癌患者(3例胰腺癌,1例胆囊癌)的组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌, 胆囊癌 | 肿瘤panel测序, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | 患者来源癌症类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 4例患者的9个样本(包括病理阴性样本) | NA | 单细胞RNA测序, 肿瘤panel测序 | NA | NA |
10037 | 2025-10-07 |
An accelerated human in-vitro aging model mimics in-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6173768/v1
PMID:40195985
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研究论文 | 开发了一种加速的人类体外衰老模型,可模拟体内衰老并用于抗衰老化合物的动态测试 | 建立了长期有丝分裂后人类成纤维细胞培养系统,能真实重现并加速体内衰老特征,首次实现了神经元衰老的伪纵向建模 | 研究主要基于成纤维细胞模型,可能无法完全代表其他细胞类型的衰老过程 | 开发人类特异性衰老研究平台并评估抗衰老化合物的疗效 | 人类成纤维细胞及其神经元转化细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学,表观遗传时钟分析,纵向配对转录组-表观遗传分析 | 体外衰老模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10038 | 2025-10-07 |
Identification of the immune infiltration and biomarkers in ulcerative colitis based on liquid-liquid phase separation-related genes
2025-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89252-1
PMID:39915583
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研究论文 | 基于液-液相分离相关基因鉴定溃疡性结肠炎的免疫浸润特征和生物标志物 | 首次将液-液相分离机制与溃疡性结肠炎免疫浸润联系起来,筛选出7个核心诊断基因并发现两个具有不同免疫特征的分子亚型 | NA | 探索液-液相分离相关基因在溃疡性结肠炎免疫浸润中的作用并寻找诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和细胞模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习算法、微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10039 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2025-02-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82218-9
PMID:39905117
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研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌对紫杉醇的反应机制及耐药性 | 发现紫杉醇反应模拟干扰素反应,并鉴定ELF3上调作为紫杉醇耐药的新生物标志物 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步临床验证 | 探索紫杉醇对三阴性乳腺癌细胞的分子响应机制及耐药性 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 活细胞成像 | 转录因子富集分析 | 基因表达数据, 成像数据 | 细胞系研究,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10040 | 2025-10-07 |
Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466
PMID:39884574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示嗜酸性食管炎中上皮细胞是干扰素反应特征基因表达最高的细胞类型,并发现IFN-γ对上皮屏障功能和细胞凋亡的显著影响 | 研究样本量有限,器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究嗜酸性食管炎中干扰素信号对食管上皮细胞功能的影响机制 | 嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官培养 | 器官模型 | 基因表达数据 | 嗜酸性食管炎患者活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |